Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5HRF7

Protein Details
Accession V5HRF7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
192-212AVDDMRKRKRRSPSPQPALDPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
198-203KRKRRS
573-597RRRGGRGRGGGYGGPWRDSWRGRGR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 10.5, cyto 6.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034257  Acinus_RRM  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR032552  RSB_motif  
IPR003034  SAP_dom  
IPR036361  SAP_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF16294  RSB_motif  
PF02037  SAP  
CDD cd12432  RRM_ACINU  
Amino Acid Sequences MTDYAKWKVVDLKAELKRRGIPQTGLKVKQNFIDKLLEADNAAAGSEGAEEGAAPEQGIEQETAEPKQAPIVEQDNANIEQQSQAPPEPETVKSPEGERQAEFGEAPREGVRDSAASEGKETQETHPDQTAPQQPQETPEQVTGQQAPEDAKEQLQERMDIERPQEESAAPATTSKQSPSTEQPSSATGEEAVDDMRKRKRRSPSPQPALDPIVQKKVKGEDGGPRVLLKEDVGVDNLPQRVVSDAGDVAMKEATTSEDTGEVRESKERAPEAANDEAKKTAHPSSEHDAEIQRDQVSHTKREKEHEESPSRDVLKDGDEGRIVEPALHPATPALYIRNFMRPLQPANLKNYLISLATPPTKSPDPDIILDFFLDSIKTHCFVSFANISAASRVRSSLHGTVWPNERDRKPLWVDFIPEEKTRQWISIEQDSEGRGRGGPRWEVVYEETRNGIDAILQEAPSLTAAPSVPKAPLGPRGGFVDRDPRRGPPASADPRARGEGFKALDELFKSTTAKPKLYYLPVPKEVAARRLDKFDELARKGPYPRPGGDETRRITFENTDSFVDQGPEYAVRRRGGRGRGGGYGGPWRDSWRGRGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.6
3 0.56
4 0.59
5 0.58
6 0.61
7 0.57
8 0.55
9 0.55
10 0.63
11 0.68
12 0.67
13 0.68
14 0.65
15 0.62
16 0.61
17 0.6
18 0.51
19 0.46
20 0.46
21 0.38
22 0.37
23 0.36
24 0.31
25 0.23
26 0.21
27 0.18
28 0.12
29 0.12
30 0.08
31 0.06
32 0.06
33 0.06
34 0.05
35 0.04
36 0.04
37 0.04
38 0.05
39 0.06
40 0.06
41 0.05
42 0.06
43 0.06
44 0.07
45 0.09
46 0.08
47 0.08
48 0.12
49 0.15
50 0.16
51 0.18
52 0.18
53 0.17
54 0.21
55 0.21
56 0.18
57 0.21
58 0.24
59 0.23
60 0.23
61 0.24
62 0.24
63 0.25
64 0.25
65 0.19
66 0.16
67 0.16
68 0.17
69 0.19
70 0.18
71 0.18
72 0.19
73 0.19
74 0.23
75 0.24
76 0.24
77 0.25
78 0.27
79 0.28
80 0.27
81 0.29
82 0.31
83 0.34
84 0.35
85 0.31
86 0.28
87 0.28
88 0.27
89 0.25
90 0.22
91 0.19
92 0.16
93 0.17
94 0.16
95 0.16
96 0.15
97 0.15
98 0.13
99 0.11
100 0.12
101 0.15
102 0.16
103 0.16
104 0.18
105 0.19
106 0.19
107 0.22
108 0.22
109 0.19
110 0.26
111 0.28
112 0.29
113 0.3
114 0.29
115 0.27
116 0.33
117 0.39
118 0.33
119 0.35
120 0.35
121 0.32
122 0.35
123 0.4
124 0.35
125 0.29
126 0.28
127 0.26
128 0.24
129 0.27
130 0.25
131 0.21
132 0.19
133 0.17
134 0.16
135 0.15
136 0.17
137 0.15
138 0.13
139 0.15
140 0.16
141 0.19
142 0.19
143 0.19
144 0.18
145 0.22
146 0.24
147 0.24
148 0.24
149 0.23
150 0.24
151 0.24
152 0.23
153 0.18
154 0.17
155 0.16
156 0.16
157 0.12
158 0.11
159 0.12
160 0.15
161 0.16
162 0.16
163 0.19
164 0.19
165 0.23
166 0.29
167 0.34
168 0.32
169 0.33
170 0.32
171 0.3
172 0.31
173 0.27
174 0.2
175 0.14
176 0.12
177 0.11
178 0.1
179 0.09
180 0.08
181 0.09
182 0.14
183 0.22
184 0.3
185 0.34
186 0.41
187 0.51
188 0.6
189 0.69
190 0.76
191 0.79
192 0.8
193 0.82
194 0.77
195 0.7
196 0.63
197 0.56
198 0.5
199 0.41
200 0.41
201 0.36
202 0.33
203 0.32
204 0.32
205 0.31
206 0.27
207 0.27
208 0.26
209 0.3
210 0.31
211 0.29
212 0.26
213 0.24
214 0.23
215 0.2
216 0.12
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.1
221 0.09
222 0.09
223 0.12
224 0.12
225 0.11
226 0.09
227 0.09
228 0.09
229 0.1
230 0.09
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.08
235 0.07
236 0.07
237 0.06
238 0.06
239 0.04
240 0.05
241 0.06
242 0.06
243 0.07
244 0.07
245 0.09
246 0.09
247 0.1
248 0.11
249 0.11
250 0.11
251 0.13
252 0.14
253 0.13
254 0.17
255 0.17
256 0.17
257 0.17
258 0.19
259 0.21
260 0.25
261 0.26
262 0.23
263 0.23
264 0.23
265 0.22
266 0.19
267 0.18
268 0.15
269 0.16
270 0.17
271 0.21
272 0.25
273 0.28
274 0.28
275 0.26
276 0.24
277 0.23
278 0.22
279 0.19
280 0.13
281 0.11
282 0.12
283 0.17
284 0.18
285 0.24
286 0.28
287 0.33
288 0.35
289 0.4
290 0.44
291 0.44
292 0.48
293 0.49
294 0.51
295 0.47
296 0.47
297 0.46
298 0.42
299 0.35
300 0.29
301 0.21
302 0.17
303 0.18
304 0.16
305 0.13
306 0.13
307 0.14
308 0.13
309 0.13
310 0.11
311 0.09
312 0.08
313 0.1
314 0.1
315 0.09
316 0.09
317 0.08
318 0.08
319 0.09
320 0.09
321 0.08
322 0.08
323 0.09
324 0.11
325 0.16
326 0.17
327 0.17
328 0.21
329 0.21
330 0.24
331 0.28
332 0.34
333 0.31
334 0.35
335 0.38
336 0.34
337 0.32
338 0.29
339 0.25
340 0.18
341 0.16
342 0.12
343 0.11
344 0.13
345 0.13
346 0.13
347 0.16
348 0.18
349 0.18
350 0.2
351 0.22
352 0.23
353 0.24
354 0.26
355 0.22
356 0.21
357 0.2
358 0.17
359 0.11
360 0.09
361 0.07
362 0.06
363 0.06
364 0.07
365 0.08
366 0.09
367 0.09
368 0.09
369 0.09
370 0.14
371 0.14
372 0.14
373 0.14
374 0.14
375 0.14
376 0.15
377 0.16
378 0.12
379 0.11
380 0.1
381 0.11
382 0.12
383 0.17
384 0.18
385 0.19
386 0.23
387 0.25
388 0.29
389 0.33
390 0.34
391 0.34
392 0.39
393 0.39
394 0.39
395 0.39
396 0.42
397 0.41
398 0.41
399 0.42
400 0.36
401 0.38
402 0.35
403 0.38
404 0.34
405 0.3
406 0.3
407 0.25
408 0.27
409 0.25
410 0.24
411 0.21
412 0.22
413 0.27
414 0.31
415 0.32
416 0.28
417 0.29
418 0.28
419 0.27
420 0.23
421 0.19
422 0.13
423 0.13
424 0.16
425 0.2
426 0.2
427 0.21
428 0.23
429 0.23
430 0.23
431 0.25
432 0.28
433 0.25
434 0.24
435 0.24
436 0.21
437 0.21
438 0.19
439 0.16
440 0.1
441 0.09
442 0.11
443 0.11
444 0.11
445 0.1
446 0.1
447 0.1
448 0.09
449 0.09
450 0.06
451 0.06
452 0.07
453 0.09
454 0.1
455 0.11
456 0.12
457 0.12
458 0.14
459 0.15
460 0.23
461 0.26
462 0.25
463 0.26
464 0.31
465 0.32
466 0.32
467 0.31
468 0.34
469 0.32
470 0.38
471 0.38
472 0.36
473 0.4
474 0.41
475 0.4
476 0.37
477 0.45
478 0.46
479 0.52
480 0.53
481 0.5
482 0.51
483 0.54
484 0.47
485 0.38
486 0.32
487 0.32
488 0.29
489 0.27
490 0.25
491 0.22
492 0.23
493 0.23
494 0.23
495 0.17
496 0.17
497 0.19
498 0.21
499 0.29
500 0.32
501 0.34
502 0.33
503 0.38
504 0.43
505 0.46
506 0.52
507 0.52
508 0.56
509 0.58
510 0.59
511 0.54
512 0.54
513 0.51
514 0.49
515 0.46
516 0.42
517 0.4
518 0.43
519 0.43
520 0.38
521 0.37
522 0.38
523 0.42
524 0.41
525 0.44
526 0.42
527 0.45
528 0.48
529 0.51
530 0.52
531 0.48
532 0.47
533 0.48
534 0.51
535 0.55
536 0.58
537 0.6
538 0.56
539 0.56
540 0.55
541 0.5
542 0.47
543 0.42
544 0.4
545 0.37
546 0.36
547 0.33
548 0.31
549 0.31
550 0.29
551 0.27
552 0.21
553 0.16
554 0.16
555 0.17
556 0.18
557 0.24
558 0.28
559 0.3
560 0.33
561 0.4
562 0.45
563 0.49
564 0.55
565 0.56
566 0.55
567 0.55
568 0.55
569 0.49
570 0.44
571 0.45
572 0.38
573 0.32
574 0.29
575 0.3
576 0.34
577 0.36