Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U7PWP6

Protein Details
Accession U7PWP6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
123-146IQNSTTIKRRKSRAKPKDSLAPAKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
130-139KRRKSRAKPK
163-197RREREDAKLRAKPARRPMAKQKEMAAVQKAKSAKK
Subcellular Location(s) cyto 11, cyto_nucl 9.833, cyto_mito 8.833, nucl 7.5, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR003195  TFIID_TAF13  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF02269  TFIID-18kDa  
CDD cd07978  TAF13  
Amino Acid Sequences MMKPKDEHLPIILLPPVLPEPYQGNGSGSMAVDTPHLTPVLPISYAVASATASTIVRLGKAPTAAMTEAATATSTTTAPVQAPRCGGRMRVGKKDAPSIATPPTGVFYPPGVCVKAAKADAMIQNSTTIKRRKSRAKPKDSLAPAKCTAIAVETEAEVKVEERREREDAKLRAKPARRPMAKQKEMAAVQKAKSAKKEEPVQYTRHNQQTPTETPTGAYMQTTEMHYTAPMPNLARIRNDLRESIIQMMYVSGETGEPSLETLSIIEEIVRQQVIELLRSCTELAARRGSRSITINDLIFQIRHDAPKVSRLRTFLSWKDVRKNVKDSDDKGADVDIGGGDDVAGAPIAGAPVEDAAKKNKKNKQVLPWEPVSYFNQEVPERDEEEDEEEEEMNYITLQRLRKADERTKAMTREEYVTWSEYRQASFTYRKSKRFREWAGFGVVTDSKPSDDIVDILGFLTFEMVQTLTEEALRIKDHEDQWKERTGDEARGSKKRKLAQGLFNLPGEGRTPVEVKHIQEAFRRLQVRQKKYRAMLNGTRLSSRPSLKLVFFPNALRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.19
4 0.17
5 0.16
6 0.15
7 0.16
8 0.18
9 0.2
10 0.18
11 0.18
12 0.18
13 0.19
14 0.19
15 0.16
16 0.14
17 0.12
18 0.12
19 0.11
20 0.11
21 0.11
22 0.11
23 0.11
24 0.1
25 0.11
26 0.13
27 0.15
28 0.13
29 0.12
30 0.13
31 0.13
32 0.13
33 0.13
34 0.1
35 0.08
36 0.08
37 0.08
38 0.08
39 0.07
40 0.07
41 0.1
42 0.1
43 0.11
44 0.12
45 0.14
46 0.15
47 0.16
48 0.16
49 0.15
50 0.18
51 0.17
52 0.17
53 0.15
54 0.13
55 0.12
56 0.12
57 0.11
58 0.08
59 0.08
60 0.08
61 0.08
62 0.08
63 0.09
64 0.1
65 0.11
66 0.17
67 0.2
68 0.22
69 0.26
70 0.27
71 0.3
72 0.3
73 0.31
74 0.33
75 0.39
76 0.42
77 0.48
78 0.51
79 0.52
80 0.54
81 0.6
82 0.54
83 0.48
84 0.44
85 0.38
86 0.36
87 0.33
88 0.29
89 0.22
90 0.21
91 0.18
92 0.16
93 0.14
94 0.12
95 0.13
96 0.15
97 0.17
98 0.16
99 0.16
100 0.17
101 0.18
102 0.21
103 0.2
104 0.18
105 0.16
106 0.2
107 0.23
108 0.25
109 0.24
110 0.19
111 0.21
112 0.22
113 0.24
114 0.27
115 0.29
116 0.33
117 0.41
118 0.49
119 0.57
120 0.67
121 0.76
122 0.79
123 0.84
124 0.84
125 0.82
126 0.83
127 0.8
128 0.79
129 0.71
130 0.67
131 0.57
132 0.51
133 0.46
134 0.36
135 0.28
136 0.19
137 0.16
138 0.11
139 0.1
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.08
145 0.08
146 0.1
147 0.15
148 0.18
149 0.2
150 0.24
151 0.29
152 0.31
153 0.37
154 0.43
155 0.45
156 0.5
157 0.52
158 0.52
159 0.56
160 0.59
161 0.6
162 0.61
163 0.64
164 0.61
165 0.63
166 0.7
167 0.73
168 0.73
169 0.68
170 0.62
171 0.58
172 0.56
173 0.53
174 0.48
175 0.42
176 0.37
177 0.39
178 0.39
179 0.34
180 0.36
181 0.38
182 0.36
183 0.38
184 0.46
185 0.48
186 0.53
187 0.54
188 0.53
189 0.54
190 0.56
191 0.56
192 0.55
193 0.51
194 0.43
195 0.44
196 0.46
197 0.43
198 0.43
199 0.37
200 0.29
201 0.27
202 0.28
203 0.25
204 0.18
205 0.15
206 0.09
207 0.09
208 0.11
209 0.11
210 0.1
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.11
215 0.11
216 0.11
217 0.11
218 0.11
219 0.14
220 0.17
221 0.19
222 0.18
223 0.2
224 0.23
225 0.26
226 0.27
227 0.24
228 0.24
229 0.24
230 0.24
231 0.23
232 0.19
233 0.15
234 0.13
235 0.12
236 0.1
237 0.08
238 0.07
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.03
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.05
256 0.06
257 0.05
258 0.05
259 0.04
260 0.08
261 0.08
262 0.09
263 0.1
264 0.11
265 0.11
266 0.12
267 0.12
268 0.09
269 0.11
270 0.12
271 0.14
272 0.19
273 0.2
274 0.2
275 0.21
276 0.21
277 0.22
278 0.21
279 0.2
280 0.17
281 0.18
282 0.17
283 0.17
284 0.17
285 0.15
286 0.12
287 0.11
288 0.11
289 0.11
290 0.12
291 0.12
292 0.14
293 0.14
294 0.23
295 0.27
296 0.26
297 0.28
298 0.29
299 0.31
300 0.33
301 0.38
302 0.32
303 0.36
304 0.39
305 0.4
306 0.45
307 0.47
308 0.49
309 0.49
310 0.52
311 0.48
312 0.51
313 0.53
314 0.48
315 0.5
316 0.45
317 0.4
318 0.35
319 0.3
320 0.22
321 0.16
322 0.14
323 0.06
324 0.04
325 0.04
326 0.03
327 0.03
328 0.03
329 0.03
330 0.02
331 0.02
332 0.02
333 0.02
334 0.02
335 0.02
336 0.02
337 0.02
338 0.02
339 0.03
340 0.04
341 0.05
342 0.06
343 0.14
344 0.22
345 0.27
346 0.36
347 0.42
348 0.51
349 0.6
350 0.66
351 0.69
352 0.73
353 0.75
354 0.72
355 0.69
356 0.62
357 0.53
358 0.49
359 0.41
360 0.34
361 0.27
362 0.23
363 0.24
364 0.22
365 0.23
366 0.24
367 0.25
368 0.23
369 0.23
370 0.22
371 0.18
372 0.21
373 0.2
374 0.16
375 0.14
376 0.12
377 0.11
378 0.11
379 0.1
380 0.06
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.1
385 0.12
386 0.16
387 0.18
388 0.23
389 0.29
390 0.37
391 0.44
392 0.47
393 0.52
394 0.54
395 0.57
396 0.56
397 0.52
398 0.47
399 0.42
400 0.38
401 0.33
402 0.3
403 0.26
404 0.26
405 0.23
406 0.21
407 0.23
408 0.21
409 0.21
410 0.19
411 0.19
412 0.22
413 0.29
414 0.34
415 0.4
416 0.46
417 0.54
418 0.62
419 0.69
420 0.73
421 0.76
422 0.78
423 0.76
424 0.73
425 0.68
426 0.65
427 0.56
428 0.47
429 0.4
430 0.33
431 0.24
432 0.21
433 0.18
434 0.12
435 0.13
436 0.13
437 0.11
438 0.1
439 0.1
440 0.11
441 0.1
442 0.1
443 0.09
444 0.09
445 0.07
446 0.06
447 0.07
448 0.05
449 0.05
450 0.05
451 0.06
452 0.06
453 0.07
454 0.08
455 0.07
456 0.07
457 0.08
458 0.08
459 0.1
460 0.11
461 0.11
462 0.13
463 0.2
464 0.25
465 0.34
466 0.4
467 0.43
468 0.46
469 0.53
470 0.52
471 0.45
472 0.47
473 0.4
474 0.41
475 0.42
476 0.46
477 0.45
478 0.54
479 0.58
480 0.58
481 0.62
482 0.61
483 0.63
484 0.65
485 0.67
486 0.67
487 0.72
488 0.74
489 0.7
490 0.63
491 0.56
492 0.45
493 0.38
494 0.3
495 0.21
496 0.15
497 0.14
498 0.15
499 0.15
500 0.23
501 0.26
502 0.27
503 0.34
504 0.36
505 0.37
506 0.42
507 0.47
508 0.44
509 0.47
510 0.48
511 0.41
512 0.48
513 0.55
514 0.59
515 0.64
516 0.69
517 0.71
518 0.73
519 0.8
520 0.78
521 0.77
522 0.76
523 0.75
524 0.73
525 0.66
526 0.63
527 0.56
528 0.53
529 0.5
530 0.46
531 0.4
532 0.38
533 0.41
534 0.4
535 0.46
536 0.46
537 0.44
538 0.42