Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5FXM0

Protein Details
Accession V5FXM0    Localization Confidence High Confidence Score 24.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
95-115GHSCYRPRRTGERKRKSIRGABasic
192-217QRLVTPQRLQRKRHRIAIKRRRAEAAHydrophilic
233-252HEEKAKKSELRKRRASSMKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
102-111RRTGERKRKS
146-220KRLGPKRATKIRRFFGLDKKDDVRKFVIRRTVTREGKKDYTKAPKIQRLVTPQRLQRKRHRIAIKRRRAEAAREA
229-252ASRVHEEKAKKSELRKRRASSMKK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014401  Ribosomal_S6_euk  
IPR001377  Ribosomal_S6e  
IPR018282  Ribosomal_S6e_CS  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF01092  Ribosomal_S6e  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00578  RIBOSOMAL_S6E  
Amino Acid Sequences MKLNISYPANGSQKIIEVDDERKLRPFMEKRMGTEVSYIPPPPDISDIFPVPGDSLGDEFKGYLFKITGGNDKQGFPMKQGVLLPTRTRLLLSDGHSCYRPRRTGERKRKSIRGAITGQDLAVLALSIIKQGESDLPGLTDTVVPKRLGPKRATKIRRFFGLDKKDDVRKFVIRRTVTREGKKDYTKAPKIQRLVTPQRLQRKRHRIAIKRRRAEAAREAANDYAKLLASRVHEEKAKKSELRKRRASSMKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.27
3 0.21
4 0.21
5 0.24
6 0.3
7 0.32
8 0.29
9 0.31
10 0.31
11 0.29
12 0.36
13 0.4
14 0.41
15 0.49
16 0.51
17 0.51
18 0.58
19 0.58
20 0.49
21 0.45
22 0.38
23 0.31
24 0.3
25 0.27
26 0.2
27 0.2
28 0.2
29 0.18
30 0.19
31 0.17
32 0.18
33 0.22
34 0.22
35 0.21
36 0.2
37 0.19
38 0.16
39 0.15
40 0.12
41 0.08
42 0.08
43 0.08
44 0.08
45 0.08
46 0.08
47 0.08
48 0.09
49 0.08
50 0.08
51 0.08
52 0.09
53 0.12
54 0.14
55 0.21
56 0.22
57 0.27
58 0.27
59 0.27
60 0.28
61 0.32
62 0.31
63 0.25
64 0.29
65 0.24
66 0.25
67 0.25
68 0.26
69 0.22
70 0.25
71 0.24
72 0.2
73 0.21
74 0.19
75 0.18
76 0.16
77 0.16
78 0.18
79 0.2
80 0.25
81 0.25
82 0.26
83 0.28
84 0.29
85 0.3
86 0.32
87 0.33
88 0.3
89 0.39
90 0.49
91 0.58
92 0.68
93 0.74
94 0.78
95 0.8
96 0.83
97 0.77
98 0.74
99 0.66
100 0.61
101 0.53
102 0.44
103 0.4
104 0.33
105 0.28
106 0.21
107 0.17
108 0.1
109 0.07
110 0.05
111 0.03
112 0.03
113 0.03
114 0.03
115 0.03
116 0.03
117 0.03
118 0.04
119 0.05
120 0.05
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.08
130 0.11
131 0.11
132 0.12
133 0.21
134 0.26
135 0.3
136 0.34
137 0.42
138 0.48
139 0.59
140 0.66
141 0.67
142 0.7
143 0.68
144 0.69
145 0.65
146 0.61
147 0.61
148 0.61
149 0.55
150 0.51
151 0.52
152 0.53
153 0.48
154 0.46
155 0.41
156 0.4
157 0.4
158 0.41
159 0.46
160 0.42
161 0.45
162 0.5
163 0.56
164 0.57
165 0.61
166 0.62
167 0.6
168 0.64
169 0.65
170 0.6
171 0.58
172 0.6
173 0.6
174 0.63
175 0.65
176 0.65
177 0.65
178 0.66
179 0.64
180 0.63
181 0.66
182 0.66
183 0.65
184 0.64
185 0.7
186 0.73
187 0.74
188 0.75
189 0.77
190 0.75
191 0.77
192 0.81
193 0.8
194 0.84
195 0.88
196 0.88
197 0.85
198 0.82
199 0.8
200 0.73
201 0.7
202 0.67
203 0.64
204 0.59
205 0.53
206 0.51
207 0.45
208 0.43
209 0.36
210 0.28
211 0.21
212 0.15
213 0.13
214 0.12
215 0.14
216 0.15
217 0.22
218 0.24
219 0.27
220 0.32
221 0.36
222 0.43
223 0.47
224 0.51
225 0.5
226 0.57
227 0.63
228 0.68
229 0.74
230 0.77
231 0.76
232 0.78