Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5FCH7

Protein Details
Accession V5FCH7    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
193-216QECAKDKKPASKRPRPRLSHFFKTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
199-209KKPASKRPRPR
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10, mito 7, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019835  SWIB_domain  
IPR036885  SWIB_MDM2_dom_sf  
IPR003121  SWIB_MDM2_domain  
Pfam View protein in Pfam  
PF02201  SWIB  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51925  SWIB_MDM2  
CDD cd10568  SWIB_like  
Amino Acid Sequences MNAPIPPNYARGYPQAAQRSPAAPRRGAPGPAQVMPVPLPPQAVPNPQLMAAQRTMAQSNDAALRRSRKPTDKNIPDGVDEVVIGEGVQQYKSLREVEKRLDAAMIRKRLDIQDSISRTVKRYRTLRIWVTNTVENQPWQKAEQNGANPGSGRYKVKIEGRLLDDEGDPTVSDESDDEGEEDQNGDAMEQDGQECAKDKKPASKRPRPRLSHFFKTITVDFDKAPSAKPEEVKPITWNKPQLPPNATSLPPTADFDSLQFSRASQENLNVTISLVRDETPERYKLSKELAEVLDTEEEARSGIVLGIWDYIRAMGLQEDEEKRQVRCDHRLRSIFGRDQMFFPQIPESTSAHTSPMDPIKLPYTIRVDQDFHKDPKPTVYDIRVAVEDPLRQKMIALTSNPQYAASIRQISTLDDQLSLVVQALTHSKAKHAFYTALSKDPATFVRRWLNSQRRDLETILGEATRGGGEDGSGPEFRRGGTASVWETPVAREAVRYMLAKPDAAAAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.47
3 0.46
4 0.46
5 0.47
6 0.46
7 0.47
8 0.51
9 0.48
10 0.42
11 0.42
12 0.46
13 0.47
14 0.46
15 0.42
16 0.43
17 0.42
18 0.41
19 0.42
20 0.36
21 0.33
22 0.31
23 0.31
24 0.25
25 0.21
26 0.21
27 0.18
28 0.23
29 0.26
30 0.31
31 0.3
32 0.31
33 0.31
34 0.3
35 0.32
36 0.28
37 0.28
38 0.23
39 0.22
40 0.21
41 0.22
42 0.23
43 0.2
44 0.21
45 0.16
46 0.18
47 0.23
48 0.22
49 0.22
50 0.26
51 0.32
52 0.37
53 0.45
54 0.51
55 0.54
56 0.6
57 0.69
58 0.75
59 0.77
60 0.78
61 0.77
62 0.7
63 0.62
64 0.55
65 0.45
66 0.34
67 0.25
68 0.18
69 0.11
70 0.08
71 0.07
72 0.06
73 0.07
74 0.08
75 0.08
76 0.09
77 0.09
78 0.11
79 0.14
80 0.17
81 0.2
82 0.26
83 0.32
84 0.37
85 0.43
86 0.42
87 0.4
88 0.39
89 0.36
90 0.38
91 0.39
92 0.4
93 0.34
94 0.34
95 0.36
96 0.36
97 0.38
98 0.32
99 0.3
100 0.32
101 0.34
102 0.37
103 0.39
104 0.38
105 0.37
106 0.43
107 0.43
108 0.42
109 0.44
110 0.48
111 0.51
112 0.58
113 0.63
114 0.64
115 0.63
116 0.6
117 0.59
118 0.55
119 0.49
120 0.44
121 0.38
122 0.32
123 0.31
124 0.28
125 0.25
126 0.23
127 0.26
128 0.25
129 0.28
130 0.31
131 0.31
132 0.34
133 0.34
134 0.32
135 0.28
136 0.27
137 0.26
138 0.23
139 0.22
140 0.19
141 0.21
142 0.25
143 0.3
144 0.35
145 0.35
146 0.37
147 0.39
148 0.39
149 0.37
150 0.33
151 0.28
152 0.22
153 0.19
154 0.14
155 0.1
156 0.08
157 0.08
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.06
181 0.08
182 0.1
183 0.13
184 0.18
185 0.2
186 0.3
187 0.39
188 0.49
189 0.58
190 0.66
191 0.73
192 0.79
193 0.87
194 0.84
195 0.83
196 0.83
197 0.81
198 0.79
199 0.74
200 0.65
201 0.57
202 0.54
203 0.46
204 0.4
205 0.33
206 0.25
207 0.2
208 0.19
209 0.19
210 0.15
211 0.15
212 0.13
213 0.15
214 0.16
215 0.18
216 0.19
217 0.26
218 0.27
219 0.27
220 0.29
221 0.33
222 0.36
223 0.38
224 0.4
225 0.35
226 0.42
227 0.45
228 0.47
229 0.42
230 0.39
231 0.4
232 0.38
233 0.35
234 0.29
235 0.26
236 0.21
237 0.19
238 0.18
239 0.15
240 0.12
241 0.12
242 0.11
243 0.14
244 0.12
245 0.13
246 0.11
247 0.1
248 0.12
249 0.13
250 0.15
251 0.11
252 0.14
253 0.14
254 0.15
255 0.15
256 0.13
257 0.12
258 0.11
259 0.11
260 0.09
261 0.08
262 0.07
263 0.08
264 0.09
265 0.13
266 0.14
267 0.16
268 0.18
269 0.19
270 0.2
271 0.21
272 0.24
273 0.23
274 0.21
275 0.24
276 0.22
277 0.21
278 0.2
279 0.19
280 0.15
281 0.12
282 0.12
283 0.07
284 0.06
285 0.06
286 0.05
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.03
291 0.04
292 0.04
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.04
302 0.05
303 0.06
304 0.1
305 0.12
306 0.13
307 0.17
308 0.19
309 0.19
310 0.23
311 0.29
312 0.3
313 0.39
314 0.46
315 0.49
316 0.56
317 0.6
318 0.58
319 0.59
320 0.6
321 0.54
322 0.5
323 0.47
324 0.39
325 0.37
326 0.36
327 0.32
328 0.26
329 0.23
330 0.2
331 0.16
332 0.16
333 0.18
334 0.16
335 0.17
336 0.19
337 0.18
338 0.17
339 0.17
340 0.17
341 0.18
342 0.21
343 0.19
344 0.18
345 0.19
346 0.2
347 0.22
348 0.22
349 0.22
350 0.25
351 0.26
352 0.29
353 0.31
354 0.31
355 0.31
356 0.39
357 0.41
358 0.38
359 0.39
360 0.39
361 0.36
362 0.41
363 0.41
364 0.37
365 0.36
366 0.36
367 0.36
368 0.35
369 0.36
370 0.29
371 0.26
372 0.24
373 0.21
374 0.21
375 0.19
376 0.22
377 0.2
378 0.19
379 0.19
380 0.2
381 0.22
382 0.23
383 0.23
384 0.24
385 0.27
386 0.29
387 0.29
388 0.26
389 0.22
390 0.19
391 0.21
392 0.21
393 0.22
394 0.21
395 0.23
396 0.24
397 0.25
398 0.27
399 0.26
400 0.22
401 0.18
402 0.18
403 0.15
404 0.15
405 0.12
406 0.1
407 0.06
408 0.05
409 0.06
410 0.09
411 0.11
412 0.14
413 0.14
414 0.18
415 0.24
416 0.26
417 0.28
418 0.3
419 0.3
420 0.3
421 0.39
422 0.37
423 0.36
424 0.35
425 0.32
426 0.29
427 0.29
428 0.31
429 0.26
430 0.26
431 0.28
432 0.36
433 0.38
434 0.43
435 0.52
436 0.57
437 0.6
438 0.68
439 0.69
440 0.65
441 0.66
442 0.61
443 0.55
444 0.47
445 0.4
446 0.32
447 0.25
448 0.2
449 0.16
450 0.15
451 0.1
452 0.08
453 0.07
454 0.06
455 0.06
456 0.09
457 0.11
458 0.13
459 0.15
460 0.16
461 0.18
462 0.18
463 0.18
464 0.19
465 0.19
466 0.18
467 0.19
468 0.23
469 0.24
470 0.27
471 0.28
472 0.26
473 0.25
474 0.24
475 0.25
476 0.21
477 0.18
478 0.16
479 0.16
480 0.19
481 0.22
482 0.23
483 0.2
484 0.26
485 0.27
486 0.27
487 0.25