Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1HDZ6

Protein Details
Accession U1HDZ6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
88-122DDAHLQVDQPKKKKKKSKKSKPKSKRGLNAPSGFEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
97-114PKKKKKKSKKSKPKSKRG
Subcellular Location(s) cyto 13.5, cyto_nucl 11.5, nucl 8.5, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018606  Arb1  
Gene Ontology GO:0033167  C:ARC complex  
GO:0031047  P:RNA-mediated gene silencing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09692  Arb1  
Amino Acid Sequences MPFVTNFKIMNHKNTLSNEDSIQNHANHPLHSPAADALGLDSSSMMQDTMEDQGGSNHNRPTGEGPENSPAIDTADDGGAEEELGAFDDAHLQVDQPKKKKKKSKKSKPKSKRGLNAPSGFEEYSADAPITPAEYDEERKLYDLDLPFTDRIITAIHRYERRRKMLPATRDTFRKYLAYGGLDVTPNMFQGISERDAESMDKDTLTHALAQTSLSHEFRDIGKESSMWVVDFEGVMKGFLSRRVPFFYALDTEADVQAITTLLINFMNYLLHHDVCPEYREPILAAKQCCVKATQELWSIVQAQRWLPGDFNIACSTLFDGAYSRRYDGQTSWADDGGEFIGQTDDQARQIVKFAVACAGSEEQYQLWYEKAMANEIKVTKVRKEVGLEITEIILPDDETRDFYKQRTKDFRPVGKIHTKGWKNPSATVDDLTPEEQALQEKTLSQVKQQSEEVHRFREAGEDEYEFFVEEAVLQHLFVGMKLEATIRTLNCGICFVDEVFNAYLSFDTFLPNDRLYGYKKPRWLPGFSLGEDGLVKYDPKAAEKGEGNDVEVDDRDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.56
3 0.49
4 0.48
5 0.43
6 0.41
7 0.39
8 0.38
9 0.39
10 0.34
11 0.32
12 0.37
13 0.37
14 0.32
15 0.33
16 0.32
17 0.28
18 0.27
19 0.26
20 0.19
21 0.18
22 0.17
23 0.14
24 0.11
25 0.11
26 0.1
27 0.09
28 0.08
29 0.07
30 0.07
31 0.07
32 0.06
33 0.05
34 0.06
35 0.07
36 0.1
37 0.11
38 0.1
39 0.1
40 0.15
41 0.2
42 0.24
43 0.27
44 0.27
45 0.29
46 0.29
47 0.31
48 0.32
49 0.33
50 0.35
51 0.33
52 0.34
53 0.37
54 0.37
55 0.35
56 0.3
57 0.23
58 0.19
59 0.17
60 0.13
61 0.1
62 0.1
63 0.09
64 0.09
65 0.09
66 0.07
67 0.07
68 0.06
69 0.05
70 0.04
71 0.05
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.09
76 0.09
77 0.1
78 0.1
79 0.1
80 0.15
81 0.24
82 0.32
83 0.37
84 0.48
85 0.56
86 0.67
87 0.77
88 0.83
89 0.86
90 0.9
91 0.93
92 0.94
93 0.96
94 0.97
95 0.97
96 0.97
97 0.97
98 0.95
99 0.93
100 0.92
101 0.91
102 0.89
103 0.84
104 0.75
105 0.67
106 0.61
107 0.51
108 0.41
109 0.31
110 0.24
111 0.19
112 0.16
113 0.13
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.07
119 0.07
120 0.08
121 0.1
122 0.14
123 0.16
124 0.17
125 0.17
126 0.18
127 0.18
128 0.16
129 0.2
130 0.18
131 0.18
132 0.18
133 0.21
134 0.2
135 0.2
136 0.2
137 0.14
138 0.13
139 0.12
140 0.12
141 0.12
142 0.17
143 0.23
144 0.29
145 0.35
146 0.45
147 0.52
148 0.57
149 0.59
150 0.59
151 0.64
152 0.66
153 0.69
154 0.68
155 0.64
156 0.62
157 0.62
158 0.61
159 0.52
160 0.45
161 0.38
162 0.29
163 0.28
164 0.26
165 0.22
166 0.19
167 0.18
168 0.18
169 0.17
170 0.16
171 0.13
172 0.1
173 0.09
174 0.08
175 0.07
176 0.05
177 0.07
178 0.1
179 0.11
180 0.12
181 0.13
182 0.13
183 0.13
184 0.14
185 0.13
186 0.12
187 0.11
188 0.1
189 0.1
190 0.1
191 0.11
192 0.11
193 0.11
194 0.09
195 0.08
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.1
200 0.13
201 0.12
202 0.12
203 0.12
204 0.13
205 0.13
206 0.17
207 0.16
208 0.14
209 0.14
210 0.14
211 0.15
212 0.15
213 0.14
214 0.1
215 0.09
216 0.08
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.06
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.06
225 0.06
226 0.09
227 0.13
228 0.14
229 0.16
230 0.19
231 0.21
232 0.21
233 0.21
234 0.2
235 0.18
236 0.17
237 0.15
238 0.12
239 0.12
240 0.1
241 0.09
242 0.07
243 0.06
244 0.05
245 0.04
246 0.04
247 0.03
248 0.03
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.05
255 0.04
256 0.08
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.1
261 0.11
262 0.11
263 0.13
264 0.1
265 0.1
266 0.1
267 0.1
268 0.1
269 0.12
270 0.15
271 0.17
272 0.17
273 0.18
274 0.22
275 0.22
276 0.22
277 0.21
278 0.17
279 0.17
280 0.19
281 0.21
282 0.21
283 0.22
284 0.22
285 0.21
286 0.23
287 0.19
288 0.19
289 0.15
290 0.12
291 0.15
292 0.16
293 0.16
294 0.13
295 0.13
296 0.16
297 0.15
298 0.17
299 0.15
300 0.13
301 0.12
302 0.12
303 0.12
304 0.09
305 0.09
306 0.07
307 0.07
308 0.08
309 0.12
310 0.13
311 0.13
312 0.15
313 0.16
314 0.17
315 0.17
316 0.22
317 0.22
318 0.24
319 0.24
320 0.21
321 0.21
322 0.19
323 0.19
324 0.12
325 0.09
326 0.06
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.06
332 0.06
333 0.07
334 0.08
335 0.08
336 0.08
337 0.1
338 0.11
339 0.1
340 0.1
341 0.1
342 0.11
343 0.11
344 0.1
345 0.11
346 0.12
347 0.11
348 0.11
349 0.11
350 0.08
351 0.09
352 0.1
353 0.08
354 0.07
355 0.07
356 0.08
357 0.1
358 0.1
359 0.14
360 0.14
361 0.14
362 0.18
363 0.18
364 0.2
365 0.21
366 0.23
367 0.22
368 0.27
369 0.29
370 0.28
371 0.3
372 0.31
373 0.33
374 0.32
375 0.29
376 0.24
377 0.23
378 0.2
379 0.17
380 0.12
381 0.08
382 0.06
383 0.06
384 0.07
385 0.07
386 0.09
387 0.12
388 0.16
389 0.17
390 0.2
391 0.28
392 0.31
393 0.4
394 0.48
395 0.52
396 0.58
397 0.66
398 0.71
399 0.7
400 0.7
401 0.69
402 0.68
403 0.64
404 0.59
405 0.59
406 0.56
407 0.55
408 0.59
409 0.58
410 0.52
411 0.54
412 0.52
413 0.48
414 0.45
415 0.39
416 0.31
417 0.25
418 0.24
419 0.2
420 0.17
421 0.12
422 0.1
423 0.1
424 0.12
425 0.11
426 0.11
427 0.11
428 0.11
429 0.14
430 0.2
431 0.2
432 0.22
433 0.28
434 0.29
435 0.33
436 0.35
437 0.39
438 0.4
439 0.49
440 0.48
441 0.45
442 0.44
443 0.4
444 0.37
445 0.37
446 0.31
447 0.25
448 0.25
449 0.22
450 0.23
451 0.24
452 0.23
453 0.17
454 0.15
455 0.11
456 0.09
457 0.07
458 0.07
459 0.08
460 0.08
461 0.07
462 0.07
463 0.09
464 0.09
465 0.09
466 0.11
467 0.09
468 0.09
469 0.1
470 0.11
471 0.1
472 0.12
473 0.17
474 0.14
475 0.18
476 0.2
477 0.21
478 0.2
479 0.21
480 0.19
481 0.16
482 0.18
483 0.15
484 0.16
485 0.15
486 0.18
487 0.17
488 0.17
489 0.16
490 0.15
491 0.13
492 0.11
493 0.13
494 0.09
495 0.11
496 0.1
497 0.14
498 0.18
499 0.18
500 0.18
501 0.18
502 0.22
503 0.25
504 0.35
505 0.41
506 0.43
507 0.51
508 0.55
509 0.64
510 0.65
511 0.65
512 0.61
513 0.61
514 0.61
515 0.54
516 0.53
517 0.43
518 0.39
519 0.34
520 0.28
521 0.2
522 0.15
523 0.14
524 0.11
525 0.17
526 0.17
527 0.2
528 0.23
529 0.23
530 0.29
531 0.34
532 0.37
533 0.39
534 0.38
535 0.37
536 0.35
537 0.34
538 0.29