Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5FGU6

Protein Details
Accession V5FGU6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
81-106VFAGAKAKKRGRKSKVEKEREREDATBasic
350-369QEQIRPKREFKLPPNPHRGQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
85-100AKAKKRGRKSKVEKER
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 11, cyto_nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR045127  TAF11-like  
IPR006809  TAFII28_dom  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0051123  P:RNA polymerase II preinitiation complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04719  TAFII28  
CDD cd08048  TAF11  
Amino Acid Sequences MSSPPPLQQNPPNPRKRPSISSTASQQGMKRARMHPLRQTSFPASLDADPRVFSATSDAGSVTGSFTGSLGGASAATGEGVFAGAKAKKRGRKSKVEKEREREDATSTRAGTVDGTRTGSVDADGGSVRAGGGGGGDDGDDDEDFDDEGELLGGDEGPTDTEAEKKNLAILVDAFNPIQSARYDLFKRAKLRKETLRRIVNHALSQSVPASVVTTINGFTKVFAGEIIEKARTVQAEWAEAHDNAALAAFEAEEAAEEAKLAEAKAAEAAKAVSETASQSTPDPSKSREASATEEHKPNGMKQEPAERNGDTLPSSVPPHVPSPSAPPNGQYNPSSAPSSQGTAPATPNQEQIRPKREFKLPPNPHRGQLLPTHLREALRRYKRDCEGGGVGMSGLSLQNLGVSGAFTWSVGSGGRRLFR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.8
3 0.77
4 0.75
5 0.71
6 0.71
7 0.66
8 0.66
9 0.65
10 0.62
11 0.58
12 0.53
13 0.48
14 0.48
15 0.5
16 0.49
17 0.5
18 0.47
19 0.54
20 0.6
21 0.65
22 0.66
23 0.69
24 0.69
25 0.65
26 0.68
27 0.63
28 0.58
29 0.51
30 0.44
31 0.36
32 0.34
33 0.34
34 0.3
35 0.25
36 0.22
37 0.21
38 0.21
39 0.18
40 0.16
41 0.17
42 0.15
43 0.14
44 0.15
45 0.14
46 0.11
47 0.12
48 0.12
49 0.08
50 0.07
51 0.07
52 0.06
53 0.06
54 0.07
55 0.06
56 0.06
57 0.05
58 0.05
59 0.05
60 0.04
61 0.05
62 0.04
63 0.04
64 0.04
65 0.03
66 0.03
67 0.04
68 0.04
69 0.03
70 0.08
71 0.11
72 0.15
73 0.23
74 0.31
75 0.38
76 0.48
77 0.59
78 0.64
79 0.72
80 0.79
81 0.82
82 0.86
83 0.9
84 0.89
85 0.87
86 0.85
87 0.81
88 0.75
89 0.65
90 0.59
91 0.52
92 0.47
93 0.43
94 0.36
95 0.3
96 0.25
97 0.24
98 0.2
99 0.18
100 0.17
101 0.15
102 0.16
103 0.15
104 0.15
105 0.16
106 0.14
107 0.12
108 0.09
109 0.08
110 0.07
111 0.07
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.05
116 0.04
117 0.04
118 0.03
119 0.03
120 0.03
121 0.03
122 0.03
123 0.03
124 0.03
125 0.03
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.04
146 0.05
147 0.05
148 0.09
149 0.11
150 0.13
151 0.13
152 0.13
153 0.14
154 0.15
155 0.14
156 0.11
157 0.1
158 0.1
159 0.11
160 0.12
161 0.1
162 0.09
163 0.09
164 0.08
165 0.09
166 0.07
167 0.09
168 0.09
169 0.14
170 0.15
171 0.21
172 0.27
173 0.3
174 0.38
175 0.43
176 0.5
177 0.51
178 0.57
179 0.61
180 0.66
181 0.7
182 0.71
183 0.71
184 0.66
185 0.66
186 0.66
187 0.58
188 0.49
189 0.41
190 0.32
191 0.25
192 0.24
193 0.17
194 0.1
195 0.08
196 0.06
197 0.07
198 0.06
199 0.06
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.06
206 0.06
207 0.07
208 0.07
209 0.06
210 0.06
211 0.07
212 0.07
213 0.08
214 0.09
215 0.09
216 0.08
217 0.09
218 0.1
219 0.09
220 0.09
221 0.1
222 0.1
223 0.12
224 0.12
225 0.14
226 0.15
227 0.15
228 0.15
229 0.12
230 0.11
231 0.08
232 0.08
233 0.06
234 0.04
235 0.04
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.03
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.05
261 0.05
262 0.06
263 0.08
264 0.08
265 0.09
266 0.09
267 0.13
268 0.15
269 0.18
270 0.19
271 0.2
272 0.26
273 0.27
274 0.29
275 0.29
276 0.3
277 0.31
278 0.36
279 0.39
280 0.37
281 0.39
282 0.37
283 0.36
284 0.35
285 0.33
286 0.35
287 0.32
288 0.29
289 0.28
290 0.38
291 0.39
292 0.41
293 0.42
294 0.33
295 0.32
296 0.3
297 0.29
298 0.19
299 0.17
300 0.15
301 0.13
302 0.15
303 0.15
304 0.16
305 0.17
306 0.19
307 0.2
308 0.2
309 0.19
310 0.25
311 0.32
312 0.34
313 0.32
314 0.32
315 0.38
316 0.4
317 0.42
318 0.35
319 0.3
320 0.3
321 0.32
322 0.32
323 0.25
324 0.25
325 0.23
326 0.25
327 0.22
328 0.23
329 0.22
330 0.21
331 0.24
332 0.25
333 0.28
334 0.27
335 0.32
336 0.31
337 0.35
338 0.41
339 0.47
340 0.51
341 0.53
342 0.56
343 0.58
344 0.63
345 0.67
346 0.69
347 0.72
348 0.73
349 0.77
350 0.83
351 0.79
352 0.74
353 0.69
354 0.61
355 0.54
356 0.51
357 0.51
358 0.48
359 0.46
360 0.47
361 0.45
362 0.45
363 0.44
364 0.45
365 0.45
366 0.47
367 0.53
368 0.54
369 0.61
370 0.65
371 0.69
372 0.62
373 0.59
374 0.53
375 0.48
376 0.43
377 0.35
378 0.28
379 0.2
380 0.18
381 0.12
382 0.08
383 0.05
384 0.05
385 0.04
386 0.05
387 0.05
388 0.06
389 0.05
390 0.06
391 0.06
392 0.07
393 0.08
394 0.07
395 0.07
396 0.07
397 0.08
398 0.09
399 0.11
400 0.14