Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

U1HPV3

Protein Details
Accession U1HPV3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
395-421LEKVEEKPKAKRPKKTKQRASYTHTSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
400-413EKPKAKRPKKTKQR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
Amino Acid Sequences METRIRRYFTFRKLNSQLPPTHHTTDELELIGVPYSSTDKGRAPVLSFAPRSKEVARTKDDLDVLAIYTIPYEAAVPGTPPVVGATPIKGNGPVKLQTSRRLSSGELLITTQDHQRTLSDIREGEYIIGRKEPKRTSRTISIKLPAHSKASASTRSSLAPALQMSNTTAEQSPRPRPELKPYRRHVPEPLNLHNGLATLESTHPDNPPRNRHSGNSTAAKAYLLSPSEVPLPLSPGKTLSSRTSLLSRGEEQNATIQALWKAEYARLVAIYGQDGVDRNIAELNRDPLAPFPEKKLSVESRSRGLSATSAGPPPLSPATIIPPLPSPRGSVTQELPFVDTASDYSSVKVPSLLSSEESSSSYTKRTSLFEADVPTTREEVSRIVESMRKNYLHALEKVEEKPKAKRPKKTKQRASYTHTSSAAMSAPARFPKGGRQSWHANTAPSTSAAEKQSKKGSNSKPKTTRDSNIAPLRTVVSKSSMKAKPPLHRADSTTLGSFFGSKREDQYPPSPERTPKASKPCRTGHIDEARPASNDSASSRTSSDNVAPEIDDFDIFYQDLARDSDPRSGNGKPAISTLHVPRTVELPAGRDTAAPPPPNIDWTPRKRTLLPAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.72
3 0.71
4 0.67
5 0.62
6 0.65
7 0.61
8 0.59
9 0.52
10 0.47
11 0.43
12 0.4
13 0.36
14 0.31
15 0.24
16 0.2
17 0.19
18 0.17
19 0.13
20 0.09
21 0.07
22 0.1
23 0.12
24 0.13
25 0.16
26 0.18
27 0.21
28 0.25
29 0.27
30 0.26
31 0.3
32 0.34
33 0.39
34 0.39
35 0.4
36 0.42
37 0.42
38 0.43
39 0.41
40 0.45
41 0.45
42 0.5
43 0.52
44 0.5
45 0.5
46 0.51
47 0.49
48 0.4
49 0.34
50 0.26
51 0.21
52 0.17
53 0.15
54 0.09
55 0.09
56 0.08
57 0.06
58 0.05
59 0.05
60 0.05
61 0.07
62 0.07
63 0.07
64 0.08
65 0.09
66 0.08
67 0.08
68 0.09
69 0.08
70 0.1
71 0.1
72 0.12
73 0.14
74 0.15
75 0.16
76 0.2
77 0.2
78 0.21
79 0.25
80 0.26
81 0.27
82 0.34
83 0.37
84 0.41
85 0.47
86 0.46
87 0.43
88 0.42
89 0.39
90 0.36
91 0.37
92 0.3
93 0.23
94 0.21
95 0.2
96 0.19
97 0.19
98 0.19
99 0.17
100 0.16
101 0.16
102 0.16
103 0.2
104 0.22
105 0.23
106 0.22
107 0.21
108 0.22
109 0.23
110 0.23
111 0.2
112 0.22
113 0.21
114 0.17
115 0.21
116 0.24
117 0.26
118 0.34
119 0.41
120 0.45
121 0.5
122 0.55
123 0.57
124 0.63
125 0.69
126 0.68
127 0.66
128 0.65
129 0.63
130 0.6
131 0.58
132 0.49
133 0.44
134 0.38
135 0.33
136 0.3
137 0.31
138 0.34
139 0.31
140 0.31
141 0.29
142 0.29
143 0.29
144 0.25
145 0.2
146 0.17
147 0.15
148 0.15
149 0.13
150 0.13
151 0.13
152 0.15
153 0.14
154 0.13
155 0.14
156 0.14
157 0.18
158 0.24
159 0.31
160 0.33
161 0.38
162 0.41
163 0.43
164 0.52
165 0.59
166 0.62
167 0.64
168 0.65
169 0.71
170 0.71
171 0.71
172 0.68
173 0.66
174 0.63
175 0.6
176 0.6
177 0.54
178 0.5
179 0.46
180 0.38
181 0.29
182 0.23
183 0.16
184 0.1
185 0.07
186 0.07
187 0.08
188 0.09
189 0.1
190 0.12
191 0.17
192 0.24
193 0.3
194 0.39
195 0.43
196 0.49
197 0.5
198 0.51
199 0.52
200 0.52
201 0.51
202 0.47
203 0.43
204 0.37
205 0.35
206 0.31
207 0.26
208 0.2
209 0.16
210 0.12
211 0.11
212 0.11
213 0.11
214 0.13
215 0.12
216 0.12
217 0.09
218 0.13
219 0.14
220 0.15
221 0.14
222 0.14
223 0.15
224 0.16
225 0.19
226 0.17
227 0.19
228 0.19
229 0.21
230 0.22
231 0.22
232 0.23
233 0.23
234 0.23
235 0.22
236 0.23
237 0.22
238 0.2
239 0.2
240 0.19
241 0.17
242 0.14
243 0.12
244 0.11
245 0.11
246 0.12
247 0.1
248 0.1
249 0.1
250 0.11
251 0.1
252 0.09
253 0.09
254 0.08
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.07
263 0.08
264 0.07
265 0.07
266 0.09
267 0.09
268 0.1
269 0.1
270 0.12
271 0.11
272 0.11
273 0.11
274 0.1
275 0.15
276 0.16
277 0.16
278 0.17
279 0.21
280 0.22
281 0.23
282 0.27
283 0.26
284 0.29
285 0.34
286 0.32
287 0.31
288 0.31
289 0.31
290 0.25
291 0.22
292 0.17
293 0.12
294 0.13
295 0.11
296 0.11
297 0.1
298 0.1
299 0.1
300 0.11
301 0.1
302 0.08
303 0.07
304 0.07
305 0.1
306 0.13
307 0.13
308 0.11
309 0.14
310 0.16
311 0.17
312 0.17
313 0.15
314 0.15
315 0.2
316 0.21
317 0.21
318 0.21
319 0.22
320 0.23
321 0.22
322 0.21
323 0.16
324 0.14
325 0.12
326 0.09
327 0.07
328 0.07
329 0.08
330 0.07
331 0.08
332 0.1
333 0.1
334 0.1
335 0.1
336 0.09
337 0.09
338 0.11
339 0.11
340 0.1
341 0.11
342 0.12
343 0.12
344 0.12
345 0.13
346 0.12
347 0.12
348 0.13
349 0.12
350 0.14
351 0.15
352 0.16
353 0.18
354 0.2
355 0.21
356 0.22
357 0.23
358 0.23
359 0.23
360 0.23
361 0.2
362 0.18
363 0.16
364 0.14
365 0.13
366 0.12
367 0.13
368 0.12
369 0.12
370 0.13
371 0.16
372 0.17
373 0.2
374 0.24
375 0.21
376 0.21
377 0.24
378 0.28
379 0.29
380 0.3
381 0.3
382 0.28
383 0.32
384 0.34
385 0.36
386 0.34
387 0.32
388 0.37
389 0.42
390 0.52
391 0.55
392 0.61
393 0.67
394 0.74
395 0.83
396 0.87
397 0.89
398 0.88
399 0.91
400 0.89
401 0.87
402 0.85
403 0.8
404 0.74
405 0.64
406 0.55
407 0.44
408 0.37
409 0.29
410 0.21
411 0.16
412 0.12
413 0.13
414 0.14
415 0.16
416 0.15
417 0.15
418 0.23
419 0.31
420 0.35
421 0.36
422 0.39
423 0.46
424 0.49
425 0.56
426 0.48
427 0.4
428 0.36
429 0.35
430 0.31
431 0.23
432 0.22
433 0.16
434 0.19
435 0.22
436 0.28
437 0.28
438 0.32
439 0.4
440 0.44
441 0.47
442 0.52
443 0.59
444 0.63
445 0.68
446 0.74
447 0.75
448 0.76
449 0.8
450 0.77
451 0.71
452 0.67
453 0.64
454 0.63
455 0.62
456 0.56
457 0.48
458 0.42
459 0.4
460 0.34
461 0.3
462 0.22
463 0.2
464 0.22
465 0.23
466 0.31
467 0.33
468 0.35
469 0.42
470 0.48
471 0.51
472 0.57
473 0.64
474 0.6
475 0.6
476 0.6
477 0.57
478 0.55
479 0.48
480 0.41
481 0.33
482 0.28
483 0.25
484 0.22
485 0.17
486 0.18
487 0.18
488 0.17
489 0.21
490 0.26
491 0.29
492 0.32
493 0.4
494 0.42
495 0.45
496 0.5
497 0.51
498 0.5
499 0.52
500 0.55
501 0.55
502 0.56
503 0.62
504 0.66
505 0.69
506 0.72
507 0.74
508 0.73
509 0.72
510 0.69
511 0.68
512 0.67
513 0.64
514 0.6
515 0.58
516 0.53
517 0.47
518 0.43
519 0.34
520 0.25
521 0.23
522 0.21
523 0.21
524 0.2
525 0.21
526 0.21
527 0.21
528 0.21
529 0.23
530 0.24
531 0.24
532 0.24
533 0.23
534 0.22
535 0.21
536 0.21
537 0.19
538 0.14
539 0.11
540 0.11
541 0.11
542 0.11
543 0.1
544 0.1
545 0.09
546 0.11
547 0.13
548 0.14
549 0.16
550 0.19
551 0.27
552 0.27
553 0.3
554 0.32
555 0.31
556 0.36
557 0.38
558 0.38
559 0.31
560 0.31
561 0.31
562 0.3
563 0.34
564 0.34
565 0.37
566 0.37
567 0.37
568 0.36
569 0.35
570 0.33
571 0.32
572 0.27
573 0.22
574 0.22
575 0.24
576 0.23
577 0.22
578 0.22
579 0.26
580 0.32
581 0.3
582 0.28
583 0.31
584 0.32
585 0.37
586 0.37
587 0.39
588 0.42
589 0.49
590 0.58
591 0.6
592 0.64
593 0.62