Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5FTD8

Protein Details
Accession V5FTD8    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
25-52TSCTRGNPSPTPRAKKQKVAKDAPIFTRHydrophilic
447-474DSEYLRRRPRSNEQMRHDVRRKRRRASABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
454-474RPRSNEQMRHDVRRKRRRASA
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036887  HTH_APSES_sf  
IPR003163  Tscrpt_reg_HTH_APSES-type  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51299  HTH_APSES  
Amino Acid Sequences MASIESLLNPLPELNRIQLPSPSLTSCTRGNPSPTPRAKKQKVAKDAPIFTRGKTRGVVRYPPCEEQDEVLAEEHRRFEIHPMGHIAEYPRHIPYNSEKKSFQEKTGRESFEVFQYTFRIPEEEKTWTVMWDYNIGLVRTTHLFKCNDYSKTTPAKMLNANPGLRDICHSITGGALAAQGYWMPFGAAKAVAATFCWKIRYALTPLFGRDFPSLCVPPEDRERFGRMIIDSSVVRRATDEADYYRSLEESPTHGCIPRLPAPGSPGPSQEEGVCRVAQSRLTRRSREVIPYHADSDGNDQYHSSPIFPAARYGNSFTPVNRPQSQAAQCDKLPSPRRLLASMSNIPRLDEASDDSETEKESVGSPDDCNTPKAQAPTVVTGDTDDNDEDYVETEDESFSSRASSDSEIDTPRAQDRPRTPFMREVNAARALLTLHLQDAALIDESGDSEYLRRRPRSNEQMRHDVRRKRRRASA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.23
3 0.25
4 0.26
5 0.28
6 0.3
7 0.31
8 0.31
9 0.29
10 0.28
11 0.29
12 0.3
13 0.31
14 0.33
15 0.35
16 0.37
17 0.41
18 0.46
19 0.52
20 0.59
21 0.65
22 0.68
23 0.73
24 0.79
25 0.8
26 0.82
27 0.83
28 0.83
29 0.84
30 0.84
31 0.84
32 0.82
33 0.81
34 0.76
35 0.75
36 0.65
37 0.56
38 0.57
39 0.49
40 0.43
41 0.41
42 0.42
43 0.42
44 0.47
45 0.56
46 0.51
47 0.59
48 0.6
49 0.61
50 0.58
51 0.53
52 0.48
53 0.4
54 0.38
55 0.31
56 0.27
57 0.23
58 0.23
59 0.21
60 0.21
61 0.21
62 0.17
63 0.16
64 0.16
65 0.2
66 0.25
67 0.25
68 0.26
69 0.29
70 0.3
71 0.29
72 0.3
73 0.28
74 0.23
75 0.24
76 0.23
77 0.22
78 0.22
79 0.22
80 0.24
81 0.31
82 0.39
83 0.42
84 0.45
85 0.43
86 0.46
87 0.57
88 0.56
89 0.54
90 0.53
91 0.5
92 0.53
93 0.6
94 0.58
95 0.48
96 0.49
97 0.42
98 0.38
99 0.38
100 0.31
101 0.24
102 0.24
103 0.24
104 0.21
105 0.2
106 0.18
107 0.15
108 0.19
109 0.21
110 0.23
111 0.23
112 0.25
113 0.25
114 0.22
115 0.23
116 0.22
117 0.19
118 0.17
119 0.16
120 0.16
121 0.18
122 0.18
123 0.17
124 0.14
125 0.15
126 0.15
127 0.18
128 0.16
129 0.2
130 0.21
131 0.21
132 0.28
133 0.33
134 0.33
135 0.35
136 0.36
137 0.37
138 0.43
139 0.43
140 0.41
141 0.37
142 0.39
143 0.39
144 0.4
145 0.41
146 0.39
147 0.38
148 0.33
149 0.34
150 0.3
151 0.25
152 0.24
153 0.19
154 0.14
155 0.15
156 0.15
157 0.12
158 0.12
159 0.12
160 0.09
161 0.06
162 0.05
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.03
170 0.03
171 0.04
172 0.04
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.06
178 0.05
179 0.05
180 0.08
181 0.08
182 0.09
183 0.11
184 0.11
185 0.12
186 0.13
187 0.17
188 0.19
189 0.21
190 0.23
191 0.23
192 0.23
193 0.25
194 0.23
195 0.22
196 0.19
197 0.17
198 0.15
199 0.17
200 0.17
201 0.15
202 0.18
203 0.16
204 0.17
205 0.25
206 0.27
207 0.25
208 0.27
209 0.3
210 0.28
211 0.27
212 0.27
213 0.18
214 0.17
215 0.15
216 0.15
217 0.11
218 0.11
219 0.15
220 0.13
221 0.12
222 0.11
223 0.12
224 0.12
225 0.12
226 0.13
227 0.1
228 0.13
229 0.14
230 0.14
231 0.13
232 0.12
233 0.11
234 0.1
235 0.1
236 0.09
237 0.11
238 0.12
239 0.13
240 0.14
241 0.14
242 0.14
243 0.19
244 0.23
245 0.25
246 0.23
247 0.24
248 0.27
249 0.3
250 0.32
251 0.28
252 0.23
253 0.22
254 0.22
255 0.21
256 0.18
257 0.17
258 0.16
259 0.17
260 0.15
261 0.13
262 0.13
263 0.14
264 0.17
265 0.21
266 0.27
267 0.35
268 0.4
269 0.43
270 0.45
271 0.49
272 0.49
273 0.51
274 0.45
275 0.41
276 0.4
277 0.4
278 0.38
279 0.34
280 0.3
281 0.22
282 0.25
283 0.23
284 0.19
285 0.16
286 0.15
287 0.15
288 0.18
289 0.18
290 0.12
291 0.09
292 0.12
293 0.15
294 0.14
295 0.17
296 0.16
297 0.18
298 0.19
299 0.22
300 0.2
301 0.21
302 0.22
303 0.19
304 0.26
305 0.29
306 0.33
307 0.33
308 0.34
309 0.33
310 0.41
311 0.44
312 0.43
313 0.42
314 0.4
315 0.37
316 0.39
317 0.39
318 0.4
319 0.42
320 0.39
321 0.41
322 0.42
323 0.44
324 0.41
325 0.42
326 0.39
327 0.4
328 0.43
329 0.4
330 0.41
331 0.38
332 0.37
333 0.34
334 0.29
335 0.22
336 0.16
337 0.16
338 0.14
339 0.15
340 0.15
341 0.16
342 0.15
343 0.15
344 0.15
345 0.12
346 0.09
347 0.1
348 0.11
349 0.13
350 0.14
351 0.14
352 0.16
353 0.2
354 0.21
355 0.22
356 0.21
357 0.21
358 0.23
359 0.25
360 0.24
361 0.24
362 0.26
363 0.29
364 0.29
365 0.27
366 0.23
367 0.22
368 0.21
369 0.17
370 0.16
371 0.12
372 0.1
373 0.1
374 0.1
375 0.09
376 0.09
377 0.1
378 0.08
379 0.08
380 0.08
381 0.08
382 0.08
383 0.11
384 0.1
385 0.09
386 0.09
387 0.1
388 0.1
389 0.12
390 0.15
391 0.13
392 0.17
393 0.2
394 0.22
395 0.24
396 0.25
397 0.25
398 0.26
399 0.3
400 0.28
401 0.33
402 0.4
403 0.46
404 0.53
405 0.55
406 0.55
407 0.58
408 0.61
409 0.61
410 0.57
411 0.52
412 0.5
413 0.5
414 0.46
415 0.37
416 0.33
417 0.25
418 0.21
419 0.19
420 0.14
421 0.1
422 0.11
423 0.1
424 0.1
425 0.1
426 0.1
427 0.1
428 0.09
429 0.08
430 0.08
431 0.08
432 0.09
433 0.09
434 0.07
435 0.09
436 0.16
437 0.23
438 0.32
439 0.37
440 0.42
441 0.5
442 0.61
443 0.7
444 0.74
445 0.77
446 0.77
447 0.82
448 0.84
449 0.86
450 0.85
451 0.83
452 0.83
453 0.84
454 0.86