Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U7PLC5

Protein Details
Accession U7PLC5    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
60-96RGGHRRYRSRSRDGRDYRDRDRDRDRRDNRHNDRSDRBasic
301-325NNAGAVRKAKRTQYRQYMNRQGGFNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-155RRPDGDRERGSGSNRHRDRNDRDYDRDRGGRGRDDRGRDDRGRDDRGRDDRGGHRRYRSRSRDGRDYRDRDRDRDRRDNRHNDRSDRGDREDRRRSASPDRRSGSPPSLSSSRLTPPPPPPPPPPSRRAAGGGPNKNHRRAPNGRR
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MADSGYRRNRRPDGDRERGSGSNRHRDRNDRDYDRDRGGRGRDDRGRDDRGRDDRGRDDRGGHRRYRSRSRDGRDYRDRDRDRDRRDNRHNDRSDRGDREDRRRSASPDRRSGSPPSLSSSRLTPPPPPPPPPPSRRAAGGGPNKNHRRAPNGRRADEDDDDDDDDDEQGGLLRNSASAGLPNRTRARPGESTSTPTTSASTVAPMSFRVGGARNGSSRSNRHYDDAGYGEADGYDDADGHDDGEADMEAGGSGGDVDGDGDGDGDDDDDVEVDDDGMDAMQAMMGFSGFSSTKGTKVAGNNAGAVRKAKRTQYRQYMNRQGGFNRPLSPSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.77
3 0.72
4 0.69
5 0.65
6 0.61
7 0.58
8 0.56
9 0.57
10 0.57
11 0.62
12 0.63
13 0.68
14 0.72
15 0.74
16 0.76
17 0.72
18 0.75
19 0.73
20 0.73
21 0.71
22 0.66
23 0.6
24 0.56
25 0.53
26 0.54
27 0.52
28 0.56
29 0.55
30 0.57
31 0.62
32 0.62
33 0.65
34 0.61
35 0.61
36 0.61
37 0.61
38 0.63
39 0.59
40 0.58
41 0.59
42 0.62
43 0.62
44 0.55
45 0.54
46 0.54
47 0.6
48 0.62
49 0.58
50 0.6
51 0.63
52 0.69
53 0.74
54 0.73
55 0.74
56 0.76
57 0.78
58 0.8
59 0.79
60 0.81
61 0.81
62 0.8
63 0.77
64 0.78
65 0.75
66 0.7
67 0.73
68 0.72
69 0.71
70 0.75
71 0.76
72 0.76
73 0.82
74 0.87
75 0.85
76 0.87
77 0.85
78 0.79
79 0.77
80 0.74
81 0.71
82 0.65
83 0.63
84 0.61
85 0.61
86 0.66
87 0.69
88 0.63
89 0.62
90 0.6
91 0.6
92 0.61
93 0.64
94 0.63
95 0.62
96 0.63
97 0.59
98 0.59
99 0.58
100 0.53
101 0.47
102 0.4
103 0.35
104 0.35
105 0.33
106 0.3
107 0.28
108 0.26
109 0.25
110 0.26
111 0.26
112 0.31
113 0.38
114 0.42
115 0.45
116 0.47
117 0.51
118 0.58
119 0.58
120 0.56
121 0.51
122 0.48
123 0.44
124 0.42
125 0.37
126 0.38
127 0.41
128 0.43
129 0.43
130 0.51
131 0.52
132 0.53
133 0.54
134 0.47
135 0.47
136 0.5
137 0.55
138 0.56
139 0.61
140 0.58
141 0.57
142 0.6
143 0.56
144 0.47
145 0.41
146 0.32
147 0.25
148 0.23
149 0.2
150 0.16
151 0.11
152 0.09
153 0.07
154 0.05
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.05
164 0.04
165 0.06
166 0.08
167 0.11
168 0.12
169 0.17
170 0.21
171 0.21
172 0.24
173 0.23
174 0.28
175 0.29
176 0.31
177 0.33
178 0.31
179 0.36
180 0.35
181 0.35
182 0.29
183 0.25
184 0.23
185 0.17
186 0.16
187 0.11
188 0.11
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.08
193 0.1
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.1
198 0.12
199 0.15
200 0.16
201 0.16
202 0.18
203 0.21
204 0.24
205 0.25
206 0.29
207 0.32
208 0.31
209 0.33
210 0.32
211 0.31
212 0.29
213 0.28
214 0.23
215 0.17
216 0.15
217 0.13
218 0.11
219 0.1
220 0.06
221 0.05
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.05
231 0.06
232 0.06
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.02
242 0.02
243 0.02
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.03
269 0.03
270 0.03
271 0.03
272 0.04
273 0.04
274 0.03
275 0.06
276 0.06
277 0.07
278 0.13
279 0.13
280 0.15
281 0.17
282 0.18
283 0.21
284 0.25
285 0.33
286 0.33
287 0.34
288 0.36
289 0.37
290 0.38
291 0.34
292 0.34
293 0.3
294 0.32
295 0.37
296 0.43
297 0.51
298 0.58
299 0.67
300 0.74
301 0.81
302 0.81
303 0.86
304 0.87
305 0.86
306 0.82
307 0.76
308 0.68
309 0.67
310 0.63
311 0.56
312 0.5