Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1I406

Protein Details
Accession U1I406    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-31AAVLRQTSEKPRRNGSKRKRSLNDERGEDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-21KPRRNGSKRKR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032704  Cms1  
Pfam View protein in Pfam  
PF14617  CMS1  
Amino Acid Sequences MAAVLRQTSEKPRRNGSKRKRSLNDERGEDSSTAKKTATEPAKRHPETDGDVDESIRHMDPGLLADHISKKIKRSFRDLSAVELGDKYLSQRIFSDTTNFDAPRSLQSLPLFLEHISNSKEDLSISGEDPGSPHTIVVAASGLRAADVTRSKASGAHCRPNADIVTRSLRIYQSPDSAVAKLFAKHIKMPEAVDYVKRTKYVHSLGLARLMPLRIGIGIGTPQRLLDLLEKDVLKTKKLKRIVIDGSHLDQKKRSVFDMKELLDPLIKLLSRRPIKERLDAEGRRCSVYVF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.84
3 0.84
4 0.85
5 0.87
6 0.92
7 0.9
8 0.88
9 0.9
10 0.89
11 0.86
12 0.8
13 0.75
14 0.67
15 0.61
16 0.52
17 0.44
18 0.4
19 0.34
20 0.29
21 0.25
22 0.24
23 0.23
24 0.32
25 0.39
26 0.41
27 0.44
28 0.53
29 0.63
30 0.63
31 0.62
32 0.55
33 0.5
34 0.45
35 0.46
36 0.39
37 0.31
38 0.3
39 0.29
40 0.27
41 0.22
42 0.2
43 0.15
44 0.12
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.1
49 0.1
50 0.08
51 0.09
52 0.11
53 0.14
54 0.17
55 0.22
56 0.22
57 0.27
58 0.35
59 0.42
60 0.44
61 0.49
62 0.52
63 0.53
64 0.6
65 0.54
66 0.51
67 0.48
68 0.44
69 0.36
70 0.29
71 0.23
72 0.15
73 0.14
74 0.11
75 0.11
76 0.11
77 0.11
78 0.12
79 0.16
80 0.18
81 0.19
82 0.22
83 0.18
84 0.21
85 0.24
86 0.23
87 0.2
88 0.19
89 0.19
90 0.17
91 0.19
92 0.16
93 0.16
94 0.16
95 0.18
96 0.17
97 0.17
98 0.15
99 0.12
100 0.14
101 0.1
102 0.12
103 0.12
104 0.11
105 0.11
106 0.11
107 0.11
108 0.09
109 0.1
110 0.1
111 0.1
112 0.1
113 0.11
114 0.11
115 0.1
116 0.1
117 0.11
118 0.1
119 0.09
120 0.08
121 0.06
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.06
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.03
131 0.04
132 0.03
133 0.06
134 0.07
135 0.1
136 0.1
137 0.11
138 0.11
139 0.14
140 0.16
141 0.23
142 0.27
143 0.32
144 0.34
145 0.35
146 0.35
147 0.35
148 0.34
149 0.26
150 0.23
151 0.18
152 0.21
153 0.2
154 0.2
155 0.19
156 0.19
157 0.18
158 0.21
159 0.2
160 0.18
161 0.17
162 0.19
163 0.19
164 0.19
165 0.18
166 0.15
167 0.14
168 0.12
169 0.15
170 0.15
171 0.16
172 0.18
173 0.2
174 0.22
175 0.22
176 0.22
177 0.22
178 0.23
179 0.22
180 0.22
181 0.24
182 0.24
183 0.24
184 0.25
185 0.23
186 0.22
187 0.28
188 0.29
189 0.29
190 0.29
191 0.31
192 0.3
193 0.35
194 0.32
195 0.26
196 0.24
197 0.2
198 0.16
199 0.13
200 0.13
201 0.07
202 0.07
203 0.06
204 0.05
205 0.08
206 0.09
207 0.1
208 0.1
209 0.1
210 0.1
211 0.1
212 0.11
213 0.13
214 0.14
215 0.15
216 0.19
217 0.19
218 0.2
219 0.28
220 0.27
221 0.26
222 0.32
223 0.39
224 0.44
225 0.51
226 0.56
227 0.53
228 0.61
229 0.65
230 0.62
231 0.6
232 0.54
233 0.51
234 0.54
235 0.51
236 0.44
237 0.38
238 0.39
239 0.39
240 0.38
241 0.39
242 0.4
243 0.4
244 0.46
245 0.52
246 0.48
247 0.46
248 0.44
249 0.41
250 0.34
251 0.32
252 0.25
253 0.21
254 0.2
255 0.17
256 0.21
257 0.3
258 0.35
259 0.41
260 0.45
261 0.5
262 0.55
263 0.63
264 0.61
265 0.59
266 0.62
267 0.63
268 0.63
269 0.62
270 0.59
271 0.52