Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5FSN7

Protein Details
Accession V5FSN7    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
97-146GEDGERPKRKEGRRKKRRDDDEVVGEEGEGKGRRKRDGERRKRREATPEDBasic
165-184DEALKKPTKRRARKADGIDLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
90-115RFKRKRDGEDGERPKRKEGRRKKRRD
124-142GEGKGRRKRDGERRKRREA
155-178RRRRALDRAMDEALKKPTKRRARK
413-415KAR
420-425QKGSRR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSATPEDRPASPVAEENNQHEENGHEAAEAANEEIEERDNDNDAADLSDDESVLSEVDEAQFEDFDPENVAIDDRPALAIDEENLKLVGRFKRKRDGEDGERPKRKEGRRKKRRDDDEVVGEEGEGKGRRKRDGERRKRREATPEDEEHLDPATRRRRALDRAMDEALKKPTKRRARKADGIDLEQMADAEIEDVRKRMTQAAQLDAINRREGKPAMHKLRMLPEVVSLLNRNQYVNSLVDPEINLLEAVKFFLEPLDDGSLPAYNIQRDLMNSLAKLPINKEALIASGIGKVIVFYTKSKRAEPGIKRQAERLLAEWTRPILQRSDDYSKRVYQEADFDPTKLATRPQVLNAQATAAEARARELLPPRLANRARVDQTHTSYTVVPRSTVVQESKFARPLGASGEDRFRRMKARQIAAQKGSRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.32
3 0.34
4 0.39
5 0.37
6 0.36
7 0.33
8 0.3
9 0.26
10 0.25
11 0.2
12 0.13
13 0.12
14 0.13
15 0.13
16 0.12
17 0.09
18 0.07
19 0.07
20 0.07
21 0.08
22 0.1
23 0.1
24 0.11
25 0.12
26 0.14
27 0.14
28 0.14
29 0.14
30 0.12
31 0.11
32 0.1
33 0.09
34 0.08
35 0.09
36 0.08
37 0.08
38 0.08
39 0.07
40 0.07
41 0.06
42 0.06
43 0.06
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.07
48 0.07
49 0.08
50 0.11
51 0.11
52 0.1
53 0.12
54 0.12
55 0.12
56 0.12
57 0.12
58 0.09
59 0.1
60 0.1
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.09
67 0.09
68 0.12
69 0.12
70 0.13
71 0.12
72 0.12
73 0.12
74 0.18
75 0.24
76 0.31
77 0.38
78 0.43
79 0.54
80 0.58
81 0.63
82 0.66
83 0.68
84 0.66
85 0.7
86 0.75
87 0.75
88 0.78
89 0.73
90 0.72
91 0.72
92 0.72
93 0.72
94 0.73
95 0.74
96 0.78
97 0.88
98 0.91
99 0.93
100 0.93
101 0.91
102 0.87
103 0.83
104 0.8
105 0.71
106 0.61
107 0.5
108 0.4
109 0.31
110 0.24
111 0.2
112 0.14
113 0.14
114 0.18
115 0.21
116 0.26
117 0.3
118 0.4
119 0.48
120 0.57
121 0.66
122 0.73
123 0.79
124 0.85
125 0.86
126 0.81
127 0.8
128 0.76
129 0.73
130 0.69
131 0.63
132 0.55
133 0.51
134 0.46
135 0.36
136 0.3
137 0.23
138 0.16
139 0.2
140 0.26
141 0.26
142 0.27
143 0.31
144 0.36
145 0.42
146 0.5
147 0.51
148 0.46
149 0.48
150 0.49
151 0.46
152 0.4
153 0.38
154 0.35
155 0.3
156 0.28
157 0.29
158 0.37
159 0.47
160 0.56
161 0.63
162 0.67
163 0.72
164 0.79
165 0.8
166 0.8
167 0.72
168 0.65
169 0.56
170 0.45
171 0.36
172 0.27
173 0.21
174 0.11
175 0.08
176 0.05
177 0.04
178 0.04
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.06
183 0.07
184 0.08
185 0.1
186 0.12
187 0.17
188 0.19
189 0.21
190 0.22
191 0.22
192 0.23
193 0.24
194 0.23
195 0.2
196 0.19
197 0.17
198 0.18
199 0.18
200 0.19
201 0.24
202 0.32
203 0.37
204 0.39
205 0.39
206 0.38
207 0.43
208 0.42
209 0.34
210 0.25
211 0.19
212 0.18
213 0.17
214 0.15
215 0.11
216 0.1
217 0.12
218 0.13
219 0.12
220 0.11
221 0.12
222 0.13
223 0.13
224 0.12
225 0.11
226 0.11
227 0.11
228 0.11
229 0.11
230 0.09
231 0.08
232 0.07
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.05
242 0.04
243 0.06
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.1
248 0.1
249 0.09
250 0.12
251 0.11
252 0.09
253 0.09
254 0.1
255 0.1
256 0.1
257 0.12
258 0.12
259 0.12
260 0.12
261 0.13
262 0.15
263 0.14
264 0.15
265 0.15
266 0.18
267 0.19
268 0.19
269 0.19
270 0.16
271 0.16
272 0.16
273 0.15
274 0.09
275 0.08
276 0.08
277 0.07
278 0.07
279 0.06
280 0.06
281 0.07
282 0.08
283 0.1
284 0.16
285 0.24
286 0.27
287 0.29
288 0.32
289 0.37
290 0.45
291 0.49
292 0.55
293 0.57
294 0.61
295 0.6
296 0.6
297 0.59
298 0.53
299 0.47
300 0.38
301 0.36
302 0.3
303 0.3
304 0.28
305 0.24
306 0.25
307 0.25
308 0.24
309 0.19
310 0.21
311 0.24
312 0.3
313 0.37
314 0.37
315 0.39
316 0.41
317 0.42
318 0.42
319 0.4
320 0.35
321 0.28
322 0.32
323 0.31
324 0.34
325 0.31
326 0.29
327 0.28
328 0.27
329 0.27
330 0.21
331 0.21
332 0.19
333 0.24
334 0.26
335 0.29
336 0.35
337 0.35
338 0.36
339 0.33
340 0.29
341 0.23
342 0.22
343 0.18
344 0.12
345 0.12
346 0.09
347 0.11
348 0.12
349 0.12
350 0.16
351 0.21
352 0.27
353 0.31
354 0.36
355 0.36
356 0.44
357 0.46
358 0.48
359 0.49
360 0.51
361 0.5
362 0.48
363 0.54
364 0.51
365 0.54
366 0.53
367 0.47
368 0.4
369 0.39
370 0.4
371 0.39
372 0.33
373 0.28
374 0.24
375 0.27
376 0.28
377 0.31
378 0.32
379 0.28
380 0.33
381 0.37
382 0.41
383 0.42
384 0.39
385 0.34
386 0.3
387 0.29
388 0.28
389 0.3
390 0.27
391 0.26
392 0.36
393 0.37
394 0.4
395 0.41
396 0.38
397 0.4
398 0.42
399 0.48
400 0.48
401 0.54
402 0.59
403 0.66
404 0.73
405 0.73