Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5FCA5

Protein Details
Accession V5FCA5    Localization Confidence High Confidence Score 17.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
322-341GESSKRRKKVSKDKQVNGDEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
309-313KRKAE
316-333SSAKTNGESSKRRKKVSK
417-432RARQKAELLKKEKRRQ
Subcellular Location(s) nucl 18.5, mito_nucl 11.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006569  CID_dom  
IPR042326  Ctk3  
IPR024637  Ctk3_C  
IPR024638  Ctk3_N  
IPR008942  ENTH_VHS  
IPR013268  U3_snoRNA_assoc  
Gene Ontology GO:0070692  C:CTDK-1 complex  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0016301  F:kinase activity  
GO:0030515  F:snoRNA binding  
GO:0016310  P:phosphorylation  
GO:0032786  P:positive regulation of DNA-templated transcription, elongation  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF12243  CTK3  
PF12350  CTK3_C  
PF08297  U3_snoRNA_assoc  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51391  CID  
Amino Acid Sequences MADPFEVRMRFTTQLQHLSASVTSSQKAAHYALKYRDMDEDLHSCILEQLERNNMNNRANIMYFIEQLCDMATKENHLDYVRMIQRDILRVVDAVAPADGSGAANVKHVRRVLQGLQSKSVLSAETVTEIDGSLKERETHPAHLDLEPVEGAEPGSKSRGTPRGQKSNGTLRVDKRQIEQRIEEDRERNKRLRESMWAVNGDDGEENGKFWDDASDTGEDDFLGAEEEIMERRQMFVTAAKGLFAKKDSDEEFSGNADCSSDPAAIQEHPDSAPTKTATMVMTTRSGRTAPVEKESSPEVNGSRVGNAKRKAESASSAKTNGESSKRRKKVSKDKQVNGDEQSKSTSEEKVAEVEKPKHFRFGSEEPAPVDEMEEVPETQQNGAQSAEDSDDDEAPEAIDNSAQLLRMKEQAQKQERARQKAELLKKEKRRQLDELHKTQAKSASKKKDIVNGTRKAEYQDDVSESTATLQGSVIHDSRRPALPALLPDEILNAAPDVRPPTPPPEDEVPEQKKPTKLRFLDKVEKAPKDIKRGGTTVRVLDGKKSTAVLAPKVSKDGRNLRQGWLNGKRASVAQVNGLRRTTGGNSGFVRSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.42
3 0.41
4 0.37
5 0.36
6 0.34
7 0.28
8 0.25
9 0.2
10 0.2
11 0.19
12 0.2
13 0.18
14 0.21
15 0.22
16 0.24
17 0.26
18 0.33
19 0.38
20 0.46
21 0.46
22 0.44
23 0.46
24 0.42
25 0.39
26 0.36
27 0.34
28 0.28
29 0.27
30 0.25
31 0.21
32 0.2
33 0.19
34 0.17
35 0.16
36 0.17
37 0.25
38 0.28
39 0.31
40 0.37
41 0.42
42 0.43
43 0.43
44 0.43
45 0.37
46 0.35
47 0.33
48 0.3
49 0.26
50 0.25
51 0.22
52 0.21
53 0.17
54 0.17
55 0.15
56 0.13
57 0.11
58 0.14
59 0.14
60 0.16
61 0.19
62 0.19
63 0.22
64 0.21
65 0.22
66 0.18
67 0.27
68 0.29
69 0.27
70 0.27
71 0.28
72 0.31
73 0.35
74 0.34
75 0.26
76 0.22
77 0.21
78 0.22
79 0.2
80 0.17
81 0.13
82 0.11
83 0.1
84 0.09
85 0.09
86 0.07
87 0.05
88 0.05
89 0.06
90 0.07
91 0.1
92 0.14
93 0.15
94 0.2
95 0.21
96 0.23
97 0.25
98 0.31
99 0.32
100 0.38
101 0.44
102 0.42
103 0.44
104 0.42
105 0.39
106 0.34
107 0.29
108 0.2
109 0.14
110 0.12
111 0.09
112 0.1
113 0.1
114 0.1
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.08
119 0.11
120 0.1
121 0.12
122 0.13
123 0.14
124 0.22
125 0.24
126 0.28
127 0.29
128 0.31
129 0.32
130 0.31
131 0.32
132 0.24
133 0.22
134 0.17
135 0.14
136 0.1
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.1
143 0.1
144 0.11
145 0.18
146 0.26
147 0.28
148 0.38
149 0.46
150 0.54
151 0.56
152 0.6
153 0.59
154 0.61
155 0.65
156 0.6
157 0.57
158 0.5
159 0.58
160 0.58
161 0.54
162 0.49
163 0.5
164 0.51
165 0.5
166 0.49
167 0.45
168 0.49
169 0.51
170 0.5
171 0.47
172 0.5
173 0.53
174 0.56
175 0.56
176 0.53
177 0.55
178 0.56
179 0.52
180 0.52
181 0.49
182 0.49
183 0.49
184 0.45
185 0.39
186 0.35
187 0.31
188 0.24
189 0.18
190 0.13
191 0.09
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.06
197 0.06
198 0.08
199 0.07
200 0.08
201 0.1
202 0.11
203 0.11
204 0.11
205 0.11
206 0.08
207 0.08
208 0.07
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.05
216 0.05
217 0.06
218 0.05
219 0.06
220 0.07
221 0.07
222 0.08
223 0.09
224 0.11
225 0.14
226 0.14
227 0.13
228 0.14
229 0.14
230 0.14
231 0.13
232 0.13
233 0.1
234 0.14
235 0.15
236 0.18
237 0.19
238 0.19
239 0.18
240 0.17
241 0.17
242 0.13
243 0.12
244 0.09
245 0.07
246 0.07
247 0.08
248 0.07
249 0.06
250 0.07
251 0.08
252 0.08
253 0.09
254 0.09
255 0.09
256 0.09
257 0.1
258 0.11
259 0.1
260 0.12
261 0.11
262 0.11
263 0.11
264 0.12
265 0.11
266 0.12
267 0.12
268 0.11
269 0.14
270 0.14
271 0.14
272 0.13
273 0.13
274 0.12
275 0.14
276 0.19
277 0.17
278 0.21
279 0.22
280 0.21
281 0.23
282 0.24
283 0.22
284 0.17
285 0.17
286 0.13
287 0.12
288 0.14
289 0.12
290 0.12
291 0.15
292 0.17
293 0.22
294 0.25
295 0.27
296 0.27
297 0.28
298 0.28
299 0.25
300 0.27
301 0.26
302 0.26
303 0.25
304 0.25
305 0.23
306 0.22
307 0.22
308 0.21
309 0.23
310 0.27
311 0.34
312 0.44
313 0.5
314 0.54
315 0.59
316 0.66
317 0.71
318 0.75
319 0.77
320 0.77
321 0.77
322 0.81
323 0.79
324 0.72
325 0.65
326 0.6
327 0.5
328 0.4
329 0.36
330 0.27
331 0.25
332 0.23
333 0.2
334 0.14
335 0.15
336 0.15
337 0.16
338 0.17
339 0.17
340 0.21
341 0.26
342 0.3
343 0.35
344 0.34
345 0.39
346 0.38
347 0.36
348 0.38
349 0.37
350 0.39
351 0.36
352 0.37
353 0.31
354 0.32
355 0.3
356 0.23
357 0.18
358 0.11
359 0.08
360 0.08
361 0.09
362 0.08
363 0.08
364 0.09
365 0.09
366 0.09
367 0.1
368 0.09
369 0.09
370 0.1
371 0.09
372 0.08
373 0.08
374 0.09
375 0.08
376 0.08
377 0.08
378 0.08
379 0.08
380 0.08
381 0.08
382 0.06
383 0.07
384 0.06
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.06
389 0.07
390 0.08
391 0.09
392 0.09
393 0.11
394 0.15
395 0.18
396 0.22
397 0.27
398 0.36
399 0.41
400 0.48
401 0.52
402 0.57
403 0.63
404 0.65
405 0.62
406 0.56
407 0.56
408 0.57
409 0.61
410 0.61
411 0.62
412 0.63
413 0.71
414 0.76
415 0.75
416 0.74
417 0.72
418 0.69
419 0.71
420 0.73
421 0.72
422 0.69
423 0.72
424 0.67
425 0.61
426 0.58
427 0.55
428 0.51
429 0.5
430 0.53
431 0.55
432 0.58
433 0.64
434 0.64
435 0.64
436 0.65
437 0.67
438 0.67
439 0.65
440 0.63
441 0.59
442 0.57
443 0.51
444 0.46
445 0.37
446 0.31
447 0.26
448 0.24
449 0.23
450 0.23
451 0.2
452 0.17
453 0.17
454 0.16
455 0.13
456 0.1
457 0.09
458 0.11
459 0.12
460 0.15
461 0.16
462 0.16
463 0.18
464 0.2
465 0.23
466 0.24
467 0.24
468 0.22
469 0.24
470 0.25
471 0.26
472 0.3
473 0.27
474 0.24
475 0.22
476 0.22
477 0.19
478 0.16
479 0.12
480 0.08
481 0.07
482 0.07
483 0.1
484 0.13
485 0.14
486 0.17
487 0.19
488 0.27
489 0.31
490 0.32
491 0.35
492 0.37
493 0.41
494 0.42
495 0.5
496 0.49
497 0.51
498 0.54
499 0.54
500 0.54
501 0.58
502 0.62
503 0.62
504 0.62
505 0.65
506 0.7
507 0.74
508 0.78
509 0.76
510 0.77
511 0.75
512 0.71
513 0.67
514 0.66
515 0.62
516 0.61
517 0.62
518 0.58
519 0.55
520 0.57
521 0.56
522 0.56
523 0.54
524 0.46
525 0.45
526 0.43
527 0.38
528 0.4
529 0.39
530 0.33
531 0.31
532 0.3
533 0.26
534 0.26
535 0.3
536 0.29
537 0.33
538 0.35
539 0.35
540 0.41
541 0.43
542 0.42
543 0.47
544 0.53
545 0.53
546 0.58
547 0.59
548 0.57
549 0.62
550 0.62
551 0.62
552 0.61
553 0.61
554 0.53
555 0.52
556 0.49
557 0.42
558 0.44
559 0.39
560 0.31
561 0.32
562 0.37
563 0.41
564 0.44
565 0.43
566 0.38
567 0.34
568 0.36
569 0.31
570 0.32
571 0.3
572 0.31
573 0.33