Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5FTX6

Protein Details
Accession V5FTX6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MPPKKQAEPKKSKKTVEDKTFGMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-33KKQAEPKKSKKTVEDKTFGMKNKKGGSARK
50-64AKRKEAEKARREAEK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032378  ZC3H15/TMA46_C  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF16543  DFRP_C  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MPPKKQAEPKKSKKTVEDKTFGMKNKKGGSARKQIAQLQAQAQSNKSADAKRKEAEKARREAEKAASEQAKREALELFKPVQVQKVPFGVDPKTVLCVFYKQGNCEKGKKCKFSHDLSVERKAAKKDLYSDDRDVKEEKEADTMDKWDEEKLRNVVLSKHGNPRTTTDKVCKYFIEAVENQKYGWFWVCPNGGDKCMYRHSLPPGFVLKTKEQKAAEKALLDKSPLKTLTLEDWLESERHKLTGTLTPVTPETFAKWKKERLDKKAAEDEARKAKEATGRMMFESGKWKAEDSSEEESEGEDEDDGAWNLEALRKETERLRAQKEEERLAKLAGTGVVPDGPVEAVSQPVVQEGDG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.87
3 0.86
4 0.8
5 0.72
6 0.71
7 0.71
8 0.69
9 0.67
10 0.6
11 0.58
12 0.58
13 0.63
14 0.62
15 0.65
16 0.67
17 0.69
18 0.7
19 0.68
20 0.67
21 0.64
22 0.65
23 0.6
24 0.55
25 0.49
26 0.5
27 0.49
28 0.46
29 0.42
30 0.38
31 0.34
32 0.32
33 0.32
34 0.32
35 0.36
36 0.42
37 0.46
38 0.45
39 0.51
40 0.56
41 0.62
42 0.66
43 0.65
44 0.66
45 0.66
46 0.69
47 0.65
48 0.62
49 0.59
50 0.54
51 0.48
52 0.47
53 0.47
54 0.41
55 0.42
56 0.42
57 0.38
58 0.32
59 0.31
60 0.27
61 0.23
62 0.26
63 0.26
64 0.24
65 0.22
66 0.24
67 0.24
68 0.26
69 0.27
70 0.26
71 0.26
72 0.27
73 0.27
74 0.26
75 0.29
76 0.25
77 0.23
78 0.23
79 0.2
80 0.2
81 0.19
82 0.18
83 0.16
84 0.17
85 0.17
86 0.23
87 0.25
88 0.25
89 0.32
90 0.38
91 0.4
92 0.47
93 0.52
94 0.56
95 0.62
96 0.66
97 0.62
98 0.66
99 0.68
100 0.64
101 0.67
102 0.63
103 0.63
104 0.6
105 0.65
106 0.57
107 0.53
108 0.51
109 0.43
110 0.4
111 0.33
112 0.3
113 0.29
114 0.35
115 0.39
116 0.4
117 0.42
118 0.45
119 0.43
120 0.43
121 0.39
122 0.31
123 0.3
124 0.26
125 0.23
126 0.19
127 0.19
128 0.18
129 0.18
130 0.18
131 0.15
132 0.14
133 0.14
134 0.13
135 0.16
136 0.16
137 0.2
138 0.2
139 0.2
140 0.2
141 0.2
142 0.19
143 0.22
144 0.26
145 0.26
146 0.33
147 0.36
148 0.38
149 0.38
150 0.4
151 0.4
152 0.38
153 0.38
154 0.35
155 0.39
156 0.39
157 0.4
158 0.36
159 0.33
160 0.33
161 0.31
162 0.3
163 0.24
164 0.28
165 0.29
166 0.29
167 0.26
168 0.22
169 0.21
170 0.16
171 0.16
172 0.11
173 0.07
174 0.12
175 0.13
176 0.13
177 0.16
178 0.16
179 0.16
180 0.17
181 0.18
182 0.17
183 0.19
184 0.21
185 0.19
186 0.22
187 0.27
188 0.29
189 0.29
190 0.29
191 0.29
192 0.28
193 0.3
194 0.3
195 0.29
196 0.33
197 0.35
198 0.37
199 0.36
200 0.39
201 0.4
202 0.41
203 0.37
204 0.32
205 0.31
206 0.29
207 0.28
208 0.26
209 0.26
210 0.22
211 0.25
212 0.24
213 0.22
214 0.19
215 0.2
216 0.21
217 0.21
218 0.2
219 0.16
220 0.16
221 0.16
222 0.16
223 0.15
224 0.15
225 0.11
226 0.12
227 0.12
228 0.11
229 0.13
230 0.18
231 0.21
232 0.21
233 0.2
234 0.21
235 0.22
236 0.22
237 0.2
238 0.15
239 0.15
240 0.21
241 0.24
242 0.31
243 0.35
244 0.41
245 0.48
246 0.59
247 0.65
248 0.65
249 0.73
250 0.69
251 0.72
252 0.73
253 0.68
254 0.64
255 0.58
256 0.56
257 0.55
258 0.52
259 0.45
260 0.38
261 0.37
262 0.37
263 0.36
264 0.36
265 0.32
266 0.32
267 0.32
268 0.33
269 0.3
270 0.27
271 0.31
272 0.27
273 0.24
274 0.23
275 0.23
276 0.22
277 0.24
278 0.26
279 0.25
280 0.29
281 0.27
282 0.27
283 0.26
284 0.25
285 0.23
286 0.2
287 0.14
288 0.08
289 0.07
290 0.07
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.07
295 0.07
296 0.08
297 0.11
298 0.12
299 0.13
300 0.18
301 0.18
302 0.22
303 0.27
304 0.35
305 0.41
306 0.48
307 0.52
308 0.55
309 0.59
310 0.63
311 0.65
312 0.66
313 0.61
314 0.58
315 0.53
316 0.46
317 0.41
318 0.34
319 0.3
320 0.22
321 0.17
322 0.12
323 0.12
324 0.12
325 0.11
326 0.1
327 0.09
328 0.08
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.08
333 0.09
334 0.1
335 0.09
336 0.11