Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1GPM1

Protein Details
Accession U1GPM1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
143-163TSEKPRQRKGLKGMFRREKKVBasic
399-425RDIGRGARKIRQKLKRRSSSDQARRSAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
146-162KPRQRKGLKGMFRREKK
395-416KAEKRDIGRGARKIRQKLKRRS
Subcellular Location(s) plas 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004713  CaH_exchang  
IPR004798  CAX-like  
IPR004837  NaCa_Exmemb  
IPR044880  NCX_ion-bd_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005774  C:vacuolar membrane  
GO:0015369  F:calcium:proton antiporter activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF01699  Na_Ca_ex  
Amino Acid Sequences MHKLRGEAKHAAWYDEPDEPANFNPFRKVRTDLLGKKNALRNAENGDGGLTRSTTDQEHRHADVSNRRAEMGAAADTPQRYGTAPISGRSRTEHVPGSDSTQFEIIRTVSPKQEAPLEDSPLPLEETKDSTSGDTIAIEDTPTSEKPRQRKGLKGMFRREKKVVGSDKPEGDDLEKPHYTFGNQIRATLFNSWINVLLIAVPVGIIVNYVHITPVAIFVINFIAIIPLAALLSYATEEIALRTGEVVGGLLNASFGNAVELIVSIIALLKDEILIVQTSLIGSMLSNLLLVLGMAFFFGGLNRFEQSFNVVVAQTASSLLALAIGSLVLPTAFHSFAGDNQTAQDPEAENDVSAGSEGIAPISRGTSIILLIVYACYLFFQLKSHVEMYTKESEKAEKRDIGRGARKIRQKLKRRSSSDQARRSALQVENAKVKAEKDEVPQLHIWVAIATLAVSTVLVAFCAEFMVSSIDAITVCGSGVSKTFVGLILLPIVGNAAEHATAVTVAVKDKMDLSIGVAVGSSMQIALLVLPLIVILGWITGHDDMTLWFDGYQVVVLFISILLVNYLIQDGKSHWLEGVLLMTLYLIIALSAWYYPTKGDGACPNGQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.34
3 0.34
4 0.27
5 0.28
6 0.26
7 0.27
8 0.3
9 0.29
10 0.26
11 0.34
12 0.34
13 0.37
14 0.39
15 0.42
16 0.39
17 0.45
18 0.54
19 0.55
20 0.62
21 0.67
22 0.65
23 0.68
24 0.7
25 0.66
26 0.61
27 0.54
28 0.48
29 0.46
30 0.47
31 0.4
32 0.33
33 0.3
34 0.24
35 0.23
36 0.19
37 0.13
38 0.1
39 0.11
40 0.13
41 0.14
42 0.2
43 0.25
44 0.3
45 0.36
46 0.37
47 0.38
48 0.39
49 0.44
50 0.47
51 0.48
52 0.48
53 0.43
54 0.41
55 0.4
56 0.37
57 0.31
58 0.24
59 0.2
60 0.14
61 0.14
62 0.17
63 0.17
64 0.17
65 0.16
66 0.14
67 0.13
68 0.15
69 0.16
70 0.21
71 0.22
72 0.25
73 0.3
74 0.31
75 0.31
76 0.32
77 0.35
78 0.3
79 0.33
80 0.35
81 0.31
82 0.34
83 0.33
84 0.35
85 0.34
86 0.32
87 0.28
88 0.26
89 0.24
90 0.2
91 0.22
92 0.17
93 0.17
94 0.2
95 0.21
96 0.22
97 0.24
98 0.25
99 0.25
100 0.29
101 0.26
102 0.31
103 0.33
104 0.34
105 0.32
106 0.31
107 0.3
108 0.25
109 0.26
110 0.19
111 0.16
112 0.12
113 0.16
114 0.17
115 0.17
116 0.17
117 0.16
118 0.16
119 0.15
120 0.14
121 0.11
122 0.09
123 0.09
124 0.08
125 0.08
126 0.07
127 0.07
128 0.1
129 0.11
130 0.16
131 0.22
132 0.27
133 0.35
134 0.45
135 0.54
136 0.57
137 0.65
138 0.69
139 0.73
140 0.77
141 0.79
142 0.8
143 0.8
144 0.81
145 0.79
146 0.72
147 0.66
148 0.6
149 0.6
150 0.57
151 0.54
152 0.54
153 0.53
154 0.51
155 0.48
156 0.45
157 0.37
158 0.31
159 0.29
160 0.24
161 0.26
162 0.25
163 0.23
164 0.24
165 0.24
166 0.22
167 0.24
168 0.27
169 0.31
170 0.29
171 0.31
172 0.31
173 0.32
174 0.33
175 0.28
176 0.25
177 0.16
178 0.17
179 0.16
180 0.15
181 0.14
182 0.12
183 0.1
184 0.07
185 0.06
186 0.05
187 0.04
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.04
195 0.04
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.06
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.06
207 0.06
208 0.05
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.02
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.04
225 0.04
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.04
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.03
253 0.03
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.03
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.04
265 0.03
266 0.04
267 0.04
268 0.03
269 0.03
270 0.03
271 0.04
272 0.03
273 0.03
274 0.03
275 0.03
276 0.03
277 0.03
278 0.02
279 0.02
280 0.02
281 0.02
282 0.02
283 0.02
284 0.02
285 0.02
286 0.04
287 0.04
288 0.05
289 0.06
290 0.07
291 0.07
292 0.08
293 0.1
294 0.09
295 0.09
296 0.09
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.08
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.04
305 0.04
306 0.03
307 0.03
308 0.03
309 0.03
310 0.02
311 0.02
312 0.02
313 0.02
314 0.02
315 0.02
316 0.02
317 0.03
318 0.05
319 0.06
320 0.06
321 0.07
322 0.07
323 0.09
324 0.14
325 0.13
326 0.11
327 0.12
328 0.13
329 0.12
330 0.12
331 0.12
332 0.08
333 0.08
334 0.1
335 0.09
336 0.08
337 0.08
338 0.08
339 0.06
340 0.06
341 0.05
342 0.03
343 0.04
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.04
360 0.04
361 0.03
362 0.03
363 0.03
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.06
368 0.1
369 0.11
370 0.14
371 0.15
372 0.16
373 0.16
374 0.18
375 0.22
376 0.26
377 0.26
378 0.25
379 0.25
380 0.29
381 0.34
382 0.38
383 0.38
384 0.35
385 0.36
386 0.42
387 0.45
388 0.48
389 0.5
390 0.52
391 0.53
392 0.55
393 0.6
394 0.62
395 0.68
396 0.69
397 0.73
398 0.76
399 0.8
400 0.84
401 0.84
402 0.83
403 0.83
404 0.85
405 0.84
406 0.82
407 0.75
408 0.68
409 0.61
410 0.55
411 0.51
412 0.42
413 0.39
414 0.35
415 0.34
416 0.36
417 0.35
418 0.35
419 0.29
420 0.28
421 0.24
422 0.23
423 0.24
424 0.22
425 0.31
426 0.31
427 0.33
428 0.33
429 0.31
430 0.27
431 0.24
432 0.2
433 0.11
434 0.1
435 0.06
436 0.05
437 0.04
438 0.04
439 0.03
440 0.03
441 0.03
442 0.03
443 0.04
444 0.03
445 0.04
446 0.04
447 0.04
448 0.04
449 0.04
450 0.04
451 0.03
452 0.04
453 0.06
454 0.06
455 0.06
456 0.06
457 0.07
458 0.07
459 0.07
460 0.07
461 0.05
462 0.05
463 0.05
464 0.05
465 0.05
466 0.06
467 0.09
468 0.08
469 0.08
470 0.09
471 0.09
472 0.09
473 0.09
474 0.09
475 0.08
476 0.08
477 0.07
478 0.06
479 0.06
480 0.05
481 0.05
482 0.05
483 0.04
484 0.04
485 0.05
486 0.05
487 0.05
488 0.05
489 0.05
490 0.06
491 0.06
492 0.07
493 0.1
494 0.1
495 0.1
496 0.11
497 0.12
498 0.11
499 0.11
500 0.12
501 0.12
502 0.12
503 0.12
504 0.11
505 0.1
506 0.09
507 0.09
508 0.07
509 0.03
510 0.03
511 0.03
512 0.03
513 0.04
514 0.04
515 0.04
516 0.03
517 0.03
518 0.03
519 0.03
520 0.03
521 0.03
522 0.02
523 0.03
524 0.03
525 0.03
526 0.06
527 0.06
528 0.07
529 0.07
530 0.07
531 0.07
532 0.11
533 0.12
534 0.11
535 0.1
536 0.1
537 0.1
538 0.1
539 0.11
540 0.07
541 0.07
542 0.06
543 0.06
544 0.06
545 0.06
546 0.06
547 0.05
548 0.05
549 0.05
550 0.05
551 0.05
552 0.06
553 0.07
554 0.07
555 0.07
556 0.08
557 0.1
558 0.17
559 0.18
560 0.18
561 0.17
562 0.17
563 0.18
564 0.17
565 0.17
566 0.11
567 0.09
568 0.08
569 0.08
570 0.07
571 0.06
572 0.05
573 0.04
574 0.03
575 0.03
576 0.03
577 0.04
578 0.04
579 0.06
580 0.07
581 0.08
582 0.08
583 0.11
584 0.14
585 0.14
586 0.19
587 0.25