FuNGI

U1HGQ6

Protein Details

Accession

U1HGQ6

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
827-849	ESKIKQPKPTPTKTPPKGKTRAA	Hydrophilic
908-932	RPSPSKRGASPDKRQDQKRQRTDTG	Hydrophilic
1130-1162	TSSKARRSSHLRGSGRNRQPVKTDKKGKGKARA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
831-922	KQPKPTPTKTPPKGKTRAAATAIPGSSKSKTTAAPGSSKAKPFFGPRTPNKAAPSPTKTRPSAGKDRKAAAASKTATRPSPSKRGASPDKRQ
1133-1162	KARRSSHLRGSGRNRQPVKTDKKGKGKARA

Subcellular Location(s)

nucl 9, cyto 9, cyto_nucl 9

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR041577 RT_RNaseH_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF17919 RT_RNaseH_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE

Amino Acid Sequences

MPIRFKDELDVSGLKTNPYNLSRRDRIEADKILDPLVEEGCVEPVPLGHPLAASSPAFIVWNKGKPRLVVDLRKVLSALEASGVSLSIKKCHFGYPSIQLLGHHVSRLGYSTLEEKVDAIRKKAFPKTLKQLETGIGFFGYYRKYVGHYSSIAEPLQRLKTIGFKGALVKGRQRDQYAAKTTLTDGTAIKNLEEEDREKLIAEAKAAWEKLKEELTAAPTLAYPDFSLPFKLYMDGSYEHGFGAAVHQVQDGALQKVPFYFDQGDFEVVTDYSPILGLCKEAKGRRSQRLDKWALFLSKFHPRIKITHRAGKKHANADGLSRLHDEKDSRALSVTVIGLQEPFLDQIRDGLNTDKAFTTVMQKVRAMKKAAEKADEDTTDREWAYHSFVWRADGLLYHIRAGHPDRLCIPVNVERTLLESAHDHNAHLGLKKAYDKGFDAFATVTCKYSKWIHILPGKETWTAGEWAHAFFDQVVRYHTLPDAIVSDRDAKFTSSFWRHLMSKCKVAGHMTAAYHPAADGQSERTNQSVEIALRCLLVGEYEERWVDIIAEVERCLNCAYNASIGMSAFEALYGYPPRIDFARGSEHNEAQEFVEARELIRKDLEDAVQLANARMAFFFDEKHEPPHFQGKVFISSKLSTIRMGPYPIKRRVGQLAYELELPSHTRIHPVISCVHLEPFHEDAHERRMAEPVPIIVDGEAEWVVEKLLRAKGKGEQQRILGDARTTRIGFGTLPKVVYKGVVYYVVLGKYYPLFGNEGGTKPDGFLSINAGVKEARNKKGSPFSFGSIRVPKKYRDVRGVVYLNRTSADFQEYELRGLRFSPAANDESKIKQPKPTPTKTPPKGKTRAAATAIPGSSKSKTTAAPGSSKAKPFFGPRTPNKAAPSPTKTRPSAGKDRKAAAASKTATRPSPSKRGASPDKRQDQKRQRTDTGYVNAIQRGREQAEDALRQAENDWQSGRTKVEGVEMDMRIKTAQAMVAFWDARARNRVLRVARHSIDQEIRGNLALNPAAERSRVLQRTAERYEQLDELVADMTDSEAEDSDDAADDASNVSADEAAADEEGPDSEWEEPGSKSPPEVPMHSDDGNGKGDDEAGPSGVNEATSDLDDEPDMESLEESSPDSSPSKTALTSSKARRSSHLRGSGRNRQPVKTDKKGKGKARA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.26
3	0.28
4	0.3
5	0.33
6	0.38
7	0.4
8	0.49
9	0.55
10	0.58
11	0.61
12	0.59
13	0.6
14	0.62
15	0.6
16	0.55
17	0.53
18	0.49
19	0.43
20	0.38
21	0.31
22	0.25
23	0.19
24	0.14
25	0.1
26	0.1
27	0.11
28	0.11
29	0.1
30	0.08
31	0.08
32	0.1
33	0.12
34	0.12
35	0.11
36	0.11
37	0.12
38	0.13
39	0.16
40	0.14
41	0.13
42	0.13
43	0.13
44	0.14
45	0.14
46	0.19
47	0.21
48	0.29
49	0.33
50	0.4
51	0.42
52	0.43
53	0.48
54	0.51
55	0.55
56	0.56
57	0.59
58	0.61
59	0.59
60	0.58
61	0.53
62	0.43
63	0.35
64	0.27
65	0.2
66	0.12
67	0.11
68	0.1
69	0.1
70	0.1
71	0.09
72	0.12
73	0.12
74	0.16
75	0.17
76	0.2
77	0.21
78	0.27
79	0.29
80	0.29
81	0.35
82	0.37
83	0.42
84	0.41
85	0.41
86	0.35
87	0.37
88	0.38
89	0.33
90	0.25
91	0.2
92	0.18
93	0.18
94	0.21
95	0.17
96	0.12
97	0.13
98	0.15
99	0.17
100	0.17
101	0.16
102	0.15
103	0.19
104	0.27
105	0.28
106	0.29
107	0.34
108	0.38
109	0.45
110	0.53
111	0.56
112	0.55
113	0.62
114	0.69
115	0.72
116	0.7
117	0.65
118	0.6
119	0.55
120	0.51
121	0.42
122	0.32
123	0.22
124	0.18
125	0.16
126	0.16
127	0.14
128	0.11
129	0.12
130	0.12
131	0.15
132	0.19
133	0.22
134	0.24
135	0.24
136	0.26
137	0.28
138	0.31
139	0.28
140	0.25
141	0.23
142	0.24
143	0.26
144	0.24
145	0.22
146	0.2
147	0.27
148	0.29
149	0.32
150	0.28
151	0.26
152	0.3
153	0.35
154	0.39
155	0.35
156	0.4
157	0.41
158	0.47
159	0.5
160	0.49
161	0.49
162	0.5
163	0.55
164	0.55
165	0.52
166	0.46
167	0.42
168	0.4
169	0.38
170	0.31
171	0.24
172	0.17
173	0.17
174	0.2
175	0.2
176	0.18
177	0.16
178	0.16
179	0.17
180	0.19
181	0.18
182	0.19
183	0.21
184	0.21
185	0.2
186	0.2
187	0.22
188	0.2
189	0.19
190	0.17
191	0.18
192	0.22
193	0.23
194	0.23
195	0.2
196	0.2
197	0.22
198	0.23
199	0.2
200	0.17
201	0.2
202	0.22
203	0.22
204	0.21
205	0.17
206	0.15
207	0.16
208	0.15
209	0.12
210	0.1
211	0.1
212	0.12
213	0.13
214	0.14
215	0.14
216	0.15
217	0.15
218	0.15
219	0.14
220	0.13
221	0.16
222	0.15
223	0.17
224	0.17
225	0.17
226	0.15
227	0.15
228	0.14
229	0.1
230	0.11
231	0.1
232	0.09
233	0.09
234	0.1
235	0.09
236	0.09
237	0.13
238	0.13
239	0.12
240	0.14
241	0.13
242	0.14
243	0.15
244	0.17
245	0.14
246	0.16
247	0.18
248	0.16
249	0.2
250	0.21
251	0.22
252	0.19
253	0.19
254	0.16
255	0.12
256	0.11
257	0.08
258	0.07
259	0.06
260	0.06
261	0.05
262	0.05
263	0.06
264	0.07
265	0.08
266	0.12
267	0.18
268	0.21
269	0.26
270	0.36
271	0.44
272	0.51
273	0.6
274	0.65
275	0.68
276	0.75
277	0.78
278	0.69
279	0.65
280	0.6
281	0.54
282	0.46
283	0.39
284	0.33
285	0.36
286	0.39
287	0.37
288	0.39
289	0.37
290	0.44
291	0.49
292	0.56
293	0.53
294	0.57
295	0.61
296	0.62
297	0.66
298	0.68
299	0.68
300	0.63
301	0.6
302	0.55
303	0.49
304	0.46
305	0.46
306	0.37
307	0.32
308	0.28
309	0.25
310	0.21
311	0.23
312	0.21
313	0.17
314	0.24
315	0.23
316	0.22
317	0.22
318	0.21
319	0.18
320	0.19
321	0.17
322	0.1
323	0.1
324	0.09
325	0.08
326	0.08
327	0.08
328	0.06
329	0.07
330	0.07
331	0.07
332	0.07
333	0.09
334	0.11
335	0.11
336	0.12
337	0.13
338	0.16
339	0.16
340	0.18
341	0.15
342	0.14
343	0.14
344	0.14
345	0.17
346	0.19
347	0.22
348	0.23
349	0.25
350	0.32
351	0.37
352	0.42
353	0.39
354	0.38
355	0.43
356	0.48
357	0.49
358	0.45
359	0.41
360	0.39
361	0.41
362	0.38
363	0.31
364	0.25
365	0.23
366	0.22
367	0.2
368	0.17
369	0.14
370	0.13
371	0.17
372	0.17
373	0.17
374	0.17
375	0.17
376	0.19
377	0.18
378	0.17
379	0.13
380	0.11
381	0.13
382	0.15
383	0.15
384	0.14
385	0.15
386	0.14
387	0.17
388	0.2
389	0.24
390	0.2
391	0.21
392	0.22
393	0.25
394	0.27
395	0.24
396	0.25
397	0.23
398	0.26
399	0.25
400	0.24
401	0.2
402	0.21
403	0.22
404	0.18
405	0.13
406	0.11
407	0.12
408	0.18
409	0.18
410	0.15
411	0.14
412	0.16
413	0.17
414	0.16
415	0.17
416	0.12
417	0.14
418	0.16
419	0.19
420	0.18
421	0.19
422	0.19
423	0.18
424	0.19
425	0.17
426	0.16
427	0.13
428	0.13
429	0.15
430	0.14
431	0.14
432	0.12
433	0.13
434	0.14
435	0.18
436	0.2
437	0.22
438	0.24
439	0.3
440	0.34
441	0.35
442	0.35
443	0.36
444	0.34
445	0.29
446	0.27
447	0.2
448	0.17
449	0.17
450	0.14
451	0.13
452	0.11
453	0.11
454	0.12
455	0.11
456	0.09
457	0.08
458	0.1
459	0.08
460	0.09
461	0.1
462	0.12
463	0.12
464	0.13
465	0.13
466	0.12
467	0.11
468	0.11
469	0.11
470	0.09
471	0.09
472	0.09
473	0.15
474	0.14
475	0.15
476	0.15
477	0.14
478	0.14
479	0.15
480	0.21
481	0.2
482	0.22
483	0.22
484	0.25
485	0.26
486	0.3
487	0.38
488	0.34
489	0.35
490	0.35
491	0.35
492	0.33
493	0.32
494	0.29
495	0.23
496	0.23
497	0.18
498	0.17
499	0.17
500	0.16
501	0.14
502	0.12
503	0.1
504	0.07
505	0.07
506	0.07
507	0.08
508	0.12
509	0.13
510	0.14
511	0.13
512	0.14
513	0.13
514	0.14
515	0.13
516	0.11
517	0.11
518	0.11
519	0.11
520	0.1
521	0.1
522	0.09
523	0.06
524	0.05
525	0.05
526	0.06
527	0.06
528	0.07
529	0.07
530	0.07
531	0.07
532	0.07
533	0.07
534	0.05
535	0.06
536	0.06
537	0.06
538	0.06
539	0.08
540	0.08
541	0.08
542	0.08
543	0.07
544	0.07
545	0.08
546	0.08
547	0.08
548	0.08
549	0.08
550	0.08
551	0.07
552	0.07
553	0.06
554	0.06
555	0.05
556	0.04
557	0.04
558	0.03
559	0.05
560	0.05
561	0.05
562	0.06
563	0.06
564	0.07
565	0.07
566	0.09
567	0.07
568	0.1
569	0.17
570	0.17
571	0.23
572	0.24
573	0.25
574	0.24
575	0.24
576	0.22
577	0.15
578	0.16
579	0.11
580	0.09
581	0.1
582	0.09
583	0.09
584	0.13
585	0.13
586	0.12
587	0.12
588	0.12
589	0.12
590	0.14
591	0.14
592	0.1
593	0.11
594	0.1
595	0.11
596	0.11
597	0.09
598	0.08
599	0.08
600	0.07
601	0.06
602	0.06
603	0.06
604	0.06
605	0.07
606	0.09
607	0.13
608	0.14
609	0.19
610	0.2
611	0.2
612	0.22
613	0.3
614	0.28
615	0.24
616	0.28
617	0.24
618	0.3
619	0.3
620	0.29
621	0.23
622	0.23
623	0.24
624	0.22
625	0.21
626	0.14
627	0.15
628	0.16
629	0.15
630	0.18
631	0.21
632	0.26
633	0.33
634	0.38
635	0.41
636	0.39
637	0.41
638	0.44
639	0.42
640	0.36
641	0.32
642	0.28
643	0.26
644	0.26
645	0.23
646	0.16
647	0.14
648	0.14
649	0.11
650	0.11
651	0.09
652	0.11
653	0.11
654	0.14
655	0.14
656	0.15
657	0.16
658	0.16
659	0.17
660	0.15
661	0.16
662	0.14
663	0.14
664	0.15
665	0.15
666	0.13
667	0.13
668	0.13
669	0.13
670	0.18
671	0.19
672	0.16
673	0.15
674	0.18
675	0.18
676	0.18
677	0.17
678	0.12
679	0.11
680	0.1
681	0.1
682	0.07
683	0.07
684	0.06
685	0.06
686	0.06
687	0.04
688	0.04
689	0.04
690	0.04
691	0.05
692	0.05
693	0.07
694	0.12
695	0.13
696	0.14
697	0.16
698	0.21
699	0.29
700	0.37
701	0.39
702	0.37
703	0.38
704	0.39
705	0.39
706	0.35
707	0.27
708	0.21
709	0.18
710	0.16
711	0.17
712	0.15
713	0.14
714	0.13
715	0.13
716	0.12
717	0.14
718	0.16
719	0.15
720	0.15
721	0.15
722	0.16
723	0.15
724	0.15
725	0.12
726	0.09
727	0.09
728	0.09
729	0.09
730	0.1
731	0.12
732	0.11
733	0.11
734	0.1
735	0.09
736	0.09
737	0.1
738	0.09
739	0.08
740	0.09
741	0.09
742	0.12
743	0.13
744	0.14
745	0.15
746	0.15
747	0.14
748	0.13
749	0.13
750	0.11
751	0.1
752	0.09
753	0.11
754	0.14
755	0.16
756	0.15
757	0.15
758	0.15
759	0.16
760	0.24
761	0.26
762	0.29
763	0.31
764	0.32
765	0.36
766	0.46
767	0.46
768	0.44
769	0.41
770	0.38
771	0.38
772	0.39
773	0.4
774	0.39
775	0.41
776	0.41
777	0.41
778	0.41
779	0.47
780	0.53
781	0.53
782	0.53
783	0.53
784	0.5
785	0.55
786	0.57
787	0.5
788	0.48
789	0.42
790	0.34
791	0.3
792	0.28
793	0.21
794	0.17
795	0.18
796	0.12
797	0.13
798	0.2
799	0.2
800	0.21
801	0.24
802	0.23
803	0.2
804	0.2
805	0.2
806	0.13
807	0.13
808	0.14
809	0.14
810	0.16
811	0.17
812	0.18
813	0.2
814	0.22
815	0.29
816	0.33
817	0.31
818	0.36
819	0.41
820	0.5
821	0.57
822	0.61
823	0.63
824	0.66
825	0.76
826	0.78
827	0.82
828	0.8
829	0.8
830	0.81
831	0.76
832	0.73
833	0.67
834	0.66
835	0.59
836	0.52
837	0.45
838	0.43
839	0.38
840	0.32
841	0.28
842	0.23
843	0.21
844	0.2
845	0.2
846	0.17
847	0.18
848	0.22
849	0.27
850	0.27
851	0.3
852	0.33
853	0.37
854	0.38
855	0.42
856	0.39
857	0.36
858	0.35
859	0.37
860	0.4
861	0.43
862	0.48
863	0.51
864	0.59
865	0.61
866	0.63
867	0.61
868	0.59
869	0.56
870	0.55
871	0.55
872	0.53
873	0.56
874	0.59
875	0.56
876	0.55
877	0.57
878	0.56
879	0.6
880	0.63
881	0.65
882	0.63
883	0.64
884	0.64
885	0.59
886	0.55
887	0.46
888	0.44
889	0.37
890	0.37
891	0.38
892	0.37
893	0.36
894	0.37
895	0.4
896	0.39
897	0.47
898	0.47
899	0.48
900	0.49
901	0.56
902	0.63
903	0.66
904	0.69
905	0.69
906	0.74
907	0.78
908	0.81
909	0.83
910	0.83
911	0.85
912	0.85
913	0.83
914	0.79
915	0.77
916	0.74
917	0.71
918	0.64
919	0.57
920	0.49
921	0.43
922	0.41
923	0.36
924	0.32
925	0.26
926	0.27
927	0.25
928	0.23
929	0.22
930	0.23
931	0.28
932	0.29
933	0.27
934	0.26
935	0.24
936	0.23
937	0.22
938	0.23
939	0.19
940	0.19
941	0.2
942	0.18
943	0.2
944	0.23
945	0.23
946	0.19
947	0.19
948	0.18
949	0.22
950	0.21
951	0.23
952	0.27
953	0.27
954	0.28
955	0.26
956	0.26
957	0.21
958	0.2
959	0.16
960	0.11
961	0.12
962	0.1
963	0.11
964	0.12
965	0.16
966	0.16
967	0.16
968	0.2
969	0.19
970	0.22
971	0.27
972	0.28
973	0.29
974	0.33
975	0.41
976	0.41
977	0.48
978	0.52
979	0.56
980	0.54
981	0.53
982	0.51
983	0.5
984	0.48
985	0.43
986	0.4
987	0.32
988	0.32
989	0.28
990	0.27
991	0.21
992	0.21
993	0.18
994	0.14
995	0.14
996	0.15
997	0.15
998	0.15
999	0.15
1000	0.16
1001	0.25
1002	0.27
1003	0.28
1004	0.32
1005	0.37
1006	0.45
1007	0.5
1008	0.51
1009	0.43
1010	0.43
1011	0.44
1012	0.38
1013	0.33
1014	0.26
1015	0.2
1016	0.16
1017	0.14
1018	0.11
1019	0.08
1020	0.07
1021	0.07
1022	0.06
1023	0.06
1024	0.05
1025	0.05
1026	0.06
1027	0.06
1028	0.07
1029	0.07
1030	0.07
1031	0.07
1032	0.07
1033	0.06
1034	0.06
1035	0.06
1036	0.06
1037	0.06
1038	0.05
1039	0.05
1040	0.05
1041	0.05
1042	0.05
1043	0.05
1044	0.06
1045	0.06
1046	0.06
1047	0.06
1048	0.06
1049	0.06
1050	0.07
1051	0.07
1052	0.08
1053	0.09
1054	0.09
1055	0.1
1056	0.12
1057	0.13
1058	0.15
1059	0.19
1060	0.18
1061	0.19
1062	0.23
1063	0.29
1064	0.31
1065	0.33
1066	0.35
1067	0.36
1068	0.4
1069	0.39
1070	0.38
1071	0.32
1072	0.32
1073	0.32
1074	0.27
1075	0.22
1076	0.17
1077	0.18
1078	0.16
1079	0.16
1080	0.14
1081	0.11
1082	0.11
1083	0.1
1084	0.12
1085	0.11
1086	0.1
1087	0.08
1088	0.08
1089	0.09
1090	0.1
1091	0.12
1092	0.1
1093	0.11
1094	0.11
1095	0.11
1096	0.11
1097	0.11
1098	0.11
1099	0.09
1100	0.09
1101	0.1
1102	0.11
1103	0.11
1104	0.1
1105	0.11
1106	0.11
1107	0.14
1108	0.15
1109	0.15
1110	0.16
1111	0.18
1112	0.19
1113	0.18
1114	0.22
1115	0.25
1116	0.29
1117	0.38
1118	0.45
1119	0.52
1120	0.57
1121	0.58
1122	0.62
1123	0.65
1124	0.69
1125	0.7
1126	0.71
1127	0.67
1128	0.7
1129	0.78
1130	0.81
1131	0.81
1132	0.81
1133	0.76
1134	0.7
1135	0.72
1136	0.73
1137	0.73
1138	0.73
1139	0.75
1140	0.75
1141	0.81
1142	0.86

U1HGQ6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer