Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U7PS00

Protein Details
Accession U7PS00    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
435-459RGRGGARQYNNRQQQQRPPRNDNDDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 12.5, cyto_mito 10, cyto 6.5, extr 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR045237  COPS7/eIF3m  
IPR027528  eIF3m  
IPR040750  eIF3m_C_helix  
IPR000717  PCI_dom  
Gene Ontology GO:0016282  C:eukaryotic 43S preinitiation complex  
GO:0033290  C:eukaryotic 48S preinitiation complex  
GO:0071541  C:eukaryotic translation initiation factor 3 complex, eIF3m  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0001732  P:formation of cytoplasmic translation initiation complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF18005  eIF3m_C_helix  
PF01399  PCI  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50250  PCI  
Amino Acid Sequences MAAPTTSSAPATPIRPRLVFVDGTFGELVQELADYLQISESVVALVAKDKNEEALAAVVEASSALNAAPEKDFTGTYNLLIHLAINESKDPSPYLRTICQNLSKPVTSSPVNGVGLALNALQAVFNLLAPNNALRYNVFMTILRFVRTHGLYDNIRSTLPQLPSWLVDWDVSEEAQRKLYLEIVAFAAEQGEAEESYQYLLKVLRTFDASDDSEVKSEEAEQLSVRAVRTALVSNTHYDFQDLRALPTVQALADSNKSAVYAQLLDIFAEQDLEDYHDFCEEHEGWVEAQNLDGDKLQRKMRLLTFTSLAASTQSRQIEYARIAKALQVPVEDVEVWAIDVIRAGLVEGKLSQQQQVFLVHRTTYRVFGEKQWRELGTRIDQWRGSLSSVLTVLRRQQAEVEAAKEREAQELERKLANANLEGGSGHQGGGGGGRGRGGARQYNNRQQQQRPPRNDNDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.39
3 0.4
4 0.4
5 0.41
6 0.39
7 0.32
8 0.33
9 0.28
10 0.3
11 0.28
12 0.24
13 0.2
14 0.17
15 0.16
16 0.08
17 0.08
18 0.05
19 0.05
20 0.06
21 0.06
22 0.06
23 0.06
24 0.06
25 0.07
26 0.07
27 0.07
28 0.06
29 0.06
30 0.06
31 0.06
32 0.1
33 0.13
34 0.13
35 0.15
36 0.15
37 0.16
38 0.16
39 0.16
40 0.13
41 0.12
42 0.11
43 0.1
44 0.09
45 0.07
46 0.07
47 0.07
48 0.05
49 0.04
50 0.04
51 0.03
52 0.05
53 0.05
54 0.07
55 0.08
56 0.09
57 0.11
58 0.12
59 0.13
60 0.13
61 0.18
62 0.17
63 0.17
64 0.18
65 0.17
66 0.17
67 0.16
68 0.15
69 0.1
70 0.11
71 0.11
72 0.11
73 0.12
74 0.14
75 0.15
76 0.16
77 0.17
78 0.17
79 0.2
80 0.23
81 0.26
82 0.29
83 0.33
84 0.36
85 0.41
86 0.46
87 0.46
88 0.48
89 0.48
90 0.44
91 0.4
92 0.38
93 0.37
94 0.31
95 0.28
96 0.26
97 0.27
98 0.26
99 0.24
100 0.22
101 0.18
102 0.16
103 0.15
104 0.11
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.04
109 0.04
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.07
117 0.08
118 0.08
119 0.09
120 0.09
121 0.08
122 0.12
123 0.14
124 0.14
125 0.14
126 0.14
127 0.15
128 0.19
129 0.2
130 0.18
131 0.16
132 0.16
133 0.21
134 0.21
135 0.21
136 0.17
137 0.21
138 0.2
139 0.23
140 0.25
141 0.2
142 0.19
143 0.18
144 0.19
145 0.21
146 0.22
147 0.19
148 0.19
149 0.19
150 0.2
151 0.21
152 0.19
153 0.13
154 0.11
155 0.11
156 0.11
157 0.1
158 0.1
159 0.1
160 0.12
161 0.12
162 0.13
163 0.13
164 0.12
165 0.12
166 0.14
167 0.13
168 0.11
169 0.11
170 0.1
171 0.1
172 0.09
173 0.08
174 0.07
175 0.05
176 0.05
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.06
187 0.07
188 0.08
189 0.1
190 0.1
191 0.11
192 0.12
193 0.12
194 0.12
195 0.15
196 0.14
197 0.14
198 0.15
199 0.15
200 0.14
201 0.13
202 0.12
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.08
207 0.08
208 0.07
209 0.08
210 0.08
211 0.09
212 0.09
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.08
217 0.09
218 0.08
219 0.1
220 0.11
221 0.12
222 0.13
223 0.14
224 0.13
225 0.13
226 0.12
227 0.11
228 0.17
229 0.16
230 0.15
231 0.17
232 0.17
233 0.16
234 0.16
235 0.15
236 0.08
237 0.09
238 0.08
239 0.07
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.07
244 0.08
245 0.07
246 0.07
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.09
251 0.09
252 0.09
253 0.09
254 0.09
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.04
259 0.04
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.14
268 0.12
269 0.12
270 0.12
271 0.13
272 0.12
273 0.16
274 0.17
275 0.11
276 0.11
277 0.11
278 0.11
279 0.11
280 0.12
281 0.11
282 0.13
283 0.18
284 0.21
285 0.23
286 0.24
287 0.29
288 0.32
289 0.36
290 0.35
291 0.34
292 0.32
293 0.29
294 0.29
295 0.24
296 0.19
297 0.14
298 0.12
299 0.11
300 0.15
301 0.15
302 0.14
303 0.15
304 0.16
305 0.18
306 0.21
307 0.26
308 0.22
309 0.22
310 0.22
311 0.24
312 0.27
313 0.25
314 0.23
315 0.17
316 0.16
317 0.16
318 0.17
319 0.15
320 0.1
321 0.08
322 0.07
323 0.06
324 0.06
325 0.05
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.06
333 0.06
334 0.07
335 0.07
336 0.09
337 0.13
338 0.14
339 0.17
340 0.16
341 0.17
342 0.19
343 0.24
344 0.24
345 0.23
346 0.25
347 0.23
348 0.23
349 0.26
350 0.26
351 0.24
352 0.25
353 0.27
354 0.27
355 0.34
356 0.44
357 0.43
358 0.46
359 0.47
360 0.45
361 0.43
362 0.45
363 0.43
364 0.38
365 0.42
366 0.4
367 0.41
368 0.4
369 0.38
370 0.39
371 0.34
372 0.29
373 0.24
374 0.21
375 0.18
376 0.19
377 0.19
378 0.17
379 0.17
380 0.21
381 0.26
382 0.26
383 0.24
384 0.26
385 0.28
386 0.32
387 0.32
388 0.31
389 0.3
390 0.3
391 0.3
392 0.31
393 0.29
394 0.28
395 0.27
396 0.27
397 0.3
398 0.35
399 0.37
400 0.36
401 0.36
402 0.32
403 0.34
404 0.32
405 0.25
406 0.22
407 0.2
408 0.17
409 0.17
410 0.16
411 0.17
412 0.15
413 0.13
414 0.11
415 0.1
416 0.1
417 0.11
418 0.13
419 0.11
420 0.11
421 0.11
422 0.12
423 0.12
424 0.15
425 0.19
426 0.24
427 0.31
428 0.41
429 0.5
430 0.6
431 0.7
432 0.76
433 0.79
434 0.79
435 0.83
436 0.84
437 0.85
438 0.85
439 0.84