Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1HHD4

Protein Details
Accession U1HHD4    Localization Confidence High Confidence Score 16.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
989-1015RKGAVEKDKQRKSRVPRKPPVAKAAKDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
901-910PSKPRTSPRK
987-1022RERKGAVEKDKQRKSRVPRKPPVAKAAKDAPTKPRR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000286  His_deacetylse  
IPR023801  His_deacetylse_dom  
IPR037138  His_deacetylse_dom_sf  
IPR023696  Ureohydrolase_dom_sf  
Gene Ontology GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00850  Hist_deacetyl  
CDD cd09998  HDAC_Hos3  
Amino Acid Sequences MGYDDPVPSIERETLPNRQLYQASTNNKAASQWSQEPASLNSASNTPLPPSSPATIAQLAPRLHMHESTPGVQSLIQKRSTSHPLNHDRRSSTPLQLNRRVSAVLSMTSSSTPTRPPTSRRVSSNLLLPSSASSARSRSSSGATIRDMERKPETTSSSVAQDYFRRELGAHASAETSSKAAVIIRDACYGHRYSRPRTSKAALSTIVERPERLHACILGASTAYVRMGGRHAGGDCPPHPDHDVSSPPFKIQKTTRSIPLNYAAVTQVHGQKWMEELQIMCDSAEGKLAMNGRELVRPIGYGKDEAGDALPKLHEGDLYLCSASLDALQGCLGGVCEAVDAVCGPGNTSRAFVCIRPPGHHCSSNFPSGFCWLNNVHVGIAHAAMTQGLTHAAIIDFDLHHGDGSQAIAWDHNRKAAGNLPKNASPYSRTPIGYFSLHDINSYPCEWGDEEKIKNASLCVENAHGQSVWNVHLEPWKNHTDFWKLYRSRYCILLEKTRIFLRQHTTRLQSASNGPKAKAAIFLSAGFDASEWEGAGMQRHKVNVPTDFYARFTSDVVKLAEEEGLGVDGRIISVLEGGYSDRALTSGVLSHLCGLTHDIQNAISKAETIDTGLASAMAKQMSMPTEPSLTPQTDGKIHADGPDTIGKPSYNPEWWSTFHLEALEVLVNPPAAPSSQTKSKDKTIGNYSSPTQASTAKMADPARERRSLSVQAEGRASIEPEPVQPPPDVDWAVASYELSRLLIPTDRQTLSCRHDELNAEATKVRRERQSTIGLPSDDPSVVDQKMQLRDRKAKAIVGEDPLKAASKADRRRTIAAVGDLPDPGALQDVRNKPAIGIANNRARRRSSAGSSMLSAFENMSMSDRDSQAPESGVSTTRRETVLEKVPVQRKVKQPAAAKVQPSKPRTSPRKTGPTPPVPKVPSAFSRSSSHTSTERRETTTNQTRSARGSVASADTLTKVDDLDALSSHMTKLKINLKVPSAEDNAARERKGAVEKDKQRKSRVPRKPPVAKAAKDAPTKPRRQSDAPHVIPSSTSETITTNKQTARVVDVPASTAQRGQQPLPVQNRQQPASADQYVPTANIADIAHAEPPLQATIPAPVPAPVEIDTAVLTQNATKDSEDASLGTPWKEALQTLALSTTPVISSPALPPHPLDSAPSQQTLSAPSASAPTTIKKTRPDLPQFTASSPIPFPKMDLGVRPLQPAKEEGKPSHHQHPVESHPHLQHQTKESTAPVAETKSALQQLPKAAADASMWEVPETPRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.39
3 0.44
4 0.43
5 0.44
6 0.45
7 0.43
8 0.46
9 0.46
10 0.48
11 0.49
12 0.51
13 0.47
14 0.46
15 0.43
16 0.38
17 0.35
18 0.37
19 0.36
20 0.36
21 0.36
22 0.37
23 0.39
24 0.37
25 0.37
26 0.31
27 0.26
28 0.23
29 0.22
30 0.22
31 0.22
32 0.21
33 0.19
34 0.19
35 0.2
36 0.22
37 0.26
38 0.26
39 0.25
40 0.26
41 0.28
42 0.3
43 0.29
44 0.29
45 0.31
46 0.29
47 0.29
48 0.3
49 0.28
50 0.27
51 0.28
52 0.26
53 0.26
54 0.3
55 0.3
56 0.31
57 0.28
58 0.26
59 0.27
60 0.33
61 0.34
62 0.37
63 0.38
64 0.36
65 0.38
66 0.45
67 0.52
68 0.51
69 0.5
70 0.54
71 0.61
72 0.69
73 0.75
74 0.75
75 0.69
76 0.66
77 0.66
78 0.6
79 0.57
80 0.56
81 0.57
82 0.6
83 0.65
84 0.66
85 0.61
86 0.58
87 0.5
88 0.42
89 0.39
90 0.31
91 0.23
92 0.2
93 0.19
94 0.19
95 0.18
96 0.2
97 0.17
98 0.16
99 0.19
100 0.23
101 0.3
102 0.34
103 0.4
104 0.48
105 0.56
106 0.62
107 0.63
108 0.64
109 0.62
110 0.6
111 0.61
112 0.56
113 0.47
114 0.4
115 0.35
116 0.3
117 0.27
118 0.25
119 0.2
120 0.17
121 0.19
122 0.21
123 0.22
124 0.23
125 0.22
126 0.25
127 0.28
128 0.3
129 0.32
130 0.32
131 0.34
132 0.35
133 0.41
134 0.39
135 0.38
136 0.4
137 0.38
138 0.4
139 0.41
140 0.43
141 0.37
142 0.39
143 0.36
144 0.34
145 0.33
146 0.3
147 0.28
148 0.27
149 0.3
150 0.3
151 0.28
152 0.25
153 0.23
154 0.25
155 0.28
156 0.27
157 0.22
158 0.2
159 0.2
160 0.2
161 0.2
162 0.18
163 0.13
164 0.09
165 0.08
166 0.08
167 0.09
168 0.09
169 0.13
170 0.16
171 0.18
172 0.21
173 0.22
174 0.22
175 0.24
176 0.26
177 0.26
178 0.3
179 0.34
180 0.38
181 0.48
182 0.55
183 0.56
184 0.61
185 0.62
186 0.6
187 0.59
188 0.58
189 0.49
190 0.44
191 0.44
192 0.41
193 0.42
194 0.35
195 0.31
196 0.27
197 0.34
198 0.33
199 0.31
200 0.29
201 0.24
202 0.25
203 0.25
204 0.24
205 0.15
206 0.13
207 0.11
208 0.09
209 0.09
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.1
215 0.11
216 0.12
217 0.13
218 0.14
219 0.15
220 0.17
221 0.21
222 0.2
223 0.25
224 0.25
225 0.25
226 0.27
227 0.26
228 0.27
229 0.27
230 0.33
231 0.3
232 0.36
233 0.34
234 0.34
235 0.38
236 0.36
237 0.38
238 0.37
239 0.42
240 0.45
241 0.49
242 0.54
243 0.56
244 0.57
245 0.53
246 0.53
247 0.45
248 0.38
249 0.34
250 0.27
251 0.21
252 0.2
253 0.2
254 0.21
255 0.19
256 0.21
257 0.2
258 0.2
259 0.22
260 0.23
261 0.2
262 0.16
263 0.15
264 0.16
265 0.18
266 0.18
267 0.15
268 0.13
269 0.13
270 0.11
271 0.13
272 0.09
273 0.08
274 0.1
275 0.13
276 0.13
277 0.14
278 0.17
279 0.16
280 0.18
281 0.19
282 0.18
283 0.16
284 0.16
285 0.15
286 0.16
287 0.16
288 0.15
289 0.14
290 0.14
291 0.13
292 0.13
293 0.13
294 0.11
295 0.09
296 0.1
297 0.1
298 0.09
299 0.1
300 0.1
301 0.09
302 0.09
303 0.11
304 0.11
305 0.12
306 0.12
307 0.11
308 0.1
309 0.1
310 0.09
311 0.07
312 0.07
313 0.05
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.04
321 0.04
322 0.03
323 0.03
324 0.03
325 0.03
326 0.03
327 0.03
328 0.04
329 0.05
330 0.05
331 0.06
332 0.08
333 0.1
334 0.11
335 0.12
336 0.11
337 0.13
338 0.14
339 0.14
340 0.18
341 0.23
342 0.25
343 0.27
344 0.32
345 0.36
346 0.4
347 0.45
348 0.4
349 0.41
350 0.44
351 0.48
352 0.44
353 0.37
354 0.33
355 0.31
356 0.32
357 0.23
358 0.23
359 0.16
360 0.18
361 0.19
362 0.18
363 0.15
364 0.14
365 0.14
366 0.11
367 0.1
368 0.08
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.05
373 0.04
374 0.04
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.05
382 0.06
383 0.05
384 0.06
385 0.07
386 0.06
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.05
391 0.06
392 0.06
393 0.05
394 0.06
395 0.07
396 0.09
397 0.14
398 0.14
399 0.17
400 0.17
401 0.17
402 0.18
403 0.24
404 0.32
405 0.34
406 0.38
407 0.38
408 0.4
409 0.42
410 0.41
411 0.36
412 0.3
413 0.27
414 0.28
415 0.29
416 0.27
417 0.26
418 0.27
419 0.29
420 0.26
421 0.22
422 0.21
423 0.2
424 0.19
425 0.19
426 0.17
427 0.16
428 0.17
429 0.17
430 0.14
431 0.1
432 0.11
433 0.12
434 0.13
435 0.17
436 0.2
437 0.21
438 0.24
439 0.25
440 0.24
441 0.23
442 0.21
443 0.19
444 0.15
445 0.15
446 0.12
447 0.13
448 0.15
449 0.15
450 0.16
451 0.13
452 0.12
453 0.12
454 0.12
455 0.11
456 0.1
457 0.1
458 0.09
459 0.15
460 0.17
461 0.18
462 0.21
463 0.26
464 0.26
465 0.27
466 0.29
467 0.31
468 0.31
469 0.33
470 0.38
471 0.34
472 0.39
473 0.45
474 0.46
475 0.41
476 0.42
477 0.41
478 0.38
479 0.41
480 0.43
481 0.41
482 0.38
483 0.39
484 0.37
485 0.38
486 0.32
487 0.33
488 0.32
489 0.34
490 0.37
491 0.39
492 0.41
493 0.39
494 0.4
495 0.36
496 0.31
497 0.31
498 0.34
499 0.35
500 0.34
501 0.31
502 0.31
503 0.31
504 0.29
505 0.27
506 0.2
507 0.15
508 0.14
509 0.15
510 0.14
511 0.13
512 0.13
513 0.09
514 0.08
515 0.07
516 0.06
517 0.05
518 0.04
519 0.04
520 0.04
521 0.05
522 0.08
523 0.09
524 0.1
525 0.11
526 0.13
527 0.13
528 0.16
529 0.19
530 0.19
531 0.21
532 0.22
533 0.23
534 0.22
535 0.23
536 0.22
537 0.2
538 0.17
539 0.15
540 0.15
541 0.14
542 0.16
543 0.15
544 0.13
545 0.12
546 0.12
547 0.12
548 0.09
549 0.08
550 0.05
551 0.05
552 0.04
553 0.04
554 0.03
555 0.03
556 0.03
557 0.03
558 0.03
559 0.02
560 0.03
561 0.03
562 0.03
563 0.03
564 0.04
565 0.04
566 0.04
567 0.04
568 0.03
569 0.04
570 0.04
571 0.04
572 0.04
573 0.05
574 0.06
575 0.06
576 0.06
577 0.07
578 0.07
579 0.06
580 0.06
581 0.08
582 0.1
583 0.11
584 0.11
585 0.11
586 0.11
587 0.13
588 0.13
589 0.11
590 0.08
591 0.07
592 0.07
593 0.07
594 0.06
595 0.05
596 0.05
597 0.05
598 0.05
599 0.05
600 0.05
601 0.04
602 0.05
603 0.05
604 0.05
605 0.05
606 0.04
607 0.06
608 0.07
609 0.07
610 0.08
611 0.07
612 0.09
613 0.09
614 0.12
615 0.13
616 0.12
617 0.13
618 0.13
619 0.13
620 0.13
621 0.15
622 0.14
623 0.13
624 0.13
625 0.14
626 0.14
627 0.13
628 0.13
629 0.16
630 0.15
631 0.14
632 0.15
633 0.13
634 0.12
635 0.14
636 0.14
637 0.13
638 0.14
639 0.16
640 0.18
641 0.19
642 0.23
643 0.24
644 0.21
645 0.19
646 0.18
647 0.16
648 0.13
649 0.12
650 0.09
651 0.06
652 0.06
653 0.06
654 0.05
655 0.05
656 0.05
657 0.04
658 0.04
659 0.06
660 0.08
661 0.11
662 0.19
663 0.23
664 0.27
665 0.3
666 0.35
667 0.4
668 0.39
669 0.41
670 0.41
671 0.42
672 0.4
673 0.39
674 0.35
675 0.32
676 0.31
677 0.26
678 0.2
679 0.17
680 0.16
681 0.16
682 0.16
683 0.12
684 0.16
685 0.16
686 0.18
687 0.22
688 0.28
689 0.3
690 0.32
691 0.32
692 0.31
693 0.35
694 0.38
695 0.34
696 0.34
697 0.32
698 0.3
699 0.3
700 0.27
701 0.23
702 0.17
703 0.17
704 0.1
705 0.1
706 0.09
707 0.1
708 0.12
709 0.11
710 0.13
711 0.12
712 0.12
713 0.13
714 0.16
715 0.14
716 0.12
717 0.12
718 0.11
719 0.12
720 0.11
721 0.08
722 0.06
723 0.06
724 0.06
725 0.06
726 0.05
727 0.05
728 0.06
729 0.08
730 0.09
731 0.11
732 0.16
733 0.16
734 0.17
735 0.2
736 0.24
737 0.26
738 0.28
739 0.27
740 0.23
741 0.26
742 0.26
743 0.27
744 0.29
745 0.25
746 0.23
747 0.22
748 0.22
749 0.24
750 0.25
751 0.26
752 0.25
753 0.28
754 0.31
755 0.36
756 0.43
757 0.4
758 0.42
759 0.42
760 0.37
761 0.33
762 0.3
763 0.26
764 0.18
765 0.15
766 0.13
767 0.12
768 0.11
769 0.11
770 0.13
771 0.16
772 0.23
773 0.28
774 0.31
775 0.34
776 0.43
777 0.46
778 0.5
779 0.47
780 0.42
781 0.39
782 0.39
783 0.35
784 0.31
785 0.32
786 0.25
787 0.24
788 0.22
789 0.2
790 0.16
791 0.14
792 0.15
793 0.21
794 0.29
795 0.38
796 0.44
797 0.47
798 0.5
799 0.51
800 0.48
801 0.42
802 0.36
803 0.3
804 0.25
805 0.22
806 0.18
807 0.17
808 0.13
809 0.1
810 0.08
811 0.08
812 0.06
813 0.06
814 0.14
815 0.18
816 0.2
817 0.22
818 0.22
819 0.2
820 0.24
821 0.27
822 0.22
823 0.24
824 0.29
825 0.36
826 0.43
827 0.44
828 0.43
829 0.41
830 0.42
831 0.42
832 0.41
833 0.36
834 0.38
835 0.4
836 0.38
837 0.38
838 0.35
839 0.29
840 0.24
841 0.2
842 0.12
843 0.09
844 0.08
845 0.07
846 0.08
847 0.08
848 0.09
849 0.11
850 0.12
851 0.13
852 0.14
853 0.15
854 0.15
855 0.15
856 0.14
857 0.12
858 0.12
859 0.14
860 0.16
861 0.16
862 0.17
863 0.18
864 0.18
865 0.19
866 0.19
867 0.22
868 0.29
869 0.31
870 0.33
871 0.39
872 0.44
873 0.51
874 0.53
875 0.53
876 0.52
877 0.57
878 0.6
879 0.59
880 0.59
881 0.59
882 0.64
883 0.62
884 0.58
885 0.57
886 0.59
887 0.6
888 0.58
889 0.56
890 0.54
891 0.6
892 0.65
893 0.65
894 0.67
895 0.68
896 0.75
897 0.73
898 0.76
899 0.75
900 0.76
901 0.75
902 0.7
903 0.69
904 0.6
905 0.58
906 0.51
907 0.46
908 0.41
909 0.4
910 0.38
911 0.33
912 0.35
913 0.38
914 0.4
915 0.37
916 0.35
917 0.35
918 0.39
919 0.41
920 0.45
921 0.43
922 0.43
923 0.43
924 0.44
925 0.48
926 0.53
927 0.51
928 0.49
929 0.49
930 0.47
931 0.48
932 0.46
933 0.37
934 0.27
935 0.25
936 0.2
937 0.19
938 0.18
939 0.15
940 0.13
941 0.12
942 0.12
943 0.11
944 0.09
945 0.07
946 0.07
947 0.08
948 0.08
949 0.08
950 0.08
951 0.09
952 0.09
953 0.09
954 0.1
955 0.12
956 0.12
957 0.12
958 0.19
959 0.25
960 0.31
961 0.35
962 0.38
963 0.38
964 0.4
965 0.41
966 0.4
967 0.36
968 0.32
969 0.3
970 0.29
971 0.33
972 0.33
973 0.31
974 0.26
975 0.23
976 0.25
977 0.31
978 0.33
979 0.34
980 0.42
981 0.51
982 0.61
983 0.7
984 0.72
985 0.73
986 0.76
987 0.79
988 0.79
989 0.8
990 0.81
991 0.82
992 0.86
993 0.88
994 0.86
995 0.86
996 0.84
997 0.75
998 0.71
999 0.69
1000 0.67
1001 0.62
1002 0.6
1003 0.6
1004 0.61
1005 0.66
1006 0.68
1007 0.67
1008 0.66
1009 0.66
1010 0.69
1011 0.69
1012 0.7
1013 0.66
1014 0.63
1015 0.55
1016 0.49
1017 0.44
1018 0.39
1019 0.35
1020 0.25
1021 0.22
1022 0.18
1023 0.19
1024 0.21
1025 0.26
1026 0.26
1027 0.24
1028 0.24
1029 0.27
1030 0.28
1031 0.28
1032 0.33
1033 0.31
1034 0.3
1035 0.29
1036 0.27
1037 0.26
1038 0.27
1039 0.28
1040 0.21
1041 0.19
1042 0.2
1043 0.22
1044 0.25
1045 0.24
1046 0.27
1047 0.3
1048 0.37
1049 0.44
1050 0.48
1051 0.48
1052 0.52
1053 0.58
1054 0.54
1055 0.52
1056 0.47
1057 0.42
1058 0.43
1059 0.4
1060 0.34
1061 0.28
1062 0.29
1063 0.26
1064 0.24
1065 0.2
1066 0.13
1067 0.1
1068 0.12
1069 0.11
1070 0.1
1071 0.11
1072 0.11
1073 0.12
1074 0.11
1075 0.12
1076 0.09
1077 0.11
1078 0.11
1079 0.09
1080 0.09
1081 0.08
1082 0.12
1083 0.13
1084 0.14
1085 0.13
1086 0.13
1087 0.15
1088 0.15
1089 0.16
1090 0.14
1091 0.14
1092 0.13
1093 0.13
1094 0.13
1095 0.12
1096 0.12
1097 0.1
1098 0.08
1099 0.08
1100 0.1
1101 0.11
1102 0.12
1103 0.12
1104 0.13
1105 0.15
1106 0.16
1107 0.15
1108 0.15
1109 0.15
1110 0.17
1111 0.18
1112 0.18
1113 0.16
1114 0.15
1115 0.16
1116 0.15
1117 0.13
1118 0.13
1119 0.14
1120 0.14
1121 0.14
1122 0.15
1123 0.14
1124 0.14
1125 0.14
1126 0.12
1127 0.09
1128 0.08
1129 0.1
1130 0.09
1131 0.12
1132 0.15
1133 0.22
1134 0.22
1135 0.23
1136 0.24
1137 0.26
1138 0.27
1139 0.26
1140 0.26
1141 0.24
1142 0.3
1143 0.32
1144 0.32
1145 0.3
1146 0.28
1147 0.29
1148 0.29
1149 0.26
1150 0.19
1151 0.16
1152 0.15
1153 0.17
1154 0.17
1155 0.18
1156 0.17
1157 0.19
1158 0.26
1159 0.31
1160 0.36
1161 0.41
1162 0.46
1163 0.51
1164 0.6
1165 0.65
1166 0.65
1167 0.66
1168 0.69
1169 0.64
1170 0.6
1171 0.58
1172 0.48
1173 0.42
1174 0.37
1175 0.34
1176 0.29
1177 0.26
1178 0.27
1179 0.26
1180 0.3
1181 0.29
1182 0.31
1183 0.33
1184 0.37
1185 0.39
1186 0.43
1187 0.41
1188 0.37
1189 0.37
1190 0.37
1191 0.36
1192 0.37
1193 0.42
1194 0.4
1195 0.45
1196 0.52
1197 0.56
1198 0.61
1199 0.63
1200 0.57
1201 0.55
1202 0.59
1203 0.6
1204 0.6
1205 0.59
1206 0.56
1207 0.53
1208 0.59
1209 0.61
1210 0.58
1211 0.56
1212 0.54
1213 0.54
1214 0.5
1215 0.48
1216 0.42
1217 0.39
1218 0.35
1219 0.31
1220 0.28
1221 0.26
1222 0.25
1223 0.23
1224 0.23
1225 0.25
1226 0.28
1227 0.28
1228 0.27
1229 0.29
1230 0.32
1231 0.36
1232 0.35
1233 0.3
1234 0.26
1235 0.25
1236 0.22
1237 0.21
1238 0.2
1239 0.17
1240 0.17
1241 0.16
1242 0.18