Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

B2AS17

Protein Details
Accession B2AS17    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
39-65GSPKGDKSKKTDDKKTDASSKKRKGTDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
46-62SKKTDDKKTDASSKKRK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11.5, nucl 11, cyto 10, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012923  Csm3  
IPR040038  TIPIN/Csm3/Swi3  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0007049  P:cell cycle  
GO:0006974  P:DNA damage response  
GO:0000076  P:DNA replication checkpoint signaling  
GO:0031297  P:replication fork processing  
KEGG pan:PODANSg3550  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07962  Swi3  
Amino Acid Sequences MPAAAGPSKVTNGNKKDSGAFVDSFLEGWSDFDEEDPFGSPKGDKSKKTDDKKTDASSKKRKGTDVLGLETEVDKKKARVPRVKLDDARLLSDKGIPWLRKNAQSRLKLKGKGHEFSDAARMLSFYQEWLDELFPKASFLDALAMVEKAGHKTSLRNARMKWIDELKPRGEGEEGPNDVDPFPIYEHDKTPKDTGRIAPVFDKAKERPKTPDGDDLFGDDDIYNATPRAATKGARGEGVPDDDDLDALMAEAEANSGQPPRSIFGNGSESIFGNGTSNSTAAAPPKPQANNIPEDDDLDALMAEAEAETLSTRPNQSTKSILGDGNSKPSAPQRKEVDDFDDDDLDALMAEVEAQPPTKAPSAPKSTEPTKVNDEEDDLDALMAEAEAEGASSKPVPETQKEAGAKKDTSFDDDEAAMAEMDGLW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.5
3 0.51
4 0.47
5 0.46
6 0.41
7 0.35
8 0.29
9 0.28
10 0.26
11 0.23
12 0.2
13 0.15
14 0.1
15 0.1
16 0.1
17 0.09
18 0.09
19 0.09
20 0.11
21 0.1
22 0.11
23 0.13
24 0.13
25 0.12
26 0.14
27 0.14
28 0.18
29 0.29
30 0.36
31 0.38
32 0.45
33 0.56
34 0.65
35 0.74
36 0.78
37 0.76
38 0.77
39 0.81
40 0.81
41 0.8
42 0.79
43 0.8
44 0.8
45 0.81
46 0.81
47 0.78
48 0.73
49 0.69
50 0.66
51 0.65
52 0.6
53 0.54
54 0.46
55 0.41
56 0.39
57 0.34
58 0.32
59 0.25
60 0.21
61 0.19
62 0.2
63 0.27
64 0.34
65 0.43
66 0.48
67 0.54
68 0.62
69 0.69
70 0.77
71 0.73
72 0.71
73 0.69
74 0.61
75 0.57
76 0.48
77 0.4
78 0.32
79 0.31
80 0.26
81 0.24
82 0.29
83 0.27
84 0.28
85 0.36
86 0.4
87 0.46
88 0.51
89 0.55
90 0.57
91 0.64
92 0.65
93 0.66
94 0.69
95 0.68
96 0.65
97 0.65
98 0.62
99 0.57
100 0.55
101 0.51
102 0.44
103 0.38
104 0.41
105 0.32
106 0.26
107 0.22
108 0.2
109 0.15
110 0.15
111 0.14
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.09
117 0.1
118 0.09
119 0.11
120 0.12
121 0.11
122 0.11
123 0.11
124 0.1
125 0.09
126 0.08
127 0.08
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.09
138 0.09
139 0.12
140 0.2
141 0.29
142 0.34
143 0.38
144 0.38
145 0.45
146 0.49
147 0.48
148 0.45
149 0.42
150 0.43
151 0.44
152 0.48
153 0.41
154 0.4
155 0.38
156 0.34
157 0.28
158 0.24
159 0.22
160 0.23
161 0.22
162 0.19
163 0.19
164 0.19
165 0.18
166 0.16
167 0.12
168 0.07
169 0.07
170 0.08
171 0.11
172 0.12
173 0.15
174 0.21
175 0.23
176 0.24
177 0.28
178 0.3
179 0.29
180 0.31
181 0.3
182 0.32
183 0.31
184 0.3
185 0.27
186 0.27
187 0.27
188 0.26
189 0.28
190 0.23
191 0.32
192 0.34
193 0.34
194 0.36
195 0.38
196 0.41
197 0.39
198 0.45
199 0.37
200 0.36
201 0.33
202 0.29
203 0.26
204 0.21
205 0.18
206 0.09
207 0.07
208 0.06
209 0.06
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.08
216 0.09
217 0.1
218 0.13
219 0.18
220 0.19
221 0.19
222 0.19
223 0.18
224 0.18
225 0.19
226 0.16
227 0.11
228 0.11
229 0.1
230 0.1
231 0.08
232 0.06
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.02
237 0.02
238 0.02
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.04
243 0.05
244 0.05
245 0.06
246 0.07
247 0.08
248 0.1
249 0.11
250 0.11
251 0.14
252 0.18
253 0.18
254 0.18
255 0.17
256 0.16
257 0.16
258 0.15
259 0.11
260 0.08
261 0.07
262 0.08
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.08
268 0.1
269 0.12
270 0.13
271 0.14
272 0.2
273 0.21
274 0.22
275 0.29
276 0.3
277 0.33
278 0.33
279 0.35
280 0.29
281 0.29
282 0.27
283 0.2
284 0.16
285 0.11
286 0.09
287 0.06
288 0.05
289 0.04
290 0.03
291 0.03
292 0.03
293 0.02
294 0.03
295 0.03
296 0.04
297 0.05
298 0.07
299 0.09
300 0.11
301 0.15
302 0.17
303 0.2
304 0.24
305 0.25
306 0.28
307 0.29
308 0.27
309 0.26
310 0.29
311 0.28
312 0.3
313 0.28
314 0.23
315 0.22
316 0.29
317 0.38
318 0.36
319 0.43
320 0.42
321 0.49
322 0.53
323 0.55
324 0.52
325 0.45
326 0.44
327 0.38
328 0.33
329 0.25
330 0.21
331 0.19
332 0.13
333 0.1
334 0.07
335 0.04
336 0.03
337 0.04
338 0.04
339 0.05
340 0.06
341 0.07
342 0.07
343 0.08
344 0.11
345 0.14
346 0.16
347 0.2
348 0.29
349 0.37
350 0.4
351 0.45
352 0.48
353 0.49
354 0.55
355 0.53
356 0.5
357 0.49
358 0.49
359 0.46
360 0.4
361 0.4
362 0.34
363 0.33
364 0.28
365 0.21
366 0.17
367 0.14
368 0.12
369 0.09
370 0.06
371 0.04
372 0.03
373 0.03
374 0.03
375 0.03
376 0.04
377 0.04
378 0.06
379 0.07
380 0.07
381 0.09
382 0.14
383 0.19
384 0.23
385 0.3
386 0.32
387 0.41
388 0.46
389 0.48
390 0.5
391 0.51
392 0.49
393 0.44
394 0.48
395 0.4
396 0.41
397 0.42
398 0.35
399 0.32
400 0.3
401 0.28
402 0.22
403 0.21
404 0.15
405 0.1