FuNGI

U1GF41

Protein Details

Accession

U1GF41

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
349-377	GLMGKVRGRERERQRRKRNEAARREKATT	Basic
491-516	AADQPTPTPRRRGRPRKSQVVQDPIV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
341-374	HGKKAGDKGLMGKVRGRERERQRRKRNEAARREK
500-506	RRRGRPR

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto_nucl 14, cyto 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR006886 RNA_pol_III_Rpc5
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04801 RPC5

Amino Acid Sequences

MPHQTAPEDDDPVIASYPVYLTSPHYASPPNASAEILPDTAQKLVLLQYPAYRPSDTPYNARNLQKPTSLRIKPNTGLLELDIPIDTKLNYNPDKGSKYATSLKRSRIIQEGGTHGLSGGFNTGPAGRNIREEEDIDMKTIPAHSGLSDDPTLNVQTLGGKIVKPSTGDPIYLLGSFKGNSMHLPRLDALVQVRPQLPHLDALDELERNRGLTALARAKGKDGAAIINGDVSAALPPPTGPSTRPESKAIDIKLKPSGPASQSNDLTTNTNAKLLRAIQQESWQIYDWIDEDETESHDHAEKALHLSMPPGDDLTPEPPNLESAINNSEWLDLMSAPRIEHGKKAGDKGLMGKVRGRERERQRRKRNEAARREKATTTTSVHNQASAEANSAPGPSGQEREDVREDGDATAGEDTADDAQIGPSDEESSEDEQGDRQAGDRDGGVGDDEGEGEGEGDIEMLDPPNLPTASQVDGADTADDDAQEVQPPTTAADQPTPTPRRRGRPRKSQVVQDPIVVDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.12
3	0.09
4	0.1
5	0.1
6	0.1
7	0.09
8	0.12
9	0.18
10	0.2
11	0.2
12	0.22
13	0.24
14	0.26
15	0.31
16	0.31
17	0.29
18	0.28
19	0.27
20	0.25
21	0.25
22	0.26
23	0.2
24	0.17
25	0.16
26	0.16
27	0.16
28	0.16
29	0.13
30	0.11
31	0.13
32	0.17
33	0.17
34	0.17
35	0.21
36	0.24
37	0.28
38	0.29
39	0.28
40	0.25
41	0.28
42	0.36
43	0.34
44	0.38
45	0.39
46	0.44
47	0.5
48	0.54
49	0.56
50	0.52
51	0.54
52	0.55
53	0.53
54	0.52
55	0.55
56	0.56
57	0.57
58	0.58
59	0.61
60	0.56
61	0.6
62	0.56
63	0.47
64	0.41
65	0.35
66	0.31
67	0.23
68	0.22
69	0.15
70	0.13
71	0.12
72	0.12
73	0.11
74	0.1
75	0.13
76	0.2
77	0.22
78	0.24
79	0.28
80	0.34
81	0.37
82	0.36
83	0.38
84	0.32
85	0.35
86	0.42
87	0.45
88	0.48
89	0.5
90	0.55
91	0.56
92	0.57
93	0.55
94	0.53
95	0.49
96	0.44
97	0.42
98	0.4
99	0.36
100	0.34
101	0.3
102	0.23
103	0.21
104	0.17
105	0.13
106	0.1
107	0.07
108	0.07
109	0.08
110	0.09
111	0.1
112	0.11
113	0.15
114	0.14
115	0.18
116	0.21
117	0.23
118	0.23
119	0.23
120	0.25
121	0.25
122	0.25
123	0.22
124	0.2
125	0.17
126	0.16
127	0.15
128	0.12
129	0.08
130	0.08
131	0.07
132	0.09
133	0.1
134	0.12
135	0.13
136	0.12
137	0.12
138	0.13
139	0.13
140	0.11
141	0.11
142	0.08
143	0.08
144	0.08
145	0.1
146	0.1
147	0.1
148	0.1
149	0.12
150	0.13
151	0.13
152	0.14
153	0.18
154	0.18
155	0.18
156	0.18
157	0.18
158	0.18
159	0.17
160	0.16
161	0.1
162	0.1
163	0.1
164	0.1
165	0.1
166	0.09
167	0.11
168	0.15
169	0.19
170	0.18
171	0.2
172	0.2
173	0.2
174	0.2
175	0.19
176	0.17
177	0.16
178	0.17
179	0.18
180	0.19
181	0.17
182	0.18
183	0.19
184	0.18
185	0.17
186	0.16
187	0.14
188	0.13
189	0.14
190	0.15
191	0.13
192	0.13
193	0.12
194	0.11
195	0.1
196	0.1
197	0.09
198	0.07
199	0.08
200	0.14
201	0.17
202	0.2
203	0.21
204	0.21
205	0.22
206	0.24
207	0.22
208	0.18
209	0.13
210	0.11
211	0.11
212	0.11
213	0.1
214	0.08
215	0.08
216	0.06
217	0.05
218	0.04
219	0.04
220	0.04
221	0.04
222	0.04
223	0.04
224	0.06
225	0.07
226	0.08
227	0.09
228	0.12
229	0.19
230	0.23
231	0.26
232	0.27
233	0.28
234	0.3
235	0.35
236	0.33
237	0.34
238	0.31
239	0.3
240	0.32
241	0.29
242	0.27
243	0.23
244	0.25
245	0.2
246	0.26
247	0.29
248	0.29
249	0.29
250	0.3
251	0.3
252	0.27
253	0.26
254	0.19
255	0.18
256	0.14
257	0.17
258	0.16
259	0.14
260	0.16
261	0.15
262	0.2
263	0.2
264	0.21
265	0.19
266	0.23
267	0.25
268	0.24
269	0.24
270	0.19
271	0.16
272	0.14
273	0.14
274	0.11
275	0.09
276	0.08
277	0.07
278	0.07
279	0.07
280	0.09
281	0.09
282	0.08
283	0.08
284	0.09
285	0.09
286	0.09
287	0.09
288	0.09
289	0.1
290	0.11
291	0.11
292	0.09
293	0.1
294	0.11
295	0.11
296	0.1
297	0.08
298	0.07
299	0.08
300	0.09
301	0.12
302	0.13
303	0.12
304	0.12
305	0.12
306	0.13
307	0.13
308	0.12
309	0.09
310	0.1
311	0.13
312	0.12
313	0.13
314	0.12
315	0.11
316	0.1
317	0.1
318	0.08
319	0.06
320	0.06
321	0.08
322	0.09
323	0.08
324	0.1
325	0.13
326	0.13
327	0.15
328	0.18
329	0.23
330	0.25
331	0.28
332	0.3
333	0.29
334	0.29
335	0.3
336	0.34
337	0.3
338	0.29
339	0.29
340	0.31
341	0.36
342	0.43
343	0.44
344	0.46
345	0.54
346	0.65
347	0.73
348	0.78
349	0.83
350	0.86
351	0.91
352	0.91
353	0.91
354	0.9
355	0.9
356	0.89
357	0.88
358	0.82
359	0.78
360	0.68
361	0.62
362	0.54
363	0.47
364	0.4
365	0.35
366	0.34
367	0.36
368	0.35
369	0.33
370	0.3
371	0.27
372	0.27
373	0.22
374	0.2
375	0.14
376	0.14
377	0.13
378	0.13
379	0.12
380	0.09
381	0.11
382	0.11
383	0.13
384	0.13
385	0.18
386	0.19
387	0.24
388	0.27
389	0.25
390	0.24
391	0.23
392	0.24
393	0.19
394	0.18
395	0.13
396	0.1
397	0.1
398	0.09
399	0.07
400	0.06
401	0.06
402	0.06
403	0.06
404	0.06
405	0.06
406	0.06
407	0.07
408	0.08
409	0.08
410	0.07
411	0.09
412	0.09
413	0.1
414	0.13
415	0.15
416	0.15
417	0.15
418	0.15
419	0.15
420	0.16
421	0.16
422	0.13
423	0.11
424	0.14
425	0.14
426	0.15
427	0.14
428	0.14
429	0.13
430	0.13
431	0.12
432	0.08
433	0.08
434	0.07
435	0.07
436	0.06
437	0.06
438	0.06
439	0.05
440	0.05
441	0.05
442	0.04
443	0.04
444	0.04
445	0.04
446	0.05
447	0.05
448	0.06
449	0.06
450	0.07
451	0.12
452	0.12
453	0.12
454	0.13
455	0.15
456	0.18
457	0.2
458	0.19
459	0.16
460	0.17
461	0.17
462	0.16
463	0.13
464	0.12
465	0.1
466	0.1
467	0.09
468	0.09
469	0.1
470	0.13
471	0.14
472	0.13
473	0.13
474	0.14
475	0.15
476	0.18
477	0.2
478	0.19
479	0.24
480	0.26
481	0.3
482	0.4
483	0.45
484	0.45
485	0.53
486	0.58
487	0.63
488	0.73
489	0.8
490	0.8
491	0.84
492	0.9
493	0.91
494	0.9
495	0.9
496	0.88
497	0.87
498	0.78
499	0.7

U1GF41

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer