Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U7PXY6

Protein Details
Accession U7PXY6    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-52EILAERKSERRGNRSRNDRNDRNDRNGGRSGRRDRDRRDDYPBasic
259-278SPPPRRRDGGRRPGERRGGRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-48KSERRGNRSRNDRNDRNDRNGGRSGRRDRDRR
253-279RLSRSHSPPPRRRDGGRRPGERRGGRN
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 13.5, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12418  RRM_Aly_REF_like  
Amino Acid Sequences MTANMDVSLDEILAERKSERRGNRSRNDRNDRNDRNGGRSGRRDRDRRDDYPRDGVRKSYRDDPRKIDDEWVHDRYDNNDSEHHVKASRSRASPERTRGTRVRVDNLHYDLTKDDLEGLFSRIGPVAAVDLVYDRAGRSEGTAYVTYLEHDDARAALREFDGANAKGQPIRLSIVPAGGRRGHNGNVAVGSGRPLAERISRPRKRGGDDGDDQDGQDDDDDDGRTSLAVAARRGIDRYVPGSGSTAGGGGSGRLSRSHSPPPRRRDGGRRPGERRGGRNGNGRSDNNNNNNNNNNNNNNNNNNNQNGGGGGGNRRPRKTQEELDAEMADYFVEGSNGAAATTTAAPAVEAAAAAHDDGDDTDMIL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.12
3 0.16
4 0.24
5 0.32
6 0.39
7 0.48
8 0.58
9 0.67
10 0.76
11 0.82
12 0.86
13 0.89
14 0.92
15 0.9
16 0.89
17 0.89
18 0.87
19 0.84
20 0.83
21 0.76
22 0.71
23 0.7
24 0.68
25 0.65
26 0.67
27 0.68
28 0.69
29 0.75
30 0.77
31 0.77
32 0.81
33 0.81
34 0.78
35 0.79
36 0.78
37 0.74
38 0.76
39 0.75
40 0.7
41 0.63
42 0.63
43 0.62
44 0.59
45 0.58
46 0.57
47 0.6
48 0.63
49 0.69
50 0.68
51 0.67
52 0.65
53 0.62
54 0.6
55 0.53
56 0.51
57 0.52
58 0.48
59 0.41
60 0.39
61 0.38
62 0.34
63 0.36
64 0.31
65 0.26
66 0.25
67 0.28
68 0.31
69 0.31
70 0.3
71 0.26
72 0.25
73 0.29
74 0.35
75 0.38
76 0.36
77 0.39
78 0.45
79 0.5
80 0.57
81 0.59
82 0.6
83 0.56
84 0.61
85 0.6
86 0.6
87 0.6
88 0.55
89 0.54
90 0.49
91 0.5
92 0.48
93 0.47
94 0.43
95 0.35
96 0.32
97 0.25
98 0.24
99 0.2
100 0.14
101 0.13
102 0.09
103 0.11
104 0.11
105 0.13
106 0.11
107 0.11
108 0.12
109 0.1
110 0.1
111 0.08
112 0.07
113 0.06
114 0.05
115 0.05
116 0.04
117 0.04
118 0.05
119 0.05
120 0.06
121 0.05
122 0.05
123 0.06
124 0.06
125 0.07
126 0.07
127 0.08
128 0.11
129 0.12
130 0.11
131 0.12
132 0.12
133 0.11
134 0.11
135 0.11
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.06
140 0.07
141 0.08
142 0.08
143 0.07
144 0.07
145 0.08
146 0.08
147 0.09
148 0.12
149 0.11
150 0.12
151 0.12
152 0.12
153 0.12
154 0.13
155 0.12
156 0.1
157 0.11
158 0.1
159 0.11
160 0.11
161 0.13
162 0.14
163 0.14
164 0.15
165 0.17
166 0.17
167 0.17
168 0.19
169 0.17
170 0.18
171 0.18
172 0.16
173 0.13
174 0.13
175 0.11
176 0.09
177 0.08
178 0.06
179 0.06
180 0.05
181 0.06
182 0.07
183 0.11
184 0.14
185 0.23
186 0.33
187 0.38
188 0.41
189 0.49
190 0.52
191 0.52
192 0.55
193 0.52
194 0.48
195 0.47
196 0.47
197 0.43
198 0.38
199 0.34
200 0.27
201 0.21
202 0.14
203 0.1
204 0.08
205 0.05
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.06
213 0.08
214 0.09
215 0.1
216 0.1
217 0.12
218 0.14
219 0.15
220 0.15
221 0.14
222 0.13
223 0.13
224 0.15
225 0.15
226 0.13
227 0.13
228 0.14
229 0.14
230 0.13
231 0.11
232 0.09
233 0.07
234 0.07
235 0.06
236 0.05
237 0.05
238 0.06
239 0.06
240 0.07
241 0.11
242 0.15
243 0.2
244 0.3
245 0.38
246 0.48
247 0.57
248 0.64
249 0.69
250 0.71
251 0.73
252 0.74
253 0.76
254 0.76
255 0.77
256 0.79
257 0.75
258 0.78
259 0.81
260 0.77
261 0.71
262 0.7
263 0.68
264 0.64
265 0.68
266 0.64
267 0.62
268 0.62
269 0.59
270 0.55
271 0.54
272 0.58
273 0.57
274 0.61
275 0.56
276 0.55
277 0.59
278 0.58
279 0.57
280 0.54
281 0.52
282 0.5
283 0.53
284 0.54
285 0.54
286 0.54
287 0.53
288 0.51
289 0.47
290 0.42
291 0.36
292 0.3
293 0.24
294 0.2
295 0.16
296 0.13
297 0.16
298 0.2
299 0.28
300 0.33
301 0.36
302 0.4
303 0.45
304 0.51
305 0.55
306 0.57
307 0.59
308 0.6
309 0.61
310 0.6
311 0.54
312 0.46
313 0.38
314 0.3
315 0.19
316 0.12
317 0.09
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.08
328 0.08
329 0.08
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.08
335 0.06
336 0.05
337 0.05
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.06
342 0.05
343 0.06
344 0.06
345 0.08