Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1GCC4

Protein Details
Accession U1GCC4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
296-325PVIVVRPSTKRLKKKKKRMADPARRNYNSIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
304-319TKRLKKKKKRMADPAR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
IPR006015  Universal_stress_UspA  
IPR006016  UspA  
Pfam View protein in Pfam  
PF00582  Usp  
CDD cd00293  USP_Like  
Amino Acid Sequences MSELSTKEDHHSLETVPERELTLPLQPTRRDAAPVVFKDSFGPMGKDGQRASVAVSNSSNGSHRPTEPLRRPSLIQFNTAPAEDTIRRESVAAGKLQSMEARKMSVGERRTSEGGRRMSSPPPKSTYQRGVSFDTFDNRDATDFSLTLNYKHRNHQSTRRSRTFLCGTDQNDYSEFALEWLLDELVDDGDEIVCLRVVERDSKLASDTSVQQGRYRQEAQKLMDWVILKNSQEGERAISLVLELAVGKVQDVIQRMIQIYEPAVLVVGTRGRNLGGMQGLLPGSVSKYCLQQSPIPVIVVRPSTKRLKKKKKRMADPARRNYNSILEKARGGYSLDKTARNSIIGPLPSATDQEAAAVAKAIGVPKNFEASPLSRGVSSKTDASERSASPRPVSPAPSNVVMKSPNLSPVDSPEVSDGDSDDASWTRSPKVGRRAGKARGATVDEVDPSRDPPWLAAILASDTRKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.32
3 0.3
4 0.29
5 0.27
6 0.27
7 0.28
8 0.21
9 0.21
10 0.25
11 0.29
12 0.35
13 0.35
14 0.38
15 0.41
16 0.41
17 0.39
18 0.35
19 0.39
20 0.41
21 0.42
22 0.46
23 0.42
24 0.4
25 0.38
26 0.38
27 0.34
28 0.27
29 0.27
30 0.2
31 0.28
32 0.31
33 0.34
34 0.32
35 0.31
36 0.3
37 0.28
38 0.3
39 0.26
40 0.24
41 0.22
42 0.22
43 0.2
44 0.19
45 0.2
46 0.19
47 0.16
48 0.2
49 0.21
50 0.22
51 0.28
52 0.34
53 0.44
54 0.52
55 0.58
56 0.59
57 0.58
58 0.6
59 0.6
60 0.63
61 0.55
62 0.5
63 0.43
64 0.41
65 0.4
66 0.37
67 0.31
68 0.21
69 0.24
70 0.22
71 0.24
72 0.24
73 0.23
74 0.23
75 0.21
76 0.23
77 0.23
78 0.25
79 0.23
80 0.2
81 0.21
82 0.22
83 0.22
84 0.24
85 0.21
86 0.21
87 0.19
88 0.2
89 0.18
90 0.2
91 0.22
92 0.25
93 0.26
94 0.27
95 0.29
96 0.32
97 0.34
98 0.35
99 0.37
100 0.38
101 0.39
102 0.37
103 0.38
104 0.37
105 0.43
106 0.5
107 0.5
108 0.47
109 0.47
110 0.51
111 0.52
112 0.56
113 0.57
114 0.55
115 0.55
116 0.54
117 0.54
118 0.51
119 0.49
120 0.43
121 0.38
122 0.33
123 0.28
124 0.25
125 0.2
126 0.19
127 0.17
128 0.16
129 0.13
130 0.11
131 0.11
132 0.15
133 0.16
134 0.17
135 0.24
136 0.28
137 0.3
138 0.37
139 0.45
140 0.46
141 0.52
142 0.6
143 0.64
144 0.69
145 0.76
146 0.75
147 0.7
148 0.64
149 0.65
150 0.61
151 0.53
152 0.46
153 0.43
154 0.38
155 0.38
156 0.38
157 0.32
158 0.27
159 0.25
160 0.21
161 0.15
162 0.13
163 0.09
164 0.09
165 0.07
166 0.07
167 0.06
168 0.05
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.04
183 0.06
184 0.07
185 0.1
186 0.11
187 0.14
188 0.14
189 0.14
190 0.15
191 0.13
192 0.13
193 0.12
194 0.13
195 0.15
196 0.18
197 0.18
198 0.19
199 0.23
200 0.24
201 0.27
202 0.3
203 0.28
204 0.3
205 0.35
206 0.35
207 0.35
208 0.34
209 0.3
210 0.28
211 0.26
212 0.2
213 0.18
214 0.18
215 0.14
216 0.14
217 0.14
218 0.12
219 0.13
220 0.13
221 0.12
222 0.1
223 0.11
224 0.09
225 0.08
226 0.07
227 0.06
228 0.05
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.04
236 0.04
237 0.07
238 0.09
239 0.1
240 0.1
241 0.11
242 0.12
243 0.12
244 0.11
245 0.1
246 0.08
247 0.08
248 0.07
249 0.06
250 0.06
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.08
255 0.07
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.09
260 0.09
261 0.1
262 0.08
263 0.07
264 0.07
265 0.08
266 0.08
267 0.07
268 0.07
269 0.05
270 0.06
271 0.06
272 0.08
273 0.07
274 0.11
275 0.12
276 0.14
277 0.17
278 0.2
279 0.22
280 0.25
281 0.25
282 0.23
283 0.22
284 0.2
285 0.2
286 0.2
287 0.19
288 0.17
289 0.21
290 0.3
291 0.38
292 0.48
293 0.57
294 0.65
295 0.74
296 0.83
297 0.89
298 0.9
299 0.92
300 0.93
301 0.93
302 0.93
303 0.93
304 0.92
305 0.92
306 0.83
307 0.74
308 0.65
309 0.62
310 0.54
311 0.47
312 0.41
313 0.31
314 0.31
315 0.31
316 0.29
317 0.22
318 0.2
319 0.21
320 0.19
321 0.26
322 0.28
323 0.29
324 0.3
325 0.34
326 0.34
327 0.3
328 0.28
329 0.23
330 0.25
331 0.23
332 0.22
333 0.18
334 0.18
335 0.17
336 0.17
337 0.15
338 0.1
339 0.1
340 0.09
341 0.1
342 0.09
343 0.08
344 0.08
345 0.07
346 0.06
347 0.07
348 0.09
349 0.11
350 0.11
351 0.14
352 0.14
353 0.18
354 0.17
355 0.18
356 0.2
357 0.19
358 0.22
359 0.22
360 0.22
361 0.2
362 0.21
363 0.22
364 0.22
365 0.22
366 0.22
367 0.21
368 0.24
369 0.24
370 0.29
371 0.31
372 0.28
373 0.33
374 0.37
375 0.37
376 0.36
377 0.39
378 0.39
379 0.38
380 0.43
381 0.41
382 0.39
383 0.4
384 0.43
385 0.42
386 0.37
387 0.36
388 0.32
389 0.29
390 0.27
391 0.24
392 0.25
393 0.25
394 0.25
395 0.23
396 0.27
397 0.33
398 0.3
399 0.3
400 0.25
401 0.24
402 0.23
403 0.22
404 0.17
405 0.12
406 0.12
407 0.11
408 0.11
409 0.11
410 0.13
411 0.15
412 0.16
413 0.16
414 0.2
415 0.26
416 0.32
417 0.42
418 0.49
419 0.54
420 0.62
421 0.68
422 0.72
423 0.75
424 0.7
425 0.64
426 0.6
427 0.57
428 0.49
429 0.43
430 0.37
431 0.32
432 0.29
433 0.28
434 0.24
435 0.22
436 0.21
437 0.21
438 0.19
439 0.17
440 0.2
441 0.19
442 0.18
443 0.16
444 0.17
445 0.18
446 0.22