Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U7PMZ2

Protein Details
Accession U7PMZ2    Localization Confidence High Confidence Score 22.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
218-242SKGDGERRHRHRSHRSHRSHRDDDDBasic
266-293GDNRRDRSDRDRERDRNRDRDRRRDELDBasic
295-349DESHGRRREHDRGQERHRDRDRDRSRDDGKDSSHRRRDRDRKDDRDDRDRDRERRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
161-167KQKKKSI
212-240ARRLRDSKGDGERRHRHRSHRSHRSHRDD
242-289DASSRRDDKDGDRREHRHRRRDDGGDNRRDRSDRDRERDRNRDRDRRR
298-350HGRRREHDRGQERHRDRDRDRSRDDGKDSSHRRRDRDRKDDRDDRDRDRERRH
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR045844  RRM_Ist3-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12411  RRM_ist3_like  
Amino Acid Sequences MNKIRQIQELNKKELEQGISPNASWHTDYRDTAFVYFGGLPYDLSEGDIITIFSQYGEPVFLKLARDQETGKSKGFGWLKYEDQRSTDLAVDNLGGAQIGGRMISVDHARYKARDDEDADEFKVGWADMQRRLGAGATAGGGGDNSDTDMGEATPSEDERKQKKKSIRSRGDGHQPLLREERELQKLIDEHDDEDPMKDFLVEEKKREVDEARRLRDSKGDGERRHRHRSHRSHRSHRDDDDASSRRDDKDGDRREHRHRRRDDGGDNRRDRSDRDRERDRNRDRDRRRDELDDDESHGRRREHDRGQERHRDRDRDRSRDDGKDSSHRRRDRDRKDDRDDRDRDRERRH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.47
3 0.39
4 0.36
5 0.36
6 0.35
7 0.33
8 0.33
9 0.3
10 0.28
11 0.27
12 0.24
13 0.25
14 0.28
15 0.3
16 0.31
17 0.33
18 0.32
19 0.3
20 0.29
21 0.21
22 0.2
23 0.19
24 0.15
25 0.13
26 0.12
27 0.11
28 0.11
29 0.13
30 0.09
31 0.1
32 0.09
33 0.08
34 0.08
35 0.08
36 0.08
37 0.07
38 0.07
39 0.06
40 0.06
41 0.07
42 0.06
43 0.06
44 0.08
45 0.08
46 0.09
47 0.11
48 0.12
49 0.13
50 0.16
51 0.22
52 0.24
53 0.26
54 0.27
55 0.32
56 0.39
57 0.4
58 0.38
59 0.34
60 0.3
61 0.36
62 0.38
63 0.32
64 0.29
65 0.3
66 0.34
67 0.4
68 0.45
69 0.38
70 0.36
71 0.37
72 0.34
73 0.31
74 0.29
75 0.22
76 0.18
77 0.16
78 0.14
79 0.12
80 0.1
81 0.08
82 0.05
83 0.04
84 0.04
85 0.04
86 0.03
87 0.03
88 0.03
89 0.03
90 0.04
91 0.06
92 0.08
93 0.09
94 0.12
95 0.14
96 0.15
97 0.16
98 0.2
99 0.24
100 0.24
101 0.26
102 0.27
103 0.29
104 0.32
105 0.33
106 0.3
107 0.24
108 0.22
109 0.19
110 0.16
111 0.12
112 0.08
113 0.1
114 0.13
115 0.16
116 0.18
117 0.18
118 0.18
119 0.18
120 0.17
121 0.13
122 0.1
123 0.07
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.05
142 0.05
143 0.08
144 0.1
145 0.17
146 0.25
147 0.33
148 0.37
149 0.43
150 0.51
151 0.59
152 0.66
153 0.72
154 0.72
155 0.71
156 0.72
157 0.71
158 0.73
159 0.66
160 0.57
161 0.48
162 0.4
163 0.36
164 0.34
165 0.28
166 0.19
167 0.18
168 0.23
169 0.24
170 0.24
171 0.22
172 0.2
173 0.21
174 0.21
175 0.22
176 0.16
177 0.14
178 0.14
179 0.15
180 0.13
181 0.13
182 0.13
183 0.09
184 0.09
185 0.07
186 0.06
187 0.09
188 0.19
189 0.2
190 0.21
191 0.24
192 0.26
193 0.26
194 0.27
195 0.27
196 0.24
197 0.34
198 0.4
199 0.41
200 0.45
201 0.46
202 0.45
203 0.47
204 0.42
205 0.39
206 0.41
207 0.45
208 0.45
209 0.54
210 0.63
211 0.66
212 0.73
213 0.7
214 0.7
215 0.72
216 0.79
217 0.8
218 0.82
219 0.84
220 0.85
221 0.91
222 0.91
223 0.86
224 0.78
225 0.74
226 0.64
227 0.57
228 0.55
229 0.48
230 0.41
231 0.37
232 0.37
233 0.3
234 0.3
235 0.29
236 0.27
237 0.34
238 0.41
239 0.46
240 0.52
241 0.58
242 0.68
243 0.76
244 0.78
245 0.78
246 0.76
247 0.78
248 0.78
249 0.79
250 0.78
251 0.78
252 0.78
253 0.78
254 0.75
255 0.69
256 0.65
257 0.58
258 0.53
259 0.51
260 0.52
261 0.51
262 0.56
263 0.64
264 0.7
265 0.79
266 0.85
267 0.85
268 0.85
269 0.85
270 0.87
271 0.86
272 0.88
273 0.86
274 0.83
275 0.8
276 0.76
277 0.69
278 0.66
279 0.63
280 0.54
281 0.51
282 0.49
283 0.45
284 0.42
285 0.43
286 0.36
287 0.36
288 0.42
289 0.47
290 0.5
291 0.59
292 0.65
293 0.69
294 0.77
295 0.82
296 0.8
297 0.81
298 0.8
299 0.79
300 0.74
301 0.76
302 0.77
303 0.76
304 0.76
305 0.74
306 0.72
307 0.71
308 0.71
309 0.67
310 0.63
311 0.64
312 0.67
313 0.69
314 0.72
315 0.71
316 0.73
317 0.78
318 0.83
319 0.83
320 0.86
321 0.86
322 0.86
323 0.89
324 0.91
325 0.88
326 0.88
327 0.84
328 0.82
329 0.82
330 0.81