Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1HPV3

Protein Details
Accession U1HPV3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
395-421LEKVEEKPKAKRPKKTKQRASYTHTSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
400-413EKPKAKRPKKTKQR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
Amino Acid Sequences METRIRRYFTFRKLNSQLPPTHHTTDELELIGVPYSSTDKGRAPVLSFAPRSKEVARTKDDLDVLAIYTIPYEAAVPGTPPVVGATPIKGNGPVKLQTSRRLSSGELLITTQDHQRTLSDIREGEYIIGRKEPKRTSRTISIKLPAHSKASASTRSSLAPALQMSNTTAEQSPRPRPELKPYRRHVPEPLNLHNGLATLESTHPDNPPRNRHSGNSTAAKAYLLSPSEVPLPLSPGKTLSSRTSLLSRGEEQNATIQALWKAEYARLVAIYGQDGVDRNIAELNRDPLAPFPEKKLSVESRSRGLSATSAGPPPLSPATIIPPLPSPRGSVTQELPFVDTASDYSSVKVPSLLSSEESSSSYTKRTSLFEADVPTTREEVSRIVESMRKNYLHALEKVEEKPKAKRPKKTKQRASYTHTSSAAMSAPARFPKGGRQSWHANTAPSTSAAEKQSKKGSNSKPKTTRDSNIAPLRTVVSKSSMKAKPPLHRADSTTLGSFFGSKREDQYPPSPERTPKASKPCRTGHIDEARPASNDSASSRTSSDNVAPEIDDFDIFYQDLARDSDPRSGNGKPAISTLHVPRTVELPAGRDTAAPPPPNIDWTPRKRTLLPAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.72
3 0.71
4 0.67
5 0.62
6 0.65
7 0.61
8 0.59
9 0.52
10 0.47
11 0.43
12 0.4
13 0.36
14 0.31
15 0.24
16 0.2
17 0.19
18 0.17
19 0.13
20 0.09
21 0.07
22 0.1
23 0.12
24 0.13
25 0.16
26 0.18
27 0.21
28 0.25
29 0.27
30 0.26
31 0.3
32 0.34
33 0.39
34 0.39
35 0.4
36 0.42
37 0.42
38 0.43
39 0.41
40 0.45
41 0.45
42 0.5
43 0.52
44 0.5
45 0.5
46 0.51
47 0.49
48 0.4
49 0.34
50 0.26
51 0.21
52 0.17
53 0.15
54 0.09
55 0.09
56 0.08
57 0.06
58 0.05
59 0.05
60 0.05
61 0.07
62 0.07
63 0.07
64 0.08
65 0.09
66 0.08
67 0.08
68 0.09
69 0.08
70 0.1
71 0.1
72 0.12
73 0.14
74 0.15
75 0.16
76 0.2
77 0.2
78 0.21
79 0.25
80 0.26
81 0.27
82 0.34
83 0.37
84 0.41
85 0.47
86 0.46
87 0.43
88 0.42
89 0.39
90 0.36
91 0.37
92 0.3
93 0.23
94 0.21
95 0.2
96 0.19
97 0.19
98 0.19
99 0.17
100 0.16
101 0.16
102 0.16
103 0.2
104 0.22
105 0.23
106 0.22
107 0.21
108 0.22
109 0.23
110 0.23
111 0.2
112 0.22
113 0.21
114 0.17
115 0.21
116 0.24
117 0.26
118 0.34
119 0.41
120 0.45
121 0.5
122 0.55
123 0.57
124 0.63
125 0.69
126 0.68
127 0.66
128 0.65
129 0.63
130 0.6
131 0.58
132 0.49
133 0.44
134 0.38
135 0.33
136 0.3
137 0.31
138 0.34
139 0.31
140 0.31
141 0.29
142 0.29
143 0.29
144 0.25
145 0.2
146 0.17
147 0.15
148 0.15
149 0.13
150 0.13
151 0.13
152 0.15
153 0.14
154 0.13
155 0.14
156 0.14
157 0.18
158 0.24
159 0.31
160 0.33
161 0.38
162 0.41
163 0.43
164 0.52
165 0.59
166 0.62
167 0.64
168 0.65
169 0.71
170 0.71
171 0.71
172 0.68
173 0.66
174 0.63
175 0.6
176 0.6
177 0.54
178 0.5
179 0.46
180 0.38
181 0.29
182 0.23
183 0.16
184 0.1
185 0.07
186 0.07
187 0.08
188 0.09
189 0.1
190 0.12
191 0.17
192 0.24
193 0.3
194 0.39
195 0.43
196 0.49
197 0.5
198 0.51
199 0.52
200 0.52
201 0.51
202 0.47
203 0.43
204 0.37
205 0.35
206 0.31
207 0.26
208 0.2
209 0.16
210 0.12
211 0.11
212 0.11
213 0.11
214 0.13
215 0.12
216 0.12
217 0.09
218 0.13
219 0.14
220 0.15
221 0.14
222 0.14
223 0.15
224 0.16
225 0.19
226 0.17
227 0.19
228 0.19
229 0.21
230 0.22
231 0.22
232 0.23
233 0.23
234 0.23
235 0.22
236 0.23
237 0.22
238 0.2
239 0.2
240 0.19
241 0.17
242 0.14
243 0.12
244 0.11
245 0.11
246 0.12
247 0.1
248 0.1
249 0.1
250 0.11
251 0.1
252 0.09
253 0.09
254 0.08
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.07
263 0.08
264 0.07
265 0.07
266 0.09
267 0.09
268 0.1
269 0.1
270 0.12
271 0.11
272 0.11
273 0.11
274 0.1
275 0.15
276 0.16
277 0.16
278 0.17
279 0.21
280 0.22
281 0.23
282 0.27
283 0.26
284 0.29
285 0.34
286 0.32
287 0.31
288 0.31
289 0.31
290 0.25
291 0.22
292 0.17
293 0.12
294 0.13
295 0.11
296 0.11
297 0.1
298 0.1
299 0.1
300 0.11
301 0.1
302 0.08
303 0.07
304 0.07
305 0.1
306 0.13
307 0.13
308 0.11
309 0.14
310 0.16
311 0.17
312 0.17
313 0.15
314 0.15
315 0.2
316 0.21
317 0.21
318 0.21
319 0.22
320 0.23
321 0.22
322 0.21
323 0.16
324 0.14
325 0.12
326 0.09
327 0.07
328 0.07
329 0.08
330 0.07
331 0.08
332 0.1
333 0.1
334 0.1
335 0.1
336 0.09
337 0.09
338 0.11
339 0.11
340 0.1
341 0.11
342 0.12
343 0.12
344 0.12
345 0.13
346 0.12
347 0.12
348 0.13
349 0.12
350 0.14
351 0.15
352 0.16
353 0.18
354 0.2
355 0.21
356 0.22
357 0.23
358 0.23
359 0.23
360 0.23
361 0.2
362 0.18
363 0.16
364 0.14
365 0.13
366 0.12
367 0.13
368 0.12
369 0.12
370 0.13
371 0.16
372 0.17
373 0.2
374 0.24
375 0.21
376 0.21
377 0.24
378 0.28
379 0.29
380 0.3
381 0.3
382 0.28
383 0.32
384 0.34
385 0.36
386 0.34
387 0.32
388 0.37
389 0.42
390 0.52
391 0.55
392 0.61
393 0.67
394 0.74
395 0.83
396 0.87
397 0.89
398 0.88
399 0.91
400 0.89
401 0.87
402 0.85
403 0.8
404 0.74
405 0.64
406 0.55
407 0.44
408 0.37
409 0.29
410 0.21
411 0.16
412 0.12
413 0.13
414 0.14
415 0.16
416 0.15
417 0.15
418 0.23
419 0.31
420 0.35
421 0.36
422 0.39
423 0.46
424 0.49
425 0.56
426 0.48
427 0.4
428 0.36
429 0.35
430 0.31
431 0.23
432 0.22
433 0.16
434 0.19
435 0.22
436 0.28
437 0.28
438 0.32
439 0.4
440 0.44
441 0.47
442 0.52
443 0.59
444 0.63
445 0.68
446 0.74
447 0.75
448 0.76
449 0.8
450 0.77
451 0.71
452 0.67
453 0.64
454 0.63
455 0.62
456 0.56
457 0.48
458 0.42
459 0.4
460 0.34
461 0.3
462 0.22
463 0.2
464 0.22
465 0.23
466 0.31
467 0.33
468 0.35
469 0.42
470 0.48
471 0.51
472 0.57
473 0.64
474 0.6
475 0.6
476 0.6
477 0.57
478 0.55
479 0.48
480 0.41
481 0.33
482 0.28
483 0.25
484 0.22
485 0.17
486 0.18
487 0.18
488 0.17
489 0.21
490 0.26
491 0.29
492 0.32
493 0.4
494 0.42
495 0.45
496 0.5
497 0.51
498 0.5
499 0.52
500 0.55
501 0.55
502 0.56
503 0.62
504 0.66
505 0.69
506 0.72
507 0.74
508 0.73
509 0.72
510 0.69
511 0.68
512 0.67
513 0.64
514 0.6
515 0.58
516 0.53
517 0.47
518 0.43
519 0.34
520 0.25
521 0.23
522 0.21
523 0.21
524 0.2
525 0.21
526 0.21
527 0.21
528 0.21
529 0.23
530 0.24
531 0.24
532 0.24
533 0.23
534 0.22
535 0.21
536 0.21
537 0.19
538 0.14
539 0.11
540 0.11
541 0.11
542 0.11
543 0.1
544 0.1
545 0.09
546 0.11
547 0.13
548 0.14
549 0.16
550 0.19
551 0.27
552 0.27
553 0.3
554 0.32
555 0.31
556 0.36
557 0.38
558 0.38
559 0.31
560 0.31
561 0.31
562 0.3
563 0.34
564 0.34
565 0.37
566 0.37
567 0.37
568 0.36
569 0.35
570 0.33
571 0.32
572 0.27
573 0.22
574 0.22
575 0.24
576 0.23
577 0.22
578 0.22
579 0.26
580 0.32
581 0.3
582 0.28
583 0.31
584 0.32
585 0.37
586 0.37
587 0.39
588 0.42
589 0.49
590 0.58
591 0.6
592 0.64
593 0.62