Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1GTF3

Protein Details
Accession U1GTF3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
414-436GGGGPAKRKRAARGKKKVDSDEDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
417-430GPAKRKRAARGKKK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 13, cyto 5, mito 2, extr 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003958  CBFA_NFYB_domain  
IPR009072  Histone-fold  
Gene Ontology GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00808  CBFD_NFYB_HMF  
Amino Acid Sequences MSQENHQHYQKTAAITAASTSTSTSTQQQQQQQQQQQPSENSNNNNTTYRPRSPDLSAFILPPQQLQQQQQPVFHPSYQDSSSSWQHQRQGSSGPALTGLPAGSGSYPPVTHRGSYDASPYFSPQGSFSLGQGQSQIPGQTGYLIGGTGAGGQQQGQVQRRETVGYGTASASAAVGEYSRLTQSPTATAGGERVGPGHSQTLQQQSFWQTPASGFTAPTHEQPVGSVPSSLLQLTQQPPQQPQHNMPPSRRKRGQTDDNDDSGDVDYAPESSSVGGAGGKSSRKRKSDNDQAWTSGRAPGEVGPSLGIDIKTKFPVARIKRIMQADEDVGKVAQATPTAVSKALELFMIALVTKAAAEARDRSSKRVTAAHLKQAVIKDQTFDFLQEIIEKVPDPTEKKGGGSGRAASEDVDDGGGGPAKRKRAARGKKKVDSDED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.26
3 0.26
4 0.2
5 0.16
6 0.13
7 0.12
8 0.12
9 0.13
10 0.15
11 0.19
12 0.25
13 0.32
14 0.39
15 0.47
16 0.54
17 0.63
18 0.71
19 0.75
20 0.76
21 0.76
22 0.74
23 0.72
24 0.67
25 0.65
26 0.63
27 0.61
28 0.58
29 0.58
30 0.56
31 0.53
32 0.5
33 0.45
34 0.45
35 0.47
36 0.48
37 0.47
38 0.46
39 0.47
40 0.5
41 0.54
42 0.5
43 0.48
44 0.42
45 0.37
46 0.36
47 0.35
48 0.3
49 0.25
50 0.23
51 0.23
52 0.27
53 0.3
54 0.36
55 0.42
56 0.45
57 0.47
58 0.47
59 0.47
60 0.45
61 0.42
62 0.37
63 0.3
64 0.32
65 0.3
66 0.28
67 0.24
68 0.26
69 0.3
70 0.35
71 0.38
72 0.38
73 0.43
74 0.46
75 0.46
76 0.44
77 0.43
78 0.39
79 0.37
80 0.32
81 0.26
82 0.23
83 0.2
84 0.18
85 0.14
86 0.11
87 0.07
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.07
93 0.08
94 0.09
95 0.1
96 0.15
97 0.17
98 0.17
99 0.18
100 0.21
101 0.22
102 0.22
103 0.27
104 0.23
105 0.24
106 0.23
107 0.24
108 0.22
109 0.2
110 0.2
111 0.15
112 0.15
113 0.17
114 0.16
115 0.15
116 0.21
117 0.21
118 0.2
119 0.21
120 0.19
121 0.17
122 0.17
123 0.17
124 0.09
125 0.1
126 0.09
127 0.08
128 0.08
129 0.07
130 0.06
131 0.06
132 0.05
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.06
141 0.08
142 0.13
143 0.17
144 0.2
145 0.21
146 0.23
147 0.24
148 0.24
149 0.22
150 0.18
151 0.16
152 0.14
153 0.14
154 0.12
155 0.12
156 0.1
157 0.1
158 0.08
159 0.06
160 0.05
161 0.04
162 0.04
163 0.03
164 0.04
165 0.04
166 0.05
167 0.05
168 0.07
169 0.08
170 0.09
171 0.1
172 0.11
173 0.11
174 0.11
175 0.11
176 0.1
177 0.09
178 0.09
179 0.08
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.08
185 0.09
186 0.1
187 0.13
188 0.2
189 0.19
190 0.2
191 0.21
192 0.23
193 0.23
194 0.23
195 0.2
196 0.13
197 0.13
198 0.15
199 0.15
200 0.11
201 0.1
202 0.1
203 0.14
204 0.15
205 0.16
206 0.15
207 0.13
208 0.13
209 0.13
210 0.14
211 0.12
212 0.11
213 0.1
214 0.08
215 0.09
216 0.1
217 0.09
218 0.07
219 0.06
220 0.1
221 0.12
222 0.16
223 0.17
224 0.19
225 0.22
226 0.26
227 0.31
228 0.3
229 0.32
230 0.39
231 0.45
232 0.46
233 0.49
234 0.57
235 0.58
236 0.65
237 0.68
238 0.62
239 0.62
240 0.67
241 0.71
242 0.69
243 0.71
244 0.66
245 0.61
246 0.57
247 0.48
248 0.4
249 0.3
250 0.21
251 0.12
252 0.07
253 0.05
254 0.05
255 0.06
256 0.05
257 0.05
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.05
262 0.05
263 0.04
264 0.05
265 0.07
266 0.11
267 0.17
268 0.25
269 0.32
270 0.36
271 0.42
272 0.49
273 0.57
274 0.64
275 0.67
276 0.67
277 0.62
278 0.61
279 0.57
280 0.51
281 0.42
282 0.34
283 0.26
284 0.18
285 0.17
286 0.15
287 0.17
288 0.15
289 0.14
290 0.11
291 0.11
292 0.11
293 0.12
294 0.1
295 0.09
296 0.1
297 0.12
298 0.13
299 0.15
300 0.14
301 0.17
302 0.26
303 0.31
304 0.39
305 0.43
306 0.45
307 0.51
308 0.54
309 0.51
310 0.44
311 0.4
312 0.33
313 0.29
314 0.26
315 0.2
316 0.17
317 0.15
318 0.13
319 0.11
320 0.08
321 0.07
322 0.08
323 0.08
324 0.1
325 0.11
326 0.12
327 0.11
328 0.11
329 0.12
330 0.11
331 0.1
332 0.08
333 0.08
334 0.07
335 0.07
336 0.06
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.04
341 0.04
342 0.05
343 0.06
344 0.08
345 0.12
346 0.17
347 0.27
348 0.28
349 0.33
350 0.38
351 0.4
352 0.42
353 0.44
354 0.44
355 0.46
356 0.51
357 0.55
358 0.54
359 0.51
360 0.52
361 0.49
362 0.49
363 0.43
364 0.38
365 0.31
366 0.27
367 0.29
368 0.25
369 0.24
370 0.19
371 0.14
372 0.14
373 0.13
374 0.14
375 0.12
376 0.13
377 0.12
378 0.12
379 0.15
380 0.2
381 0.22
382 0.26
383 0.32
384 0.33
385 0.33
386 0.39
387 0.39
388 0.38
389 0.39
390 0.38
391 0.33
392 0.34
393 0.33
394 0.27
395 0.25
396 0.21
397 0.17
398 0.13
399 0.1
400 0.09
401 0.1
402 0.13
403 0.12
404 0.17
405 0.21
406 0.26
407 0.33
408 0.36
409 0.45
410 0.52
411 0.64
412 0.69
413 0.76
414 0.82
415 0.85
416 0.9