Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

U1HMF6

Protein Details
Accession U1HMF6    Localization Confidence High Confidence Score 27
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-22AEPFSKKRKVKDDDTSPHAPRBasic
33-59QSDPRYRLPGKRRTHVKVDKRFSHMLRBasic
463-493ETTVEKYARKERERKQKRKEKMRHNRDGVGSBasic
527-547VSAARMRKEERLRKRAEREAEBasic
580-610AIEREEKIAKKKGKKGKGKKEFDTEKKSQKABasic
682-701TDDVRKLVEKVKSKKKDRRABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
470-486ARKERERKQKRKEKMRH
532-542MRKEERLRKRA
583-600REEKIAKKKGKKGKGKKE
691-701KVKSKKKDRRA
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039754  Esf1  
IPR012580  NUC153  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08159  NUC153  
Amino Acid Sequences MAEPFSKKRKVKDDDTSPHAPRSITDPRFSNIQSDPRYRLPGKRRTHVKVDKRFSHMLRDDDFGRKAKVDRYGRPLEADMERKRLKRRYEFEDRLDDDDDVQKELQRVEKAFDPIRDGGYPQSSSSEESSSDEDEVDENERGQLVALGNQQGGEIPMGEVSSRVAVVNLDWDNIHAADLMAVFSSFLPSGGRLLNVSIYPSQFGKERMEREETEGPPKEIFTSVKEDTAGPAAVMDDDDEQQIKDSIVQADTGEDFDSAALRRYQLQRLQYFYAILAFSSPDVAKAVYDAVDGTEYLTTANFFDLRFVPDDTDFSDDKPREECEKIPDGYKPNEFVTDALQHSNVKLTWDAEDASRKEAQAKAFRGSRKDIDENDLKAYLGSDSSSDEEAHLDLEAVVGSSLSKKEQERQKMRALLGLEDEPKRKSKSNDGPIGELQITFSSGLSGANGIKKSVFENEPQVEETTVEKYARKERERKQKRKEKMRHNRDGVGSIIDGKLPDGKTSDEPPEDLGFDDPFFAAPEHDKVSAARMRKEERLRKRAEREAEEAATAAKRAELELLMVDDKDDDGKGIRHFDMKAIEREEKIAKKKGKKGKGKKEFDTEKKSQKAGFEMDTHDPRFSRLYENHEFAIDPTNPRFKGTEGMKALLEEGRKYRKKDTNLEDAGFGTMLKGSSSMANHETDDVRKLVEKVKSKKKDRRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.81
3 0.81
4 0.74
5 0.69
6 0.62
7 0.51
8 0.41
9 0.41
10 0.44
11 0.39
12 0.42
13 0.41
14 0.41
15 0.47
16 0.46
17 0.44
18 0.39
19 0.44
20 0.46
21 0.49
22 0.52
23 0.51
24 0.59
25 0.58
26 0.61
27 0.62
28 0.65
29 0.68
30 0.72
31 0.77
32 0.75
33 0.82
34 0.83
35 0.84
36 0.85
37 0.86
38 0.84
39 0.81
40 0.82
41 0.73
42 0.73
43 0.68
44 0.63
45 0.56
46 0.52
47 0.48
48 0.46
49 0.48
50 0.41
51 0.37
52 0.34
53 0.35
54 0.37
55 0.43
56 0.45
57 0.48
58 0.54
59 0.59
60 0.57
61 0.57
62 0.53
63 0.48
64 0.47
65 0.48
66 0.43
67 0.45
68 0.5
69 0.52
70 0.6
71 0.63
72 0.66
73 0.68
74 0.72
75 0.71
76 0.76
77 0.78
78 0.76
79 0.77
80 0.7
81 0.63
82 0.58
83 0.49
84 0.4
85 0.38
86 0.33
87 0.25
88 0.23
89 0.21
90 0.21
91 0.23
92 0.27
93 0.25
94 0.26
95 0.27
96 0.31
97 0.35
98 0.37
99 0.37
100 0.36
101 0.33
102 0.35
103 0.32
104 0.28
105 0.26
106 0.26
107 0.26
108 0.21
109 0.22
110 0.2
111 0.22
112 0.23
113 0.21
114 0.17
115 0.18
116 0.2
117 0.19
118 0.18
119 0.16
120 0.14
121 0.13
122 0.13
123 0.14
124 0.12
125 0.11
126 0.11
127 0.11
128 0.1
129 0.1
130 0.11
131 0.08
132 0.12
133 0.14
134 0.15
135 0.15
136 0.15
137 0.15
138 0.12
139 0.12
140 0.09
141 0.07
142 0.05
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.12
155 0.11
156 0.11
157 0.11
158 0.11
159 0.13
160 0.13
161 0.13
162 0.07
163 0.07
164 0.06
165 0.07
166 0.06
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.06
172 0.05
173 0.05
174 0.06
175 0.06
176 0.08
177 0.09
178 0.09
179 0.08
180 0.09
181 0.1
182 0.1
183 0.12
184 0.12
185 0.12
186 0.13
187 0.13
188 0.13
189 0.14
190 0.16
191 0.21
192 0.25
193 0.28
194 0.31
195 0.36
196 0.35
197 0.4
198 0.45
199 0.4
200 0.42
201 0.41
202 0.38
203 0.33
204 0.32
205 0.27
206 0.22
207 0.21
208 0.16
209 0.21
210 0.2
211 0.21
212 0.21
213 0.2
214 0.19
215 0.2
216 0.16
217 0.09
218 0.09
219 0.08
220 0.07
221 0.07
222 0.06
223 0.05
224 0.06
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.08
229 0.08
230 0.07
231 0.07
232 0.09
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.09
237 0.1
238 0.1
239 0.1
240 0.08
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.07
245 0.06
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.13
250 0.16
251 0.22
252 0.25
253 0.32
254 0.33
255 0.37
256 0.39
257 0.35
258 0.32
259 0.26
260 0.24
261 0.16
262 0.13
263 0.09
264 0.07
265 0.06
266 0.08
267 0.07
268 0.06
269 0.06
270 0.07
271 0.06
272 0.06
273 0.07
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.07
291 0.08
292 0.1
293 0.11
294 0.11
295 0.12
296 0.12
297 0.12
298 0.12
299 0.15
300 0.13
301 0.13
302 0.19
303 0.18
304 0.19
305 0.2
306 0.21
307 0.22
308 0.23
309 0.24
310 0.22
311 0.27
312 0.27
313 0.27
314 0.29
315 0.28
316 0.3
317 0.29
318 0.26
319 0.21
320 0.22
321 0.2
322 0.17
323 0.15
324 0.16
325 0.15
326 0.14
327 0.14
328 0.13
329 0.13
330 0.14
331 0.11
332 0.09
333 0.09
334 0.09
335 0.09
336 0.09
337 0.1
338 0.09
339 0.14
340 0.14
341 0.16
342 0.16
343 0.15
344 0.17
345 0.19
346 0.22
347 0.25
348 0.26
349 0.28
350 0.32
351 0.34
352 0.35
353 0.36
354 0.35
355 0.33
356 0.34
357 0.31
358 0.32
359 0.34
360 0.32
361 0.3
362 0.27
363 0.21
364 0.18
365 0.17
366 0.11
367 0.07
368 0.06
369 0.05
370 0.06
371 0.07
372 0.08
373 0.08
374 0.08
375 0.08
376 0.08
377 0.08
378 0.06
379 0.05
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.03
384 0.03
385 0.03
386 0.03
387 0.04
388 0.05
389 0.05
390 0.09
391 0.1
392 0.18
393 0.25
394 0.36
395 0.42
396 0.47
397 0.54
398 0.56
399 0.55
400 0.51
401 0.44
402 0.35
403 0.29
404 0.26
405 0.22
406 0.2
407 0.21
408 0.2
409 0.23
410 0.25
411 0.27
412 0.28
413 0.35
414 0.43
415 0.51
416 0.57
417 0.55
418 0.56
419 0.51
420 0.51
421 0.4
422 0.3
423 0.21
424 0.13
425 0.12
426 0.08
427 0.08
428 0.05
429 0.05
430 0.05
431 0.05
432 0.06
433 0.07
434 0.1
435 0.1
436 0.1
437 0.1
438 0.11
439 0.12
440 0.16
441 0.17
442 0.15
443 0.22
444 0.24
445 0.25
446 0.26
447 0.25
448 0.2
449 0.19
450 0.18
451 0.14
452 0.14
453 0.13
454 0.14
455 0.17
456 0.25
457 0.33
458 0.39
459 0.47
460 0.54
461 0.65
462 0.74
463 0.82
464 0.85
465 0.86
466 0.89
467 0.91
468 0.92
469 0.92
470 0.92
471 0.92
472 0.91
473 0.87
474 0.82
475 0.73
476 0.66
477 0.55
478 0.45
479 0.34
480 0.25
481 0.2
482 0.14
483 0.12
484 0.1
485 0.13
486 0.12
487 0.13
488 0.12
489 0.15
490 0.17
491 0.21
492 0.26
493 0.22
494 0.22
495 0.24
496 0.23
497 0.21
498 0.19
499 0.17
500 0.13
501 0.12
502 0.12
503 0.09
504 0.08
505 0.09
506 0.08
507 0.08
508 0.09
509 0.12
510 0.14
511 0.14
512 0.15
513 0.14
514 0.2
515 0.23
516 0.25
517 0.28
518 0.31
519 0.35
520 0.43
521 0.53
522 0.57
523 0.64
524 0.7
525 0.73
526 0.76
527 0.8
528 0.8
529 0.79
530 0.74
531 0.68
532 0.64
533 0.57
534 0.47
535 0.39
536 0.32
537 0.24
538 0.18
539 0.13
540 0.09
541 0.08
542 0.08
543 0.09
544 0.08
545 0.08
546 0.08
547 0.1
548 0.1
549 0.1
550 0.09
551 0.08
552 0.08
553 0.08
554 0.08
555 0.07
556 0.08
557 0.11
558 0.14
559 0.18
560 0.19
561 0.21
562 0.22
563 0.24
564 0.3
565 0.31
566 0.35
567 0.36
568 0.38
569 0.35
570 0.39
571 0.43
572 0.43
573 0.46
574 0.49
575 0.53
576 0.59
577 0.68
578 0.74
579 0.77
580 0.81
581 0.85
582 0.87
583 0.9
584 0.9
585 0.87
586 0.88
587 0.88
588 0.86
589 0.84
590 0.81
591 0.8
592 0.77
593 0.73
594 0.65
595 0.58
596 0.54
597 0.49
598 0.44
599 0.38
600 0.37
601 0.41
602 0.44
603 0.43
604 0.39
605 0.35
606 0.33
607 0.33
608 0.3
609 0.31
610 0.29
611 0.36
612 0.41
613 0.44
614 0.42
615 0.4
616 0.38
617 0.31
618 0.34
619 0.28
620 0.25
621 0.27
622 0.34
623 0.34
624 0.36
625 0.36
626 0.3
627 0.36
628 0.36
629 0.4
630 0.36
631 0.38
632 0.36
633 0.35
634 0.36
635 0.3
636 0.28
637 0.22
638 0.26
639 0.34
640 0.4
641 0.44
642 0.53
643 0.58
644 0.65
645 0.72
646 0.72
647 0.72
648 0.73
649 0.7
650 0.61
651 0.53
652 0.45
653 0.35
654 0.27
655 0.17
656 0.11
657 0.1
658 0.09
659 0.08
660 0.08
661 0.12
662 0.13
663 0.18
664 0.19
665 0.2
666 0.21
667 0.24
668 0.26
669 0.24
670 0.27
671 0.23
672 0.22
673 0.24
674 0.26
675 0.3
676 0.35
677 0.43
678 0.49
679 0.6
680 0.69
681 0.76