Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

B2ATX0

Protein Details
Accession B2ATX0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
278-356SSRSADRRDSRSRSRDRRDSRSRSYSRSRSRTRSRSRSRSRSRSRSRSRSRSGRYRSRSRSGSRHRSPSRSRSRGERSDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
184-190RKLRRKG
270-353RSRSRSYSSSRSADRRDSRSRSRDRRDSRSRSYSRSRSRTRSRSRSRSRSRSRSRSRSRSGRYRSRSRSGSRHRSPSRSRSRGE
Subcellular Location(s) nucl 17.5, mito_nucl 11.5, mito 4.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
IPR024767  PRP38_C  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG pan:PODANSg4205  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
PF12871  PRP38_assoc  
Amino Acid Sequences MWGTIFRGALCVLLQQMFAIQNIPIPSSRPHTITMTDRKPKTSEFHRADERRFLDERGSSGPLAPNGLNPATILEKAVRERIVDSYFYKEQCYAINEADIVDRVVEHVDHIGGVTGTVQKPTPFLCLAFKLLQLAPNDDILNEYLNFGGEKFKYLRALAVFYIRLTRQDKDVYTRLEPFLEDRRKLRRKGRNGVSLTYMDEFVDDLLVKDRVCATSLWKMRRRDVLEDLELLEPRVSPLGSLEDLLEEEDEEMKDGGEDKNGRGGSGGERSRSRSYSSSRSADRRDSRSRSRDRRDSRSRSYSRSRSRTRSRSRSRSRSRSRSRSRSRSGRYRSRSRSGSRHRSPSRSRSRGERSDHDRMDIDRSDKDREEGEASP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.1
3 0.13
4 0.13
5 0.13
6 0.12
7 0.1
8 0.13
9 0.14
10 0.16
11 0.14
12 0.16
13 0.19
14 0.24
15 0.28
16 0.27
17 0.29
18 0.31
19 0.35
20 0.41
21 0.48
22 0.52
23 0.58
24 0.58
25 0.58
26 0.58
27 0.58
28 0.56
29 0.55
30 0.56
31 0.53
32 0.58
33 0.65
34 0.68
35 0.68
36 0.7
37 0.63
38 0.58
39 0.54
40 0.48
41 0.43
42 0.38
43 0.37
44 0.32
45 0.31
46 0.25
47 0.26
48 0.27
49 0.23
50 0.24
51 0.21
52 0.18
53 0.19
54 0.19
55 0.17
56 0.14
57 0.15
58 0.14
59 0.14
60 0.14
61 0.12
62 0.15
63 0.17
64 0.21
65 0.2
66 0.19
67 0.2
68 0.23
69 0.24
70 0.24
71 0.23
72 0.26
73 0.29
74 0.29
75 0.29
76 0.25
77 0.24
78 0.24
79 0.26
80 0.22
81 0.18
82 0.18
83 0.17
84 0.17
85 0.16
86 0.13
87 0.1
88 0.07
89 0.06
90 0.06
91 0.07
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.08
103 0.09
104 0.1
105 0.11
106 0.1
107 0.12
108 0.13
109 0.15
110 0.13
111 0.14
112 0.15
113 0.17
114 0.2
115 0.2
116 0.19
117 0.19
118 0.18
119 0.21
120 0.19
121 0.2
122 0.17
123 0.18
124 0.17
125 0.14
126 0.15
127 0.11
128 0.12
129 0.09
130 0.08
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.1
136 0.08
137 0.11
138 0.12
139 0.14
140 0.16
141 0.16
142 0.18
143 0.15
144 0.17
145 0.15
146 0.16
147 0.15
148 0.13
149 0.16
150 0.13
151 0.17
152 0.18
153 0.18
154 0.18
155 0.21
156 0.22
157 0.25
158 0.3
159 0.28
160 0.28
161 0.29
162 0.27
163 0.24
164 0.23
165 0.2
166 0.25
167 0.27
168 0.27
169 0.28
170 0.38
171 0.44
172 0.51
173 0.58
174 0.58
175 0.62
176 0.71
177 0.75
178 0.74
179 0.7
180 0.65
181 0.58
182 0.5
183 0.41
184 0.32
185 0.24
186 0.14
187 0.11
188 0.1
189 0.06
190 0.06
191 0.05
192 0.04
193 0.06
194 0.07
195 0.06
196 0.07
197 0.08
198 0.08
199 0.09
200 0.09
201 0.11
202 0.19
203 0.25
204 0.32
205 0.38
206 0.41
207 0.44
208 0.52
209 0.52
210 0.48
211 0.49
212 0.46
213 0.4
214 0.38
215 0.36
216 0.29
217 0.25
218 0.21
219 0.15
220 0.1
221 0.08
222 0.09
223 0.07
224 0.05
225 0.06
226 0.08
227 0.08
228 0.09
229 0.09
230 0.08
231 0.08
232 0.09
233 0.08
234 0.05
235 0.05
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.07
243 0.07
244 0.11
245 0.13
246 0.12
247 0.18
248 0.18
249 0.18
250 0.17
251 0.18
252 0.17
253 0.24
254 0.25
255 0.23
256 0.25
257 0.3
258 0.34
259 0.34
260 0.35
261 0.32
262 0.36
263 0.41
264 0.46
265 0.47
266 0.49
267 0.54
268 0.56
269 0.6
270 0.61
271 0.61
272 0.63
273 0.65
274 0.69
275 0.73
276 0.79
277 0.79
278 0.82
279 0.84
280 0.84
281 0.86
282 0.88
283 0.86
284 0.85
285 0.85
286 0.81
287 0.78
288 0.8
289 0.8
290 0.79
291 0.81
292 0.8
293 0.79
294 0.85
295 0.88
296 0.88
297 0.89
298 0.9
299 0.9
300 0.92
301 0.93
302 0.94
303 0.94
304 0.94
305 0.94
306 0.94
307 0.94
308 0.94
309 0.94
310 0.94
311 0.93
312 0.93
313 0.92
314 0.91
315 0.91
316 0.9
317 0.89
318 0.88
319 0.88
320 0.87
321 0.85
322 0.84
323 0.82
324 0.82
325 0.83
326 0.84
327 0.83
328 0.85
329 0.84
330 0.85
331 0.87
332 0.87
333 0.87
334 0.84
335 0.8
336 0.79
337 0.81
338 0.8
339 0.78
340 0.77
341 0.75
342 0.77
343 0.74
344 0.67
345 0.6
346 0.53
347 0.52
348 0.47
349 0.42
350 0.38
351 0.4
352 0.43
353 0.41
354 0.41
355 0.36
356 0.35