Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

U1HT24

Protein Details
Accession U1HT24    Localization Confidence High Confidence Score 16.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
208-229GSTRVGKRKRDAPRQVNKLPPQHydrophilic
639-665KPNTLPKLTKAQRRDRAAKDRASRLKTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
213-232GKRKRDAPRQVNKLPPQARK
648-661KAQRRDRAAKDRAS
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11, cyto 5.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043519  NT_sf  
IPR002058  PAP_assoc  
IPR002934  Polymerase_NTP_transf_dom  
IPR045862  Trf4-like  
Gene Ontology GO:0031499  C:TRAMP complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:1990817  F:poly(A) RNA polymerase activity  
GO:0031123  P:RNA 3'-end processing  
GO:0043631  P:RNA polyadenylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF01909  NTP_transf_2  
PF03828  PAP_assoc  
CDD cd05402  NT_PAP_TUTase  
Amino Acid Sequences MASNPGTDRYRPRYGDDEGPPAAPADVRKVMYEFQGNRGQGHGRATTGGEFTFRQGPRPRISDRPLLTERQALSPDPIFNGGDTIEKFRQIDNLTDSENEEMDVSQSDDDGPQRPSKRLRSGPSWSNPDPYTALPPVTDAPKKKQDVVKLIRKSRVTPPAQPANAEATNGEDFISLDMGGSVSDNDPDIRKDVPENAPTGPKTQPEEGSTRVGKRKRDAPRQVNKLPPQARKGSRLHQNGMIIGGWQARNPDSPMPWYRPPSTSHVLAGVALHQEILDFYEWVRPQDFEQEIRLDVITRLQKMFSRIEPGCQLKPFGSFAAGLYLPTGDMDLVLMTHPSRSRFPPQPKNLLFFVHTVLQKEGIAVPGSLQPIAKAKVPIIKFVDAITGLKVDLSFNNDAGIIANNTFQAWKLQYPAMPILVSVMKQYLLIRGLNDVAFGGLGGFSTICLVTSLIQHHIRPGQVPNLGYLLLNFFYFYGHVFNKQEIAIRLEPPSFVRKDQYTPFHYNSDRPNRLAIVDPNKADNNISGGTAEIDLIFRCFSHAYSQLSARMAERQDTGTTSKSLLVDLLGGDFEAYSQQRERLRRIYSDRLGQNKQPLPPTVSLSGPPGVGLPNIATGGRKQPDMSQPNGREVSSGKDKPNTLPKLTKAQRRDRAAKDRASRLKTLRPDIATKVGERVTMEHAMQLGGYESAQEMDLDLAQRARGMSL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.6
3 0.56
4 0.55
5 0.47
6 0.45
7 0.4
8 0.34
9 0.3
10 0.22
11 0.19
12 0.19
13 0.23
14 0.23
15 0.24
16 0.26
17 0.27
18 0.3
19 0.38
20 0.33
21 0.34
22 0.41
23 0.4
24 0.38
25 0.4
26 0.38
27 0.32
28 0.35
29 0.3
30 0.23
31 0.24
32 0.25
33 0.24
34 0.23
35 0.2
36 0.18
37 0.16
38 0.18
39 0.26
40 0.24
41 0.3
42 0.37
43 0.44
44 0.48
45 0.54
46 0.56
47 0.57
48 0.62
49 0.64
50 0.59
51 0.6
52 0.57
53 0.56
54 0.53
55 0.5
56 0.46
57 0.41
58 0.4
59 0.32
60 0.33
61 0.31
62 0.3
63 0.25
64 0.26
65 0.21
66 0.19
67 0.19
68 0.15
69 0.16
70 0.16
71 0.21
72 0.2
73 0.22
74 0.23
75 0.23
76 0.29
77 0.27
78 0.3
79 0.28
80 0.29
81 0.28
82 0.28
83 0.29
84 0.24
85 0.22
86 0.17
87 0.13
88 0.11
89 0.1
90 0.1
91 0.1
92 0.08
93 0.08
94 0.09
95 0.1
96 0.12
97 0.15
98 0.17
99 0.23
100 0.27
101 0.33
102 0.4
103 0.47
104 0.55
105 0.6
106 0.64
107 0.65
108 0.7
109 0.73
110 0.73
111 0.73
112 0.65
113 0.62
114 0.56
115 0.5
116 0.44
117 0.36
118 0.34
119 0.27
120 0.26
121 0.2
122 0.21
123 0.21
124 0.25
125 0.29
126 0.28
127 0.34
128 0.43
129 0.45
130 0.5
131 0.53
132 0.55
133 0.59
134 0.65
135 0.67
136 0.67
137 0.71
138 0.72
139 0.69
140 0.65
141 0.63
142 0.64
143 0.59
144 0.57
145 0.59
146 0.61
147 0.6
148 0.56
149 0.49
150 0.46
151 0.41
152 0.34
153 0.25
154 0.19
155 0.19
156 0.18
157 0.16
158 0.1
159 0.09
160 0.09
161 0.1
162 0.06
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.06
172 0.07
173 0.08
174 0.1
175 0.11
176 0.11
177 0.12
178 0.14
179 0.2
180 0.25
181 0.26
182 0.27
183 0.27
184 0.31
185 0.31
186 0.32
187 0.28
188 0.26
189 0.28
190 0.29
191 0.3
192 0.28
193 0.31
194 0.31
195 0.34
196 0.34
197 0.35
198 0.4
199 0.42
200 0.43
201 0.45
202 0.52
203 0.56
204 0.64
205 0.69
206 0.72
207 0.77
208 0.82
209 0.83
210 0.83
211 0.78
212 0.77
213 0.74
214 0.69
215 0.64
216 0.64
217 0.61
218 0.6
219 0.59
220 0.58
221 0.59
222 0.59
223 0.57
224 0.52
225 0.49
226 0.42
227 0.38
228 0.3
229 0.2
230 0.15
231 0.15
232 0.11
233 0.1
234 0.11
235 0.11
236 0.12
237 0.14
238 0.16
239 0.14
240 0.2
241 0.23
242 0.28
243 0.32
244 0.35
245 0.36
246 0.36
247 0.38
248 0.4
249 0.39
250 0.35
251 0.3
252 0.27
253 0.24
254 0.22
255 0.18
256 0.13
257 0.09
258 0.07
259 0.07
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.06
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.11
268 0.11
269 0.12
270 0.13
271 0.13
272 0.13
273 0.2
274 0.21
275 0.17
276 0.19
277 0.19
278 0.18
279 0.18
280 0.18
281 0.12
282 0.1
283 0.14
284 0.15
285 0.15
286 0.15
287 0.15
288 0.17
289 0.2
290 0.23
291 0.19
292 0.23
293 0.22
294 0.24
295 0.28
296 0.3
297 0.29
298 0.27
299 0.27
300 0.2
301 0.22
302 0.2
303 0.15
304 0.13
305 0.1
306 0.1
307 0.12
308 0.11
309 0.09
310 0.08
311 0.07
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.03
316 0.03
317 0.03
318 0.03
319 0.03
320 0.03
321 0.03
322 0.03
323 0.05
324 0.07
325 0.09
326 0.11
327 0.15
328 0.21
329 0.29
330 0.39
331 0.48
332 0.52
333 0.6
334 0.6
335 0.6
336 0.55
337 0.48
338 0.39
339 0.3
340 0.26
341 0.2
342 0.19
343 0.17
344 0.16
345 0.15
346 0.14
347 0.13
348 0.12
349 0.08
350 0.08
351 0.06
352 0.07
353 0.09
354 0.09
355 0.09
356 0.08
357 0.08
358 0.1
359 0.12
360 0.13
361 0.11
362 0.12
363 0.17
364 0.18
365 0.22
366 0.22
367 0.22
368 0.2
369 0.2
370 0.2
371 0.15
372 0.15
373 0.1
374 0.08
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.1
381 0.1
382 0.09
383 0.1
384 0.1
385 0.1
386 0.1
387 0.1
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.06
393 0.06
394 0.06
395 0.08
396 0.08
397 0.09
398 0.11
399 0.12
400 0.13
401 0.15
402 0.16
403 0.15
404 0.13
405 0.12
406 0.12
407 0.11
408 0.1
409 0.08
410 0.08
411 0.07
412 0.08
413 0.08
414 0.09
415 0.1
416 0.1
417 0.1
418 0.11
419 0.12
420 0.11
421 0.11
422 0.08
423 0.06
424 0.06
425 0.05
426 0.04
427 0.03
428 0.03
429 0.03
430 0.03
431 0.02
432 0.03
433 0.03
434 0.03
435 0.04
436 0.04
437 0.05
438 0.07
439 0.09
440 0.14
441 0.16
442 0.16
443 0.18
444 0.2
445 0.2
446 0.2
447 0.21
448 0.21
449 0.22
450 0.22
451 0.21
452 0.19
453 0.19
454 0.16
455 0.14
456 0.11
457 0.08
458 0.08
459 0.07
460 0.06
461 0.06
462 0.07
463 0.07
464 0.09
465 0.1
466 0.14
467 0.15
468 0.15
469 0.17
470 0.17
471 0.2
472 0.18
473 0.23
474 0.21
475 0.22
476 0.23
477 0.22
478 0.22
479 0.21
480 0.25
481 0.21
482 0.21
483 0.24
484 0.24
485 0.29
486 0.35
487 0.39
488 0.41
489 0.45
490 0.47
491 0.48
492 0.47
493 0.47
494 0.51
495 0.54
496 0.51
497 0.46
498 0.45
499 0.4
500 0.39
501 0.39
502 0.36
503 0.33
504 0.34
505 0.33
506 0.34
507 0.34
508 0.34
509 0.3
510 0.23
511 0.19
512 0.15
513 0.14
514 0.11
515 0.1
516 0.1
517 0.1
518 0.09
519 0.06
520 0.06
521 0.06
522 0.07
523 0.07
524 0.06
525 0.07
526 0.08
527 0.08
528 0.13
529 0.18
530 0.21
531 0.23
532 0.25
533 0.27
534 0.28
535 0.28
536 0.24
537 0.24
538 0.22
539 0.22
540 0.21
541 0.2
542 0.2
543 0.22
544 0.23
545 0.2
546 0.2
547 0.19
548 0.2
549 0.18
550 0.17
551 0.15
552 0.13
553 0.11
554 0.1
555 0.09
556 0.06
557 0.06
558 0.05
559 0.05
560 0.05
561 0.07
562 0.08
563 0.1
564 0.12
565 0.17
566 0.24
567 0.29
568 0.35
569 0.4
570 0.44
571 0.49
572 0.55
573 0.6
574 0.59
575 0.64
576 0.64
577 0.65
578 0.65
579 0.62
580 0.64
581 0.59
582 0.58
583 0.54
584 0.5
585 0.47
586 0.45
587 0.45
588 0.38
589 0.34
590 0.31
591 0.29
592 0.27
593 0.22
594 0.19
595 0.15
596 0.13
597 0.12
598 0.11
599 0.09
600 0.09
601 0.1
602 0.1
603 0.1
604 0.11
605 0.2
606 0.21
607 0.22
608 0.22
609 0.28
610 0.38
611 0.42
612 0.46
613 0.47
614 0.48
615 0.54
616 0.55
617 0.49
618 0.4
619 0.36
620 0.38
621 0.38
622 0.41
623 0.38
624 0.42
625 0.44
626 0.49
627 0.59
628 0.57
629 0.54
630 0.56
631 0.56
632 0.61
633 0.67
634 0.69
635 0.68
636 0.73
637 0.75
638 0.78
639 0.83
640 0.81
641 0.84
642 0.83
643 0.83
644 0.81
645 0.82
646 0.81
647 0.77
648 0.75
649 0.71
650 0.72
651 0.71
652 0.7
653 0.67
654 0.62
655 0.61
656 0.58
657 0.61
658 0.54
659 0.47
660 0.45
661 0.39
662 0.36
663 0.32
664 0.3
665 0.27
666 0.28
667 0.27
668 0.23
669 0.22
670 0.2
671 0.19
672 0.16
673 0.12
674 0.09
675 0.08
676 0.07
677 0.07
678 0.08
679 0.08
680 0.08
681 0.07
682 0.08
683 0.1
684 0.1
685 0.12
686 0.12
687 0.12
688 0.13