Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1GIX0

Protein Details
Accession U1GIX0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
563-591TAKSDASEKSRFRRKRKSSDRWWRISDDKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
548-580RSGKSEAFRPRSSASTAKSDASEKSRFRRKRKS
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 7, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR001394  Peptidase_C19_UCH  
IPR018200  USP_CS  
IPR028889  USP_dom  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0004843  F:cysteine-type deubiquitinase activity  
GO:0016579  P:protein deubiquitination  
GO:0006511  P:ubiquitin-dependent protein catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00443  UCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00972  USP_1  
PS00973  USP_2  
PS50235  USP_3  
CDD cd02662  Peptidase_C19F  
Amino Acid Sequences MPDKPVTVAAYAAGASLAAITFFYVFGPTFFIDGENSSNTSNGRKRGIIGLSNPANDCFINSVLQALAGLGDLRLYLIRELHRRELDGVEIYEDLPDEQDAKGIEKPDKIRELQQGPVTRAVKVMLDALNERPIYKKTISARPLIEALEKAFNTRINRNQQDAQEFLQVVAERLCDEYHAAVQARKRAVSALDRRKEEDEGNILVTSEDLDADQLRPNNAPAQDEAESRPEPSPDTPLLLMEDEGFPFEGRLESQIQCQTCRFRNKPSSSNFVTLTLNVPQKSSTTLDSCFDILLKTENIDDFKCDKCRLQHAFEVRSNELIKAKSEKQATDLERDIALIKKALKEDPEKMPEGVELPSLDKAPKRSIKKYMRITSFPKLLAIHLSRSIFEPRTVSMKNAARVSFPERLRLGGILDEKWYKLLGIVCHKGNHDSGHYESFRRNHLYPPFATPDVFSAYGAQSKSGSKVASPDPSPKIPAMARTSDVNSRPSTASGCSPVISTLSVSSSSVSSPPQSRLSSKQSLDRSVPSTARESVTSDQPKSPSRSRSGKSEAFRPRSSASTAKSDASEKSRFRRKRKSSDRWWRISDDKIKECKTSEVLAMQKEVYLLFYEIERPGDDISG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.05
3 0.05
4 0.05
5 0.04
6 0.04
7 0.04
8 0.05
9 0.05
10 0.06
11 0.07
12 0.07
13 0.08
14 0.11
15 0.11
16 0.11
17 0.12
18 0.12
19 0.12
20 0.13
21 0.16
22 0.15
23 0.16
24 0.16
25 0.17
26 0.18
27 0.25
28 0.29
29 0.32
30 0.34
31 0.34
32 0.36
33 0.42
34 0.46
35 0.44
36 0.41
37 0.45
38 0.45
39 0.46
40 0.45
41 0.38
42 0.34
43 0.28
44 0.26
45 0.19
46 0.16
47 0.14
48 0.13
49 0.14
50 0.12
51 0.12
52 0.11
53 0.08
54 0.06
55 0.05
56 0.05
57 0.04
58 0.04
59 0.04
60 0.05
61 0.06
62 0.07
63 0.08
64 0.12
65 0.18
66 0.25
67 0.3
68 0.38
69 0.4
70 0.41
71 0.42
72 0.4
73 0.37
74 0.33
75 0.28
76 0.21
77 0.2
78 0.18
79 0.15
80 0.14
81 0.11
82 0.08
83 0.08
84 0.08
85 0.07
86 0.09
87 0.1
88 0.12
89 0.14
90 0.17
91 0.21
92 0.25
93 0.3
94 0.35
95 0.4
96 0.4
97 0.44
98 0.49
99 0.49
100 0.49
101 0.52
102 0.5
103 0.47
104 0.53
105 0.47
106 0.38
107 0.36
108 0.31
109 0.25
110 0.2
111 0.21
112 0.14
113 0.15
114 0.17
115 0.17
116 0.22
117 0.21
118 0.21
119 0.2
120 0.2
121 0.24
122 0.23
123 0.28
124 0.29
125 0.39
126 0.42
127 0.45
128 0.45
129 0.42
130 0.43
131 0.37
132 0.33
133 0.24
134 0.23
135 0.22
136 0.2
137 0.19
138 0.2
139 0.23
140 0.25
141 0.31
142 0.37
143 0.41
144 0.46
145 0.49
146 0.53
147 0.53
148 0.52
149 0.48
150 0.42
151 0.36
152 0.32
153 0.27
154 0.24
155 0.2
156 0.17
157 0.15
158 0.13
159 0.09
160 0.1
161 0.1
162 0.07
163 0.08
164 0.09
165 0.09
166 0.12
167 0.12
168 0.14
169 0.17
170 0.23
171 0.23
172 0.23
173 0.22
174 0.2
175 0.22
176 0.29
177 0.37
178 0.41
179 0.46
180 0.48
181 0.5
182 0.51
183 0.5
184 0.42
185 0.36
186 0.29
187 0.23
188 0.23
189 0.2
190 0.18
191 0.15
192 0.14
193 0.11
194 0.07
195 0.06
196 0.04
197 0.05
198 0.06
199 0.07
200 0.1
201 0.1
202 0.11
203 0.12
204 0.13
205 0.17
206 0.17
207 0.17
208 0.15
209 0.19
210 0.19
211 0.2
212 0.2
213 0.2
214 0.2
215 0.2
216 0.2
217 0.16
218 0.17
219 0.17
220 0.2
221 0.16
222 0.17
223 0.16
224 0.15
225 0.16
226 0.14
227 0.13
228 0.09
229 0.09
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.05
237 0.05
238 0.07
239 0.1
240 0.1
241 0.14
242 0.18
243 0.18
244 0.19
245 0.22
246 0.25
247 0.28
248 0.37
249 0.37
250 0.42
251 0.51
252 0.56
253 0.61
254 0.6
255 0.61
256 0.55
257 0.55
258 0.47
259 0.39
260 0.34
261 0.27
262 0.24
263 0.21
264 0.21
265 0.18
266 0.18
267 0.16
268 0.16
269 0.17
270 0.17
271 0.15
272 0.14
273 0.15
274 0.15
275 0.16
276 0.15
277 0.13
278 0.12
279 0.09
280 0.07
281 0.08
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.08
286 0.09
287 0.09
288 0.12
289 0.12
290 0.15
291 0.17
292 0.18
293 0.19
294 0.21
295 0.3
296 0.32
297 0.33
298 0.35
299 0.38
300 0.42
301 0.42
302 0.44
303 0.36
304 0.34
305 0.3
306 0.27
307 0.24
308 0.19
309 0.18
310 0.18
311 0.2
312 0.23
313 0.24
314 0.23
315 0.24
316 0.3
317 0.3
318 0.3
319 0.28
320 0.24
321 0.22
322 0.22
323 0.2
324 0.14
325 0.13
326 0.1
327 0.11
328 0.12
329 0.13
330 0.14
331 0.17
332 0.2
333 0.24
334 0.29
335 0.31
336 0.31
337 0.29
338 0.28
339 0.25
340 0.22
341 0.18
342 0.12
343 0.09
344 0.09
345 0.09
346 0.1
347 0.11
348 0.11
349 0.13
350 0.2
351 0.27
352 0.32
353 0.37
354 0.47
355 0.55
356 0.63
357 0.7
358 0.71
359 0.69
360 0.68
361 0.68
362 0.64
363 0.58
364 0.49
365 0.41
366 0.33
367 0.28
368 0.29
369 0.25
370 0.2
371 0.2
372 0.2
373 0.19
374 0.2
375 0.24
376 0.19
377 0.19
378 0.18
379 0.16
380 0.21
381 0.21
382 0.2
383 0.24
384 0.27
385 0.3
386 0.32
387 0.31
388 0.27
389 0.29
390 0.33
391 0.33
392 0.29
393 0.31
394 0.28
395 0.29
396 0.29
397 0.26
398 0.21
399 0.18
400 0.19
401 0.14
402 0.16
403 0.16
404 0.15
405 0.15
406 0.14
407 0.1
408 0.11
409 0.13
410 0.15
411 0.21
412 0.25
413 0.27
414 0.29
415 0.3
416 0.3
417 0.28
418 0.26
419 0.21
420 0.21
421 0.21
422 0.25
423 0.26
424 0.26
425 0.28
426 0.29
427 0.31
428 0.33
429 0.32
430 0.33
431 0.37
432 0.41
433 0.38
434 0.41
435 0.41
436 0.37
437 0.36
438 0.29
439 0.25
440 0.24
441 0.23
442 0.17
443 0.14
444 0.14
445 0.18
446 0.17
447 0.16
448 0.13
449 0.14
450 0.16
451 0.17
452 0.16
453 0.13
454 0.18
455 0.22
456 0.26
457 0.27
458 0.32
459 0.34
460 0.36
461 0.38
462 0.34
463 0.34
464 0.29
465 0.33
466 0.31
467 0.29
468 0.29
469 0.29
470 0.32
471 0.34
472 0.35
473 0.33
474 0.29
475 0.29
476 0.28
477 0.27
478 0.26
479 0.21
480 0.22
481 0.22
482 0.22
483 0.19
484 0.18
485 0.18
486 0.17
487 0.15
488 0.13
489 0.1
490 0.1
491 0.1
492 0.1
493 0.11
494 0.1
495 0.11
496 0.11
497 0.12
498 0.15
499 0.17
500 0.21
501 0.26
502 0.29
503 0.32
504 0.38
505 0.45
506 0.49
507 0.48
508 0.52
509 0.51
510 0.54
511 0.53
512 0.5
513 0.46
514 0.43
515 0.42
516 0.37
517 0.36
518 0.33
519 0.32
520 0.28
521 0.29
522 0.27
523 0.35
524 0.39
525 0.38
526 0.39
527 0.42
528 0.47
529 0.5
530 0.54
531 0.52
532 0.54
533 0.61
534 0.6
535 0.65
536 0.67
537 0.67
538 0.64
539 0.67
540 0.69
541 0.67
542 0.65
543 0.61
544 0.55
545 0.51
546 0.51
547 0.48
548 0.41
549 0.42
550 0.43
551 0.4
552 0.39
553 0.38
554 0.38
555 0.38
556 0.42
557 0.4
558 0.47
559 0.56
560 0.64
561 0.71
562 0.78
563 0.82
564 0.85
565 0.9
566 0.92
567 0.92
568 0.95
569 0.95
570 0.92
571 0.87
572 0.82
573 0.76
574 0.75
575 0.73
576 0.71
577 0.7
578 0.7
579 0.68
580 0.65
581 0.63
582 0.59
583 0.53
584 0.47
585 0.41
586 0.39
587 0.41
588 0.39
589 0.39
590 0.33
591 0.29
592 0.27
593 0.23
594 0.17
595 0.14
596 0.13
597 0.11
598 0.12
599 0.15
600 0.16
601 0.18
602 0.17
603 0.16