Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1HJW1

Protein Details
Accession U1HJW1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
30-60KYRVSKTTVAYRRRGRNPRTQANRRTQRLSLHydrophilic
455-481ALKQELTKRSKRIQKETKQRSWNLEQVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 5, pero 3, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004875  DDE_SF_endonuclease_dom  
IPR006600  HTH_CenpB_DNA-bd_dom  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03184  DDE_1  
PF03221  HTH_Tnp_Tc5  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51253  HTH_CENPB  
Amino Acid Sequences MASNQEQLIQQALNDLDIGAEKSIRKVAAKYRVSKTTVAYRRRGRNPRTQANRRTQRLSLEEEKTLIQWIRDLQRQNLCPNYPRIRSFVYEILRNRGDSRPLGKNYVSRFISRHSELRTSRSRAMDIKRLSALDPTVIESFFSEFEQLRSQYGVEIENIWNMDETGFQMGQTTSNFVAYDASIGRPVAPQPDNTQWVTIIECISYHRALKPYLIFCGKAPELHMFPAIDELPDIIWAFSLKGWTDNELGIDWLRRIFIPQRPIGKHSILILDGHDSHSTGLFQYLCLQNDIHPLYLPAHASHKLQPLDLGPFSPLKAAYGQLVQRFALTGLATLNRRVFTKLYIEARQTTFTERNIRAGWHRTGIWPLNKQKLLNDPEIRNFGRTTPEYQPPATSDGLYSTPKQSDNLRALIRQIEAKTTPQTRRAVRKLGHSAIQEHTGAQLLRTQLRELRQLALKQELTKRSKRIQKETKQRSWNLEQVRAALAPKKVHFVRKEGGEKRILRTVTLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.13
3 0.1
4 0.11
5 0.12
6 0.08
7 0.11
8 0.12
9 0.14
10 0.18
11 0.2
12 0.21
13 0.26
14 0.34
15 0.42
16 0.49
17 0.55
18 0.59
19 0.65
20 0.66
21 0.63
22 0.59
23 0.59
24 0.6
25 0.6
26 0.62
27 0.64
28 0.7
29 0.78
30 0.83
31 0.8
32 0.82
33 0.85
34 0.86
35 0.88
36 0.88
37 0.87
38 0.88
39 0.91
40 0.87
41 0.82
42 0.75
43 0.72
44 0.66
45 0.64
46 0.61
47 0.55
48 0.5
49 0.45
50 0.42
51 0.35
52 0.35
53 0.28
54 0.2
55 0.18
56 0.22
57 0.27
58 0.32
59 0.35
60 0.37
61 0.45
62 0.49
63 0.52
64 0.54
65 0.51
66 0.51
67 0.56
68 0.58
69 0.55
70 0.54
71 0.52
72 0.48
73 0.48
74 0.47
75 0.45
76 0.41
77 0.42
78 0.42
79 0.45
80 0.43
81 0.41
82 0.4
83 0.36
84 0.37
85 0.34
86 0.38
87 0.4
88 0.41
89 0.45
90 0.44
91 0.46
92 0.45
93 0.5
94 0.45
95 0.38
96 0.37
97 0.37
98 0.41
99 0.39
100 0.41
101 0.36
102 0.42
103 0.42
104 0.48
105 0.52
106 0.51
107 0.53
108 0.5
109 0.49
110 0.48
111 0.52
112 0.53
113 0.47
114 0.45
115 0.41
116 0.4
117 0.37
118 0.32
119 0.26
120 0.19
121 0.17
122 0.16
123 0.15
124 0.14
125 0.13
126 0.11
127 0.12
128 0.11
129 0.11
130 0.1
131 0.09
132 0.11
133 0.15
134 0.15
135 0.15
136 0.15
137 0.14
138 0.14
139 0.15
140 0.14
141 0.1
142 0.12
143 0.12
144 0.13
145 0.13
146 0.11
147 0.1
148 0.09
149 0.09
150 0.07
151 0.07
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.09
156 0.09
157 0.1
158 0.1
159 0.12
160 0.09
161 0.1
162 0.11
163 0.09
164 0.1
165 0.08
166 0.1
167 0.08
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.09
173 0.09
174 0.14
175 0.14
176 0.15
177 0.19
178 0.24
179 0.27
180 0.26
181 0.26
182 0.2
183 0.2
184 0.19
185 0.16
186 0.11
187 0.07
188 0.07
189 0.08
190 0.11
191 0.11
192 0.12
193 0.13
194 0.15
195 0.16
196 0.19
197 0.22
198 0.2
199 0.23
200 0.24
201 0.22
202 0.2
203 0.25
204 0.22
205 0.18
206 0.19
207 0.17
208 0.17
209 0.17
210 0.18
211 0.12
212 0.11
213 0.13
214 0.11
215 0.08
216 0.07
217 0.07
218 0.05
219 0.06
220 0.06
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.05
225 0.05
226 0.06
227 0.05
228 0.07
229 0.08
230 0.1
231 0.11
232 0.11
233 0.11
234 0.1
235 0.1
236 0.08
237 0.08
238 0.07
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.07
243 0.12
244 0.15
245 0.2
246 0.24
247 0.31
248 0.33
249 0.36
250 0.38
251 0.34
252 0.31
253 0.27
254 0.24
255 0.17
256 0.16
257 0.13
258 0.11
259 0.1
260 0.11
261 0.1
262 0.08
263 0.08
264 0.08
265 0.08
266 0.06
267 0.08
268 0.06
269 0.06
270 0.1
271 0.13
272 0.13
273 0.14
274 0.14
275 0.13
276 0.19
277 0.2
278 0.16
279 0.13
280 0.13
281 0.14
282 0.15
283 0.15
284 0.1
285 0.13
286 0.14
287 0.16
288 0.19
289 0.24
290 0.23
291 0.23
292 0.23
293 0.21
294 0.23
295 0.21
296 0.18
297 0.13
298 0.13
299 0.13
300 0.13
301 0.11
302 0.08
303 0.09
304 0.09
305 0.09
306 0.12
307 0.15
308 0.16
309 0.17
310 0.16
311 0.15
312 0.15
313 0.14
314 0.12
315 0.09
316 0.07
317 0.07
318 0.1
319 0.11
320 0.13
321 0.15
322 0.14
323 0.15
324 0.17
325 0.17
326 0.16
327 0.2
328 0.24
329 0.27
330 0.3
331 0.32
332 0.33
333 0.34
334 0.34
335 0.31
336 0.3
337 0.28
338 0.28
339 0.34
340 0.31
341 0.34
342 0.32
343 0.34
344 0.33
345 0.36
346 0.35
347 0.29
348 0.29
349 0.27
350 0.32
351 0.36
352 0.37
353 0.39
354 0.43
355 0.49
356 0.5
357 0.5
358 0.47
359 0.5
360 0.49
361 0.5
362 0.5
363 0.45
364 0.47
365 0.52
366 0.5
367 0.42
368 0.38
369 0.31
370 0.31
371 0.29
372 0.31
373 0.3
374 0.37
375 0.38
376 0.38
377 0.38
378 0.33
379 0.35
380 0.3
381 0.25
382 0.18
383 0.17
384 0.19
385 0.2
386 0.2
387 0.19
388 0.21
389 0.22
390 0.24
391 0.26
392 0.31
393 0.33
394 0.37
395 0.36
396 0.34
397 0.35
398 0.36
399 0.33
400 0.3
401 0.27
402 0.25
403 0.25
404 0.27
405 0.32
406 0.37
407 0.4
408 0.42
409 0.49
410 0.52
411 0.61
412 0.64
413 0.66
414 0.62
415 0.67
416 0.69
417 0.66
418 0.64
419 0.56
420 0.53
421 0.46
422 0.46
423 0.37
424 0.28
425 0.24
426 0.22
427 0.19
428 0.16
429 0.16
430 0.16
431 0.2
432 0.21
433 0.23
434 0.24
435 0.28
436 0.35
437 0.33
438 0.36
439 0.38
440 0.4
441 0.41
442 0.44
443 0.43
444 0.43
445 0.49
446 0.52
447 0.54
448 0.58
449 0.62
450 0.64
451 0.7
452 0.73
453 0.77
454 0.78
455 0.82
456 0.85
457 0.89
458 0.89
459 0.9
460 0.87
461 0.84
462 0.81
463 0.79
464 0.75
465 0.71
466 0.63
467 0.56
468 0.52
469 0.45
470 0.39
471 0.36
472 0.34
473 0.33
474 0.33
475 0.39
476 0.41
477 0.49
478 0.5
479 0.52
480 0.54
481 0.58
482 0.66
483 0.63
484 0.65
485 0.65
486 0.65
487 0.63
488 0.64
489 0.55