Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

U1GK60

Protein Details
Accession U1GK60    Localization Confidence High Confidence Score 19.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
268-289SDEPARKRTRSPKKKSTTITGLHydrophilic
653-675HDVSARPTPKTKKPRGRLKSEGABasic
705-726PQEKTKKPSKSAQSRVKKAKEVHydrophilic
832-851GDTPKRAKTKVKPTAFRSSTHydrophilic
958-979RGGWRGKSVKGARRQGRGKEIEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
94-94K
262-282PKPSRGSDEPARKRTRSPKKK
329-347KRKGSAKNPKALKKAPRKS
659-687PTPKTKKPRGRLKSEGAGASSPENRSSKT
710-722KKPSKSAQSRVKK
962-975RGKSVKGARRQGRG
Subcellular Location(s) mito 14.5, mito_nucl 13, nucl 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027784  Slx4_ascomycetes  
IPR018574  Structure-sp_endonuc_su_Slx4  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006996  P:organelle organization  
Pfam View protein in Pfam  
PF09494  Slx4  
CDD cd22999  SAP_SLX4  
Amino Acid Sequences MSIVGGVILLSSSPPRLLARSPTPADNTASSPALPSPETIFASQRSKGSQNGFAAPWTGPTGLDRNRKFKTTSTFRERVGSGLSSSKKLPLKEKANKGNLPMVRRAQGLKKGLGSEKHYFQRPVSPEENRLGEKDKIKDVGTTRSQACDSSHHELKAQPKAAEAYRPREPSPLGLDKASSRRLDWTPPACHSNQNSPGTAPASFSENLLGSFGYNAAAIGPKDSLVPKDDSESNPTKRRKLDVVDVGALGTAAAMKASKLFPKPSRGSDEPARKRTRSPKKKSTTITGLATSHYFGEETSEKSPMMQYLSATQQRALGLDSDTAPDTAKRKGSAKNPKALKKAPRKSTLRSPQSAIKAFDDQDMLFGSASQLAGDESPMFIRDTVQAMKQSENTILISDPVSTQITIPTSEPAETPRRHHKCGVSRFVKSKNLWSVAGRDVDNALLQVDTVDMFDSPDLRTAFAGKDVLLEPGAPRFRDSTSPEKQVGIGQDPMRTCIMTDDCLSMGWDEGNLSSLHDSRGILDIDELKLKTPCAMRRPQIPVQVRALHAAAVGRTCTGQARGPTNKLSEAPAERIPNPQPIRPSFTGLTTNQLATQLAAYGFKPIKKREKMIEVLNRCWDDKHPSVSGADSVATITGETIETSHGDFLTKLHDVSARPTPKTKKPRGRLKSEGAGASSPENRSSKTSRTKKSAGEMINVDGNLPQEKTKKPSKSAQSRVKKAKEVTVTSLVKPQAKSPLKSRYKVNKATISDEPVMDVDDIESSDNSILDDVAQVQSCRTGVKRANTVRRHCSPTNPPSSYAFETASWLEQEPEASEPETTILEAAMPINGDTPKRAKTKVKPTAFRSSTATMTTPAAPLPVITANPSPSSPSQPALSKQITLAITTFQPPPSTLQHNSQQNPTFHQKILMYDPIILEDLAAWLNTEGFKCIGEDREVGPIEVREWCEDRGICCLWRGGWRGKSVKGARRQGRGKEIEEHGLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.13
3 0.16
4 0.2
5 0.27
6 0.34
7 0.41
8 0.44
9 0.47
10 0.5
11 0.5
12 0.5
13 0.44
14 0.39
15 0.35
16 0.32
17 0.27
18 0.24
19 0.23
20 0.22
21 0.2
22 0.18
23 0.18
24 0.22
25 0.24
26 0.24
27 0.26
28 0.28
29 0.33
30 0.34
31 0.33
32 0.34
33 0.35
34 0.39
35 0.41
36 0.44
37 0.43
38 0.44
39 0.42
40 0.37
41 0.36
42 0.3
43 0.27
44 0.22
45 0.18
46 0.14
47 0.16
48 0.23
49 0.3
50 0.39
51 0.43
52 0.49
53 0.53
54 0.57
55 0.57
56 0.56
57 0.59
58 0.59
59 0.64
60 0.65
61 0.66
62 0.64
63 0.66
64 0.6
65 0.51
66 0.45
67 0.36
68 0.29
69 0.31
70 0.32
71 0.29
72 0.3
73 0.35
74 0.35
75 0.38
76 0.44
77 0.46
78 0.54
79 0.61
80 0.71
81 0.74
82 0.79
83 0.78
84 0.74
85 0.72
86 0.66
87 0.61
88 0.58
89 0.53
90 0.46
91 0.46
92 0.46
93 0.45
94 0.49
95 0.49
96 0.45
97 0.44
98 0.45
99 0.48
100 0.49
101 0.49
102 0.46
103 0.49
104 0.52
105 0.54
106 0.52
107 0.48
108 0.51
109 0.48
110 0.5
111 0.49
112 0.48
113 0.47
114 0.49
115 0.53
116 0.45
117 0.44
118 0.42
119 0.41
120 0.42
121 0.41
122 0.41
123 0.4
124 0.39
125 0.41
126 0.4
127 0.43
128 0.41
129 0.43
130 0.39
131 0.39
132 0.39
133 0.35
134 0.34
135 0.31
136 0.33
137 0.35
138 0.38
139 0.36
140 0.37
141 0.39
142 0.45
143 0.48
144 0.46
145 0.38
146 0.36
147 0.39
148 0.39
149 0.44
150 0.42
151 0.4
152 0.43
153 0.46
154 0.45
155 0.45
156 0.44
157 0.4
158 0.42
159 0.43
160 0.37
161 0.34
162 0.34
163 0.35
164 0.4
165 0.41
166 0.34
167 0.28
168 0.32
169 0.33
170 0.38
171 0.42
172 0.44
173 0.43
174 0.46
175 0.5
176 0.45
177 0.5
178 0.48
179 0.49
180 0.5
181 0.48
182 0.45
183 0.41
184 0.42
185 0.37
186 0.33
187 0.25
188 0.17
189 0.17
190 0.17
191 0.16
192 0.15
193 0.14
194 0.14
195 0.13
196 0.12
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.06
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.07
205 0.07
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.1
210 0.11
211 0.12
212 0.14
213 0.17
214 0.16
215 0.2
216 0.24
217 0.24
218 0.3
219 0.36
220 0.4
221 0.46
222 0.51
223 0.53
224 0.53
225 0.56
226 0.55
227 0.53
228 0.55
229 0.55
230 0.54
231 0.49
232 0.45
233 0.4
234 0.33
235 0.27
236 0.18
237 0.09
238 0.05
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.06
244 0.08
245 0.13
246 0.16
247 0.24
248 0.28
249 0.38
250 0.42
251 0.45
252 0.52
253 0.5
254 0.53
255 0.55
256 0.62
257 0.62
258 0.67
259 0.68
260 0.61
261 0.66
262 0.71
263 0.73
264 0.73
265 0.74
266 0.76
267 0.78
268 0.85
269 0.82
270 0.8
271 0.77
272 0.71
273 0.63
274 0.56
275 0.47
276 0.39
277 0.35
278 0.27
279 0.19
280 0.14
281 0.1
282 0.07
283 0.11
284 0.12
285 0.14
286 0.15
287 0.16
288 0.16
289 0.16
290 0.17
291 0.14
292 0.15
293 0.13
294 0.12
295 0.14
296 0.2
297 0.24
298 0.23
299 0.22
300 0.22
301 0.21
302 0.21
303 0.19
304 0.13
305 0.11
306 0.11
307 0.11
308 0.1
309 0.11
310 0.1
311 0.1
312 0.11
313 0.12
314 0.15
315 0.17
316 0.18
317 0.22
318 0.28
319 0.38
320 0.47
321 0.52
322 0.56
323 0.62
324 0.67
325 0.7
326 0.71
327 0.71
328 0.71
329 0.74
330 0.74
331 0.76
332 0.74
333 0.72
334 0.76
335 0.77
336 0.73
337 0.66
338 0.61
339 0.58
340 0.59
341 0.57
342 0.49
343 0.4
344 0.36
345 0.33
346 0.31
347 0.26
348 0.19
349 0.16
350 0.14
351 0.12
352 0.09
353 0.08
354 0.07
355 0.07
356 0.07
357 0.06
358 0.05
359 0.04
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.04
364 0.05
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.07
369 0.08
370 0.1
371 0.12
372 0.13
373 0.16
374 0.17
375 0.19
376 0.19
377 0.19
378 0.17
379 0.17
380 0.15
381 0.12
382 0.11
383 0.1
384 0.09
385 0.08
386 0.07
387 0.08
388 0.08
389 0.08
390 0.08
391 0.09
392 0.09
393 0.1
394 0.1
395 0.1
396 0.1
397 0.1
398 0.1
399 0.13
400 0.19
401 0.2
402 0.24
403 0.34
404 0.39
405 0.42
406 0.46
407 0.5
408 0.52
409 0.59
410 0.65
411 0.59
412 0.58
413 0.6
414 0.6
415 0.6
416 0.52
417 0.49
418 0.45
419 0.42
420 0.39
421 0.35
422 0.33
423 0.29
424 0.3
425 0.24
426 0.18
427 0.16
428 0.15
429 0.14
430 0.1
431 0.07
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.03
436 0.03
437 0.03
438 0.04
439 0.03
440 0.04
441 0.04
442 0.05
443 0.05
444 0.09
445 0.09
446 0.09
447 0.09
448 0.11
449 0.11
450 0.11
451 0.11
452 0.07
453 0.08
454 0.08
455 0.09
456 0.08
457 0.08
458 0.07
459 0.11
460 0.12
461 0.11
462 0.11
463 0.12
464 0.13
465 0.18
466 0.22
467 0.26
468 0.3
469 0.34
470 0.34
471 0.33
472 0.32
473 0.3
474 0.27
475 0.2
476 0.19
477 0.16
478 0.18
479 0.18
480 0.19
481 0.17
482 0.15
483 0.13
484 0.12
485 0.12
486 0.1
487 0.11
488 0.1
489 0.1
490 0.1
491 0.1
492 0.08
493 0.07
494 0.05
495 0.04
496 0.04
497 0.04
498 0.05
499 0.05
500 0.05
501 0.06
502 0.06
503 0.07
504 0.08
505 0.08
506 0.07
507 0.1
508 0.1
509 0.09
510 0.09
511 0.1
512 0.1
513 0.12
514 0.11
515 0.09
516 0.1
517 0.1
518 0.12
519 0.15
520 0.19
521 0.23
522 0.3
523 0.32
524 0.39
525 0.46
526 0.47
527 0.52
528 0.51
529 0.48
530 0.47
531 0.47
532 0.41
533 0.35
534 0.3
535 0.21
536 0.18
537 0.15
538 0.1
539 0.08
540 0.07
541 0.06
542 0.06
543 0.06
544 0.06
545 0.08
546 0.1
547 0.12
548 0.19
549 0.22
550 0.25
551 0.27
552 0.27
553 0.27
554 0.25
555 0.24
556 0.21
557 0.2
558 0.21
559 0.22
560 0.23
561 0.23
562 0.26
563 0.26
564 0.31
565 0.31
566 0.3
567 0.32
568 0.32
569 0.38
570 0.35
571 0.38
572 0.3
573 0.3
574 0.32
575 0.27
576 0.29
577 0.22
578 0.21
579 0.17
580 0.17
581 0.15
582 0.11
583 0.1
584 0.07
585 0.06
586 0.07
587 0.07
588 0.11
589 0.12
590 0.15
591 0.2
592 0.26
593 0.36
594 0.4
595 0.45
596 0.46
597 0.52
598 0.53
599 0.57
600 0.6
601 0.55
602 0.53
603 0.54
604 0.49
605 0.42
606 0.38
607 0.32
608 0.3
609 0.29
610 0.3
611 0.25
612 0.25
613 0.25
614 0.25
615 0.23
616 0.16
617 0.13
618 0.09
619 0.07
620 0.07
621 0.06
622 0.05
623 0.04
624 0.04
625 0.04
626 0.04
627 0.04
628 0.05
629 0.05
630 0.06
631 0.07
632 0.06
633 0.07
634 0.07
635 0.07
636 0.1
637 0.1
638 0.1
639 0.1
640 0.13
641 0.13
642 0.17
643 0.26
644 0.26
645 0.27
646 0.34
647 0.39
648 0.46
649 0.57
650 0.64
651 0.65
652 0.71
653 0.81
654 0.83
655 0.85
656 0.84
657 0.8
658 0.76
659 0.7
660 0.61
661 0.51
662 0.43
663 0.35
664 0.29
665 0.25
666 0.19
667 0.2
668 0.19
669 0.19
670 0.23
671 0.27
672 0.33
673 0.4
674 0.49
675 0.52
676 0.59
677 0.63
678 0.62
679 0.64
680 0.63
681 0.55
682 0.5
683 0.44
684 0.38
685 0.35
686 0.31
687 0.25
688 0.18
689 0.16
690 0.13
691 0.12
692 0.14
693 0.16
694 0.2
695 0.25
696 0.34
697 0.39
698 0.43
699 0.51
700 0.59
701 0.65
702 0.72
703 0.77
704 0.78
705 0.82
706 0.86
707 0.83
708 0.8
709 0.71
710 0.68
711 0.65
712 0.59
713 0.54
714 0.54
715 0.5
716 0.44
717 0.47
718 0.43
719 0.4
720 0.36
721 0.33
722 0.35
723 0.39
724 0.41
725 0.43
726 0.51
727 0.54
728 0.58
729 0.65
730 0.65
731 0.69
732 0.74
733 0.74
734 0.72
735 0.67
736 0.68
737 0.62
738 0.57
739 0.49
740 0.4
741 0.33
742 0.25
743 0.23
744 0.18
745 0.14
746 0.08
747 0.07
748 0.07
749 0.07
750 0.07
751 0.07
752 0.07
753 0.07
754 0.07
755 0.06
756 0.06
757 0.05
758 0.06
759 0.06
760 0.08
761 0.09
762 0.09
763 0.09
764 0.1
765 0.11
766 0.12
767 0.12
768 0.19
769 0.24
770 0.3
771 0.39
772 0.47
773 0.57
774 0.64
775 0.71
776 0.71
777 0.73
778 0.74
779 0.67
780 0.66
781 0.66
782 0.67
783 0.7
784 0.63
785 0.59
786 0.55
787 0.59
788 0.53
789 0.46
790 0.38
791 0.28
792 0.28
793 0.26
794 0.24
795 0.19
796 0.16
797 0.15
798 0.13
799 0.13
800 0.12
801 0.12
802 0.12
803 0.12
804 0.11
805 0.1
806 0.11
807 0.11
808 0.1
809 0.08
810 0.06
811 0.06
812 0.06
813 0.06
814 0.06
815 0.06
816 0.06
817 0.08
818 0.1
819 0.11
820 0.14
821 0.18
822 0.24
823 0.29
824 0.35
825 0.42
826 0.5
827 0.61
828 0.68
829 0.74
830 0.76
831 0.78
832 0.83
833 0.76
834 0.69
835 0.63
836 0.56
837 0.48
838 0.42
839 0.37
840 0.27
841 0.27
842 0.26
843 0.2
844 0.17
845 0.15
846 0.12
847 0.11
848 0.12
849 0.12
850 0.11
851 0.14
852 0.16
853 0.18
854 0.19
855 0.2
856 0.22
857 0.22
858 0.28
859 0.28
860 0.28
861 0.3
862 0.33
863 0.36
864 0.39
865 0.39
866 0.33
867 0.31
868 0.35
869 0.31
870 0.28
871 0.25
872 0.19
873 0.18
874 0.2
875 0.23
876 0.18
877 0.18
878 0.18
879 0.22
880 0.26
881 0.31
882 0.32
883 0.37
884 0.44
885 0.52
886 0.54
887 0.58
888 0.6
889 0.55
890 0.58
891 0.59
892 0.55
893 0.47
894 0.48
895 0.42
896 0.39
897 0.42
898 0.41
899 0.34
900 0.31
901 0.3
902 0.27
903 0.26
904 0.21
905 0.15
906 0.1
907 0.1
908 0.09
909 0.08
910 0.07
911 0.06
912 0.08
913 0.09
914 0.1
915 0.1
916 0.11
917 0.11
918 0.12
919 0.15
920 0.18
921 0.19
922 0.21
923 0.21
924 0.28
925 0.28
926 0.27
927 0.26
928 0.24
929 0.22
930 0.24
931 0.25
932 0.22
933 0.24
934 0.25
935 0.29
936 0.3
937 0.3
938 0.31
939 0.32
940 0.28
941 0.28
942 0.29
943 0.25
944 0.31
945 0.36
946 0.39
947 0.42
948 0.49
949 0.53
950 0.55
951 0.62
952 0.64
953 0.67
954 0.68
955 0.73
956 0.72
957 0.77
958 0.81
959 0.8
960 0.81
961 0.79
962 0.73
963 0.71
964 0.67