Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1HHT6

Protein Details
Accession U1HHT6    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
72-98HDSYKLRWVLRKARRPHSKENTSTENAHydrophilic
613-632YDKPYRKKVLTRRRRLQAIEHydrophilic
730-754TEGRRRTPPRSQRASPERRPKRSASBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
731-753EGRRRTPPRSQRASPERRPKRSA
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007275  YTH_domain  
IPR045168  YTH_prot  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04146  YTH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50882  YTH  
CDD cd21134  YTH  
Amino Acid Sequences MYGHNSIVEGDITDESEDEITRRHPDLLGAIAYARKAKNGSTNHDEIYLENGLVWEAICLKVGVYEFSAKNHDSYKLRWVLRKARRPHSKENTSTENANKPSSSRFTFSIINPNTRIHPVIATLTADNKLDILNRFLTAGSPAIRSALSSNSQSPVHSDFSSETSYFDRPANREALYTETDEALQILIILTGIWVISKQGWSEGLSKSPDLIDKSRPESGDRSPSSVVSSTETIFKGSSQHGVAPFRYQRSSTSPSPRRAGKQPALSDRANSMGALGVGTPTASMPPTVNGGVLLPSAHHSYQPNGKRCKPTLGMDTHGQTPGFVSGGLGDATDAQKTLSSMEINATLQDGAKALPLVVDENVLGCGSEETEAPYQAYQDGEKDEEKDGLKKRPNKLMEMIRASADLQPQSTAPSSHLGVLESKARATFTNDPLANLKMRAKESVMAKRTRSIRSASNDSKAELAGVVEPDLTHNGEFSNTVRPEELGSKSRGPTVTNRAPSLPPSGSLLISPRVSAKATSAELEDLLAEGRAAASLSKTTIAENLFTTEQHGLNGQQHQPREPETSGVRESRENSVRHDETATNLQATLKPDHFPPYQMDEINAWLAMTGYYDKPYRKKVLTRRRRLQAIEEERLKLLEEEKEDQRLRGPFSSITSFHAPQRSTSPVATMSPSMLTVKQDVGLRIKDSALKKTTAQELTTSNDETPVKRRIEEDTKDSEVLHQSKVARTEGRRRTPPRSQRASPERRPKRSASPEVTKNHSATSPRKQSPHSKDEYDRWLPDREVNLRGLKDRALEENGWRNELRGRHDQRRDSGFGTSHASKPDLQDGRVRFFLLKSWNYENIATAQREGTWATQTKNEDTFVEAFKTCRHVIFFFSANHSKAFQGYARMQGLPGEKGVPQPSWVKNLHWPTTAPFRIKWIVKEETPYRAVGNLKNPLNENLAVFVGRDGQEIPEKIGLQMSEIIDDDTAYRAEFRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.11
4 0.11
5 0.09
6 0.11
7 0.13
8 0.18
9 0.2
10 0.21
11 0.2
12 0.22
13 0.24
14 0.26
15 0.24
16 0.2
17 0.2
18 0.19
19 0.2
20 0.24
21 0.21
22 0.2
23 0.21
24 0.24
25 0.31
26 0.37
27 0.44
28 0.46
29 0.5
30 0.48
31 0.49
32 0.45
33 0.37
34 0.35
35 0.28
36 0.2
37 0.16
38 0.15
39 0.12
40 0.12
41 0.11
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.08
46 0.08
47 0.08
48 0.1
49 0.11
50 0.12
51 0.13
52 0.19
53 0.19
54 0.22
55 0.27
56 0.25
57 0.27
58 0.29
59 0.33
60 0.3
61 0.32
62 0.39
63 0.43
64 0.47
65 0.52
66 0.58
67 0.62
68 0.69
69 0.75
70 0.75
71 0.77
72 0.83
73 0.84
74 0.87
75 0.87
76 0.87
77 0.85
78 0.83
79 0.81
80 0.73
81 0.71
82 0.66
83 0.63
84 0.56
85 0.51
86 0.44
87 0.37
88 0.4
89 0.42
90 0.4
91 0.35
92 0.34
93 0.35
94 0.39
95 0.4
96 0.44
97 0.41
98 0.43
99 0.42
100 0.42
101 0.41
102 0.39
103 0.38
104 0.29
105 0.26
106 0.22
107 0.22
108 0.22
109 0.2
110 0.18
111 0.19
112 0.19
113 0.18
114 0.16
115 0.14
116 0.13
117 0.15
118 0.16
119 0.17
120 0.17
121 0.17
122 0.17
123 0.17
124 0.17
125 0.15
126 0.16
127 0.14
128 0.14
129 0.13
130 0.14
131 0.14
132 0.14
133 0.14
134 0.15
135 0.17
136 0.19
137 0.21
138 0.23
139 0.24
140 0.23
141 0.25
142 0.25
143 0.25
144 0.22
145 0.22
146 0.2
147 0.23
148 0.27
149 0.23
150 0.21
151 0.2
152 0.21
153 0.21
154 0.23
155 0.25
156 0.24
157 0.28
158 0.3
159 0.27
160 0.27
161 0.27
162 0.28
163 0.25
164 0.24
165 0.21
166 0.18
167 0.17
168 0.16
169 0.15
170 0.11
171 0.08
172 0.06
173 0.05
174 0.04
175 0.04
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.04
183 0.06
184 0.07
185 0.07
186 0.09
187 0.11
188 0.13
189 0.17
190 0.18
191 0.21
192 0.22
193 0.22
194 0.21
195 0.21
196 0.22
197 0.23
198 0.25
199 0.27
200 0.3
201 0.34
202 0.38
203 0.37
204 0.37
205 0.37
206 0.4
207 0.43
208 0.39
209 0.39
210 0.36
211 0.35
212 0.35
213 0.32
214 0.27
215 0.21
216 0.21
217 0.17
218 0.2
219 0.2
220 0.18
221 0.16
222 0.15
223 0.15
224 0.15
225 0.18
226 0.15
227 0.18
228 0.22
229 0.24
230 0.25
231 0.29
232 0.32
233 0.32
234 0.33
235 0.3
236 0.3
237 0.34
238 0.4
239 0.4
240 0.47
241 0.51
242 0.55
243 0.6
244 0.62
245 0.6
246 0.62
247 0.64
248 0.6
249 0.61
250 0.62
251 0.63
252 0.63
253 0.58
254 0.52
255 0.43
256 0.38
257 0.3
258 0.23
259 0.16
260 0.11
261 0.1
262 0.09
263 0.07
264 0.05
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.03
269 0.04
270 0.04
271 0.05
272 0.05
273 0.07
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.08
281 0.07
282 0.05
283 0.07
284 0.1
285 0.1
286 0.12
287 0.13
288 0.16
289 0.25
290 0.33
291 0.4
292 0.44
293 0.51
294 0.56
295 0.57
296 0.61
297 0.57
298 0.54
299 0.53
300 0.5
301 0.47
302 0.43
303 0.42
304 0.37
305 0.34
306 0.28
307 0.2
308 0.17
309 0.14
310 0.11
311 0.08
312 0.06
313 0.05
314 0.06
315 0.06
316 0.05
317 0.05
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.05
323 0.06
324 0.06
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.08
329 0.09
330 0.1
331 0.1
332 0.1
333 0.09
334 0.08
335 0.08
336 0.07
337 0.07
338 0.05
339 0.06
340 0.06
341 0.05
342 0.05
343 0.05
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.05
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.05
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.05
356 0.05
357 0.07
358 0.08
359 0.09
360 0.09
361 0.09
362 0.09
363 0.09
364 0.1
365 0.07
366 0.08
367 0.09
368 0.11
369 0.11
370 0.13
371 0.13
372 0.15
373 0.16
374 0.21
375 0.24
376 0.3
377 0.37
378 0.42
379 0.47
380 0.53
381 0.55
382 0.52
383 0.55
384 0.55
385 0.54
386 0.51
387 0.47
388 0.38
389 0.36
390 0.33
391 0.27
392 0.22
393 0.15
394 0.11
395 0.11
396 0.1
397 0.12
398 0.11
399 0.1
400 0.09
401 0.11
402 0.11
403 0.12
404 0.13
405 0.11
406 0.11
407 0.12
408 0.14
409 0.12
410 0.12
411 0.11
412 0.11
413 0.11
414 0.16
415 0.2
416 0.2
417 0.27
418 0.27
419 0.27
420 0.28
421 0.29
422 0.25
423 0.21
424 0.21
425 0.17
426 0.18
427 0.18
428 0.18
429 0.2
430 0.25
431 0.32
432 0.34
433 0.34
434 0.34
435 0.38
436 0.42
437 0.41
438 0.38
439 0.32
440 0.33
441 0.36
442 0.43
443 0.41
444 0.41
445 0.39
446 0.37
447 0.34
448 0.28
449 0.22
450 0.13
451 0.11
452 0.06
453 0.06
454 0.05
455 0.04
456 0.04
457 0.05
458 0.06
459 0.06
460 0.05
461 0.05
462 0.05
463 0.05
464 0.06
465 0.07
466 0.14
467 0.13
468 0.14
469 0.14
470 0.14
471 0.15
472 0.18
473 0.2
474 0.15
475 0.18
476 0.2
477 0.2
478 0.22
479 0.21
480 0.2
481 0.22
482 0.27
483 0.31
484 0.31
485 0.32
486 0.31
487 0.31
488 0.31
489 0.31
490 0.22
491 0.16
492 0.16
493 0.16
494 0.15
495 0.14
496 0.14
497 0.12
498 0.12
499 0.12
500 0.1
501 0.11
502 0.11
503 0.11
504 0.1
505 0.11
506 0.11
507 0.12
508 0.11
509 0.1
510 0.1
511 0.1
512 0.08
513 0.05
514 0.05
515 0.04
516 0.03
517 0.03
518 0.03
519 0.03
520 0.03
521 0.03
522 0.03
523 0.04
524 0.04
525 0.05
526 0.06
527 0.06
528 0.09
529 0.09
530 0.1
531 0.1
532 0.12
533 0.11
534 0.11
535 0.12
536 0.12
537 0.11
538 0.11
539 0.11
540 0.1
541 0.13
542 0.17
543 0.2
544 0.21
545 0.22
546 0.24
547 0.24
548 0.26
549 0.28
550 0.24
551 0.22
552 0.21
553 0.24
554 0.25
555 0.25
556 0.24
557 0.21
558 0.23
559 0.26
560 0.31
561 0.28
562 0.29
563 0.36
564 0.35
565 0.34
566 0.34
567 0.27
568 0.24
569 0.28
570 0.24
571 0.17
572 0.16
573 0.16
574 0.16
575 0.19
576 0.19
577 0.16
578 0.16
579 0.17
580 0.22
581 0.22
582 0.21
583 0.21
584 0.24
585 0.25
586 0.24
587 0.24
588 0.2
589 0.2
590 0.19
591 0.15
592 0.09
593 0.07
594 0.06
595 0.05
596 0.05
597 0.06
598 0.06
599 0.09
600 0.12
601 0.15
602 0.2
603 0.26
604 0.31
605 0.34
606 0.42
607 0.51
608 0.59
609 0.67
610 0.74
611 0.77
612 0.79
613 0.81
614 0.74
615 0.71
616 0.7
617 0.67
618 0.64
619 0.57
620 0.51
621 0.44
622 0.42
623 0.35
624 0.25
625 0.19
626 0.15
627 0.15
628 0.18
629 0.2
630 0.27
631 0.27
632 0.27
633 0.29
634 0.29
635 0.29
636 0.26
637 0.27
638 0.2
639 0.23
640 0.27
641 0.23
642 0.24
643 0.26
644 0.26
645 0.27
646 0.31
647 0.28
648 0.26
649 0.3
650 0.3
651 0.27
652 0.26
653 0.24
654 0.21
655 0.22
656 0.21
657 0.17
658 0.14
659 0.12
660 0.12
661 0.12
662 0.11
663 0.11
664 0.11
665 0.11
666 0.13
667 0.15
668 0.16
669 0.19
670 0.2
671 0.2
672 0.19
673 0.2
674 0.23
675 0.23
676 0.28
677 0.27
678 0.27
679 0.28
680 0.31
681 0.37
682 0.34
683 0.32
684 0.28
685 0.27
686 0.29
687 0.3
688 0.27
689 0.2
690 0.22
691 0.22
692 0.22
693 0.25
694 0.28
695 0.27
696 0.27
697 0.29
698 0.32
699 0.4
700 0.42
701 0.43
702 0.42
703 0.43
704 0.43
705 0.41
706 0.36
707 0.34
708 0.32
709 0.27
710 0.24
711 0.23
712 0.26
713 0.29
714 0.29
715 0.28
716 0.31
717 0.41
718 0.47
719 0.54
720 0.61
721 0.64
722 0.69
723 0.74
724 0.79
725 0.79
726 0.78
727 0.74
728 0.75
729 0.8
730 0.81
731 0.81
732 0.82
733 0.82
734 0.81
735 0.82
736 0.77
737 0.77
738 0.77
739 0.77
740 0.74
741 0.73
742 0.73
743 0.72
744 0.74
745 0.67
746 0.57
747 0.49
748 0.44
749 0.41
750 0.4
751 0.46
752 0.49
753 0.5
754 0.54
755 0.58
756 0.65
757 0.68
758 0.7
759 0.66
760 0.62
761 0.63
762 0.65
763 0.68
764 0.63
765 0.58
766 0.52
767 0.5
768 0.44
769 0.44
770 0.43
771 0.38
772 0.36
773 0.36
774 0.38
775 0.36
776 0.37
777 0.34
778 0.29
779 0.28
780 0.27
781 0.26
782 0.26
783 0.26
784 0.29
785 0.37
786 0.37
787 0.37
788 0.35
789 0.32
790 0.33
791 0.35
792 0.36
793 0.37
794 0.44
795 0.51
796 0.6
797 0.65
798 0.67
799 0.7
800 0.67
801 0.58
802 0.54
803 0.46
804 0.39
805 0.39
806 0.36
807 0.31
808 0.3
809 0.3
810 0.27
811 0.28
812 0.35
813 0.32
814 0.3
815 0.35
816 0.36
817 0.4
818 0.39
819 0.38
820 0.29
821 0.26
822 0.3
823 0.31
824 0.31
825 0.31
826 0.36
827 0.38
828 0.4
829 0.4
830 0.36
831 0.32
832 0.35
833 0.3
834 0.26
835 0.23
836 0.2
837 0.21
838 0.21
839 0.19
840 0.19
841 0.22
842 0.22
843 0.27
844 0.31
845 0.34
846 0.35
847 0.34
848 0.28
849 0.29
850 0.3
851 0.26
852 0.27
853 0.23
854 0.21
855 0.23
856 0.27
857 0.25
858 0.24
859 0.26
860 0.23
861 0.27
862 0.3
863 0.32
864 0.29
865 0.35
866 0.38
867 0.36
868 0.36
869 0.33
870 0.3
871 0.27
872 0.27
873 0.22
874 0.23
875 0.25
876 0.31
877 0.32
878 0.32
879 0.31
880 0.32
881 0.33
882 0.27
883 0.25
884 0.2
885 0.18
886 0.23
887 0.26
888 0.22
889 0.23
890 0.29
891 0.31
892 0.36
893 0.37
894 0.36
895 0.42
896 0.5
897 0.52
898 0.47
899 0.45
900 0.42
901 0.51
902 0.53
903 0.48
904 0.4
905 0.42
906 0.47
907 0.49
908 0.5
909 0.46
910 0.47
911 0.46
912 0.53
913 0.51
914 0.5
915 0.48
916 0.44
917 0.38
918 0.36
919 0.38
920 0.35
921 0.4
922 0.41
923 0.43
924 0.45
925 0.47
926 0.46
927 0.46
928 0.41
929 0.34
930 0.27
931 0.25
932 0.21
933 0.19
934 0.16
935 0.16
936 0.15
937 0.16
938 0.14
939 0.16
940 0.23
941 0.23
942 0.26
943 0.25
944 0.25
945 0.25
946 0.27
947 0.24
948 0.19
949 0.23
950 0.21
951 0.18
952 0.18
953 0.18
954 0.15
955 0.15
956 0.14
957 0.11
958 0.11
959 0.09