FuNGI

V5FBT0

Protein Details

Accession

V5FBT0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
654-673	FVTPEKPKPKIRPSDTRHFA	Hydrophilic
811-830	PEQKVASKPKRMSRNVLQPS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 12, nucl 10.5, cyto 10.5, mito 2, pero 1, E.R. 1, cysk 1, vacu 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012340 NA-bd_OB-fold IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR045113 Rpb7-like IPR005576 Rpb7-like_N IPR003029 S1_domain
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF00575 S1 PF03876 SHS2_Rpb7-N
CDD	cd04329 RNAP_II_Rpb7_N cd04462 S1_RNAPII_Rpb7

Amino Acid Sequences

MFFLKEETKVVALHPSYFGPNVKEYLINRLNEEEEGRCTGDHFVICVMDMVDIGEGRVIPGSGHAEYTIQYRAIIWKPFRGETVDAIVTSVKPTGIFTLAGPLSVFIARKNIPSDIKWEPNTVPPQYTDHGDQVIEKGTSLRLKILGVKPDVAAINAIGTIKEDYLGARDIKGLLDDPLHPHEIPPPEGAQGHRYKLGALEIFETVWIVSVLEPEIGMCLVWDCSVAAVVLYACRLERQPARSAGAQVLSKFRLLRCLFQLAPRPALREEIGQQSASGLEPPSQTPFFARNMSLKSIYERFLADPASAPLASDVSLIYITTTTTVSEANSVLKHLSSQQRIVKKKAEKIIGVVEGSDSLCLDVETTLEFVDGGGAYLPSLDDNFLIDHVATFPTIHIVRFNAQNEIQQIRLYWDQGSLLKQVEVIGARSRSWPIRDAKDQLRLISSATSGESSGLVTPPNGSENKSAPKDEQERATKASPSKKRIKDPYAAESLFELLSPGQDRMQKVVAPRAAATGKPPPRDYSELFVGEDDDVAPVQSPANRPVAPKIGSSKHYKPSSLFVEEDESATQEEQTPSKPIAPKAGSSKNFKPSRVFIDEEEEHVEDKEPKYKTHPKKFSHFELGDGDDEVGQPSKPIPSRPKSQHVAQWGFEDFVTPEKPKPKIRPSDTRHFAWSDDEVDAQDTPPARPHVAQPRRDAETHFQLQHDDTEEEIKPRKTLGSAHNKGLGLYDNNLYDEEGNPTPHQPEQKAPLAIIPNGTHRRKDFDSHWSVTDELAEEEPISHENKKPIAHDKMKHIKHMEASWAAYDESPEQKVASKPKRMSRNVLQPSWALGDEDEGF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.24
3	0.25
4	0.28
5	0.3
6	0.25
7	0.27
8	0.27
9	0.27
10	0.3
11	0.28
12	0.36
13	0.39
14	0.37
15	0.36
16	0.37
17	0.37
18	0.33
19	0.35
20	0.27
21	0.24
22	0.26
23	0.24
24	0.21
25	0.21
26	0.21
27	0.22
28	0.2
29	0.18
30	0.16
31	0.15
32	0.15
33	0.15
34	0.13
35	0.09
36	0.08
37	0.08
38	0.07
39	0.07
40	0.07
41	0.07
42	0.06
43	0.07
44	0.07
45	0.07
46	0.06
47	0.09
48	0.13
49	0.12
50	0.13
51	0.13
52	0.13
53	0.14
54	0.17
55	0.17
56	0.13
57	0.13
58	0.14
59	0.2
60	0.25
61	0.32
62	0.32
63	0.36
64	0.4
65	0.41
66	0.42
67	0.4
68	0.37
69	0.32
70	0.36
71	0.3
72	0.26
73	0.25
74	0.24
75	0.19
76	0.18
77	0.16
78	0.1
79	0.09
80	0.1
81	0.11
82	0.12
83	0.12
84	0.11
85	0.18
86	0.18
87	0.18
88	0.17
89	0.15
90	0.15
91	0.16
92	0.16
93	0.09
94	0.16
95	0.17
96	0.2
97	0.23
98	0.27
99	0.28
100	0.29
101	0.35
102	0.36
103	0.43
104	0.42
105	0.43
106	0.39
107	0.43
108	0.49
109	0.45
110	0.4
111	0.34
112	0.36
113	0.35
114	0.37
115	0.32
116	0.28
117	0.27
118	0.25
119	0.23
120	0.21
121	0.22
122	0.18
123	0.15
124	0.14
125	0.16
126	0.18
127	0.18
128	0.19
129	0.16
130	0.18
131	0.26
132	0.3
133	0.33
134	0.32
135	0.33
136	0.3
137	0.32
138	0.31
139	0.23
140	0.19
141	0.12
142	0.1
143	0.1
144	0.1
145	0.06
146	0.07
147	0.08
148	0.07
149	0.08
150	0.07
151	0.07
152	0.09
153	0.12
154	0.12
155	0.11
156	0.13
157	0.13
158	0.13
159	0.14
160	0.12
161	0.1
162	0.11
163	0.12
164	0.15
165	0.18
166	0.21
167	0.2
168	0.2
169	0.24
170	0.26
171	0.27
172	0.25
173	0.23
174	0.22
175	0.24
176	0.24
177	0.26
178	0.27
179	0.28
180	0.28
181	0.27
182	0.25
183	0.25
184	0.28
185	0.22
186	0.18
187	0.17
188	0.15
189	0.15
190	0.14
191	0.13
192	0.09
193	0.07
194	0.06
195	0.05
196	0.04
197	0.05
198	0.06
199	0.06
200	0.06
201	0.05
202	0.05
203	0.05
204	0.05
205	0.04
206	0.04
207	0.04
208	0.05
209	0.05
210	0.04
211	0.04
212	0.05
213	0.05
214	0.04
215	0.04
216	0.04
217	0.04
218	0.05
219	0.05
220	0.05
221	0.06
222	0.07
223	0.12
224	0.18
225	0.22
226	0.28
227	0.31
228	0.35
229	0.35
230	0.36
231	0.33
232	0.31
233	0.29
234	0.24
235	0.24
236	0.22
237	0.22
238	0.22
239	0.2
240	0.25
241	0.25
242	0.28
243	0.27
244	0.32
245	0.31
246	0.34
247	0.43
248	0.37
249	0.41
250	0.38
251	0.37
252	0.32
253	0.34
254	0.3
255	0.24
256	0.24
257	0.24
258	0.24
259	0.22
260	0.21
261	0.18
262	0.18
263	0.15
264	0.13
265	0.08
266	0.08
267	0.09
268	0.1
269	0.14
270	0.14
271	0.14
272	0.15
273	0.17
274	0.18
275	0.19
276	0.19
277	0.19
278	0.22
279	0.25
280	0.25
281	0.22
282	0.24
283	0.25
284	0.24
285	0.22
286	0.2
287	0.18
288	0.18
289	0.18
290	0.14
291	0.12
292	0.11
293	0.12
294	0.11
295	0.1
296	0.08
297	0.08
298	0.08
299	0.07
300	0.06
301	0.05
302	0.05
303	0.05
304	0.05
305	0.04
306	0.04
307	0.05
308	0.05
309	0.05
310	0.05
311	0.06
312	0.06
313	0.07
314	0.08
315	0.08
316	0.08
317	0.09
318	0.09
319	0.08
320	0.09
321	0.13
322	0.19
323	0.2
324	0.26
325	0.31
326	0.39
327	0.44
328	0.47
329	0.5
330	0.49
331	0.53
332	0.54
333	0.53
334	0.45
335	0.43
336	0.43
337	0.37
338	0.3
339	0.24
340	0.17
341	0.13
342	0.12
343	0.1
344	0.06
345	0.04
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.03
350	0.04
351	0.04
352	0.04
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.03
357	0.04
358	0.04
359	0.03
360	0.03
361	0.03
362	0.03
363	0.03
364	0.03
365	0.03
366	0.03
367	0.03
368	0.03
369	0.04
370	0.04
371	0.04
372	0.05
373	0.04
374	0.04
375	0.05
376	0.05
377	0.05
378	0.05
379	0.04
380	0.07
381	0.08
382	0.08
383	0.08
384	0.09
385	0.11
386	0.15
387	0.16
388	0.16
389	0.16
390	0.18
391	0.2
392	0.2
393	0.18
394	0.14
395	0.13
396	0.13
397	0.14
398	0.13
399	0.1
400	0.1
401	0.1
402	0.11
403	0.13
404	0.11
405	0.11
406	0.1
407	0.1
408	0.1
409	0.1
410	0.09
411	0.08
412	0.09
413	0.1
414	0.1
415	0.11
416	0.13
417	0.14
418	0.15
419	0.19
420	0.21
421	0.26
422	0.29
423	0.34
424	0.36
425	0.43
426	0.42
427	0.37
428	0.34
429	0.29
430	0.25
431	0.21
432	0.17
433	0.09
434	0.08
435	0.08
436	0.06
437	0.06
438	0.06
439	0.06
440	0.06
441	0.06
442	0.05
443	0.05
444	0.06
445	0.06
446	0.08
447	0.09
448	0.1
449	0.12
450	0.15
451	0.22
452	0.23
453	0.24
454	0.22
455	0.29
456	0.32
457	0.32
458	0.36
459	0.35
460	0.36
461	0.38
462	0.39
463	0.36
464	0.35
465	0.42
466	0.43
467	0.45
468	0.53
469	0.56
470	0.63
471	0.68
472	0.69
473	0.67
474	0.64
475	0.62
476	0.59
477	0.52
478	0.44
479	0.35
480	0.3
481	0.23
482	0.18
483	0.12
484	0.05
485	0.06
486	0.07
487	0.07
488	0.09
489	0.12
490	0.13
491	0.15
492	0.17
493	0.17
494	0.18
495	0.24
496	0.23
497	0.2
498	0.2
499	0.21
500	0.2
501	0.19
502	0.2
503	0.23
504	0.27
505	0.29
506	0.3
507	0.3
508	0.34
509	0.39
510	0.38
511	0.34
512	0.33
513	0.31
514	0.3
515	0.27
516	0.23
517	0.18
518	0.16
519	0.11
520	0.06
521	0.05
522	0.05
523	0.05
524	0.04
525	0.05
526	0.08
527	0.09
528	0.12
529	0.17
530	0.18
531	0.19
532	0.22
533	0.28
534	0.26
535	0.27
536	0.3
537	0.3
538	0.33
539	0.39
540	0.42
541	0.45
542	0.46
543	0.45
544	0.41
545	0.43
546	0.44
547	0.4
548	0.34
549	0.26
550	0.28
551	0.27
552	0.26
553	0.2
554	0.15
555	0.13
556	0.12
557	0.11
558	0.1
559	0.11
560	0.11
561	0.12
562	0.14
563	0.14
564	0.19
565	0.23
566	0.21
567	0.28
568	0.29
569	0.31
570	0.37
571	0.45
572	0.45
573	0.48
574	0.54
575	0.55
576	0.58
577	0.56
578	0.53
579	0.48
580	0.51
581	0.49
582	0.45
583	0.36
584	0.4
585	0.38
586	0.35
587	0.34
588	0.27
589	0.22
590	0.21
591	0.21
592	0.17
593	0.18
594	0.23
595	0.21
596	0.22
597	0.3
598	0.41
599	0.5
600	0.57
601	0.66
602	0.65
603	0.73
604	0.79
605	0.77
606	0.77
607	0.66
608	0.58
609	0.52
610	0.48
611	0.39
612	0.33
613	0.25
614	0.15
615	0.15
616	0.13
617	0.1
618	0.07
619	0.07
620	0.07
621	0.13
622	0.15
623	0.22
624	0.3
625	0.36
626	0.46
627	0.53
628	0.61
629	0.61
630	0.64
631	0.62
632	0.63
633	0.61
634	0.53
635	0.49
636	0.41
637	0.36
638	0.31
639	0.26
640	0.17
641	0.16
642	0.18
643	0.16
644	0.2
645	0.26
646	0.32
647	0.39
648	0.48
649	0.55
650	0.62
651	0.68
652	0.75
653	0.76
654	0.81
655	0.79
656	0.72
657	0.67
658	0.57
659	0.5
660	0.43
661	0.37
662	0.28
663	0.23
664	0.21
665	0.17
666	0.17
667	0.16
668	0.13
669	0.13
670	0.12
671	0.12
672	0.16
673	0.18
674	0.19
675	0.2
676	0.27
677	0.36
678	0.44
679	0.49
680	0.52
681	0.55
682	0.57
683	0.58
684	0.55
685	0.51
686	0.51
687	0.51
688	0.46
689	0.41
690	0.39
691	0.38
692	0.36
693	0.32
694	0.24
695	0.18
696	0.21
697	0.22
698	0.24
699	0.29
700	0.27
701	0.24
702	0.25
703	0.26
704	0.23
705	0.29
706	0.35
707	0.4
708	0.44
709	0.47
710	0.52
711	0.5
712	0.48
713	0.42
714	0.36
715	0.27
716	0.25
717	0.24
718	0.19
719	0.2
720	0.2
721	0.19
722	0.16
723	0.15
724	0.17
725	0.16
726	0.18
727	0.19
728	0.21
729	0.22
730	0.26
731	0.31
732	0.29
733	0.33
734	0.37
735	0.43
736	0.42
737	0.4
738	0.41
739	0.39
740	0.37
741	0.34
742	0.29
743	0.31
744	0.39
745	0.42
746	0.42
747	0.41
748	0.47
749	0.47
750	0.52
751	0.48
752	0.49
753	0.54
754	0.52
755	0.52
756	0.47
757	0.44
758	0.37
759	0.34
760	0.25
761	0.18
762	0.15
763	0.14
764	0.11
765	0.11
766	0.12
767	0.13
768	0.14
769	0.16
770	0.2
771	0.25
772	0.3
773	0.32
774	0.37
775	0.45
776	0.52
777	0.58
778	0.6
779	0.65
780	0.71
781	0.72
782	0.75
783	0.69
784	0.64
785	0.61
786	0.58
787	0.54
788	0.47
789	0.45
790	0.38
791	0.35
792	0.31
793	0.25
794	0.24
795	0.2
796	0.21
797	0.21
798	0.19
799	0.19
800	0.23
801	0.29
802	0.38
803	0.43
804	0.49
805	0.56
806	0.64
807	0.74
808	0.76
809	0.79
810	0.79
811	0.8
812	0.8
813	0.75
814	0.69
815	0.59
816	0.56
817	0.5
818	0.4
819	0.3
820	0.21

V5FBT0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer