Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U7PM88

Protein Details
Accession U7PM88    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
411-436AVRAREEARREKRRQEERKLRQSRMGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
228-245PPKFKHKKIPRGPPSPPP
358-380GPSSSRRPGRGRERSRSSSGSRS
385-435SRSRSRSYDSRRRSRSRGGSEEEEDRAVRAREEARREKRRQEERKLRQSRM
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 14, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MASIASSLAQSLPKPKYTGEDEEAPVRAQRGPRIVSAADLDETQVVLKRTTAPPYGQRQGWRPRAPEDFGDGGAFPEIPFAQYPLDMGRPGASAAKTKSNALAVQVDGEGKVKYDAIARLGHADGRVIHTSFKDLIPLRQRAEAGDLNLDRPDQESVAETTERTKNALALLVSGAVAAQKPKTLAHMGGQRKEATYVRYTPASQFGDSSTKQDRVMKIVERQRDPLEPPKFKHKKIPRGPPSPPPPVMHSPPRKLTAADQEAWKIPPPISNWKNPKGYTVPLDKRLAAAGKGLEDVTINDKFAQFSEALFMADRHAREEVRQRAQMQQRLAEKEKLQKEEHLRELAQQARAERAAAAGPSSSRRPGRGRERSRSSSGSRSSYSDSRSRSRSYDSRRRSRSRGGSEEEEDRAVRAREEARREKRRQEERKLRQSRMGAERRMQVLAREQNRDISEKVALGLAKPTASAEGMYDSRLFNQTSGFDSGFNEDNPYDKPLFAGQDAISSIYRSRGGPGGAGGDDDFDDPAAGDAEMAKIQKTSRFGEALGRGTFKGARDVEAREGPVQFEKETTGLGVSGSGPAGSSAAADPFNVDKFLSEVEQGQGQGGASAGGSKRGYGLQADGGPSARQSKRARVEDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.31
3 0.36
4 0.41
5 0.47
6 0.44
7 0.46
8 0.44
9 0.46
10 0.47
11 0.41
12 0.36
13 0.3
14 0.29
15 0.26
16 0.29
17 0.33
18 0.34
19 0.35
20 0.39
21 0.37
22 0.35
23 0.34
24 0.3
25 0.23
26 0.2
27 0.19
28 0.14
29 0.14
30 0.13
31 0.14
32 0.13
33 0.12
34 0.14
35 0.19
36 0.22
37 0.28
38 0.31
39 0.33
40 0.4
41 0.49
42 0.54
43 0.53
44 0.55
45 0.58
46 0.64
47 0.7
48 0.68
49 0.63
50 0.63
51 0.65
52 0.63
53 0.57
54 0.53
55 0.44
56 0.38
57 0.35
58 0.28
59 0.23
60 0.19
61 0.17
62 0.1
63 0.1
64 0.09
65 0.09
66 0.1
67 0.1
68 0.11
69 0.1
70 0.12
71 0.12
72 0.14
73 0.13
74 0.13
75 0.13
76 0.13
77 0.14
78 0.17
79 0.16
80 0.19
81 0.22
82 0.29
83 0.29
84 0.3
85 0.32
86 0.31
87 0.31
88 0.28
89 0.28
90 0.2
91 0.2
92 0.2
93 0.17
94 0.14
95 0.15
96 0.12
97 0.1
98 0.1
99 0.09
100 0.09
101 0.13
102 0.14
103 0.16
104 0.18
105 0.17
106 0.2
107 0.2
108 0.21
109 0.17
110 0.16
111 0.14
112 0.17
113 0.2
114 0.17
115 0.18
116 0.17
117 0.2
118 0.21
119 0.2
120 0.22
121 0.2
122 0.27
123 0.34
124 0.38
125 0.37
126 0.39
127 0.39
128 0.33
129 0.38
130 0.33
131 0.26
132 0.27
133 0.26
134 0.24
135 0.24
136 0.23
137 0.17
138 0.16
139 0.16
140 0.1
141 0.1
142 0.11
143 0.11
144 0.14
145 0.14
146 0.13
147 0.16
148 0.2
149 0.2
150 0.2
151 0.19
152 0.17
153 0.18
154 0.2
155 0.15
156 0.12
157 0.12
158 0.11
159 0.1
160 0.09
161 0.08
162 0.05
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.07
167 0.08
168 0.09
169 0.12
170 0.14
171 0.15
172 0.2
173 0.28
174 0.33
175 0.36
176 0.39
177 0.36
178 0.34
179 0.36
180 0.32
181 0.27
182 0.26
183 0.25
184 0.25
185 0.26
186 0.26
187 0.25
188 0.3
189 0.29
190 0.25
191 0.22
192 0.22
193 0.25
194 0.25
195 0.28
196 0.24
197 0.24
198 0.26
199 0.3
200 0.29
201 0.27
202 0.31
203 0.31
204 0.35
205 0.39
206 0.44
207 0.42
208 0.44
209 0.43
210 0.41
211 0.41
212 0.43
213 0.46
214 0.44
215 0.45
216 0.53
217 0.57
218 0.56
219 0.62
220 0.62
221 0.64
222 0.68
223 0.77
224 0.76
225 0.77
226 0.8
227 0.79
228 0.76
229 0.73
230 0.66
231 0.57
232 0.53
233 0.5
234 0.51
235 0.51
236 0.51
237 0.49
238 0.5
239 0.51
240 0.46
241 0.41
242 0.4
243 0.4
244 0.37
245 0.33
246 0.3
247 0.29
248 0.29
249 0.29
250 0.26
251 0.18
252 0.14
253 0.16
254 0.18
255 0.27
256 0.29
257 0.37
258 0.43
259 0.48
260 0.54
261 0.5
262 0.51
263 0.43
264 0.43
265 0.39
266 0.42
267 0.39
268 0.39
269 0.41
270 0.36
271 0.33
272 0.32
273 0.28
274 0.19
275 0.16
276 0.11
277 0.1
278 0.1
279 0.09
280 0.08
281 0.07
282 0.07
283 0.09
284 0.09
285 0.09
286 0.09
287 0.1
288 0.1
289 0.1
290 0.11
291 0.07
292 0.07
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.07
298 0.07
299 0.1
300 0.1
301 0.09
302 0.1
303 0.1
304 0.13
305 0.21
306 0.27
307 0.29
308 0.32
309 0.32
310 0.39
311 0.45
312 0.47
313 0.39
314 0.38
315 0.37
316 0.4
317 0.41
318 0.37
319 0.34
320 0.37
321 0.4
322 0.4
323 0.37
324 0.37
325 0.42
326 0.44
327 0.45
328 0.39
329 0.34
330 0.32
331 0.36
332 0.34
333 0.29
334 0.25
335 0.22
336 0.21
337 0.21
338 0.19
339 0.14
340 0.11
341 0.09
342 0.08
343 0.07
344 0.06
345 0.06
346 0.08
347 0.1
348 0.13
349 0.14
350 0.18
351 0.22
352 0.3
353 0.4
354 0.49
355 0.57
356 0.62
357 0.69
358 0.71
359 0.72
360 0.68
361 0.61
362 0.58
363 0.53
364 0.47
365 0.4
366 0.37
367 0.36
368 0.35
369 0.35
370 0.33
371 0.33
372 0.34
373 0.36
374 0.37
375 0.35
376 0.38
377 0.43
378 0.47
379 0.53
380 0.58
381 0.64
382 0.71
383 0.75
384 0.75
385 0.76
386 0.76
387 0.74
388 0.71
389 0.66
390 0.62
391 0.58
392 0.55
393 0.46
394 0.38
395 0.3
396 0.23
397 0.2
398 0.15
399 0.13
400 0.13
401 0.17
402 0.22
403 0.3
404 0.4
405 0.48
406 0.58
407 0.63
408 0.69
409 0.74
410 0.79
411 0.81
412 0.82
413 0.83
414 0.83
415 0.89
416 0.89
417 0.81
418 0.77
419 0.71
420 0.68
421 0.67
422 0.65
423 0.57
424 0.53
425 0.55
426 0.5
427 0.48
428 0.4
429 0.31
430 0.31
431 0.36
432 0.36
433 0.36
434 0.34
435 0.38
436 0.39
437 0.4
438 0.33
439 0.26
440 0.23
441 0.19
442 0.18
443 0.15
444 0.14
445 0.11
446 0.12
447 0.11
448 0.1
449 0.09
450 0.09
451 0.08
452 0.08
453 0.08
454 0.07
455 0.1
456 0.1
457 0.11
458 0.12
459 0.11
460 0.13
461 0.16
462 0.15
463 0.12
464 0.14
465 0.14
466 0.16
467 0.19
468 0.18
469 0.16
470 0.16
471 0.19
472 0.19
473 0.17
474 0.17
475 0.13
476 0.15
477 0.16
478 0.19
479 0.17
480 0.15
481 0.16
482 0.17
483 0.19
484 0.17
485 0.19
486 0.14
487 0.16
488 0.16
489 0.17
490 0.15
491 0.13
492 0.14
493 0.13
494 0.15
495 0.13
496 0.15
497 0.16
498 0.16
499 0.16
500 0.16
501 0.16
502 0.15
503 0.15
504 0.13
505 0.1
506 0.1
507 0.1
508 0.09
509 0.06
510 0.06
511 0.06
512 0.06
513 0.06
514 0.05
515 0.05
516 0.05
517 0.07
518 0.09
519 0.09
520 0.09
521 0.1
522 0.11
523 0.16
524 0.2
525 0.22
526 0.24
527 0.25
528 0.26
529 0.32
530 0.35
531 0.36
532 0.34
533 0.33
534 0.28
535 0.29
536 0.31
537 0.24
538 0.27
539 0.23
540 0.24
541 0.26
542 0.29
543 0.33
544 0.34
545 0.35
546 0.3
547 0.3
548 0.28
549 0.3
550 0.29
551 0.23
552 0.21
553 0.2
554 0.18
555 0.18
556 0.16
557 0.12
558 0.1
559 0.09
560 0.09
561 0.08
562 0.08
563 0.08
564 0.07
565 0.07
566 0.07
567 0.07
568 0.06
569 0.07
570 0.06
571 0.08
572 0.09
573 0.09
574 0.11
575 0.13
576 0.14
577 0.14
578 0.13
579 0.11
580 0.12
581 0.15
582 0.14
583 0.13
584 0.14
585 0.15
586 0.17
587 0.17
588 0.16
589 0.15
590 0.13
591 0.12
592 0.1
593 0.08
594 0.06
595 0.1
596 0.1
597 0.14
598 0.15
599 0.14
600 0.16
601 0.18
602 0.2
603 0.17
604 0.2
605 0.19
606 0.22
607 0.23
608 0.23
609 0.23
610 0.22
611 0.22
612 0.28
613 0.25
614 0.32
615 0.35
616 0.44
617 0.53
618 0.61