Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5GBJ4

Protein Details
Accession V5GBJ4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-47SDSEGRGRSKKVKRETSKKQSETFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
30-38GRSKKVKRE
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, cyto 3.5, mito 1, pero 1, golg 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003173  PC4_C  
IPR009044  ssDNA-bd_transcriptional_reg  
IPR045125  Sub1/Tcp4-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003713  F:transcription coactivator activity  
GO:0060261  P:positive regulation of transcription initiation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF02229  PC4  
Amino Acid Sequences MAPKSNKRQARQDSYDEGDDFVVSDSEGRGRSKKVKRETSKKQSETFAGRNGSAKVDSNGDTYWEISRLRRVTISTFRGKTMVNIREYYEKDGQELPGKKTLLDCLPADRNYVLQGISMPIDQFSAFISVLPQIESVLHEKGVVVPRPEYDESGEEVEGDKDTSSKEAAVMGRSNIEETSEEEDEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.66
3 0.55
4 0.46
5 0.36
6 0.29
7 0.22
8 0.16
9 0.11
10 0.07
11 0.07
12 0.07
13 0.09
14 0.12
15 0.14
16 0.16
17 0.21
18 0.32
19 0.4
20 0.49
21 0.56
22 0.65
23 0.73
24 0.81
25 0.87
26 0.88
27 0.9
28 0.86
29 0.8
30 0.73
31 0.68
32 0.65
33 0.57
34 0.52
35 0.44
36 0.39
37 0.37
38 0.34
39 0.3
40 0.24
41 0.21
42 0.16
43 0.17
44 0.17
45 0.16
46 0.15
47 0.15
48 0.15
49 0.14
50 0.14
51 0.13
52 0.13
53 0.12
54 0.19
55 0.18
56 0.19
57 0.19
58 0.2
59 0.23
60 0.3
61 0.34
62 0.35
63 0.35
64 0.34
65 0.34
66 0.33
67 0.31
68 0.32
69 0.32
70 0.27
71 0.27
72 0.28
73 0.32
74 0.33
75 0.34
76 0.3
77 0.25
78 0.24
79 0.24
80 0.23
81 0.25
82 0.26
83 0.23
84 0.24
85 0.24
86 0.23
87 0.23
88 0.24
89 0.19
90 0.19
91 0.17
92 0.16
93 0.2
94 0.2
95 0.21
96 0.19
97 0.17
98 0.16
99 0.16
100 0.12
101 0.08
102 0.08
103 0.07
104 0.08
105 0.08
106 0.07
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.08
117 0.08
118 0.09
119 0.08
120 0.07
121 0.07
122 0.09
123 0.11
124 0.1
125 0.1
126 0.1
127 0.1
128 0.14
129 0.2
130 0.22
131 0.21
132 0.21
133 0.22
134 0.28
135 0.3
136 0.26
137 0.23
138 0.21
139 0.22
140 0.23
141 0.22
142 0.16
143 0.16
144 0.16
145 0.13
146 0.12
147 0.09
148 0.08
149 0.09
150 0.1
151 0.1
152 0.1
153 0.1
154 0.13
155 0.15
156 0.18
157 0.2
158 0.19
159 0.21
160 0.21
161 0.22
162 0.18
163 0.18
164 0.15
165 0.16
166 0.22