Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1GCC2

Protein Details
Accession U1GCC2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MDEFVSRKRKRPTSPIQDHSTRLHydrophilic
390-410ATVLKCVQKKKENRGRYMWMCHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 6, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027450  AlkB-like  
IPR037151  AlkB-like_sf  
IPR032854  ALKBH3  
IPR003892  CUE  
IPR005123  Oxoglu/Fe-dep_dioxygenase  
IPR010666  Znf_GRF  
Gene Ontology GO:0051213  F:dioxygenase activity  
GO:0043130  F:ubiquitin binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006307  P:DNA dealkylation involved in DNA repair  
GO:0035552  P:oxidative single-stranded DNA demethylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF13532  2OG-FeII_Oxy_2  
PF06839  zf-GRF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51140  CUE  
PS51471  FE2OG_OXY  
PS51999  ZF_GRF  
Amino Acid Sequences MDEFVSRKRKRPTSPIQDHSTRLQMSGPAITQDQEESTDVKLTILASLAPTISQEDLLELLISCDGYLDNARAVLLYRNKAPTSPRKKLTSIGLQSSLGFPTTNDPSKAQKPLTRKGKTVHLFSSADIAAHTPCSIIHNFLPAEDATKLLKELLAEAPTFPRATFKLFDNVVQSPHSAGFYVSSLQERERQKSEYLYNGSYLSDVRELLPEMRKVSSKVKDAVNKEIAIRIAKHYPDGKKLKYQCPHEWVPNAAFVNCYDGGAESVGYHSDQLSYIGPRAVIGSLSLGVAREFRVRKIVGREEKETDAKHKEETDRSRADEEGQIAIHLPHNSLLVMHAEMQEEWKHSIHPSSTVDLHPVSGNKRINITYRWYRESFNPRYTPRCKCGIATVLKCVQKKKENRGRYMWMCQAGGIPGKQGCGYFEWAEFTSDGEPLWKSASAPRMQETLPA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.86
3 0.84
4 0.81
5 0.75
6 0.69
7 0.66
8 0.55
9 0.45
10 0.39
11 0.33
12 0.3
13 0.29
14 0.25
15 0.2
16 0.2
17 0.2
18 0.19
19 0.17
20 0.16
21 0.15
22 0.15
23 0.14
24 0.15
25 0.17
26 0.16
27 0.15
28 0.15
29 0.13
30 0.12
31 0.11
32 0.11
33 0.08
34 0.09
35 0.09
36 0.08
37 0.08
38 0.09
39 0.09
40 0.09
41 0.09
42 0.08
43 0.09
44 0.09
45 0.09
46 0.07
47 0.07
48 0.07
49 0.07
50 0.06
51 0.06
52 0.05
53 0.06
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.09
58 0.09
59 0.09
60 0.1
61 0.15
62 0.2
63 0.22
64 0.26
65 0.31
66 0.32
67 0.35
68 0.42
69 0.46
70 0.5
71 0.56
72 0.59
73 0.6
74 0.62
75 0.64
76 0.64
77 0.63
78 0.59
79 0.54
80 0.5
81 0.44
82 0.43
83 0.39
84 0.32
85 0.22
86 0.15
87 0.11
88 0.13
89 0.18
90 0.21
91 0.22
92 0.24
93 0.29
94 0.35
95 0.41
96 0.41
97 0.41
98 0.45
99 0.53
100 0.61
101 0.6
102 0.59
103 0.56
104 0.62
105 0.61
106 0.59
107 0.52
108 0.47
109 0.43
110 0.39
111 0.4
112 0.29
113 0.24
114 0.19
115 0.17
116 0.11
117 0.1
118 0.1
119 0.06
120 0.06
121 0.09
122 0.1
123 0.12
124 0.12
125 0.16
126 0.16
127 0.16
128 0.17
129 0.14
130 0.16
131 0.13
132 0.14
133 0.1
134 0.11
135 0.11
136 0.09
137 0.1
138 0.07
139 0.1
140 0.11
141 0.12
142 0.12
143 0.12
144 0.13
145 0.14
146 0.14
147 0.12
148 0.12
149 0.11
150 0.14
151 0.16
152 0.16
153 0.21
154 0.21
155 0.23
156 0.24
157 0.24
158 0.22
159 0.21
160 0.19
161 0.15
162 0.15
163 0.13
164 0.09
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.08
170 0.09
171 0.09
172 0.1
173 0.17
174 0.19
175 0.23
176 0.25
177 0.27
178 0.27
179 0.3
180 0.31
181 0.31
182 0.31
183 0.28
184 0.26
185 0.24
186 0.23
187 0.19
188 0.16
189 0.11
190 0.09
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.09
195 0.11
196 0.14
197 0.14
198 0.15
199 0.16
200 0.16
201 0.18
202 0.25
203 0.27
204 0.28
205 0.3
206 0.34
207 0.39
208 0.4
209 0.44
210 0.4
211 0.35
212 0.32
213 0.3
214 0.26
215 0.21
216 0.19
217 0.15
218 0.16
219 0.15
220 0.18
221 0.22
222 0.23
223 0.31
224 0.36
225 0.36
226 0.4
227 0.46
228 0.52
229 0.53
230 0.58
231 0.55
232 0.55
233 0.57
234 0.53
235 0.49
236 0.42
237 0.36
238 0.33
239 0.28
240 0.22
241 0.18
242 0.14
243 0.17
244 0.14
245 0.13
246 0.09
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.09
251 0.04
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.06
260 0.08
261 0.08
262 0.09
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.08
268 0.07
269 0.06
270 0.06
271 0.05
272 0.06
273 0.06
274 0.05
275 0.05
276 0.06
277 0.07
278 0.12
279 0.13
280 0.14
281 0.19
282 0.2
283 0.24
284 0.31
285 0.39
286 0.42
287 0.46
288 0.49
289 0.47
290 0.5
291 0.5
292 0.45
293 0.41
294 0.38
295 0.34
296 0.33
297 0.33
298 0.35
299 0.4
300 0.45
301 0.47
302 0.45
303 0.47
304 0.46
305 0.42
306 0.39
307 0.34
308 0.29
309 0.22
310 0.18
311 0.16
312 0.14
313 0.14
314 0.15
315 0.12
316 0.11
317 0.1
318 0.11
319 0.11
320 0.1
321 0.1
322 0.09
323 0.09
324 0.1
325 0.1
326 0.11
327 0.11
328 0.13
329 0.14
330 0.15
331 0.16
332 0.15
333 0.15
334 0.16
335 0.2
336 0.18
337 0.22
338 0.22
339 0.24
340 0.26
341 0.25
342 0.27
343 0.23
344 0.23
345 0.2
346 0.21
347 0.2
348 0.25
349 0.28
350 0.27
351 0.3
352 0.32
353 0.34
354 0.34
355 0.4
356 0.42
357 0.45
358 0.5
359 0.48
360 0.48
361 0.53
362 0.59
363 0.59
364 0.58
365 0.6
366 0.59
367 0.66
368 0.71
369 0.71
370 0.65
371 0.65
372 0.58
373 0.52
374 0.54
375 0.54
376 0.55
377 0.5
378 0.52
379 0.52
380 0.55
381 0.57
382 0.56
383 0.56
384 0.56
385 0.62
386 0.67
387 0.71
388 0.74
389 0.79
390 0.81
391 0.82
392 0.8
393 0.78
394 0.74
395 0.68
396 0.58
397 0.51
398 0.44
399 0.37
400 0.34
401 0.26
402 0.23
403 0.2
404 0.21
405 0.21
406 0.2
407 0.19
408 0.18
409 0.23
410 0.21
411 0.21
412 0.24
413 0.23
414 0.25
415 0.23
416 0.21
417 0.17
418 0.16
419 0.15
420 0.13
421 0.13
422 0.12
423 0.15
424 0.14
425 0.14
426 0.2
427 0.28
428 0.31
429 0.34
430 0.36
431 0.38