Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1GFD1

Protein Details
Accession U1GFD1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
585-612QRDAMRDLRAARKRRKRLAELRVAKLEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
524-527EKRK
590-617RDLRAARKRRKRLAELRVAKLEALKKRQ
646-655IKWKIRERKR
Subcellular Location(s) mito 10.5, cyto_mito 9, cyto 6.5, nucl 5, plas 2, extr 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029044  Nucleotide-diphossugar_trans  
IPR007144  SSU_processome_Utp11  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0048856  P:anatomical structure development  
GO:0006364  P:rRNA processing  
GO:0043934  P:sporulation  
Pfam View protein in Pfam  
PF13641  Glyco_tranf_2_3  
PF03998  Utp11  
CDD cd06434  GT2_HAS  
Amino Acid Sequences MFSVAPLSYLSCFIGLFLYRYVRYVVNLVAFSCFRPIPLPEKPSLTSDDVTVILPSLEGRGMELEHTIESILQNEPKELILVTIQANLELAQKTIAKMPASQHDRLRCLSVPNPNKRRQMARAIPEVNTKIIVFADDDVSWPRQTLKWMLAPFENEKYGGVVTCQRLRRKEYPIFSQKRIWSFLGALYLERRNFDCAATTFMDGGVPCMSGRTVAYRTKILRDKNFTYEFTNEAWWFGKYRLNADDDNFITRWMVSHGWKTYMQYHPECEVQTILEDNPKYLKQCVRWSRSNWRSNLTSMFTERHIWSGQPYSAYAVHLTTLSPPAFIGDSTLVWLLWKAGQTWPEEQQHLAIYSLLVWMFISKFSKNLGHYIRYPSDTALLPVSIFFGWFHGLIKLYAMVTLDVDYSLRARDYNLKKQKLAILSQKARNRNEDEFAFGMLSANKAQAGKHGRVDTQANRLSHDAVKLLKTQDAGYLRTVAGRGRKEISKLEQDVVMTKASGNGRKVLFVEEDERLNGTKGRAEKRKKLSNEVAAAGNNQEEQEVTSLGTENIASVTGTTVYAIDIDSSSTKPTAPTSKKALAAQRDAMRDLRAARKRRKRLAELRVAKLEALKKRQREIMAAADELELQRAKMARTVGGVNKDGIKWKIRERKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.14
4 0.15
5 0.2
6 0.19
7 0.21
8 0.23
9 0.21
10 0.22
11 0.23
12 0.22
13 0.22
14 0.22
15 0.21
16 0.23
17 0.22
18 0.21
19 0.23
20 0.19
21 0.16
22 0.19
23 0.22
24 0.25
25 0.33
26 0.38
27 0.37
28 0.43
29 0.44
30 0.44
31 0.45
32 0.43
33 0.35
34 0.3
35 0.29
36 0.24
37 0.23
38 0.2
39 0.15
40 0.1
41 0.09
42 0.09
43 0.08
44 0.08
45 0.07
46 0.08
47 0.09
48 0.09
49 0.1
50 0.1
51 0.1
52 0.1
53 0.1
54 0.09
55 0.09
56 0.09
57 0.1
58 0.13
59 0.15
60 0.15
61 0.16
62 0.17
63 0.16
64 0.16
65 0.14
66 0.12
67 0.1
68 0.12
69 0.11
70 0.14
71 0.14
72 0.13
73 0.13
74 0.13
75 0.15
76 0.13
77 0.13
78 0.12
79 0.13
80 0.14
81 0.19
82 0.22
83 0.19
84 0.22
85 0.26
86 0.33
87 0.38
88 0.42
89 0.45
90 0.47
91 0.5
92 0.49
93 0.49
94 0.41
95 0.41
96 0.42
97 0.45
98 0.49
99 0.56
100 0.63
101 0.67
102 0.73
103 0.73
104 0.75
105 0.71
106 0.72
107 0.7
108 0.68
109 0.69
110 0.63
111 0.6
112 0.59
113 0.54
114 0.44
115 0.36
116 0.29
117 0.2
118 0.18
119 0.16
120 0.11
121 0.1
122 0.11
123 0.1
124 0.11
125 0.13
126 0.15
127 0.15
128 0.14
129 0.15
130 0.15
131 0.18
132 0.21
133 0.23
134 0.27
135 0.28
136 0.3
137 0.31
138 0.33
139 0.33
140 0.33
141 0.29
142 0.23
143 0.21
144 0.2
145 0.18
146 0.14
147 0.12
148 0.15
149 0.18
150 0.24
151 0.3
152 0.35
153 0.4
154 0.48
155 0.53
156 0.56
157 0.61
158 0.6
159 0.64
160 0.69
161 0.7
162 0.66
163 0.67
164 0.63
165 0.59
166 0.57
167 0.48
168 0.39
169 0.33
170 0.31
171 0.27
172 0.22
173 0.19
174 0.18
175 0.21
176 0.2
177 0.2
178 0.2
179 0.19
180 0.2
181 0.19
182 0.2
183 0.16
184 0.2
185 0.2
186 0.2
187 0.16
188 0.16
189 0.16
190 0.12
191 0.13
192 0.09
193 0.08
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.1
200 0.14
201 0.17
202 0.2
203 0.24
204 0.26
205 0.33
206 0.39
207 0.42
208 0.46
209 0.5
210 0.51
211 0.54
212 0.55
213 0.5
214 0.47
215 0.41
216 0.36
217 0.29
218 0.29
219 0.21
220 0.19
221 0.18
222 0.15
223 0.15
224 0.14
225 0.17
226 0.14
227 0.17
228 0.19
229 0.21
230 0.22
231 0.22
232 0.26
233 0.23
234 0.25
235 0.22
236 0.19
237 0.16
238 0.14
239 0.13
240 0.1
241 0.12
242 0.11
243 0.16
244 0.17
245 0.2
246 0.21
247 0.22
248 0.27
249 0.3
250 0.33
251 0.3
252 0.31
253 0.3
254 0.31
255 0.3
256 0.24
257 0.19
258 0.14
259 0.13
260 0.11
261 0.1
262 0.11
263 0.11
264 0.11
265 0.13
266 0.14
267 0.15
268 0.17
269 0.21
270 0.22
271 0.32
272 0.4
273 0.45
274 0.5
275 0.54
276 0.62
277 0.67
278 0.69
279 0.62
280 0.57
281 0.52
282 0.48
283 0.46
284 0.37
285 0.29
286 0.24
287 0.23
288 0.2
289 0.21
290 0.19
291 0.18
292 0.16
293 0.15
294 0.15
295 0.16
296 0.15
297 0.13
298 0.12
299 0.12
300 0.12
301 0.13
302 0.11
303 0.09
304 0.08
305 0.08
306 0.08
307 0.06
308 0.09
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.08
315 0.08
316 0.06
317 0.05
318 0.06
319 0.07
320 0.06
321 0.05
322 0.06
323 0.05
324 0.05
325 0.06
326 0.06
327 0.08
328 0.11
329 0.13
330 0.16
331 0.2
332 0.22
333 0.22
334 0.21
335 0.2
336 0.18
337 0.16
338 0.14
339 0.09
340 0.07
341 0.06
342 0.07
343 0.06
344 0.05
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.06
349 0.08
350 0.07
351 0.08
352 0.1
353 0.14
354 0.15
355 0.21
356 0.23
357 0.24
358 0.27
359 0.32
360 0.32
361 0.3
362 0.3
363 0.23
364 0.22
365 0.19
366 0.18
367 0.13
368 0.11
369 0.09
370 0.08
371 0.09
372 0.06
373 0.06
374 0.05
375 0.06
376 0.06
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.08
381 0.07
382 0.08
383 0.08
384 0.07
385 0.07
386 0.07
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.06
396 0.06
397 0.05
398 0.07
399 0.17
400 0.24
401 0.35
402 0.44
403 0.47
404 0.48
405 0.5
406 0.53
407 0.48
408 0.47
409 0.45
410 0.45
411 0.48
412 0.55
413 0.58
414 0.61
415 0.6
416 0.59
417 0.56
418 0.5
419 0.47
420 0.41
421 0.38
422 0.31
423 0.29
424 0.23
425 0.17
426 0.15
427 0.11
428 0.11
429 0.08
430 0.08
431 0.08
432 0.09
433 0.09
434 0.15
435 0.21
436 0.22
437 0.27
438 0.29
439 0.28
440 0.31
441 0.37
442 0.34
443 0.37
444 0.39
445 0.34
446 0.34
447 0.34
448 0.34
449 0.3
450 0.27
451 0.21
452 0.18
453 0.19
454 0.21
455 0.21
456 0.2
457 0.19
458 0.19
459 0.22
460 0.22
461 0.22
462 0.2
463 0.21
464 0.19
465 0.19
466 0.19
467 0.17
468 0.21
469 0.21
470 0.23
471 0.25
472 0.28
473 0.3
474 0.35
475 0.38
476 0.4
477 0.4
478 0.38
479 0.36
480 0.34
481 0.33
482 0.29
483 0.23
484 0.14
485 0.12
486 0.16
487 0.18
488 0.23
489 0.22
490 0.26
491 0.26
492 0.27
493 0.28
494 0.26
495 0.23
496 0.21
497 0.23
498 0.19
499 0.2
500 0.19
501 0.19
502 0.17
503 0.17
504 0.17
505 0.14
506 0.17
507 0.22
508 0.31
509 0.4
510 0.48
511 0.56
512 0.64
513 0.73
514 0.73
515 0.76
516 0.76
517 0.75
518 0.71
519 0.63
520 0.56
521 0.47
522 0.43
523 0.34
524 0.26
525 0.18
526 0.13
527 0.11
528 0.08
529 0.09
530 0.09
531 0.09
532 0.08
533 0.08
534 0.09
535 0.09
536 0.09
537 0.08
538 0.07
539 0.07
540 0.07
541 0.06
542 0.05
543 0.06
544 0.06
545 0.06
546 0.06
547 0.06
548 0.06
549 0.07
550 0.06
551 0.06
552 0.06
553 0.07
554 0.09
555 0.1
556 0.12
557 0.12
558 0.12
559 0.13
560 0.18
561 0.27
562 0.31
563 0.37
564 0.43
565 0.48
566 0.52
567 0.57
568 0.6
569 0.57
570 0.57
571 0.58
572 0.56
573 0.53
574 0.51
575 0.47
576 0.41
577 0.36
578 0.36
579 0.38
580 0.41
581 0.48
582 0.56
583 0.65
584 0.74
585 0.82
586 0.86
587 0.87
588 0.89
589 0.9
590 0.9
591 0.88
592 0.85
593 0.81
594 0.72
595 0.62
596 0.57
597 0.54
598 0.51
599 0.52
600 0.53
601 0.53
602 0.58
603 0.64
604 0.61
605 0.59
606 0.56
607 0.55
608 0.5
609 0.45
610 0.4
611 0.34
612 0.32
613 0.26
614 0.24
615 0.15
616 0.11
617 0.14
618 0.15
619 0.16
620 0.18
621 0.2
622 0.19
623 0.22
624 0.28
625 0.31
626 0.35
627 0.36
628 0.34
629 0.36
630 0.36
631 0.39
632 0.38
633 0.39
634 0.38
635 0.47