Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1HDX2

Protein Details
Accession U1HDX2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
55-88SYYGTKRRPAVLRRARKQAKLRSRKLTLNKPPVTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
60-79KRRPAVLRRARKQAKLRSRK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10, mito 7, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038883  AN11006-like  
Amino Acid Sequences MPRNRPTRVAKKVKLDTAATDTDVDDALQSGDTFEQVFGGYADVADETSDASDDSYYGTKRRPAVLRRARKQAKLRSRKLTLNKPPVTEAPAADPMSDIEYDSEVGDEVQWLKPHPRTPPKSAKEGRIPDASATPANAVAITKRSPSTPNILEIHVNMGPKSGGSTINVDLTPLLNASGSGGALTISPNAVTLPDDSTTVALNSSAAAPSLRMQRLNEAKARLLKADSPKKRKTGFTDLPSEIRIRIYRSVFVTEFQINLHTRQNFQRSSSLLSTCKLVHEEGRAVLYGENAFHLERSYTSRGRFFDEDWREIGFKDIRRFLETIGTTNISMMRYISFEFADTNKANTPVEEVERRCVNDPVVWHCLELIGNNARLEKFVFQFSGRKNLDRNDLHFLRALTTIKAKKVTNLANFSGGFKVKPELFADLKKLMVLPRDDADEVDETKKKPPTVVMHHERNRGTRFYELCCR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.69
3 0.62
4 0.58
5 0.52
6 0.43
7 0.36
8 0.29
9 0.24
10 0.22
11 0.17
12 0.11
13 0.09
14 0.08
15 0.08
16 0.07
17 0.08
18 0.08
19 0.08
20 0.09
21 0.08
22 0.08
23 0.08
24 0.08
25 0.07
26 0.08
27 0.07
28 0.06
29 0.07
30 0.06
31 0.06
32 0.06
33 0.05
34 0.05
35 0.05
36 0.06
37 0.05
38 0.06
39 0.06
40 0.06
41 0.08
42 0.11
43 0.13
44 0.16
45 0.2
46 0.25
47 0.28
48 0.36
49 0.43
50 0.47
51 0.57
52 0.64
53 0.72
54 0.74
55 0.81
56 0.81
57 0.81
58 0.84
59 0.83
60 0.84
61 0.84
62 0.85
63 0.84
64 0.83
65 0.83
66 0.82
67 0.83
68 0.82
69 0.82
70 0.77
71 0.7
72 0.67
73 0.61
74 0.56
75 0.47
76 0.38
77 0.31
78 0.33
79 0.31
80 0.26
81 0.24
82 0.2
83 0.19
84 0.18
85 0.14
86 0.09
87 0.09
88 0.1
89 0.09
90 0.09
91 0.07
92 0.07
93 0.06
94 0.07
95 0.08
96 0.1
97 0.11
98 0.12
99 0.17
100 0.22
101 0.26
102 0.35
103 0.44
104 0.48
105 0.57
106 0.66
107 0.66
108 0.72
109 0.73
110 0.71
111 0.7
112 0.69
113 0.65
114 0.58
115 0.54
116 0.45
117 0.41
118 0.35
119 0.26
120 0.2
121 0.16
122 0.12
123 0.11
124 0.1
125 0.08
126 0.07
127 0.1
128 0.1
129 0.12
130 0.13
131 0.14
132 0.17
133 0.19
134 0.26
135 0.25
136 0.29
137 0.29
138 0.29
139 0.28
140 0.26
141 0.27
142 0.21
143 0.2
144 0.14
145 0.13
146 0.12
147 0.1
148 0.11
149 0.09
150 0.08
151 0.09
152 0.12
153 0.12
154 0.15
155 0.15
156 0.13
157 0.12
158 0.12
159 0.1
160 0.08
161 0.07
162 0.04
163 0.04
164 0.05
165 0.05
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.05
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.05
179 0.06
180 0.07
181 0.07
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.07
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.05
196 0.08
197 0.14
198 0.14
199 0.15
200 0.16
201 0.23
202 0.28
203 0.31
204 0.32
205 0.28
206 0.29
207 0.32
208 0.33
209 0.26
210 0.22
211 0.23
212 0.28
213 0.37
214 0.43
215 0.48
216 0.52
217 0.57
218 0.59
219 0.59
220 0.58
221 0.58
222 0.57
223 0.52
224 0.54
225 0.49
226 0.47
227 0.44
228 0.37
229 0.27
230 0.22
231 0.19
232 0.14
233 0.18
234 0.18
235 0.19
236 0.2
237 0.23
238 0.21
239 0.21
240 0.21
241 0.17
242 0.16
243 0.14
244 0.16
245 0.13
246 0.15
247 0.19
248 0.17
249 0.19
250 0.24
251 0.3
252 0.28
253 0.29
254 0.31
255 0.28
256 0.32
257 0.32
258 0.3
259 0.25
260 0.24
261 0.24
262 0.2
263 0.2
264 0.16
265 0.14
266 0.13
267 0.14
268 0.15
269 0.14
270 0.14
271 0.13
272 0.13
273 0.12
274 0.11
275 0.09
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.13
285 0.18
286 0.2
287 0.23
288 0.27
289 0.28
290 0.33
291 0.34
292 0.3
293 0.35
294 0.37
295 0.36
296 0.33
297 0.33
298 0.29
299 0.27
300 0.29
301 0.24
302 0.23
303 0.27
304 0.31
305 0.31
306 0.34
307 0.34
308 0.3
309 0.34
310 0.3
311 0.26
312 0.24
313 0.23
314 0.2
315 0.2
316 0.21
317 0.14
318 0.13
319 0.11
320 0.09
321 0.09
322 0.1
323 0.11
324 0.09
325 0.09
326 0.11
327 0.11
328 0.16
329 0.16
330 0.17
331 0.17
332 0.19
333 0.19
334 0.17
335 0.2
336 0.17
337 0.21
338 0.26
339 0.25
340 0.29
341 0.32
342 0.34
343 0.33
344 0.32
345 0.29
346 0.25
347 0.26
348 0.27
349 0.29
350 0.27
351 0.25
352 0.23
353 0.22
354 0.2
355 0.17
356 0.16
357 0.15
358 0.17
359 0.18
360 0.2
361 0.19
362 0.19
363 0.21
364 0.19
365 0.17
366 0.18
367 0.19
368 0.19
369 0.26
370 0.28
371 0.37
372 0.35
373 0.37
374 0.39
375 0.42
376 0.49
377 0.47
378 0.49
379 0.48
380 0.47
381 0.45
382 0.44
383 0.39
384 0.32
385 0.31
386 0.28
387 0.21
388 0.28
389 0.31
390 0.32
391 0.38
392 0.36
393 0.37
394 0.44
395 0.5
396 0.49
397 0.51
398 0.49
399 0.48
400 0.48
401 0.45
402 0.42
403 0.34
404 0.26
405 0.21
406 0.25
407 0.21
408 0.23
409 0.24
410 0.25
411 0.28
412 0.31
413 0.35
414 0.32
415 0.31
416 0.28
417 0.28
418 0.25
419 0.27
420 0.26
421 0.24
422 0.25
423 0.29
424 0.28
425 0.27
426 0.27
427 0.24
428 0.24
429 0.27
430 0.29
431 0.27
432 0.33
433 0.39
434 0.37
435 0.37
436 0.42
437 0.46
438 0.51
439 0.61
440 0.63
441 0.68
442 0.75
443 0.8
444 0.76
445 0.74
446 0.7
447 0.63
448 0.56
449 0.54
450 0.5