Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1GH71

Protein Details
Accession U1GH71    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
624-648TGQAGKLKKNKDEGEKKKKKHHFFKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
628-648GKLKKNKDEGEKKKKKHHFFK
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto 10, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043154  Sec-1-like_dom1  
IPR043127  Sec-1-like_dom3a  
IPR001619  Sec1-like  
IPR027482  Sec1-like_dom2  
IPR036045  Sec1-like_sf  
Gene Ontology GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF00995  Sec1  
Amino Acid Sequences MDAVYVLTPQPHIVDCLLADMEKRRYRRLFLVWTSELDHNLRKRIECLPTAREQIADYKTLYVDYYPREAQLVTFRDPSSFFVLFHPDCSNLVRGHLEALAQKVVSICVSLGEYPAVRYYRPRAPTHEAGVLCSHLARFIQEALDSHARLHPDFPPPTSTPKPRAILLITDRTMDLLSPLVHEFTYQAMALDLLDIKDGDKLTYLNTVNQGRPNEETKEVEIGEADKIWTANRHMHMKDLLGKIVDDFKKFREAHPQFAENDGASTSVNTIKDMLAGLPKFSEKKEAFSLHLDMAEKCMKIFQENKLLDLGSVEQSLATGLDEDYKKPKNLADQIVRLMDDESVPQEARLRLLILYILYRGGLLNGDIQKLHAHAQLQPQDRDIIDNLDLLGARVRKPLKDMSSRPDPIFPTKPPAGPLEEEVSLSRYEPALRSMLEEQIQGTLDPLIFPPTKPHLEGNGIGIDMAAQQTSLRTANKPTWARTRPVANEQRQRLLVFMAGGATYAEARACYQVSQNASKDVFLITSHMLTPKLFLHQLRGLNLDKRRLDIPAERPPPKAPAHLFERQQAPGLPQQQKPKQAWQPHPNTMPPTAAMHNMSLNSKPENGARPIGSFSPSLPSSPATGQAGKLKKNKDEGEKKKKKHHFFK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.13
3 0.16
4 0.16
5 0.14
6 0.15
7 0.19
8 0.28
9 0.33
10 0.37
11 0.43
12 0.47
13 0.52
14 0.58
15 0.61
16 0.61
17 0.62
18 0.67
19 0.6
20 0.57
21 0.56
22 0.5
23 0.44
24 0.38
25 0.39
26 0.34
27 0.39
28 0.41
29 0.38
30 0.4
31 0.44
32 0.48
33 0.47
34 0.49
35 0.48
36 0.51
37 0.54
38 0.51
39 0.45
40 0.39
41 0.4
42 0.36
43 0.33
44 0.27
45 0.24
46 0.23
47 0.23
48 0.22
49 0.17
50 0.18
51 0.19
52 0.24
53 0.23
54 0.23
55 0.24
56 0.23
57 0.23
58 0.28
59 0.29
60 0.27
61 0.3
62 0.3
63 0.3
64 0.32
65 0.33
66 0.31
67 0.27
68 0.24
69 0.22
70 0.3
71 0.29
72 0.3
73 0.29
74 0.23
75 0.24
76 0.25
77 0.27
78 0.19
79 0.21
80 0.2
81 0.19
82 0.19
83 0.18
84 0.17
85 0.16
86 0.18
87 0.17
88 0.15
89 0.15
90 0.14
91 0.14
92 0.12
93 0.1
94 0.08
95 0.07
96 0.09
97 0.08
98 0.09
99 0.1
100 0.1
101 0.1
102 0.15
103 0.15
104 0.14
105 0.19
106 0.24
107 0.31
108 0.37
109 0.4
110 0.43
111 0.5
112 0.55
113 0.55
114 0.55
115 0.47
116 0.43
117 0.4
118 0.33
119 0.25
120 0.2
121 0.16
122 0.1
123 0.1
124 0.09
125 0.09
126 0.1
127 0.1
128 0.11
129 0.12
130 0.17
131 0.2
132 0.2
133 0.2
134 0.21
135 0.22
136 0.21
137 0.23
138 0.21
139 0.25
140 0.27
141 0.27
142 0.31
143 0.31
144 0.39
145 0.44
146 0.47
147 0.45
148 0.51
149 0.51
150 0.46
151 0.48
152 0.42
153 0.41
154 0.4
155 0.4
156 0.33
157 0.32
158 0.31
159 0.27
160 0.26
161 0.19
162 0.14
163 0.08
164 0.08
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.08
172 0.1
173 0.08
174 0.08
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.06
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.08
185 0.08
186 0.07
187 0.08
188 0.08
189 0.09
190 0.15
191 0.16
192 0.15
193 0.21
194 0.24
195 0.26
196 0.3
197 0.31
198 0.27
199 0.29
200 0.31
201 0.28
202 0.28
203 0.27
204 0.24
205 0.25
206 0.23
207 0.2
208 0.17
209 0.15
210 0.12
211 0.1
212 0.09
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.09
217 0.1
218 0.16
219 0.19
220 0.25
221 0.25
222 0.28
223 0.29
224 0.29
225 0.34
226 0.29
227 0.27
228 0.21
229 0.2
230 0.18
231 0.25
232 0.25
233 0.19
234 0.19
235 0.2
236 0.28
237 0.29
238 0.29
239 0.33
240 0.34
241 0.4
242 0.43
243 0.45
244 0.36
245 0.38
246 0.37
247 0.26
248 0.23
249 0.15
250 0.11
251 0.08
252 0.07
253 0.07
254 0.09
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.09
262 0.1
263 0.1
264 0.1
265 0.1
266 0.11
267 0.12
268 0.12
269 0.2
270 0.17
271 0.2
272 0.25
273 0.26
274 0.27
275 0.29
276 0.3
277 0.22
278 0.23
279 0.21
280 0.15
281 0.17
282 0.17
283 0.15
284 0.12
285 0.13
286 0.12
287 0.14
288 0.18
289 0.18
290 0.26
291 0.26
292 0.27
293 0.26
294 0.26
295 0.22
296 0.19
297 0.17
298 0.08
299 0.08
300 0.07
301 0.06
302 0.05
303 0.06
304 0.05
305 0.04
306 0.03
307 0.03
308 0.07
309 0.08
310 0.09
311 0.14
312 0.16
313 0.17
314 0.17
315 0.19
316 0.21
317 0.27
318 0.33
319 0.33
320 0.33
321 0.35
322 0.35
323 0.33
324 0.27
325 0.21
326 0.14
327 0.1
328 0.08
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.09
334 0.09
335 0.1
336 0.1
337 0.1
338 0.08
339 0.09
340 0.09
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.04
350 0.04
351 0.08
352 0.09
353 0.1
354 0.09
355 0.1
356 0.1
357 0.11
358 0.13
359 0.11
360 0.11
361 0.13
362 0.2
363 0.27
364 0.31
365 0.31
366 0.29
367 0.29
368 0.28
369 0.26
370 0.2
371 0.15
372 0.11
373 0.11
374 0.1
375 0.09
376 0.09
377 0.08
378 0.1
379 0.09
380 0.09
381 0.14
382 0.15
383 0.15
384 0.19
385 0.25
386 0.28
387 0.36
388 0.39
389 0.41
390 0.49
391 0.51
392 0.49
393 0.47
394 0.43
395 0.41
396 0.42
397 0.37
398 0.34
399 0.34
400 0.34
401 0.32
402 0.32
403 0.28
404 0.25
405 0.25
406 0.21
407 0.19
408 0.19
409 0.17
410 0.16
411 0.14
412 0.13
413 0.11
414 0.09
415 0.09
416 0.09
417 0.11
418 0.12
419 0.12
420 0.14
421 0.15
422 0.17
423 0.17
424 0.17
425 0.15
426 0.14
427 0.14
428 0.11
429 0.1
430 0.08
431 0.07
432 0.07
433 0.07
434 0.11
435 0.11
436 0.11
437 0.15
438 0.2
439 0.22
440 0.24
441 0.26
442 0.25
443 0.28
444 0.29
445 0.27
446 0.22
447 0.2
448 0.18
449 0.15
450 0.12
451 0.08
452 0.08
453 0.05
454 0.04
455 0.04
456 0.04
457 0.07
458 0.09
459 0.11
460 0.12
461 0.17
462 0.21
463 0.3
464 0.34
465 0.37
466 0.45
467 0.47
468 0.49
469 0.5
470 0.54
471 0.5
472 0.57
473 0.61
474 0.6
475 0.65
476 0.65
477 0.66
478 0.6
479 0.55
480 0.45
481 0.36
482 0.28
483 0.19
484 0.15
485 0.1
486 0.08
487 0.08
488 0.07
489 0.06
490 0.05
491 0.05
492 0.05
493 0.05
494 0.06
495 0.08
496 0.08
497 0.09
498 0.11
499 0.16
500 0.2
501 0.26
502 0.26
503 0.3
504 0.3
505 0.29
506 0.27
507 0.23
508 0.19
509 0.13
510 0.15
511 0.11
512 0.12
513 0.13
514 0.14
515 0.14
516 0.13
517 0.15
518 0.14
519 0.17
520 0.2
521 0.19
522 0.24
523 0.29
524 0.33
525 0.33
526 0.36
527 0.36
528 0.39
529 0.43
530 0.45
531 0.4
532 0.39
533 0.38
534 0.36
535 0.37
536 0.38
537 0.41
538 0.44
539 0.52
540 0.52
541 0.53
542 0.54
543 0.55
544 0.5
545 0.5
546 0.43
547 0.41
548 0.45
549 0.5
550 0.51
551 0.5
552 0.52
553 0.45
554 0.44
555 0.38
556 0.35
557 0.35
558 0.41
559 0.42
560 0.43
561 0.52
562 0.56
563 0.63
564 0.64
565 0.67
566 0.67
567 0.71
568 0.76
569 0.76
570 0.78
571 0.79
572 0.79
573 0.75
574 0.69
575 0.62
576 0.53
577 0.44
578 0.39
579 0.32
580 0.31
581 0.27
582 0.24
583 0.24
584 0.25
585 0.25
586 0.24
587 0.25
588 0.24
589 0.24
590 0.24
591 0.27
592 0.31
593 0.33
594 0.35
595 0.34
596 0.33
597 0.35
598 0.35
599 0.32
600 0.26
601 0.23
602 0.25
603 0.24
604 0.23
605 0.21
606 0.21
607 0.22
608 0.23
609 0.27
610 0.24
611 0.25
612 0.27
613 0.34
614 0.4
615 0.44
616 0.5
617 0.53
618 0.55
619 0.63
620 0.67
621 0.7
622 0.74
623 0.77
624 0.81
625 0.85
626 0.87
627 0.88
628 0.91