Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U7Q7L3

Protein Details
Accession U7Q7L3    Localization Confidence Low Confidence Score 6.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
895-915QPSLHQFSRPKNSHRPPRVFGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 19.5, cyto_nucl 14.833, cyto_mito 10.832, nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045055  DNA2/NAM7-like  
IPR041679  DNA2/NAM7-like_C  
IPR041677  DNA2/NAM7_AAA_11  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR047187  SF1_C_Upf1  
IPR040812  UPF1_1B_dom  
IPR018999  UPF1_CH/ZBD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF13086  AAA_11  
PF13087  AAA_12  
PF18141  UPF1_1B_dom  
PF09416  UPF1_Zn_bind  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51997  UPF1_CH_RICH  
CDD cd21407  1B_UPF1-like  
cd18039  DEXXQc_UPF1  
cd18808  SF1_C_Upf1  
cd21400  ZBD_UPF1-like  
Amino Acid Sequences MEGAFNHVGNHLISDSAAAIKADDNDDLSSIDPDENLLYNKYGGHDGLGSATRRRQDDDDNDNGTEVAFDDADNDSVVSALADNVQYAKLEPEEEEKEQELPAHACVYCGIHSPASVVKCMICNKWFCSARGNVGSSHIVNHLVRARHKEVQLHPDSSLGETVLECYNCGNRNVFILGFIPAKSDTVVVLLCRQSCVSNTSAKDMSWDINRWQPLIENRQFLSWLVAQPSDAEQLRARHLPAAMIARLEEMWKDNASATVQDLDAAAGVDDDPHPVLLKYDDPYHHQNIFGPLVKMESDYDKKLKEAQSEDNLVIRWDFGLNNKHMASFILPKIESGDVKLAVGDEMRLKYKGELRPAWEGVGYVVKIPNNQSDEVTLELRKTGNEKSVPTECTHNFSADYVWKATSYDRMQWAMRTFAVNELSVSGYIFHKLLGHEVAVAPMKTTLPKKFTAPALPELNGSQISAIKAVLSTPLSLIQGPPGTGKTVTSATIIYHLAKLNNSQVLVCAPSNVAVDQLCERVHRTGLKVVRLTAKSREDVESSVNFLALHEQVRMNDTNVELARLQQLKNEIGELSSADEKKFRQLTKAAEREILSNADVVCCTCVGAGDPRLSKMKFRNVLIDESTQSAEPECMIPLVLGCKQVVLVGDHKQLGPVIMNKKAAKAGLNQSLFERLVKLGFSPIRLETQYRMHPHLAEFPSNMFYDGSLQNGVSTAERLRSDIDFPWPVADTPMMFWSNLGNEEISASGTSYLNRTEASNVEKIVTRFFKAGVKPADIGVITPYEGQRSYIVTTMQNTGTFKKESYKEVEVASVDAFQGREKDYIVLSCVRSNENHGIGFLSDPRRLNVALTRAKYGLVIIGNPKVLAKHDLWYYLLVHYKDSKCLVEGPLSNLQPSLHQFSRPKNSHRPPRVFGNGIGNETSNASLGVGGLGNGGGHGGPGGPVGAGGGRYGHHGQHNHLGHNGSGTRDFDTGSIMSYIPDDVSSIHSSAIGSGGGGGGGGGANLSSAYPAMFSSFSPDQWPGLPGASAMGRSGGKGRNRGGGAESVAGESVANSEYTDITAGSSVIGGKGVGQGGVSLGAGLHDTVTNGRMTSFSQSDRLKDYVENSGRLASGNGYRRYDDDQQSISTAGFASQIGGSGYD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.1
4 0.11
5 0.09
6 0.09
7 0.11
8 0.13
9 0.14
10 0.14
11 0.14
12 0.14
13 0.15
14 0.15
15 0.14
16 0.13
17 0.13
18 0.13
19 0.11
20 0.11
21 0.12
22 0.13
23 0.14
24 0.15
25 0.15
26 0.15
27 0.16
28 0.17
29 0.18
30 0.16
31 0.16
32 0.15
33 0.14
34 0.17
35 0.21
36 0.21
37 0.23
38 0.27
39 0.31
40 0.33
41 0.37
42 0.38
43 0.42
44 0.49
45 0.53
46 0.56
47 0.55
48 0.53
49 0.49
50 0.44
51 0.34
52 0.25
53 0.18
54 0.12
55 0.08
56 0.07
57 0.09
58 0.1
59 0.1
60 0.1
61 0.1
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.06
66 0.05
67 0.05
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.08
72 0.09
73 0.09
74 0.1
75 0.12
76 0.11
77 0.12
78 0.13
79 0.19
80 0.24
81 0.25
82 0.28
83 0.27
84 0.27
85 0.27
86 0.27
87 0.24
88 0.2
89 0.19
90 0.19
91 0.18
92 0.17
93 0.17
94 0.18
95 0.16
96 0.18
97 0.19
98 0.16
99 0.16
100 0.18
101 0.22
102 0.21
103 0.21
104 0.18
105 0.17
106 0.21
107 0.26
108 0.29
109 0.29
110 0.32
111 0.34
112 0.43
113 0.45
114 0.42
115 0.45
116 0.44
117 0.47
118 0.49
119 0.47
120 0.38
121 0.38
122 0.41
123 0.34
124 0.32
125 0.25
126 0.23
127 0.21
128 0.25
129 0.27
130 0.28
131 0.32
132 0.38
133 0.43
134 0.45
135 0.49
136 0.53
137 0.54
138 0.59
139 0.61
140 0.55
141 0.49
142 0.45
143 0.42
144 0.35
145 0.29
146 0.19
147 0.13
148 0.11
149 0.13
150 0.14
151 0.13
152 0.12
153 0.13
154 0.18
155 0.19
156 0.22
157 0.22
158 0.19
159 0.21
160 0.23
161 0.21
162 0.17
163 0.16
164 0.17
165 0.16
166 0.15
167 0.15
168 0.13
169 0.14
170 0.13
171 0.12
172 0.09
173 0.1
174 0.1
175 0.09
176 0.13
177 0.16
178 0.16
179 0.17
180 0.17
181 0.17
182 0.18
183 0.2
184 0.18
185 0.22
186 0.23
187 0.27
188 0.28
189 0.26
190 0.27
191 0.26
192 0.27
193 0.25
194 0.27
195 0.24
196 0.3
197 0.31
198 0.29
199 0.28
200 0.29
201 0.31
202 0.39
203 0.41
204 0.39
205 0.38
206 0.39
207 0.39
208 0.34
209 0.32
210 0.24
211 0.21
212 0.19
213 0.19
214 0.18
215 0.18
216 0.19
217 0.2
218 0.17
219 0.17
220 0.18
221 0.21
222 0.25
223 0.26
224 0.25
225 0.23
226 0.23
227 0.22
228 0.22
229 0.24
230 0.2
231 0.18
232 0.17
233 0.15
234 0.15
235 0.15
236 0.12
237 0.1
238 0.12
239 0.12
240 0.12
241 0.12
242 0.13
243 0.14
244 0.14
245 0.13
246 0.12
247 0.11
248 0.11
249 0.11
250 0.09
251 0.08
252 0.07
253 0.06
254 0.04
255 0.04
256 0.05
257 0.05
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.07
262 0.07
263 0.08
264 0.09
265 0.11
266 0.12
267 0.17
268 0.19
269 0.24
270 0.3
271 0.34
272 0.33
273 0.31
274 0.32
275 0.31
276 0.33
277 0.31
278 0.25
279 0.2
280 0.2
281 0.2
282 0.18
283 0.15
284 0.18
285 0.19
286 0.22
287 0.26
288 0.25
289 0.26
290 0.32
291 0.34
292 0.34
293 0.35
294 0.38
295 0.4
296 0.42
297 0.42
298 0.37
299 0.33
300 0.28
301 0.23
302 0.16
303 0.11
304 0.09
305 0.09
306 0.12
307 0.18
308 0.19
309 0.23
310 0.24
311 0.23
312 0.22
313 0.22
314 0.2
315 0.19
316 0.19
317 0.2
318 0.2
319 0.2
320 0.22
321 0.23
322 0.2
323 0.16
324 0.18
325 0.14
326 0.14
327 0.14
328 0.11
329 0.1
330 0.1
331 0.09
332 0.09
333 0.1
334 0.12
335 0.13
336 0.13
337 0.16
338 0.23
339 0.27
340 0.31
341 0.33
342 0.35
343 0.41
344 0.41
345 0.38
346 0.31
347 0.27
348 0.2
349 0.2
350 0.16
351 0.11
352 0.12
353 0.12
354 0.13
355 0.15
356 0.19
357 0.19
358 0.2
359 0.19
360 0.18
361 0.19
362 0.2
363 0.2
364 0.15
365 0.12
366 0.13
367 0.13
368 0.12
369 0.14
370 0.14
371 0.18
372 0.21
373 0.22
374 0.26
375 0.3
376 0.31
377 0.3
378 0.34
379 0.29
380 0.31
381 0.3
382 0.26
383 0.22
384 0.21
385 0.21
386 0.18
387 0.19
388 0.15
389 0.14
390 0.13
391 0.14
392 0.14
393 0.19
394 0.18
395 0.21
396 0.22
397 0.25
398 0.25
399 0.28
400 0.28
401 0.24
402 0.22
403 0.19
404 0.16
405 0.17
406 0.18
407 0.15
408 0.13
409 0.12
410 0.12
411 0.11
412 0.1
413 0.08
414 0.07
415 0.08
416 0.07
417 0.07
418 0.08
419 0.08
420 0.1
421 0.09
422 0.09
423 0.09
424 0.09
425 0.1
426 0.1
427 0.1
428 0.08
429 0.08
430 0.08
431 0.11
432 0.15
433 0.18
434 0.2
435 0.21
436 0.23
437 0.26
438 0.29
439 0.32
440 0.31
441 0.33
442 0.32
443 0.31
444 0.3
445 0.26
446 0.25
447 0.19
448 0.15
449 0.1
450 0.08
451 0.08
452 0.08
453 0.07
454 0.06
455 0.06
456 0.06
457 0.07
458 0.06
459 0.06
460 0.06
461 0.08
462 0.08
463 0.08
464 0.08
465 0.09
466 0.09
467 0.09
468 0.09
469 0.09
470 0.09
471 0.09
472 0.09
473 0.09
474 0.1
475 0.1
476 0.1
477 0.1
478 0.09
479 0.11
480 0.11
481 0.1
482 0.11
483 0.12
484 0.12
485 0.12
486 0.13
487 0.14
488 0.14
489 0.14
490 0.11
491 0.11
492 0.1
493 0.12
494 0.1
495 0.08
496 0.07
497 0.08
498 0.09
499 0.08
500 0.08
501 0.06
502 0.07
503 0.08
504 0.09
505 0.08
506 0.09
507 0.1
508 0.1
509 0.12
510 0.13
511 0.14
512 0.19
513 0.22
514 0.26
515 0.25
516 0.26
517 0.3
518 0.3
519 0.31
520 0.3
521 0.3
522 0.27
523 0.28
524 0.28
525 0.23
526 0.22
527 0.23
528 0.17
529 0.17
530 0.15
531 0.13
532 0.12
533 0.1
534 0.11
535 0.09
536 0.09
537 0.08
538 0.08
539 0.08
540 0.11
541 0.12
542 0.11
543 0.11
544 0.1
545 0.12
546 0.12
547 0.12
548 0.1
549 0.1
550 0.14
551 0.15
552 0.15
553 0.13
554 0.16
555 0.16
556 0.16
557 0.16
558 0.11
559 0.09
560 0.09
561 0.08
562 0.07
563 0.09
564 0.1
565 0.09
566 0.11
567 0.11
568 0.17
569 0.21
570 0.2
571 0.21
572 0.25
573 0.32
574 0.4
575 0.44
576 0.4
577 0.38
578 0.38
579 0.35
580 0.33
581 0.26
582 0.17
583 0.13
584 0.12
585 0.09
586 0.09
587 0.07
588 0.06
589 0.05
590 0.05
591 0.04
592 0.04
593 0.04
594 0.07
595 0.09
596 0.12
597 0.12
598 0.14
599 0.18
600 0.18
601 0.22
602 0.25
603 0.31
604 0.33
605 0.33
606 0.39
607 0.37
608 0.39
609 0.38
610 0.34
611 0.26
612 0.23
613 0.23
614 0.15
615 0.13
616 0.11
617 0.08
618 0.07
619 0.07
620 0.05
621 0.05
622 0.05
623 0.04
624 0.04
625 0.06
626 0.07
627 0.08
628 0.07
629 0.07
630 0.07
631 0.08
632 0.09
633 0.09
634 0.1
635 0.12
636 0.15
637 0.15
638 0.15
639 0.15
640 0.14
641 0.13
642 0.12
643 0.14
644 0.15
645 0.17
646 0.22
647 0.22
648 0.23
649 0.24
650 0.23
651 0.2
652 0.21
653 0.24
654 0.28
655 0.28
656 0.28
657 0.27
658 0.29
659 0.28
660 0.23
661 0.18
662 0.1
663 0.1
664 0.1
665 0.09
666 0.11
667 0.12
668 0.13
669 0.14
670 0.14
671 0.16
672 0.17
673 0.18
674 0.16
675 0.2
676 0.25
677 0.27
678 0.29
679 0.28
680 0.28
681 0.28
682 0.33
683 0.31
684 0.26
685 0.23
686 0.21
687 0.22
688 0.21
689 0.21
690 0.12
691 0.1
692 0.12
693 0.12
694 0.12
695 0.1
696 0.1
697 0.09
698 0.1
699 0.1
700 0.07
701 0.08
702 0.07
703 0.1
704 0.1
705 0.11
706 0.12
707 0.13
708 0.15
709 0.15
710 0.19
711 0.17
712 0.17
713 0.17
714 0.16
715 0.15
716 0.14
717 0.13
718 0.08
719 0.08
720 0.11
721 0.11
722 0.1
723 0.1
724 0.1
725 0.1
726 0.11
727 0.11
728 0.08
729 0.07
730 0.08
731 0.08
732 0.07
733 0.06
734 0.05
735 0.06
736 0.07
737 0.07
738 0.08
739 0.08
740 0.09
741 0.09
742 0.1
743 0.1
744 0.12
745 0.16
746 0.17
747 0.16
748 0.17
749 0.19
750 0.19
751 0.23
752 0.22
753 0.2
754 0.19
755 0.2
756 0.24
757 0.22
758 0.29
759 0.27
760 0.27
761 0.26
762 0.26
763 0.26
764 0.2
765 0.19
766 0.13
767 0.1
768 0.08
769 0.09
770 0.09
771 0.09
772 0.1
773 0.1
774 0.1
775 0.12
776 0.13
777 0.13
778 0.14
779 0.14
780 0.16
781 0.18
782 0.18
783 0.18
784 0.18
785 0.19
786 0.2
787 0.2
788 0.19
789 0.23
790 0.25
791 0.27
792 0.33
793 0.34
794 0.33
795 0.32
796 0.34
797 0.27
798 0.25
799 0.21
800 0.15
801 0.11
802 0.1
803 0.09
804 0.08
805 0.1
806 0.1
807 0.11
808 0.11
809 0.12
810 0.12
811 0.13
812 0.15
813 0.17
814 0.16
815 0.18
816 0.19
817 0.19
818 0.19
819 0.24
820 0.26
821 0.25
822 0.23
823 0.21
824 0.2
825 0.19
826 0.19
827 0.19
828 0.18
829 0.19
830 0.2
831 0.2
832 0.22
833 0.22
834 0.23
835 0.22
836 0.27
837 0.3
838 0.31
839 0.33
840 0.31
841 0.31
842 0.29
843 0.25
844 0.19
845 0.13
846 0.13
847 0.14
848 0.15
849 0.16
850 0.16
851 0.16
852 0.13
853 0.14
854 0.16
855 0.15
856 0.17
857 0.18
858 0.2
859 0.2
860 0.21
861 0.21
862 0.2
863 0.24
864 0.2
865 0.21
866 0.27
867 0.27
868 0.29
869 0.31
870 0.28
871 0.24
872 0.27
873 0.26
874 0.25
875 0.25
876 0.27
877 0.31
878 0.31
879 0.3
880 0.27
881 0.26
882 0.23
883 0.25
884 0.27
885 0.21
886 0.27
887 0.31
888 0.39
889 0.5
890 0.53
891 0.57
892 0.61
893 0.7
894 0.75
895 0.81
896 0.8
897 0.74
898 0.77
899 0.76
900 0.68
901 0.61
902 0.6
903 0.52
904 0.46
905 0.42
906 0.33
907 0.26
908 0.24
909 0.22
910 0.12
911 0.09
912 0.07
913 0.07
914 0.06
915 0.06
916 0.05
917 0.05
918 0.05
919 0.04
920 0.04
921 0.04
922 0.04
923 0.03
924 0.03
925 0.03
926 0.03
927 0.03
928 0.04
929 0.04
930 0.04
931 0.04
932 0.04
933 0.05
934 0.05
935 0.05
936 0.06
937 0.06
938 0.1
939 0.13
940 0.16
941 0.21
942 0.23
943 0.26
944 0.35
945 0.38
946 0.35
947 0.36
948 0.34
949 0.29
950 0.31
951 0.29
952 0.22
953 0.21
954 0.21
955 0.2
956 0.19
957 0.2
958 0.15
959 0.17
960 0.15
961 0.14
962 0.14
963 0.11
964 0.11
965 0.11
966 0.11
967 0.08
968 0.08
969 0.07
970 0.07
971 0.11
972 0.13
973 0.13
974 0.13
975 0.13
976 0.13
977 0.13
978 0.13
979 0.09
980 0.06
981 0.06
982 0.06
983 0.05
984 0.04
985 0.04
986 0.03
987 0.03
988 0.03
989 0.02
990 0.02
991 0.03
992 0.03
993 0.03
994 0.03
995 0.04
996 0.04
997 0.04
998 0.05
999 0.07
1000 0.07
1001 0.08
1002 0.15
1003 0.16
1004 0.17
1005 0.2
1006 0.21
1007 0.21
1008 0.22
1009 0.23
1010 0.17
1011 0.16
1012 0.16
1013 0.12
1014 0.13
1015 0.13
1016 0.12
1017 0.11
1018 0.12
1019 0.11
1020 0.12
1021 0.18
1022 0.23
1023 0.27
1024 0.34
1025 0.37
1026 0.41
1027 0.42
1028 0.43
1029 0.4
1030 0.37
1031 0.34
1032 0.29
1033 0.27
1034 0.19
1035 0.18
1036 0.16
1037 0.13
1038 0.1
1039 0.09
1040 0.07
1041 0.07
1042 0.06
1043 0.07
1044 0.08
1045 0.08
1046 0.09
1047 0.08
1048 0.08
1049 0.08
1050 0.08
1051 0.07
1052 0.07
1053 0.07
1054 0.07
1055 0.07
1056 0.06
1057 0.06
1058 0.09
1059 0.09
1060 0.09
1061 0.08
1062 0.08
1063 0.08
1064 0.09
1065 0.08
1066 0.05
1067 0.05
1068 0.05
1069 0.06
1070 0.05
1071 0.06
1072 0.05
1073 0.07
1074 0.08
1075 0.1
1076 0.1
1077 0.1
1078 0.11
1079 0.11
1080 0.13
1081 0.18
1082 0.21
1083 0.22
1084 0.29
1085 0.32
1086 0.35
1087 0.39
1088 0.39
1089 0.35
1090 0.34
1091 0.35
1092 0.37
1093 0.39
1094 0.38
1095 0.34
1096 0.34
1097 0.32
1098 0.3
1099 0.28
1100 0.2
1101 0.24
1102 0.3
1103 0.35
1104 0.36
1105 0.37
1106 0.39
1107 0.45
1108 0.5
1109 0.49
1110 0.47
1111 0.44
1112 0.42
1113 0.43
1114 0.41
1115 0.34
1116 0.25
1117 0.19
1118 0.13
1119 0.11
1120 0.09
1121 0.09
1122 0.09
1123 0.1