Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5FDL7

Protein Details
Accession V5FDL7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
129-148ESEKWDKRMDKKQRHRDDVABasic
238-257KAEEVRLKKRRERRGEEEADBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
244-251LKKRRERR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 13, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MPAENRDNSSPESAEQGNPTSTENEVADVKAGTASDNTGSEEPNQDDAATKARERQERFKALRARAKAATERNLKETAAESQRLATDQSQLASLSRKHAFASHNLLKADTEASGEDFERKRAWDWTVEESEKWDKRMDKKQRHRDDVAFQDYRQDARKVYKRQLREIQPDLERYERDKMAAIERAAASGGLEVVETNDGELVAVDKNGTFYSTADSTDFIENKPERSAVDKLVKDLQKAEEVRLKKRRERRGEEEADVTYINEKNKQFNQKLARFYNKYTAEIRDSFERGHITALVGRWQNSRRV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.27
3 0.26
4 0.23
5 0.23
6 0.24
7 0.21
8 0.2
9 0.2
10 0.17
11 0.17
12 0.17
13 0.16
14 0.15
15 0.14
16 0.13
17 0.11
18 0.11
19 0.09
20 0.09
21 0.1
22 0.1
23 0.11
24 0.14
25 0.14
26 0.15
27 0.16
28 0.19
29 0.2
30 0.21
31 0.2
32 0.17
33 0.18
34 0.18
35 0.22
36 0.21
37 0.19
38 0.24
39 0.31
40 0.39
41 0.44
42 0.52
43 0.55
44 0.63
45 0.66
46 0.68
47 0.7
48 0.7
49 0.73
50 0.68
51 0.63
52 0.57
53 0.58
54 0.56
55 0.54
56 0.54
57 0.54
58 0.53
59 0.51
60 0.49
61 0.43
62 0.37
63 0.33
64 0.31
65 0.27
66 0.26
67 0.23
68 0.22
69 0.23
70 0.23
71 0.23
72 0.16
73 0.15
74 0.15
75 0.15
76 0.14
77 0.14
78 0.14
79 0.16
80 0.16
81 0.18
82 0.19
83 0.19
84 0.19
85 0.23
86 0.24
87 0.25
88 0.33
89 0.33
90 0.36
91 0.35
92 0.35
93 0.31
94 0.29
95 0.25
96 0.16
97 0.11
98 0.07
99 0.08
100 0.08
101 0.08
102 0.13
103 0.12
104 0.14
105 0.14
106 0.15
107 0.16
108 0.18
109 0.19
110 0.19
111 0.22
112 0.26
113 0.29
114 0.29
115 0.28
116 0.28
117 0.34
118 0.3
119 0.28
120 0.27
121 0.27
122 0.33
123 0.44
124 0.51
125 0.55
126 0.65
127 0.74
128 0.8
129 0.82
130 0.79
131 0.73
132 0.68
133 0.64
134 0.6
135 0.51
136 0.41
137 0.38
138 0.34
139 0.32
140 0.28
141 0.22
142 0.17
143 0.23
144 0.32
145 0.33
146 0.41
147 0.45
148 0.46
149 0.53
150 0.6
151 0.6
152 0.59
153 0.58
154 0.54
155 0.51
156 0.49
157 0.43
158 0.37
159 0.3
160 0.26
161 0.27
162 0.21
163 0.2
164 0.19
165 0.18
166 0.2
167 0.23
168 0.2
169 0.18
170 0.18
171 0.17
172 0.16
173 0.14
174 0.1
175 0.06
176 0.06
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.1
199 0.1
200 0.11
201 0.11
202 0.12
203 0.13
204 0.17
205 0.17
206 0.14
207 0.21
208 0.21
209 0.23
210 0.23
211 0.22
212 0.19
213 0.23
214 0.25
215 0.24
216 0.32
217 0.31
218 0.32
219 0.4
220 0.41
221 0.37
222 0.38
223 0.33
224 0.32
225 0.33
226 0.34
227 0.33
228 0.35
229 0.44
230 0.49
231 0.54
232 0.55
233 0.64
234 0.71
235 0.74
236 0.8
237 0.79
238 0.81
239 0.8
240 0.75
241 0.69
242 0.59
243 0.49
244 0.4
245 0.32
246 0.25
247 0.21
248 0.19
249 0.23
250 0.23
251 0.29
252 0.37
253 0.47
254 0.47
255 0.53
256 0.61
257 0.62
258 0.69
259 0.7
260 0.72
261 0.66
262 0.67
263 0.68
264 0.6
265 0.57
266 0.52
267 0.49
268 0.46
269 0.43
270 0.43
271 0.39
272 0.38
273 0.35
274 0.35
275 0.33
276 0.27
277 0.27
278 0.24
279 0.2
280 0.21
281 0.22
282 0.25
283 0.25
284 0.27
285 0.32