Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U7PTC0

Protein Details
Accession U7PTC0    Localization Confidence High Confidence Score 18.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
106-143ARGLKATKRKRDGTEKPRKPKEGRREKKRRPAADDGDABasic
204-223LAIRNPNKRRRKQDEDDLEKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
107-136RGLKATKRKRDGTEKPRKPKEGRREKKRRP
172-177APRRKK
194-197RKRA
206-215IRNPNKRRRK
470-478RAKMRNKKK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MADEASSPAAAISPKADAGIDDDVAKAAATPEPEASDPAGPDGEEARDNGDDNDDAPQTVEDAGGASGDDDEDEEQLSDVDEDFEDYDPATAEIEERPVTIDEEAARGLKATKRKRDGTEKPRKPKEGRREKKRRPAADDGDAAPGAGDSDEAAEGSNRARRSRADDGAASAPRRKKSASPEVNEEDLTPEERRKRALNRAIDLAIRNPNKRRRKQDEDDLEKMADEEIAQLKIRMERACMADIDARAEGRPAVNKLQLLPQVLSVLNRNDIQETILDPETNFLQSLKFFLEPLNDGSLPSYTIQRDIFTCLTQLPIEKDALLSSGIGKVVLFYTRSKRAEPAIKRMAERLVGEWSRPILKKTDDFKKRHIETREYDYRAARLAEQKSAMGGAPGSQYTQTLAERPMSRFELDREMQLAPPVVNANRATPVGLPQSYTIAPKSTFDGHRGADYRPIGASSVAAFQRMAQRAKMRNKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.12
3 0.12
4 0.1
5 0.14
6 0.16
7 0.15
8 0.14
9 0.14
10 0.13
11 0.13
12 0.13
13 0.09
14 0.08
15 0.09
16 0.1
17 0.11
18 0.12
19 0.15
20 0.16
21 0.17
22 0.18
23 0.18
24 0.17
25 0.17
26 0.17
27 0.14
28 0.14
29 0.14
30 0.14
31 0.13
32 0.13
33 0.15
34 0.15
35 0.16
36 0.16
37 0.16
38 0.14
39 0.14
40 0.18
41 0.15
42 0.14
43 0.14
44 0.13
45 0.11
46 0.11
47 0.11
48 0.07
49 0.07
50 0.07
51 0.06
52 0.06
53 0.05
54 0.05
55 0.05
56 0.05
57 0.05
58 0.05
59 0.06
60 0.06
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.07
65 0.07
66 0.06
67 0.07
68 0.06
69 0.07
70 0.08
71 0.09
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.06
79 0.07
80 0.08
81 0.1
82 0.1
83 0.1
84 0.11
85 0.12
86 0.13
87 0.12
88 0.13
89 0.11
90 0.12
91 0.13
92 0.11
93 0.1
94 0.1
95 0.12
96 0.15
97 0.24
98 0.32
99 0.41
100 0.49
101 0.56
102 0.63
103 0.71
104 0.78
105 0.8
106 0.82
107 0.82
108 0.85
109 0.87
110 0.89
111 0.86
112 0.85
113 0.85
114 0.85
115 0.86
116 0.87
117 0.89
118 0.91
119 0.93
120 0.93
121 0.9
122 0.86
123 0.85
124 0.81
125 0.76
126 0.68
127 0.59
128 0.51
129 0.43
130 0.35
131 0.24
132 0.17
133 0.11
134 0.07
135 0.06
136 0.03
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.05
143 0.07
144 0.11
145 0.12
146 0.13
147 0.15
148 0.17
149 0.25
150 0.32
151 0.34
152 0.33
153 0.32
154 0.34
155 0.38
156 0.38
157 0.32
158 0.3
159 0.31
160 0.3
161 0.31
162 0.3
163 0.3
164 0.36
165 0.46
166 0.49
167 0.48
168 0.54
169 0.55
170 0.55
171 0.5
172 0.41
173 0.31
174 0.23
175 0.21
176 0.15
177 0.16
178 0.19
179 0.2
180 0.23
181 0.26
182 0.32
183 0.4
184 0.47
185 0.49
186 0.47
187 0.49
188 0.48
189 0.44
190 0.38
191 0.31
192 0.31
193 0.28
194 0.29
195 0.34
196 0.42
197 0.51
198 0.58
199 0.66
200 0.67
201 0.74
202 0.77
203 0.8
204 0.81
205 0.78
206 0.73
207 0.64
208 0.54
209 0.44
210 0.37
211 0.27
212 0.16
213 0.08
214 0.07
215 0.06
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.08
220 0.1
221 0.13
222 0.12
223 0.11
224 0.14
225 0.16
226 0.16
227 0.15
228 0.15
229 0.15
230 0.15
231 0.15
232 0.12
233 0.1
234 0.09
235 0.09
236 0.08
237 0.07
238 0.09
239 0.09
240 0.12
241 0.13
242 0.14
243 0.15
244 0.19
245 0.2
246 0.2
247 0.18
248 0.16
249 0.16
250 0.15
251 0.15
252 0.13
253 0.12
254 0.12
255 0.13
256 0.13
257 0.12
258 0.12
259 0.11
260 0.1
261 0.1
262 0.11
263 0.1
264 0.1
265 0.09
266 0.1
267 0.1
268 0.1
269 0.09
270 0.06
271 0.07
272 0.07
273 0.08
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.11
279 0.12
280 0.13
281 0.16
282 0.14
283 0.14
284 0.14
285 0.13
286 0.13
287 0.12
288 0.13
289 0.1
290 0.12
291 0.13
292 0.13
293 0.14
294 0.17
295 0.18
296 0.15
297 0.16
298 0.13
299 0.14
300 0.13
301 0.14
302 0.12
303 0.13
304 0.13
305 0.12
306 0.12
307 0.11
308 0.11
309 0.1
310 0.07
311 0.06
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.06
317 0.07
318 0.08
319 0.09
320 0.11
321 0.17
322 0.26
323 0.28
324 0.29
325 0.31
326 0.36
327 0.44
328 0.46
329 0.5
330 0.5
331 0.52
332 0.51
333 0.51
334 0.46
335 0.4
336 0.35
337 0.27
338 0.27
339 0.24
340 0.24
341 0.23
342 0.22
343 0.25
344 0.26
345 0.25
346 0.22
347 0.26
348 0.33
349 0.4
350 0.48
351 0.52
352 0.55
353 0.61
354 0.67
355 0.68
356 0.69
357 0.68
358 0.65
359 0.61
360 0.66
361 0.67
362 0.6
363 0.59
364 0.52
365 0.47
366 0.42
367 0.38
368 0.32
369 0.3
370 0.29
371 0.3
372 0.29
373 0.28
374 0.26
375 0.25
376 0.21
377 0.14
378 0.11
379 0.09
380 0.1
381 0.1
382 0.1
383 0.1
384 0.1
385 0.11
386 0.14
387 0.14
388 0.14
389 0.16
390 0.22
391 0.25
392 0.27
393 0.31
394 0.31
395 0.31
396 0.31
397 0.32
398 0.34
399 0.31
400 0.32
401 0.29
402 0.28
403 0.27
404 0.27
405 0.25
406 0.16
407 0.17
408 0.18
409 0.17
410 0.2
411 0.2
412 0.21
413 0.22
414 0.22
415 0.22
416 0.19
417 0.23
418 0.24
419 0.24
420 0.23
421 0.21
422 0.24
423 0.25
424 0.26
425 0.23
426 0.21
427 0.21
428 0.21
429 0.24
430 0.28
431 0.3
432 0.3
433 0.34
434 0.32
435 0.38
436 0.39
437 0.36
438 0.37
439 0.35
440 0.33
441 0.29
442 0.28
443 0.22
444 0.2
445 0.19
446 0.13
447 0.19
448 0.17
449 0.17
450 0.17
451 0.19
452 0.27
453 0.33
454 0.34
455 0.33
456 0.42
457 0.5
458 0.62