Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5GCF4

Protein Details
Accession V5GCF4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
266-285EEERRRRQTQEKEEERRRIQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
256-283KEKKRREAAAEEERRRRQTQEKEEERRR
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11, mito 6, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001715  CH_dom  
IPR036872  CH_dom_sf  
IPR003096  SM22_calponin  
Gene Ontology GO:0016043  P:cellular component organization  
Pfam View protein in Pfam  
PF00307  CH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50021  CH  
CDD cd21210  CH_SCP1-like  
Amino Acid Sequences MASVTSLDKDLRNMRLSKYTPQAANEVREWIEEVLHEKLASSDLLAALKDGVALCKLVNLAVSPGVKYKQSSMPFVQMENISHFLRAVQMPPLSLPPHDVFLTVDLYESKDPAQVLQCLSAFSRRANVIEPAKFPRTLGAKSKGGAVTPQLTGSSQGQLSTRPRGASNVSNSGALSPAAMSTMSGRSSPGKGGSPSPKAPVSSWSRKTDETVTAPAWNIHQYGYMGGASQANQGVTFGARRQITSPLPAVPSLAEKEKKRREAAAEEERRRRQTQEKEEERRRIQREEEEANARAEEERRWAEETERLREKERREVEEQKKKWDEEQRKWEEEEQRRLQEEKELEDKFNQERQRSRGLSDARLNGQFLSQYQAHQPKSPPRTVESAESQRIKQLERELELAKERERQYERERLDLREKQERETRSRSRSHPRPVQPSYDLSSLEQERKLLRSEWQQQQDDSSVPPMTPPRQSRPLPDPTAAQQTSPRPLPDPKVASQTSPRPLPDPAAYASRTDRFLASNPAPSPPKPASHRPADYSSTAEIDAENSRRVAAQQKTRAGGWASKSLLEREMERERERQREWEESQKQTSEAAKKGLKDNIGVGPGQGAWDVHQYGYTGGDNQNRGGQGLGIGGARRQIIGPRPPP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.49
3 0.51
4 0.53
5 0.55
6 0.56
7 0.53
8 0.53
9 0.57
10 0.52
11 0.54
12 0.48
13 0.43
14 0.36
15 0.33
16 0.33
17 0.25
18 0.21
19 0.17
20 0.18
21 0.17
22 0.17
23 0.16
24 0.14
25 0.14
26 0.15
27 0.14
28 0.11
29 0.1
30 0.1
31 0.12
32 0.11
33 0.11
34 0.1
35 0.1
36 0.1
37 0.09
38 0.09
39 0.09
40 0.09
41 0.09
42 0.1
43 0.1
44 0.09
45 0.1
46 0.09
47 0.1
48 0.14
49 0.15
50 0.14
51 0.18
52 0.2
53 0.21
54 0.22
55 0.25
56 0.29
57 0.32
58 0.38
59 0.38
60 0.44
61 0.43
62 0.43
63 0.42
64 0.35
65 0.33
66 0.31
67 0.31
68 0.24
69 0.22
70 0.21
71 0.17
72 0.19
73 0.19
74 0.16
75 0.18
76 0.18
77 0.18
78 0.2
79 0.23
80 0.21
81 0.2
82 0.23
83 0.19
84 0.22
85 0.21
86 0.21
87 0.17
88 0.18
89 0.2
90 0.14
91 0.14
92 0.11
93 0.14
94 0.14
95 0.14
96 0.13
97 0.13
98 0.13
99 0.15
100 0.18
101 0.18
102 0.19
103 0.22
104 0.21
105 0.2
106 0.21
107 0.23
108 0.21
109 0.19
110 0.23
111 0.21
112 0.22
113 0.23
114 0.29
115 0.31
116 0.33
117 0.37
118 0.38
119 0.4
120 0.39
121 0.36
122 0.35
123 0.33
124 0.34
125 0.38
126 0.39
127 0.39
128 0.39
129 0.44
130 0.39
131 0.35
132 0.31
133 0.26
134 0.23
135 0.2
136 0.21
137 0.15
138 0.15
139 0.17
140 0.17
141 0.16
142 0.13
143 0.14
144 0.14
145 0.19
146 0.22
147 0.26
148 0.27
149 0.26
150 0.26
151 0.28
152 0.32
153 0.33
154 0.35
155 0.35
156 0.33
157 0.32
158 0.32
159 0.29
160 0.25
161 0.18
162 0.13
163 0.06
164 0.06
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.06
169 0.08
170 0.09
171 0.09
172 0.1
173 0.13
174 0.14
175 0.16
176 0.16
177 0.18
178 0.19
179 0.25
180 0.31
181 0.34
182 0.35
183 0.37
184 0.36
185 0.35
186 0.34
187 0.35
188 0.36
189 0.4
190 0.44
191 0.47
192 0.48
193 0.47
194 0.49
195 0.46
196 0.43
197 0.36
198 0.33
199 0.29
200 0.27
201 0.27
202 0.24
203 0.21
204 0.17
205 0.14
206 0.11
207 0.11
208 0.1
209 0.1
210 0.1
211 0.09
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.09
217 0.09
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.11
226 0.12
227 0.12
228 0.14
229 0.19
230 0.2
231 0.22
232 0.22
233 0.19
234 0.2
235 0.19
236 0.18
237 0.14
238 0.14
239 0.13
240 0.17
241 0.2
242 0.22
243 0.32
244 0.4
245 0.45
246 0.46
247 0.48
248 0.47
249 0.48
250 0.53
251 0.54
252 0.56
253 0.57
254 0.63
255 0.64
256 0.63
257 0.59
258 0.55
259 0.53
260 0.53
261 0.57
262 0.6
263 0.65
264 0.71
265 0.77
266 0.81
267 0.77
268 0.76
269 0.69
270 0.62
271 0.55
272 0.52
273 0.5
274 0.45
275 0.43
276 0.38
277 0.35
278 0.32
279 0.28
280 0.22
281 0.17
282 0.15
283 0.12
284 0.13
285 0.13
286 0.14
287 0.16
288 0.16
289 0.17
290 0.21
291 0.24
292 0.27
293 0.3
294 0.3
295 0.32
296 0.37
297 0.38
298 0.41
299 0.43
300 0.41
301 0.43
302 0.52
303 0.58
304 0.64
305 0.62
306 0.61
307 0.6
308 0.56
309 0.56
310 0.55
311 0.54
312 0.53
313 0.62
314 0.6
315 0.58
316 0.59
317 0.59
318 0.58
319 0.56
320 0.56
321 0.5
322 0.47
323 0.46
324 0.46
325 0.41
326 0.37
327 0.31
328 0.25
329 0.27
330 0.25
331 0.24
332 0.24
333 0.27
334 0.24
335 0.29
336 0.29
337 0.27
338 0.31
339 0.34
340 0.41
341 0.39
342 0.38
343 0.39
344 0.38
345 0.39
346 0.39
347 0.38
348 0.32
349 0.32
350 0.31
351 0.24
352 0.21
353 0.16
354 0.12
355 0.13
356 0.1
357 0.11
358 0.16
359 0.23
360 0.24
361 0.27
362 0.31
363 0.35
364 0.41
365 0.43
366 0.39
367 0.35
368 0.39
369 0.37
370 0.38
371 0.36
372 0.36
373 0.38
374 0.38
375 0.36
376 0.34
377 0.34
378 0.3
379 0.27
380 0.27
381 0.25
382 0.25
383 0.28
384 0.26
385 0.27
386 0.29
387 0.27
388 0.23
389 0.26
390 0.26
391 0.3
392 0.32
393 0.36
394 0.39
395 0.46
396 0.46
397 0.47
398 0.49
399 0.45
400 0.51
401 0.51
402 0.49
403 0.5
404 0.5
405 0.46
406 0.5
407 0.5
408 0.48
409 0.52
410 0.56
411 0.53
412 0.59
413 0.61
414 0.65
415 0.69
416 0.72
417 0.73
418 0.73
419 0.76
420 0.73
421 0.72
422 0.64
423 0.59
424 0.53
425 0.45
426 0.38
427 0.29
428 0.3
429 0.27
430 0.27
431 0.24
432 0.22
433 0.21
434 0.22
435 0.24
436 0.2
437 0.22
438 0.28
439 0.37
440 0.44
441 0.5
442 0.5
443 0.48
444 0.49
445 0.46
446 0.38
447 0.3
448 0.24
449 0.16
450 0.14
451 0.16
452 0.18
453 0.2
454 0.26
455 0.31
456 0.35
457 0.43
458 0.45
459 0.5
460 0.52
461 0.58
462 0.55
463 0.51
464 0.46
465 0.41
466 0.49
467 0.43
468 0.36
469 0.33
470 0.33
471 0.37
472 0.36
473 0.34
474 0.28
475 0.33
476 0.37
477 0.4
478 0.42
479 0.39
480 0.44
481 0.44
482 0.43
483 0.45
484 0.47
485 0.45
486 0.44
487 0.42
488 0.36
489 0.37
490 0.38
491 0.34
492 0.29
493 0.26
494 0.26
495 0.26
496 0.26
497 0.28
498 0.27
499 0.26
500 0.24
501 0.23
502 0.21
503 0.22
504 0.28
505 0.27
506 0.31
507 0.3
508 0.34
509 0.36
510 0.35
511 0.39
512 0.34
513 0.4
514 0.39
515 0.48
516 0.5
517 0.56
518 0.6
519 0.58
520 0.6
521 0.57
522 0.52
523 0.46
524 0.4
525 0.32
526 0.27
527 0.22
528 0.17
529 0.15
530 0.18
531 0.17
532 0.17
533 0.16
534 0.16
535 0.17
536 0.19
537 0.25
538 0.28
539 0.36
540 0.42
541 0.48
542 0.5
543 0.5
544 0.52
545 0.46
546 0.44
547 0.38
548 0.37
549 0.32
550 0.34
551 0.35
552 0.33
553 0.33
554 0.3
555 0.28
556 0.28
557 0.35
558 0.37
559 0.39
560 0.46
561 0.49
562 0.55
563 0.56
564 0.58
565 0.55
566 0.58
567 0.6
568 0.62
569 0.64
570 0.62
571 0.65
572 0.58
573 0.53
574 0.48
575 0.51
576 0.47
577 0.43
578 0.44
579 0.42
580 0.44
581 0.49
582 0.51
583 0.45
584 0.4
585 0.4
586 0.37
587 0.36
588 0.32
589 0.26
590 0.22
591 0.19
592 0.18
593 0.14
594 0.1
595 0.09
596 0.14
597 0.15
598 0.13
599 0.14
600 0.14
601 0.14
602 0.17
603 0.16
604 0.15
605 0.19
606 0.25
607 0.26
608 0.27
609 0.31
610 0.29
611 0.28
612 0.25
613 0.2
614 0.15
615 0.14
616 0.14
617 0.11
618 0.11
619 0.11
620 0.14
621 0.14
622 0.13
623 0.14
624 0.18
625 0.25