Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1HSX0

Protein Details
Accession U1HSX0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
67-91VDDDPPAKRRKPNLSKRQQDEQEDDAcidic
99-126VEFVSERAKGQRRKKKKAVEPVLPNVSHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
105-115RAKGQRRKKKK
Subcellular Location(s) cyto 12, cyto_nucl 10.5, nucl 7, mito 3, E.R. 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028884  Trm82  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0036265  P:RNA (guanine-N7)-methylation  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Amino Acid Sequences MTTPPCHPFQKLCCISQSGDIHLLLVATGPHILSLDLKNGGIVSKWPNDAVQSAERQSLEELGNGIVDDDPPAKRRKPNLSKRQQDEQEDDSRDSSISVEFVSERAKGQRRKKKKAVEPVLPNVSHIIATLDGLRVVATTAEDKCIRVFELGSSGQLTLLSERHNDRDKFGDVYALPLHPSLEKATALPSKPQLQKTKPMKPSASELTVHTKGNLEALRQQKLQNASASKKTAPTFEHRLILGHVSLLTDLVVGTDPSNDSREYILTADRDEHIRVSRGIPQAHVIKNYCLGHTEFVSKLCTVPDLPQILISGGGEPSLRIYDWLRGTCVAAASLEEDLKHLISSSAFNGLISSGIRAVSCIQAMKVRDTDDLGDVIMIVVAFEGIPGISTYLFHPEKCLLKQDRQYVMDANVLDIVLLKESGLMLVSLDNVHSPLSTKEPTSHALAPAIRVFGLKLEKFDGEQQFGWVGYDPATGSHGTVHNGSFEDIASKLNQTLQSNDIRHEIELQSATKPNALYSPLGEFLYGLENLRKKSQGDGQEQEAEELAVTHPEER
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.5
3 0.5
4 0.46
5 0.4
6 0.38
7 0.35
8 0.31
9 0.27
10 0.25
11 0.16
12 0.14
13 0.09
14 0.06
15 0.07
16 0.06
17 0.06
18 0.07
19 0.07
20 0.1
21 0.12
22 0.15
23 0.16
24 0.16
25 0.16
26 0.16
27 0.16
28 0.13
29 0.15
30 0.17
31 0.21
32 0.22
33 0.23
34 0.24
35 0.25
36 0.26
37 0.27
38 0.26
39 0.26
40 0.27
41 0.3
42 0.29
43 0.29
44 0.28
45 0.27
46 0.23
47 0.19
48 0.17
49 0.14
50 0.14
51 0.12
52 0.12
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.1
57 0.12
58 0.16
59 0.23
60 0.28
61 0.35
62 0.44
63 0.53
64 0.62
65 0.71
66 0.78
67 0.83
68 0.88
69 0.87
70 0.89
71 0.85
72 0.8
73 0.75
74 0.7
75 0.67
76 0.6
77 0.55
78 0.45
79 0.38
80 0.32
81 0.26
82 0.21
83 0.13
84 0.1
85 0.08
86 0.09
87 0.08
88 0.09
89 0.11
90 0.11
91 0.12
92 0.2
93 0.29
94 0.37
95 0.47
96 0.57
97 0.66
98 0.76
99 0.84
100 0.87
101 0.87
102 0.9
103 0.89
104 0.88
105 0.85
106 0.83
107 0.8
108 0.7
109 0.6
110 0.5
111 0.41
112 0.31
113 0.22
114 0.15
115 0.08
116 0.08
117 0.09
118 0.08
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.06
123 0.06
124 0.05
125 0.05
126 0.08
127 0.08
128 0.12
129 0.13
130 0.14
131 0.14
132 0.15
133 0.15
134 0.13
135 0.13
136 0.1
137 0.15
138 0.14
139 0.15
140 0.14
141 0.13
142 0.12
143 0.12
144 0.12
145 0.08
146 0.09
147 0.1
148 0.13
149 0.15
150 0.2
151 0.28
152 0.29
153 0.29
154 0.33
155 0.33
156 0.32
157 0.3
158 0.28
159 0.2
160 0.23
161 0.22
162 0.18
163 0.16
164 0.14
165 0.15
166 0.11
167 0.12
168 0.1
169 0.11
170 0.11
171 0.1
172 0.15
173 0.19
174 0.2
175 0.21
176 0.23
177 0.3
178 0.35
179 0.42
180 0.46
181 0.46
182 0.55
183 0.61
184 0.68
185 0.66
186 0.68
187 0.63
188 0.56
189 0.58
190 0.53
191 0.47
192 0.38
193 0.33
194 0.34
195 0.34
196 0.32
197 0.26
198 0.22
199 0.19
200 0.23
201 0.21
202 0.15
203 0.19
204 0.23
205 0.26
206 0.27
207 0.28
208 0.27
209 0.3
210 0.31
211 0.3
212 0.3
213 0.29
214 0.32
215 0.34
216 0.31
217 0.31
218 0.3
219 0.29
220 0.27
221 0.3
222 0.33
223 0.33
224 0.34
225 0.29
226 0.29
227 0.27
228 0.25
229 0.18
230 0.11
231 0.09
232 0.07
233 0.07
234 0.06
235 0.05
236 0.04
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.04
242 0.04
243 0.05
244 0.06
245 0.07
246 0.07
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.09
251 0.09
252 0.1
253 0.09
254 0.1
255 0.1
256 0.1
257 0.11
258 0.11
259 0.11
260 0.11
261 0.12
262 0.12
263 0.13
264 0.18
265 0.21
266 0.21
267 0.2
268 0.22
269 0.27
270 0.27
271 0.29
272 0.23
273 0.2
274 0.25
275 0.25
276 0.22
277 0.18
278 0.17
279 0.15
280 0.15
281 0.17
282 0.12
283 0.13
284 0.14
285 0.12
286 0.12
287 0.11
288 0.11
289 0.09
290 0.1
291 0.14
292 0.14
293 0.14
294 0.14
295 0.14
296 0.13
297 0.13
298 0.1
299 0.07
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.04
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.06
308 0.07
309 0.12
310 0.15
311 0.15
312 0.16
313 0.16
314 0.16
315 0.16
316 0.15
317 0.1
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.05
329 0.05
330 0.06
331 0.07
332 0.07
333 0.1
334 0.1
335 0.1
336 0.09
337 0.09
338 0.09
339 0.08
340 0.08
341 0.05
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.07
346 0.08
347 0.08
348 0.08
349 0.08
350 0.12
351 0.14
352 0.16
353 0.17
354 0.17
355 0.17
356 0.18
357 0.18
358 0.16
359 0.15
360 0.12
361 0.1
362 0.08
363 0.07
364 0.06
365 0.04
366 0.03
367 0.03
368 0.03
369 0.02
370 0.02
371 0.02
372 0.02
373 0.03
374 0.03
375 0.04
376 0.04
377 0.05
378 0.05
379 0.14
380 0.15
381 0.14
382 0.17
383 0.2
384 0.25
385 0.26
386 0.34
387 0.31
388 0.38
389 0.45
390 0.51
391 0.54
392 0.52
393 0.52
394 0.45
395 0.42
396 0.38
397 0.31
398 0.23
399 0.17
400 0.14
401 0.12
402 0.11
403 0.09
404 0.06
405 0.06
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.05
410 0.04
411 0.04
412 0.04
413 0.04
414 0.05
415 0.05
416 0.05
417 0.06
418 0.06
419 0.06
420 0.06
421 0.07
422 0.08
423 0.14
424 0.15
425 0.16
426 0.19
427 0.22
428 0.24
429 0.28
430 0.29
431 0.25
432 0.28
433 0.27
434 0.27
435 0.25
436 0.23
437 0.18
438 0.16
439 0.15
440 0.15
441 0.21
442 0.19
443 0.2
444 0.22
445 0.22
446 0.24
447 0.31
448 0.31
449 0.27
450 0.27
451 0.26
452 0.25
453 0.24
454 0.23
455 0.16
456 0.13
457 0.1
458 0.11
459 0.09
460 0.09
461 0.11
462 0.1
463 0.1
464 0.13
465 0.14
466 0.15
467 0.17
468 0.17
469 0.17
470 0.17
471 0.18
472 0.14
473 0.13
474 0.12
475 0.11
476 0.12
477 0.11
478 0.12
479 0.12
480 0.16
481 0.21
482 0.21
483 0.23
484 0.27
485 0.34
486 0.34
487 0.35
488 0.35
489 0.32
490 0.31
491 0.32
492 0.28
493 0.24
494 0.26
495 0.25
496 0.25
497 0.27
498 0.28
499 0.26
500 0.26
501 0.22
502 0.22
503 0.24
504 0.21
505 0.19
506 0.22
507 0.22
508 0.22
509 0.2
510 0.17
511 0.15
512 0.18
513 0.16
514 0.14
515 0.18
516 0.22
517 0.25
518 0.3
519 0.32
520 0.29
521 0.35
522 0.42
523 0.45
524 0.49
525 0.52
526 0.53
527 0.56
528 0.56
529 0.5
530 0.42
531 0.33
532 0.24
533 0.2
534 0.15
535 0.1