Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5G3T7

Protein Details
Accession V5G3T7    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
217-241IKGTSQDKGKREKQRKEKNILEVDMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
33-62EKAAPRHGKRDAPKEPAAAAPRGGARNNRG
224-234KGKREKQRKEK
246-286APRGRGDGPRGRGRGGRGGRGGRGDGPRTGGRGDGPRPAGR
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 6, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MTDVRSKNLYELLGNDPELDPNRPADPPTRAIEKAAPRHGKRDAPKEPAAAAPRGGARNNRGPSGNEGAFRDREAGSYNNRNRPVDEHKEAQRRGFRARDDRGERVRNDRHPRSGHTDTNKKVDQGWGANSGEKEWTDEKIGEAVAQADENEPQTPAEEEPSEKSKSYAEYLAELAEKKSQELGIKEARAPNEGVKVDPKWAQAKPLKRDEEEDAYIKGTSQDKGKREKQRKEKNILEVDMRFVEAPRGRGDGPRGRGRGGRGGRGGRGDGPRTGGRGDGPRPAGRGGNSGPTVDEKNFPSLGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.26
3 0.22
4 0.25
5 0.26
6 0.26
7 0.22
8 0.21
9 0.24
10 0.23
11 0.25
12 0.27
13 0.3
14 0.31
15 0.35
16 0.38
17 0.37
18 0.38
19 0.43
20 0.46
21 0.49
22 0.54
23 0.59
24 0.55
25 0.61
26 0.64
27 0.65
28 0.65
29 0.67
30 0.65
31 0.63
32 0.65
33 0.61
34 0.56
35 0.54
36 0.5
37 0.41
38 0.33
39 0.28
40 0.28
41 0.28
42 0.3
43 0.29
44 0.31
45 0.38
46 0.4
47 0.4
48 0.38
49 0.37
50 0.4
51 0.43
52 0.39
53 0.32
54 0.32
55 0.34
56 0.32
57 0.31
58 0.28
59 0.2
60 0.18
61 0.19
62 0.2
63 0.23
64 0.32
65 0.39
66 0.44
67 0.48
68 0.49
69 0.47
70 0.5
71 0.52
72 0.5
73 0.48
74 0.47
75 0.51
76 0.59
77 0.59
78 0.6
79 0.57
80 0.51
81 0.52
82 0.51
83 0.49
84 0.49
85 0.53
86 0.56
87 0.56
88 0.6
89 0.62
90 0.63
91 0.58
92 0.58
93 0.6
94 0.59
95 0.64
96 0.62
97 0.61
98 0.58
99 0.6
100 0.6
101 0.59
102 0.56
103 0.55
104 0.58
105 0.53
106 0.57
107 0.53
108 0.45
109 0.4
110 0.36
111 0.31
112 0.25
113 0.24
114 0.21
115 0.21
116 0.22
117 0.21
118 0.19
119 0.16
120 0.14
121 0.15
122 0.11
123 0.12
124 0.12
125 0.12
126 0.11
127 0.11
128 0.11
129 0.08
130 0.07
131 0.07
132 0.06
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.05
141 0.06
142 0.07
143 0.07
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.11
148 0.15
149 0.15
150 0.15
151 0.15
152 0.15
153 0.16
154 0.17
155 0.17
156 0.14
157 0.14
158 0.14
159 0.14
160 0.14
161 0.13
162 0.11
163 0.12
164 0.11
165 0.1
166 0.11
167 0.12
168 0.13
169 0.14
170 0.18
171 0.2
172 0.21
173 0.23
174 0.25
175 0.24
176 0.23
177 0.23
178 0.2
179 0.21
180 0.2
181 0.19
182 0.19
183 0.19
184 0.21
185 0.22
186 0.24
187 0.24
188 0.24
189 0.31
190 0.34
191 0.42
192 0.46
193 0.53
194 0.54
195 0.5
196 0.53
197 0.5
198 0.5
199 0.45
200 0.39
201 0.31
202 0.28
203 0.26
204 0.23
205 0.21
206 0.17
207 0.15
208 0.21
209 0.27
210 0.31
211 0.4
212 0.49
213 0.57
214 0.65
215 0.74
216 0.78
217 0.82
218 0.87
219 0.87
220 0.86
221 0.84
222 0.81
223 0.74
224 0.68
225 0.57
226 0.51
227 0.42
228 0.35
229 0.25
230 0.18
231 0.22
232 0.2
233 0.21
234 0.2
235 0.22
236 0.22
237 0.26
238 0.33
239 0.35
240 0.39
241 0.46
242 0.46
243 0.45
244 0.48
245 0.48
246 0.51
247 0.47
248 0.47
249 0.45
250 0.47
251 0.48
252 0.47
253 0.45
254 0.42
255 0.43
256 0.39
257 0.34
258 0.35
259 0.34
260 0.33
261 0.32
262 0.27
263 0.25
264 0.29
265 0.3
266 0.32
267 0.36
268 0.37
269 0.38
270 0.39
271 0.39
272 0.33
273 0.36
274 0.32
275 0.34
276 0.33
277 0.31
278 0.3
279 0.3
280 0.32
281 0.29
282 0.31
283 0.25
284 0.29