Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1HHW6

Protein Details
Accession U1HHW6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
67-95SFDPLRASRSRKKQLPPSRYQFRPPKYDRHydrophilic
1036-1069ASDEKVKGFLRRERKREKSKSRLNKAPNTSGKGKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1042-1072KGFLRRERKREKSKSRLNKAPNTSGKGKGEK
Subcellular Location(s) mito 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR001394  Peptidase_C19_UCH  
IPR002132  Ribosomal_L5  
IPR031309  Ribosomal_L5_C  
IPR022803  Ribosomal_L5_dom_sf  
IPR028889  USP_dom  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0004843  F:cysteine-type deubiquitinase activity  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0016579  P:protein deubiquitination  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00673  Ribosomal_L5_C  
PF00443  UCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50235  USP_3  
Amino Acid Sequences MVSTDKSCQLARALRRISRPAICTRCLNARRSVTMDVRSDSIQDPTDELEQSSGLGSSGPLGALSDSFDPLRASRSRKKQLPPSRYQFRPPKYDRGPLHPHQPPPASDPSSRIFVPGPFSSPRVEQTYHNMIAPDILTLCYQHNPPGYRPPLKAPRLRSWDDSSPYHANRQLRGPRGGDVLRLLRKPITFRNIPMIERITVHTFVKQVIKEGSAPLHVAGMVLQAITNVRVQTHKSRTGEAGWNLVPGKSMAATATLKGEDMYHFLGKLVNVVLPRIKDWRGVRATTGDGSGNLTFGLDPEVVGGFPEIEINYDSYPQKMIPGCNITLHTTANTDKDARLLLQTVGIPFCGKSTSATTIASEAPAKDYYGLFSAQEKPADAQEEQKVKTLRKRVMEARSFTFQDSQILYALHSTYASNDLDKALELLLAMSSACEGSIIKYEPGVKLLGAVNRKAVTCYLDSIIFAMFSRLDSFESMLYNTFEDDARNRLGLLLRLWVNLLRTGKLITTDIVQLLQESLAECGWEEAAQLHQQDASEAFTFITEKLELPLLTLKMDIYHTGREDLTDDHKFINERLLEVAVPSDPADPQQSVPLEDCLESYFNNRIEVKRYLERRSTSSPVPPYNSPEAMSAKGGALHVETVELGGDASARIPPSSTSSIQESPVRQRATSIIQQRFIPDGSGPSSPPAYEADVKHAGGRLRSGSIRKEVMMPAWQFFSLIPWYTKNTPKNDAQVAAHFSSKRPILGMCLKRYSFTDNGKAIRLSTKIDIPTEIGLPHFISDDSMDEGGPIYGNFKLSLQSVVCHRGTSVDSGHYIALVKGTTASLGAENGSTSNGVQDTNHWMRFDDLASERITLVDIHQALKDETPYLLFYQIVPIEIVPERLDDRESLPLYAPSETHDSGIGGMSVSSSNFQGSTDEMLAPLRPSLEITAPEECPRGRSPVQEERRQSVAFSRPADQGDLAIPDPESSQASSKRGSMQGKNGIQSRSQSQAGERFSISLSRLTRGKSKEAIPTLGNSVEADEIAGNGLEAPAASDEKVKGFLRRERKREKSKSRLNKAPNTSGKGKGEKPDRECCVM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.61
3 0.65
4 0.65
5 0.64
6 0.62
7 0.63
8 0.62
9 0.6
10 0.58
11 0.57
12 0.6
13 0.59
14 0.58
15 0.57
16 0.56
17 0.57
18 0.57
19 0.59
20 0.54
21 0.55
22 0.54
23 0.48
24 0.44
25 0.4
26 0.38
27 0.32
28 0.3
29 0.25
30 0.21
31 0.21
32 0.21
33 0.23
34 0.21
35 0.2
36 0.17
37 0.15
38 0.14
39 0.14
40 0.11
41 0.08
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.06
48 0.07
49 0.07
50 0.07
51 0.09
52 0.09
53 0.11
54 0.11
55 0.12
56 0.13
57 0.14
58 0.2
59 0.23
60 0.3
61 0.38
62 0.49
63 0.58
64 0.66
65 0.75
66 0.8
67 0.85
68 0.87
69 0.87
70 0.87
71 0.86
72 0.83
73 0.84
74 0.83
75 0.8
76 0.8
77 0.76
78 0.76
79 0.73
80 0.78
81 0.72
82 0.71
83 0.73
84 0.67
85 0.71
86 0.67
87 0.64
88 0.62
89 0.62
90 0.56
91 0.53
92 0.57
93 0.51
94 0.46
95 0.46
96 0.41
97 0.41
98 0.38
99 0.34
100 0.27
101 0.24
102 0.29
103 0.26
104 0.27
105 0.25
106 0.27
107 0.27
108 0.28
109 0.3
110 0.3
111 0.3
112 0.28
113 0.34
114 0.41
115 0.39
116 0.38
117 0.34
118 0.29
119 0.28
120 0.26
121 0.19
122 0.11
123 0.11
124 0.09
125 0.11
126 0.13
127 0.14
128 0.15
129 0.19
130 0.25
131 0.27
132 0.31
133 0.39
134 0.46
135 0.49
136 0.51
137 0.56
138 0.6
139 0.65
140 0.68
141 0.66
142 0.68
143 0.69
144 0.71
145 0.67
146 0.64
147 0.64
148 0.62
149 0.57
150 0.53
151 0.53
152 0.51
153 0.51
154 0.49
155 0.45
156 0.43
157 0.5
158 0.51
159 0.5
160 0.53
161 0.49
162 0.46
163 0.48
164 0.46
165 0.38
166 0.35
167 0.36
168 0.36
169 0.35
170 0.35
171 0.32
172 0.34
173 0.37
174 0.4
175 0.41
176 0.38
177 0.4
178 0.48
179 0.48
180 0.46
181 0.46
182 0.41
183 0.34
184 0.32
185 0.33
186 0.27
187 0.26
188 0.26
189 0.23
190 0.21
191 0.23
192 0.28
193 0.25
194 0.24
195 0.24
196 0.25
197 0.23
198 0.25
199 0.23
200 0.19
201 0.19
202 0.15
203 0.14
204 0.12
205 0.1
206 0.08
207 0.07
208 0.06
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.07
214 0.08
215 0.08
216 0.09
217 0.11
218 0.16
219 0.25
220 0.32
221 0.39
222 0.39
223 0.41
224 0.43
225 0.46
226 0.49
227 0.41
228 0.39
229 0.31
230 0.32
231 0.3
232 0.27
233 0.22
234 0.15
235 0.14
236 0.1
237 0.1
238 0.07
239 0.1
240 0.11
241 0.11
242 0.13
243 0.12
244 0.12
245 0.12
246 0.13
247 0.09
248 0.12
249 0.14
250 0.13
251 0.13
252 0.13
253 0.14
254 0.13
255 0.14
256 0.12
257 0.11
258 0.1
259 0.12
260 0.14
261 0.13
262 0.15
263 0.18
264 0.19
265 0.24
266 0.25
267 0.33
268 0.35
269 0.35
270 0.36
271 0.34
272 0.35
273 0.29
274 0.28
275 0.2
276 0.15
277 0.17
278 0.15
279 0.12
280 0.1
281 0.09
282 0.08
283 0.07
284 0.09
285 0.06
286 0.06
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.04
293 0.04
294 0.06
295 0.05
296 0.06
297 0.06
298 0.08
299 0.08
300 0.12
301 0.12
302 0.12
303 0.13
304 0.12
305 0.16
306 0.17
307 0.18
308 0.2
309 0.23
310 0.24
311 0.25
312 0.26
313 0.25
314 0.23
315 0.23
316 0.18
317 0.17
318 0.17
319 0.17
320 0.17
321 0.16
322 0.14
323 0.15
324 0.15
325 0.13
326 0.13
327 0.13
328 0.11
329 0.12
330 0.12
331 0.12
332 0.12
333 0.11
334 0.1
335 0.09
336 0.09
337 0.08
338 0.07
339 0.08
340 0.11
341 0.15
342 0.16
343 0.17
344 0.17
345 0.18
346 0.18
347 0.17
348 0.14
349 0.11
350 0.12
351 0.12
352 0.12
353 0.11
354 0.11
355 0.11
356 0.11
357 0.12
358 0.09
359 0.12
360 0.16
361 0.16
362 0.17
363 0.16
364 0.16
365 0.17
366 0.19
367 0.17
368 0.17
369 0.22
370 0.26
371 0.27
372 0.31
373 0.33
374 0.33
375 0.39
376 0.43
377 0.42
378 0.42
379 0.47
380 0.5
381 0.56
382 0.6
383 0.57
384 0.53
385 0.51
386 0.48
387 0.42
388 0.37
389 0.28
390 0.24
391 0.21
392 0.18
393 0.14
394 0.13
395 0.12
396 0.11
397 0.11
398 0.08
399 0.07
400 0.07
401 0.06
402 0.09
403 0.1
404 0.09
405 0.09
406 0.09
407 0.09
408 0.09
409 0.09
410 0.05
411 0.05
412 0.05
413 0.04
414 0.04
415 0.04
416 0.04
417 0.03
418 0.03
419 0.03
420 0.03
421 0.03
422 0.03
423 0.04
424 0.07
425 0.08
426 0.08
427 0.1
428 0.12
429 0.12
430 0.13
431 0.12
432 0.09
433 0.1
434 0.13
435 0.15
436 0.15
437 0.16
438 0.17
439 0.18
440 0.18
441 0.16
442 0.15
443 0.13
444 0.12
445 0.13
446 0.12
447 0.11
448 0.11
449 0.11
450 0.1
451 0.08
452 0.07
453 0.06
454 0.05
455 0.05
456 0.06
457 0.06
458 0.07
459 0.07
460 0.08
461 0.08
462 0.08
463 0.09
464 0.08
465 0.08
466 0.08
467 0.08
468 0.08
469 0.07
470 0.07
471 0.08
472 0.1
473 0.1
474 0.1
475 0.1
476 0.1
477 0.11
478 0.12
479 0.11
480 0.12
481 0.12
482 0.12
483 0.12
484 0.12
485 0.11
486 0.14
487 0.14
488 0.11
489 0.11
490 0.11
491 0.11
492 0.12
493 0.11
494 0.08
495 0.09
496 0.09
497 0.08
498 0.08
499 0.08
500 0.07
501 0.06
502 0.06
503 0.05
504 0.04
505 0.04
506 0.04
507 0.04
508 0.04
509 0.04
510 0.04
511 0.04
512 0.04
513 0.03
514 0.05
515 0.06
516 0.07
517 0.06
518 0.07
519 0.07
520 0.07
521 0.07
522 0.08
523 0.07
524 0.07
525 0.07
526 0.07
527 0.07
528 0.07
529 0.08
530 0.06
531 0.06
532 0.06
533 0.08
534 0.07
535 0.08
536 0.1
537 0.09
538 0.09
539 0.09
540 0.08
541 0.08
542 0.08
543 0.09
544 0.08
545 0.1
546 0.1
547 0.11
548 0.11
549 0.11
550 0.11
551 0.12
552 0.15
553 0.14
554 0.15
555 0.14
556 0.15
557 0.15
558 0.14
559 0.18
560 0.13
561 0.13
562 0.12
563 0.13
564 0.11
565 0.11
566 0.11
567 0.06
568 0.06
569 0.06
570 0.06
571 0.05
572 0.06
573 0.08
574 0.08
575 0.08
576 0.11
577 0.11
578 0.12
579 0.13
580 0.13
581 0.12
582 0.11
583 0.11
584 0.09
585 0.09
586 0.08
587 0.1
588 0.13
589 0.13
590 0.16
591 0.17
592 0.17
593 0.21
594 0.24
595 0.26
596 0.29
597 0.33
598 0.35
599 0.4
600 0.41
601 0.41
602 0.44
603 0.43
604 0.39
605 0.4
606 0.41
607 0.38
608 0.4
609 0.36
610 0.35
611 0.35
612 0.33
613 0.28
614 0.25
615 0.24
616 0.21
617 0.2
618 0.16
619 0.12
620 0.12
621 0.11
622 0.09
623 0.07
624 0.06
625 0.06
626 0.05
627 0.05
628 0.04
629 0.04
630 0.03
631 0.03
632 0.03
633 0.03
634 0.03
635 0.03
636 0.04
637 0.05
638 0.05
639 0.05
640 0.06
641 0.11
642 0.15
643 0.16
644 0.16
645 0.21
646 0.22
647 0.24
648 0.27
649 0.25
650 0.28
651 0.33
652 0.32
653 0.28
654 0.28
655 0.28
656 0.3
657 0.34
658 0.36
659 0.33
660 0.34
661 0.35
662 0.35
663 0.34
664 0.29
665 0.23
666 0.14
667 0.13
668 0.13
669 0.14
670 0.13
671 0.12
672 0.13
673 0.12
674 0.12
675 0.12
676 0.13
677 0.16
678 0.16
679 0.21
680 0.23
681 0.23
682 0.23
683 0.24
684 0.22
685 0.19
686 0.2
687 0.15
688 0.16
689 0.19
690 0.21
691 0.21
692 0.24
693 0.25
694 0.24
695 0.25
696 0.24
697 0.22
698 0.25
699 0.23
700 0.2
701 0.2
702 0.19
703 0.16
704 0.15
705 0.16
706 0.12
707 0.12
708 0.13
709 0.13
710 0.18
711 0.22
712 0.3
713 0.34
714 0.36
715 0.4
716 0.42
717 0.46
718 0.45
719 0.43
720 0.37
721 0.35
722 0.35
723 0.31
724 0.3
725 0.25
726 0.22
727 0.24
728 0.23
729 0.2
730 0.16
731 0.15
732 0.18
733 0.27
734 0.33
735 0.33
736 0.38
737 0.38
738 0.38
739 0.4
740 0.39
741 0.36
742 0.34
743 0.37
744 0.36
745 0.37
746 0.39
747 0.37
748 0.33
749 0.3
750 0.27
751 0.22
752 0.2
753 0.22
754 0.22
755 0.22
756 0.22
757 0.2
758 0.2
759 0.18
760 0.16
761 0.12
762 0.11
763 0.1
764 0.1
765 0.09
766 0.08
767 0.07
768 0.07
769 0.08
770 0.09
771 0.09
772 0.09
773 0.08
774 0.09
775 0.08
776 0.08
777 0.06
778 0.06
779 0.06
780 0.07
781 0.08
782 0.08
783 0.09
784 0.1
785 0.13
786 0.12
787 0.13
788 0.16
789 0.21
790 0.21
791 0.2
792 0.19
793 0.18
794 0.19
795 0.2
796 0.19
797 0.15
798 0.16
799 0.17
800 0.17
801 0.14
802 0.14
803 0.11
804 0.1
805 0.08
806 0.07
807 0.07
808 0.07
809 0.06
810 0.06
811 0.07
812 0.06
813 0.06
814 0.07
815 0.06
816 0.06
817 0.06
818 0.07
819 0.06
820 0.06
821 0.07
822 0.07
823 0.08
824 0.08
825 0.1
826 0.18
827 0.24
828 0.26
829 0.25
830 0.25
831 0.26
832 0.27
833 0.26
834 0.22
835 0.18
836 0.18
837 0.19
838 0.19
839 0.17
840 0.16
841 0.16
842 0.11
843 0.1
844 0.14
845 0.13
846 0.14
847 0.15
848 0.16
849 0.17
850 0.17
851 0.17
852 0.13
853 0.12
854 0.12
855 0.13
856 0.12
857 0.13
858 0.12
859 0.11
860 0.15
861 0.15
862 0.14
863 0.13
864 0.12
865 0.14
866 0.14
867 0.15
868 0.11
869 0.12
870 0.13
871 0.13
872 0.15
873 0.13
874 0.15
875 0.21
876 0.21
877 0.21
878 0.21
879 0.22
880 0.22
881 0.22
882 0.2
883 0.16
884 0.2
885 0.2
886 0.19
887 0.17
888 0.16
889 0.16
890 0.16
891 0.13
892 0.07
893 0.06
894 0.06
895 0.06
896 0.07
897 0.07
898 0.07
899 0.08
900 0.08
901 0.08
902 0.08
903 0.09
904 0.13
905 0.13
906 0.13
907 0.13
908 0.14
909 0.14
910 0.14
911 0.13
912 0.1
913 0.08
914 0.1
915 0.12
916 0.14
917 0.15
918 0.18
919 0.21
920 0.22
921 0.24
922 0.26
923 0.24
924 0.25
925 0.25
926 0.29
927 0.27
928 0.32
929 0.39
930 0.47
931 0.55
932 0.6
933 0.63
934 0.6
935 0.63
936 0.57
937 0.5
938 0.46
939 0.46
940 0.43
941 0.41
942 0.4
943 0.38
944 0.39
945 0.4
946 0.33
947 0.26
948 0.22
949 0.21
950 0.18
951 0.15
952 0.14
953 0.12
954 0.13
955 0.13
956 0.13
957 0.12
958 0.17
959 0.21
960 0.24
961 0.25
962 0.27
963 0.32
964 0.37
965 0.43
966 0.44
967 0.48
968 0.55
969 0.57
970 0.61
971 0.6
972 0.55
973 0.5
974 0.48
975 0.43
976 0.39
977 0.37
978 0.33
979 0.33
980 0.38
981 0.38
982 0.38
983 0.34
984 0.29
985 0.28
986 0.3
987 0.26
988 0.25
989 0.24
990 0.25
991 0.28
992 0.3
993 0.37
994 0.38
995 0.44
996 0.43
997 0.46
998 0.51
999 0.53
1000 0.53
1001 0.47
1002 0.46
1003 0.42
1004 0.37
1005 0.33
1006 0.23
1007 0.2
1008 0.16
1009 0.14
1010 0.12
1011 0.08
1012 0.08
1013 0.08
1014 0.07
1015 0.06
1016 0.05
1017 0.05
1018 0.05
1019 0.04
1020 0.05
1021 0.07
1022 0.08
1023 0.09
1024 0.12
1025 0.13
1026 0.15
1027 0.21
1028 0.22
1029 0.26
1030 0.33
1031 0.42
1032 0.5
1033 0.59
1034 0.68
1035 0.73
1036 0.82
1037 0.87
1038 0.9
1039 0.93
1040 0.93
1041 0.94
1042 0.95
1043 0.94
1044 0.93
1045 0.92
1046 0.91
1047 0.88
1048 0.88
1049 0.85
1050 0.82
1051 0.77
1052 0.75
1053 0.72
1054 0.7
1055 0.66
1056 0.65
1057 0.66
1058 0.68
1059 0.7
1060 0.71