Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1GF28

Protein Details
Accession U1GF28    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-32EAPQYQPPKAPPKQNPAFRMHydrophilic
61-80ITYDRRQKKAAQKKWCDLVSHydrophilic
144-167GTAEQIRRLRRKKGEQTENSDQREHydrophilic
399-420EADWHKSAKKPRKDDLERVWLDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12, cyto 6.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021056  Mt_import_IM_translocase_Tim54  
Gene Ontology GO:0005743  C:mitochondrial inner membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF11711  Tim54  
Amino Acid Sequences MSTPASPGNGVPEAPQYQPPKAPPKQNPAFRMLGMPNFRFKLPSRNWLIFLSVTGSFAAAITYDRRQKKAAQKKWCDLVSHIAQHPLPVNQMPRKLTIFLSAPPGDGIRPSREYFKEYIKPVLVAAAMDYDVIEGRKEGDVRYGTAEQIRRLRRKKGEQTENSDQREIDPEQLVENIREQLKIRPEPVIRGDLIIGRHTWKEYLRGLHEGWLGPLDEPQSRREPTLPSDDASHSTSTDLPPNDASTSTNTDTPSESLAESKIPPPKEAETRPPSPPYAYISTSAYNTSPASPNLPIHLEPSAPIPHRHILGFFNTPIRIYRFLTQRHLADSVGRDTAALVLGLHRPYRQDSSFASSSTGEIDASPVTTSPPEKDGTTSPAATVQTAQTWEQQSLLQEEEADWHKSAKKPRKDDLERVWLDDVVMDPRIGERMRRFELPPEEEERAKRIGQGSERSRAAEVMDLRSEPVITDESQASSGKTWWAFWEKGKG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.33
3 0.32
4 0.35
5 0.4
6 0.46
7 0.5
8 0.55
9 0.63
10 0.65
11 0.71
12 0.77
13 0.8
14 0.78
15 0.74
16 0.69
17 0.6
18 0.57
19 0.5
20 0.48
21 0.46
22 0.44
23 0.44
24 0.42
25 0.42
26 0.39
27 0.38
28 0.41
29 0.4
30 0.47
31 0.48
32 0.5
33 0.53
34 0.5
35 0.51
36 0.4
37 0.35
38 0.29
39 0.21
40 0.18
41 0.15
42 0.13
43 0.1
44 0.1
45 0.09
46 0.06
47 0.07
48 0.09
49 0.16
50 0.24
51 0.29
52 0.32
53 0.35
54 0.43
55 0.53
56 0.61
57 0.64
58 0.67
59 0.72
60 0.77
61 0.83
62 0.77
63 0.69
64 0.6
65 0.6
66 0.55
67 0.52
68 0.45
69 0.41
70 0.38
71 0.37
72 0.37
73 0.29
74 0.25
75 0.23
76 0.29
77 0.3
78 0.36
79 0.36
80 0.37
81 0.38
82 0.38
83 0.35
84 0.32
85 0.29
86 0.25
87 0.3
88 0.26
89 0.24
90 0.23
91 0.23
92 0.18
93 0.19
94 0.2
95 0.18
96 0.22
97 0.23
98 0.29
99 0.31
100 0.35
101 0.35
102 0.4
103 0.42
104 0.41
105 0.45
106 0.39
107 0.37
108 0.33
109 0.31
110 0.23
111 0.16
112 0.13
113 0.09
114 0.07
115 0.07
116 0.06
117 0.05
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.05
122 0.07
123 0.09
124 0.1
125 0.1
126 0.15
127 0.16
128 0.17
129 0.22
130 0.21
131 0.2
132 0.24
133 0.27
134 0.25
135 0.32
136 0.39
137 0.44
138 0.49
139 0.57
140 0.61
141 0.69
142 0.76
143 0.78
144 0.81
145 0.79
146 0.83
147 0.85
148 0.83
149 0.76
150 0.67
151 0.56
152 0.46
153 0.43
154 0.35
155 0.27
156 0.2
157 0.17
158 0.16
159 0.18
160 0.18
161 0.13
162 0.14
163 0.14
164 0.14
165 0.15
166 0.15
167 0.18
168 0.25
169 0.27
170 0.27
171 0.3
172 0.3
173 0.33
174 0.35
175 0.32
176 0.25
177 0.23
178 0.22
179 0.18
180 0.18
181 0.15
182 0.13
183 0.12
184 0.12
185 0.12
186 0.14
187 0.12
188 0.16
189 0.18
190 0.22
191 0.22
192 0.25
193 0.25
194 0.26
195 0.27
196 0.22
197 0.19
198 0.16
199 0.14
200 0.11
201 0.11
202 0.1
203 0.1
204 0.12
205 0.14
206 0.19
207 0.19
208 0.2
209 0.21
210 0.22
211 0.23
212 0.3
213 0.28
214 0.23
215 0.25
216 0.25
217 0.25
218 0.24
219 0.21
220 0.14
221 0.14
222 0.14
223 0.12
224 0.15
225 0.13
226 0.12
227 0.13
228 0.13
229 0.13
230 0.12
231 0.12
232 0.1
233 0.15
234 0.15
235 0.16
236 0.16
237 0.16
238 0.16
239 0.16
240 0.15
241 0.11
242 0.1
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.1
247 0.13
248 0.17
249 0.17
250 0.17
251 0.19
252 0.22
253 0.27
254 0.3
255 0.35
256 0.37
257 0.4
258 0.43
259 0.43
260 0.4
261 0.35
262 0.33
263 0.28
264 0.26
265 0.23
266 0.22
267 0.21
268 0.21
269 0.21
270 0.2
271 0.16
272 0.13
273 0.12
274 0.12
275 0.12
276 0.12
277 0.14
278 0.15
279 0.15
280 0.15
281 0.17
282 0.15
283 0.15
284 0.15
285 0.12
286 0.11
287 0.14
288 0.17
289 0.16
290 0.17
291 0.19
292 0.21
293 0.22
294 0.22
295 0.2
296 0.17
297 0.2
298 0.21
299 0.18
300 0.19
301 0.18
302 0.18
303 0.19
304 0.2
305 0.19
306 0.19
307 0.24
308 0.28
309 0.32
310 0.37
311 0.39
312 0.37
313 0.37
314 0.36
315 0.3
316 0.27
317 0.25
318 0.22
319 0.18
320 0.17
321 0.14
322 0.13
323 0.13
324 0.1
325 0.07
326 0.05
327 0.06
328 0.09
329 0.11
330 0.11
331 0.11
332 0.13
333 0.16
334 0.22
335 0.21
336 0.22
337 0.23
338 0.3
339 0.31
340 0.29
341 0.28
342 0.23
343 0.22
344 0.2
345 0.18
346 0.11
347 0.09
348 0.1
349 0.08
350 0.08
351 0.08
352 0.06
353 0.07
354 0.09
355 0.1
356 0.11
357 0.13
358 0.15
359 0.15
360 0.18
361 0.19
362 0.23
363 0.25
364 0.24
365 0.21
366 0.24
367 0.23
368 0.21
369 0.2
370 0.16
371 0.14
372 0.16
373 0.17
374 0.18
375 0.2
376 0.2
377 0.19
378 0.2
379 0.19
380 0.19
381 0.2
382 0.14
383 0.13
384 0.12
385 0.16
386 0.17
387 0.18
388 0.16
389 0.18
390 0.23
391 0.28
392 0.38
393 0.45
394 0.51
395 0.57
396 0.65
397 0.74
398 0.78
399 0.82
400 0.81
401 0.82
402 0.73
403 0.68
404 0.61
405 0.5
406 0.41
407 0.32
408 0.24
409 0.16
410 0.15
411 0.11
412 0.1
413 0.1
414 0.15
415 0.15
416 0.2
417 0.24
418 0.31
419 0.36
420 0.4
421 0.41
422 0.45
423 0.54
424 0.52
425 0.5
426 0.49
427 0.49
428 0.49
429 0.49
430 0.44
431 0.39
432 0.34
433 0.34
434 0.32
435 0.35
436 0.38
437 0.46
438 0.48
439 0.53
440 0.53
441 0.51
442 0.48
443 0.41
444 0.35
445 0.32
446 0.29
447 0.25
448 0.26
449 0.25
450 0.25
451 0.25
452 0.24
453 0.17
454 0.17
455 0.14
456 0.13
457 0.16
458 0.16
459 0.17
460 0.19
461 0.2
462 0.19
463 0.18
464 0.18
465 0.2
466 0.2
467 0.2
468 0.24
469 0.3
470 0.32