FuNGI

U1GFF4

Protein Details

Accession

U1GFF4

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
369-392	TFERTFSKRSRKPRKDGTNRVLRE	Hydrophilic
708-744	DKMICRKCYARLPPRATNCRKKKCGHSNQLRPKKKIK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
377-383	RSRKPRK
737-744	LRPKKKIK

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, mito_nucl 9.5, cyto 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR038587 L40e_sf IPR001975 Ribosomal_L40e IPR026258 SRP68 IPR034652 SRP68-RBD IPR038253 SRP68_N_sf IPR000626 Ubiquitin-like_dom IPR029071 Ubiquitin-like_domsf IPR019954 Ubiquitin_CS IPR019956 Ubiquitin_dom
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0005840 C:ribosome GO:0005786 C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting GO:0008312 F:7S RNA binding GO:0030942 F:endoplasmic reticulum signal peptide binding GO:0005047 F:signal recognition particle binding GO:0003735 F:structural constituent of ribosome GO:0006614 P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane GO:0006412 P:translation
Pfam	View protein in Pfam PF01020 Ribosomal_L40e PF16969 SRP68 PF00240 ubiquitin
PROSITE	View protein in PROSITE PS00299 UBIQUITIN_1 PS50053 UBIQUITIN_2
CDD	cd15481 SRP68-RBD cd01803 Ubl_ubiquitin

Amino Acid Sequences

MNITSYVTSERESALLVGDYSVYRAQATRRIHSLRKRMGQTTPKGRKYIPKAPVTADDIQRDHEFVNLLLMSAERAWAAAMAMKKAQSTENTQRRMPGSTKRQIYSRLSKAIQYAEHLQKCLQDKVLSCVNDTDNLEAAAYLALMRGALHFEKARWEPCIREYSVARVIYATLGSASRLDLFKDLLSNTVDPSIRYAAYQLRYSRTKAVSDIAIEGFPQSKSELLGQIKSLNPDALLTSEAAEAKGQNASYDTPSTITWRGRTVKIEDATIAQAIESADRKERELAKLHAKGQSDVRELTAAYDDVINARQEAVDATKTAIEELMSEGMDTSDTRVQSLQVTRTAVNYAVIELMVGRNRQLCGQYDGATFERTFSKRSRKPRKDGTNRVLREESTSVQVAKLRERVALYDSILQSIDAVGDLLGVAGDLSFMEELSTKRAYFRALKCLTIGRRYAILGEFRNALALYARSLELTSSVLSTHSIEETEASHGLSKLDVTSKDLQRFHGLIDGTVSQYRALVELKDLMEQQKASAKDIYVPPLVERLGEYPAEDIDLMKLVNFPPKIQPIPVKPLFFDLAWNYIDYPGRAMSGVNGAPAAPETAAEVKKEPAKKGWFGFGRFVKTLTGKTITLEVESSDTIDNVKSKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGIIEPSLKALASKYNCDKMICRKCYARLPPRATNCRKKKCGHSNQLRPKKKIK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.13
2	0.13
3	0.11
4	0.1
5	0.11
6	0.1
7	0.12
8	0.13
9	0.11
10	0.11
11	0.13
12	0.17
13	0.24
14	0.3
15	0.33
16	0.4
17	0.47
18	0.55
19	0.63
20	0.7
21	0.71
22	0.75
23	0.76
24	0.73
25	0.75
26	0.76
27	0.77
28	0.77
29	0.78
30	0.75
31	0.73
32	0.72
33	0.72
34	0.72
35	0.72
36	0.69
37	0.66
38	0.64
39	0.63
40	0.65
41	0.61
42	0.59
43	0.54
44	0.51
45	0.44
46	0.44
47	0.41
48	0.37
49	0.31
50	0.26
51	0.22
52	0.16
53	0.19
54	0.15
55	0.14
56	0.12
57	0.12
58	0.11
59	0.1
60	0.11
61	0.06
62	0.06
63	0.06
64	0.06
65	0.06
66	0.09
67	0.1
68	0.12
69	0.15
70	0.15
71	0.16
72	0.17
73	0.2
74	0.21
75	0.28
76	0.37
77	0.44
78	0.48
79	0.48
80	0.52
81	0.51
82	0.53
83	0.49
84	0.48
85	0.49
86	0.54
87	0.59
88	0.57
89	0.59
90	0.61
91	0.65
92	0.64
93	0.61
94	0.6
95	0.55
96	0.55
97	0.54
98	0.51
99	0.43
100	0.38
101	0.39
102	0.41
103	0.42
104	0.4
105	0.38
106	0.39
107	0.42
108	0.41
109	0.36
110	0.3
111	0.29
112	0.33
113	0.39
114	0.34
115	0.31
116	0.31
117	0.29
118	0.29
119	0.29
120	0.26
121	0.19
122	0.19
123	0.18
124	0.14
125	0.13
126	0.08
127	0.07
128	0.05
129	0.04
130	0.04
131	0.04
132	0.04
133	0.04
134	0.07
135	0.08
136	0.11
137	0.12
138	0.12
139	0.19
140	0.23
141	0.25
142	0.27
143	0.28
144	0.28
145	0.32
146	0.39
147	0.33
148	0.34
149	0.33
150	0.35
151	0.4
152	0.37
153	0.32
154	0.25
155	0.24
156	0.2
157	0.19
158	0.13
159	0.07
160	0.07
161	0.07
162	0.07
163	0.07
164	0.09
165	0.1
166	0.1
167	0.11
168	0.11
169	0.12
170	0.13
171	0.13
172	0.13
173	0.15
174	0.14
175	0.14
176	0.17
177	0.17
178	0.15
179	0.18
180	0.18
181	0.15
182	0.15
183	0.17
184	0.18
185	0.21
186	0.26
187	0.26
188	0.29
189	0.32
190	0.35
191	0.4
192	0.36
193	0.35
194	0.31
195	0.31
196	0.27
197	0.25
198	0.25
199	0.19
200	0.16
201	0.14
202	0.13
203	0.12
204	0.1
205	0.1
206	0.08
207	0.08
208	0.09
209	0.11
210	0.16
211	0.17
212	0.18
213	0.18
214	0.21
215	0.22
216	0.23
217	0.22
218	0.16
219	0.14
220	0.13
221	0.13
222	0.1
223	0.09
224	0.08
225	0.08
226	0.09
227	0.09
228	0.09
229	0.09
230	0.08
231	0.08
232	0.09
233	0.08
234	0.07
235	0.09
236	0.1
237	0.11
238	0.13
239	0.12
240	0.12
241	0.12
242	0.15
243	0.18
244	0.19
245	0.19
246	0.23
247	0.27
248	0.28
249	0.31
250	0.32
251	0.35
252	0.34
253	0.33
254	0.27
255	0.25
256	0.23
257	0.2
258	0.16
259	0.08
260	0.08
261	0.08
262	0.09
263	0.08
264	0.09
265	0.13
266	0.14
267	0.15
268	0.19
269	0.22
270	0.24
271	0.28
272	0.31
273	0.36
274	0.4
275	0.42
276	0.42
277	0.4
278	0.37
279	0.37
280	0.38
281	0.31
282	0.27
283	0.25
284	0.21
285	0.2
286	0.19
287	0.15
288	0.1
289	0.07
290	0.07
291	0.06
292	0.07
293	0.08
294	0.07
295	0.06
296	0.06
297	0.06
298	0.06
299	0.07
300	0.07
301	0.07
302	0.07
303	0.07
304	0.08
305	0.08
306	0.08
307	0.08
308	0.06
309	0.06
310	0.06
311	0.07
312	0.05
313	0.05
314	0.05
315	0.05
316	0.05
317	0.05
318	0.06
319	0.08
320	0.08
321	0.09
322	0.09
323	0.1
324	0.13
325	0.15
326	0.15
327	0.15
328	0.17
329	0.17
330	0.17
331	0.17
332	0.14
333	0.13
334	0.11
335	0.08
336	0.07
337	0.06
338	0.05
339	0.05
340	0.05
341	0.06
342	0.06
343	0.07
344	0.08
345	0.09
346	0.1
347	0.12
348	0.13
349	0.15
350	0.16
351	0.17
352	0.16
353	0.18
354	0.18
355	0.17
356	0.15
357	0.13
358	0.16
359	0.15
360	0.17
361	0.2
362	0.3
363	0.35
364	0.47
365	0.57
366	0.61
367	0.69
368	0.77
369	0.83
370	0.83
371	0.87
372	0.85
373	0.83
374	0.75
375	0.71
376	0.62
377	0.51
378	0.43
379	0.35
380	0.27
381	0.19
382	0.19
383	0.15
384	0.14
385	0.17
386	0.15
387	0.16
388	0.18
389	0.17
390	0.18
391	0.18
392	0.18
393	0.17
394	0.17
395	0.16
396	0.17
397	0.16
398	0.15
399	0.15
400	0.13
401	0.11
402	0.1
403	0.08
404	0.04
405	0.04
406	0.03
407	0.03
408	0.03
409	0.02
410	0.02
411	0.02
412	0.02
413	0.02
414	0.02
415	0.02
416	0.02
417	0.02
418	0.02
419	0.03
420	0.04
421	0.05
422	0.08
423	0.1
424	0.1
425	0.11
426	0.12
427	0.15
428	0.22
429	0.25
430	0.32
431	0.32
432	0.33
433	0.33
434	0.38
435	0.38
436	0.34
437	0.33
438	0.24
439	0.23
440	0.23
441	0.23
442	0.19
443	0.2
444	0.16
445	0.17
446	0.16
447	0.15
448	0.16
449	0.14
450	0.12
451	0.09
452	0.08
453	0.07
454	0.07
455	0.08
456	0.07
457	0.07
458	0.07
459	0.07
460	0.07
461	0.07
462	0.06
463	0.06
464	0.06
465	0.07
466	0.08
467	0.08
468	0.07
469	0.07
470	0.07
471	0.08
472	0.08
473	0.1
474	0.09
475	0.08
476	0.09
477	0.09
478	0.09
479	0.09
480	0.08
481	0.07
482	0.1
483	0.11
484	0.14
485	0.22
486	0.26
487	0.33
488	0.34
489	0.34
490	0.35
491	0.35
492	0.31
493	0.28
494	0.23
495	0.17
496	0.18
497	0.17
498	0.14
499	0.14
500	0.14
501	0.09
502	0.1
503	0.1
504	0.09
505	0.1
506	0.08
507	0.09
508	0.12
509	0.12
510	0.13
511	0.15
512	0.14
513	0.16
514	0.15
515	0.16
516	0.18
517	0.18
518	0.19
519	0.2
520	0.18
521	0.22
522	0.24
523	0.27
524	0.23
525	0.23
526	0.21
527	0.21
528	0.21
529	0.16
530	0.15
531	0.12
532	0.13
533	0.12
534	0.12
535	0.1
536	0.1
537	0.11
538	0.1
539	0.08
540	0.06
541	0.07
542	0.07
543	0.06
544	0.08
545	0.08
546	0.14
547	0.14
548	0.15
549	0.2
550	0.26
551	0.28
552	0.3
553	0.37
554	0.36
555	0.45
556	0.48
557	0.44
558	0.39
559	0.41
560	0.39
561	0.32
562	0.3
563	0.22
564	0.2
565	0.2
566	0.2
567	0.17
568	0.17
569	0.19
570	0.15
571	0.15
572	0.12
573	0.12
574	0.12
575	0.11
576	0.1
577	0.13
578	0.13
579	0.12
580	0.11
581	0.1
582	0.1
583	0.11
584	0.1
585	0.06
586	0.05
587	0.07
588	0.13
589	0.14
590	0.15
591	0.16
592	0.19
593	0.26
594	0.3
595	0.31
596	0.34
597	0.39
598	0.44
599	0.45
600	0.51
601	0.5
602	0.49
603	0.54
604	0.51
605	0.51
606	0.46
607	0.44
608	0.39
609	0.36
610	0.35
611	0.31
612	0.3
613	0.24
614	0.24
615	0.27
616	0.24
617	0.22
618	0.2
619	0.16
620	0.15
621	0.15
622	0.15
623	0.11
624	0.11
625	0.11
626	0.12
627	0.13
628	0.12
629	0.15
630	0.18
631	0.23
632	0.28
633	0.31
634	0.37
635	0.37
636	0.46
637	0.5
638	0.49
639	0.48
640	0.49
641	0.49
642	0.48
643	0.46
644	0.37
645	0.34
646	0.34
647	0.33
648	0.3
649	0.32
650	0.26
651	0.31
652	0.31
653	0.29
654	0.26
655	0.25
656	0.24
657	0.2
658	0.21
659	0.17
660	0.23
661	0.26
662	0.28
663	0.31
664	0.28
665	0.27
666	0.27
667	0.3
668	0.27
669	0.26
670	0.22
671	0.24
672	0.28
673	0.29
674	0.31
675	0.28
676	0.23
677	0.2
678	0.21
679	0.18
680	0.16
681	0.18
682	0.15
683	0.18
684	0.18
685	0.17
686	0.16
687	0.16
688	0.22
689	0.22
690	0.3
691	0.35
692	0.41
693	0.44
694	0.46
695	0.51
696	0.53
697	0.61
698	0.58
699	0.58
700	0.57
701	0.61
702	0.69
703	0.74
704	0.73
705	0.73
706	0.76
707	0.79
708	0.83
709	0.87
710	0.87
711	0.87
712	0.88
713	0.88
714	0.89
715	0.87
716	0.88
717	0.88
718	0.9
719	0.9
720	0.9
721	0.9
722	0.93
723	0.96
724	0.95

U1GFF4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer