FuNGI

U1GAF2

Protein Details

Accession

U1GAF2

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
533-556	GTDVSLSRKKKKNRHLSSTQPTPY	Hydrophilic
617-637	MSDNSRKQKRLKLNLGHKDGS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
25-65	KKKPKAADPLFGGKKKPTYKAAVPLAKPGINGAPPPVLKPR
417-440	RERREKERKKLISKGIKRALEKRE
540-544	RKKKK

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MNPSLPPTDPVSHDQHPQRSVALLKKKPKAADPLFGGKKKPTYKAAVPLAKPGINGAPPPVLKPRPGLSPAPLGGPSPGRASPAPSDRKTFSGFSDLNGTVDGVAYRDYTLVTTKRELLNGLRYHVLQFSGDRPIDIRNEADFTRPVRLHRRDPRSVPTEQNQGENGEGVNDGMDAEEREEFDKRKEARRLEREANLAQVAPSVDSGKRSNIIKTKTAQVFNRDYTPEERKKMQNNYEEKLPWHIEDFDNKHCYVGSNQAGSSNVHAAFVYEQSIDAQNGRFRVLPIEKMYQFKPRKTFKTMTIEEAENAMKKKGRDPQWIIDQREANLKTAQLERLSRGNRPFFGTKDDTAAGREDGGADLDFNMEEDFADDEEGDTFFEKDEDEKLAESRIKEDQLNANIFGIKEEIEYDQAEERERREKERKKLISKGIKRALEKREKNFDHASDSDDPFGSTSESENTEAERRRLQAEKKTKAELEAKNSGASTGTNTPSGRKEKHGGTASDREGGMKRSSSSKSLKRPGSPNLSDASGTDVSLSRKKKKNRHLSSTQPTPYPSRPISPANVPSSSSAPTSGVRKDSNTSHLNVINPAKKRKSLALGPGSDTETAAHSDGGAMSDNSRKQKRLKLNLGHKDGSGSPKVATPQGGSRASSPKPAAVPVQAARPGPDPSTYPTAAEVYAAIPPAGITTNDLSNMFRSRYRKEDKSQMVDRIREVARFDKPTRLLFPSETFKAA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.51
2	0.53
3	0.52
4	0.49
5	0.45
6	0.42
7	0.44
8	0.45
9	0.48
10	0.49
11	0.56
12	0.62
13	0.67
14	0.68
15	0.68
16	0.7
17	0.65
18	0.65
19	0.62
20	0.65
21	0.67
22	0.67
23	0.63
24	0.58
25	0.61
26	0.59
27	0.59
28	0.56
29	0.55
30	0.58
31	0.65
32	0.69
33	0.69
34	0.64
35	0.65
36	0.63
37	0.56
38	0.49
39	0.41
40	0.36
41	0.29
42	0.29
43	0.24
44	0.26
45	0.25
46	0.28
47	0.34
48	0.33
49	0.33
50	0.38
51	0.38
52	0.39
53	0.43
54	0.44
55	0.39
56	0.43
57	0.42
58	0.4
59	0.37
60	0.3
61	0.28
62	0.27
63	0.24
64	0.21
65	0.21
66	0.21
67	0.21
68	0.25
69	0.29
70	0.36
71	0.44
72	0.43
73	0.48
74	0.46
75	0.5
76	0.49
77	0.44
78	0.37
79	0.37
80	0.34
81	0.3
82	0.35
83	0.31
84	0.27
85	0.26
86	0.23
87	0.14
88	0.15
89	0.13
90	0.07
91	0.07
92	0.07
93	0.07
94	0.07
95	0.08
96	0.08
97	0.14
98	0.16
99	0.19
100	0.21
101	0.26
102	0.28
103	0.29
104	0.3
105	0.29
106	0.35
107	0.34
108	0.34
109	0.31
110	0.3
111	0.3
112	0.29
113	0.25
114	0.17
115	0.17
116	0.17
117	0.22
118	0.21
119	0.2
120	0.2
121	0.22
122	0.24
123	0.24
124	0.23
125	0.17
126	0.2
127	0.2
128	0.23
129	0.22
130	0.22
131	0.28
132	0.27
133	0.31
134	0.39
135	0.45
136	0.52
137	0.59
138	0.66
139	0.67
140	0.71
141	0.74
142	0.69
143	0.67
144	0.64
145	0.59
146	0.6
147	0.52
148	0.5
149	0.43
150	0.39
151	0.34
152	0.28
153	0.22
154	0.13
155	0.12
156	0.08
157	0.07
158	0.05
159	0.05
160	0.04
161	0.05
162	0.05
163	0.06
164	0.07
165	0.07
166	0.09
167	0.12
168	0.14
169	0.16
170	0.24
171	0.27
172	0.36
173	0.43
174	0.5
175	0.58
176	0.65
177	0.7
178	0.68
179	0.69
180	0.65
181	0.58
182	0.52
183	0.43
184	0.34
185	0.26
186	0.21
187	0.16
188	0.11
189	0.11
190	0.1
191	0.1
192	0.13
193	0.14
194	0.15
195	0.19
196	0.2
197	0.25
198	0.3
199	0.34
200	0.35
201	0.37
202	0.43
203	0.46
204	0.5
205	0.47
206	0.47
207	0.48
208	0.46
209	0.47
210	0.4
211	0.36
212	0.36
213	0.42
214	0.42
215	0.41
216	0.44
217	0.47
218	0.54
219	0.6
220	0.63
221	0.62
222	0.61
223	0.6
224	0.6
225	0.55
226	0.48
227	0.45
228	0.38
229	0.3
230	0.26
231	0.25
232	0.21
233	0.27
234	0.3
235	0.3
236	0.32
237	0.31
238	0.29
239	0.27
240	0.27
241	0.21
242	0.25
243	0.22
244	0.2
245	0.2
246	0.21
247	0.22
248	0.21
249	0.21
250	0.16
251	0.13
252	0.12
253	0.12
254	0.11
255	0.11
256	0.11
257	0.1
258	0.07
259	0.07
260	0.08
261	0.09
262	0.09
263	0.09
264	0.1
265	0.11
266	0.12
267	0.13
268	0.12
269	0.12
270	0.17
271	0.18
272	0.2
273	0.22
274	0.28
275	0.28
276	0.31
277	0.32
278	0.36
279	0.39
280	0.41
281	0.46
282	0.47
283	0.51
284	0.56
285	0.58
286	0.56
287	0.61
288	0.58
289	0.53
290	0.48
291	0.43
292	0.36
293	0.34
294	0.27
295	0.19
296	0.18
297	0.15
298	0.14
299	0.14
300	0.19
301	0.26
302	0.33
303	0.4
304	0.45
305	0.49
306	0.57
307	0.65
308	0.62
309	0.58
310	0.51
311	0.43
312	0.45
313	0.4
314	0.31
315	0.24
316	0.22
317	0.2
318	0.2
319	0.21
320	0.16
321	0.17
322	0.17
323	0.22
324	0.24
325	0.26
326	0.29
327	0.3
328	0.29
329	0.32
330	0.32
331	0.26
332	0.31
333	0.3
334	0.26
335	0.25
336	0.25
337	0.21
338	0.2
339	0.2
340	0.13
341	0.1
342	0.09
343	0.07
344	0.06
345	0.06
346	0.05
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.04
351	0.04
352	0.04
353	0.03
354	0.03
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.04
359	0.04
360	0.04
361	0.05
362	0.05
363	0.04
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.06
371	0.07
372	0.07
373	0.08
374	0.08
375	0.1
376	0.12
377	0.12
378	0.13
379	0.14
380	0.15
381	0.15
382	0.17
383	0.2
384	0.22
385	0.23
386	0.21
387	0.19
388	0.18
389	0.18
390	0.16
391	0.11
392	0.07
393	0.06
394	0.07
395	0.07
396	0.07
397	0.07
398	0.08
399	0.1
400	0.1
401	0.12
402	0.12
403	0.14
404	0.2
405	0.22
406	0.28
407	0.36
408	0.45
409	0.52
410	0.62
411	0.68
412	0.68
413	0.75
414	0.77
415	0.77
416	0.76
417	0.77
418	0.74
419	0.7
420	0.66
421	0.65
422	0.65
423	0.65
424	0.65
425	0.61
426	0.64
427	0.61
428	0.63
429	0.59
430	0.51
431	0.46
432	0.4
433	0.38
434	0.32
435	0.31
436	0.27
437	0.23
438	0.22
439	0.16
440	0.16
441	0.12
442	0.07
443	0.08
444	0.08
445	0.1
446	0.11
447	0.11
448	0.13
449	0.18
450	0.2
451	0.21
452	0.22
453	0.21
454	0.24
455	0.3
456	0.34
457	0.38
458	0.47
459	0.53
460	0.53
461	0.56
462	0.53
463	0.52
464	0.55
465	0.49
466	0.46
467	0.43
468	0.4
469	0.37
470	0.36
471	0.31
472	0.23
473	0.19
474	0.15
475	0.14
476	0.14
477	0.17
478	0.17
479	0.2
480	0.25
481	0.32
482	0.31
483	0.31
484	0.35
485	0.35
486	0.43
487	0.46
488	0.43
489	0.42
490	0.47
491	0.44
492	0.41
493	0.38
494	0.32
495	0.28
496	0.28
497	0.24
498	0.18
499	0.18
500	0.21
501	0.23
502	0.28
503	0.35
504	0.4
505	0.47
506	0.55
507	0.6
508	0.6
509	0.64
510	0.66
511	0.68
512	0.61
513	0.54
514	0.47
515	0.42
516	0.35
517	0.3
518	0.27
519	0.18
520	0.16
521	0.15
522	0.15
523	0.17
524	0.23
525	0.29
526	0.33
527	0.41
528	0.5
529	0.59
530	0.68
531	0.76
532	0.8
533	0.84
534	0.83
535	0.86
536	0.85
537	0.85
538	0.78
539	0.69
540	0.61
541	0.57
542	0.51
543	0.48
544	0.41
545	0.35
546	0.36
547	0.38
548	0.39
549	0.4
550	0.44
551	0.41
552	0.4
553	0.37
554	0.35
555	0.33
556	0.31
557	0.24
558	0.19
559	0.16
560	0.17
561	0.2
562	0.21
563	0.24
564	0.24
565	0.26
566	0.29
567	0.31
568	0.35
569	0.35
570	0.34
571	0.33
572	0.34
573	0.33
574	0.35
575	0.39
576	0.38
577	0.41
578	0.47
579	0.46
580	0.48
581	0.49
582	0.5
583	0.5
584	0.51
585	0.55
586	0.55
587	0.53
588	0.52
589	0.51
590	0.47
591	0.39
592	0.33
593	0.24
594	0.16
595	0.15
596	0.13
597	0.11
598	0.09
599	0.09
600	0.09
601	0.09
602	0.09
603	0.08
604	0.09
605	0.15
606	0.2
607	0.28
608	0.32
609	0.36
610	0.42
611	0.51
612	0.6
613	0.66
614	0.71
615	0.73
616	0.8
617	0.85
618	0.86
619	0.78
620	0.67
621	0.59
622	0.52
623	0.48
624	0.4
625	0.31
626	0.24
627	0.26
628	0.28
629	0.27
630	0.25
631	0.22
632	0.25
633	0.31
634	0.33
635	0.31
636	0.34
637	0.38
638	0.38
639	0.42
640	0.38
641	0.34
642	0.33
643	0.35
644	0.34
645	0.3
646	0.34
647	0.29
648	0.34
649	0.34
650	0.33
651	0.33
652	0.33
653	0.32
654	0.27
655	0.28
656	0.24
657	0.25
658	0.31
659	0.3
660	0.27
661	0.27
662	0.26
663	0.24
664	0.22
665	0.17
666	0.11
667	0.12
668	0.12
669	0.1
670	0.08
671	0.08
672	0.09
673	0.1
674	0.09
675	0.1
676	0.12
677	0.14
678	0.16
679	0.17
680	0.17
681	0.19
682	0.23
683	0.23
684	0.27
685	0.31
686	0.35
687	0.45
688	0.53
689	0.58
690	0.62
691	0.7
692	0.74
693	0.77
694	0.79
695	0.78
696	0.77
697	0.72
698	0.65
699	0.62
700	0.54
701	0.48
702	0.45
703	0.41
704	0.42
705	0.46
706	0.47
707	0.48
708	0.51
709	0.54
710	0.55
711	0.53
712	0.49
713	0.46
714	0.49
715	0.48

U1GAF2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer