FuNGI

V5GCK1

Protein Details

Accession

V5GCK1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
115-140	KEVDERMDRRRKARREAREREEREEY	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
123-134	RRRKARREARER

Subcellular Location(s)

nucl 9.5, mito_nucl 9.333, cyto_mito 8.333, mito 8, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR003107 HAT IPR010491 PRP1_N IPR045075 Syf1-like IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf IPR019734 TPR_repeat
Gene Ontology	GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF06424 PRP1_N PF13432 TPR_16 PF14559 TPR_19

Amino Acid Sequences

MSFGRKDFLSQPAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPAREGPTPEQIQEALAKRAQLLGTAPPTAYGAGREKGRGEAKVEEQEEDDERFQDPENEVGLFAYGQYDQEDDEADRIYKEVDERMDRRRKARREAREREEREEYERNNPKIQQQFADLKRSLATVSDEDWANIPEVGDLTGKNRRAKQNLRQRFYAVPDSVIASARDATQFDTTVAEDGTQTDVRGGESADGTMTNFADIGAARDKVLQVRLDQAAQGSTADTASGSATNIDPKGYLTSLTKSELKAGEVEIGDIKRVRVLLESVTRTNPKHAPGWIAIARLEELAGRIGAARNYIAKGCELCPKSEDAWLENIRLNEGHNAKVIAANAIKNNDRSTRLWIEAMRLETEPRAKKNVLRQAILHIPQSVAIWKEAVNLEEDPADARLLLAKAVEMIPLSVELWLALARLETPENAQKVLNAARKAVPTSHEVWIAAARLQEQMGTADKVNVMKRAVQSLARENAMLKREEWIAEAEKCEEEGAVLTCGAIIRETLGWGLDEDDDRKDIWMEDARSSIARGKYETARAIYAYALRVFVNRKSIWLAAADLERNHGTKEALWQVLEKAVEACPQSEVLWMQLAKEKWQAGEIDNARRVLGRAFNQNPNNEDIWLAAVKLEADARQTDQARELLATARREAGTDRVWIKSVAFERQLGNTDEALDLVNQGLQLYPKADKLWMMKGQIYEAQNKYPQAREAYGTGTRACPKSVPLWLLASRLEEKAGLVVKARSVLDRARLAVPKNAELWTESVRVERRANNITQAKVLMAKALQEVPDSGLLWSESIWYLEPRTQRKPRSLEAIKKVDNDPILFVTVARIFWGERRLEKAMTWFEKAIVANSDLGDAWAWYYKFLLQHGTEEKRADVMSKCVATEPKHGEVWQSVAKDPANAYKTTEEILKMVVERLA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.41
2	0.38
3	0.3
4	0.28
5	0.25
6	0.19
7	0.15
8	0.12
9	0.12
10	0.12
11	0.12
12	0.07
13	0.09
14	0.1
15	0.11
16	0.15
17	0.15
18	0.16
19	0.2
20	0.23
21	0.25
22	0.29
23	0.3
24	0.29
25	0.32
26	0.34
27	0.32
28	0.38
29	0.37
30	0.32
31	0.32
32	0.29
33	0.27
34	0.31
35	0.31
36	0.28
37	0.27
38	0.26
39	0.24
40	0.28
41	0.26
42	0.21
43	0.19
44	0.21
45	0.23
46	0.24
47	0.23
48	0.2
49	0.21
50	0.2
51	0.19
52	0.16
53	0.18
54	0.22
55	0.24
56	0.26
57	0.26
58	0.33
59	0.37
60	0.35
61	0.34
62	0.35
63	0.38
64	0.44
65	0.44
66	0.38
67	0.35
68	0.36
69	0.34
70	0.32
71	0.28
72	0.2
73	0.2
74	0.2
75	0.19
76	0.21
77	0.2
78	0.19
79	0.19
80	0.18
81	0.17
82	0.16
83	0.16
84	0.11
85	0.1
86	0.08
87	0.07
88	0.07
89	0.08
90	0.08
91	0.08
92	0.09
93	0.1
94	0.1
95	0.11
96	0.12
97	0.12
98	0.11
99	0.11
100	0.12
101	0.12
102	0.13
103	0.16
104	0.2
105	0.27
106	0.31
107	0.41
108	0.5
109	0.54
110	0.61
111	0.67
112	0.7
113	0.73
114	0.79
115	0.8
116	0.82
117	0.87
118	0.88
119	0.88
120	0.85
121	0.81
122	0.79
123	0.7
124	0.66
125	0.63
126	0.57
127	0.56
128	0.61
129	0.57
130	0.55
131	0.55
132	0.56
133	0.56
134	0.56
135	0.48
136	0.46
137	0.52
138	0.5
139	0.56
140	0.48
141	0.41
142	0.38
143	0.36
144	0.3
145	0.22
146	0.22
147	0.15
148	0.16
149	0.18
150	0.18
151	0.18
152	0.18
153	0.17
154	0.15
155	0.13
156	0.11
157	0.08
158	0.09
159	0.09
160	0.09
161	0.09
162	0.12
163	0.19
164	0.24
165	0.3
166	0.37
167	0.44
168	0.53
169	0.62
170	0.68
171	0.73
172	0.78
173	0.77
174	0.73
175	0.68
176	0.63
177	0.59
178	0.57
179	0.47
180	0.37
181	0.32
182	0.31
183	0.28
184	0.25
185	0.2
186	0.13
187	0.13
188	0.12
189	0.13
190	0.12
191	0.13
192	0.13
193	0.13
194	0.13
195	0.13
196	0.13
197	0.12
198	0.12
199	0.1
200	0.08
201	0.08
202	0.12
203	0.11
204	0.1
205	0.1
206	0.11
207	0.11
208	0.11
209	0.11
210	0.08
211	0.08
212	0.08
213	0.08
214	0.07
215	0.07
216	0.08
217	0.08
218	0.06
219	0.06
220	0.06
221	0.06
222	0.06
223	0.08
224	0.1
225	0.1
226	0.11
227	0.12
228	0.13
229	0.14
230	0.18
231	0.17
232	0.15
233	0.19
234	0.21
235	0.2
236	0.2
237	0.18
238	0.15
239	0.14
240	0.13
241	0.08
242	0.07
243	0.06
244	0.06
245	0.05
246	0.05
247	0.05
248	0.06
249	0.05
250	0.06
251	0.07
252	0.1
253	0.1
254	0.1
255	0.09
256	0.1
257	0.12
258	0.11
259	0.13
260	0.12
261	0.14
262	0.16
263	0.19
264	0.21
265	0.19
266	0.23
267	0.22
268	0.21
269	0.19
270	0.18
271	0.18
272	0.15
273	0.16
274	0.14
275	0.13
276	0.14
277	0.14
278	0.13
279	0.11
280	0.11
281	0.11
282	0.09
283	0.11
284	0.13
285	0.19
286	0.22
287	0.23
288	0.26
289	0.29
290	0.29
291	0.33
292	0.31
293	0.28
294	0.28
295	0.28
296	0.28
297	0.26
298	0.32
299	0.28
300	0.26
301	0.23
302	0.21
303	0.19
304	0.15
305	0.14
306	0.08
307	0.07
308	0.06
309	0.06
310	0.05
311	0.05
312	0.07
313	0.07
314	0.07
315	0.08
316	0.08
317	0.1
318	0.1
319	0.1
320	0.1
321	0.12
322	0.13
323	0.2
324	0.2
325	0.2
326	0.2
327	0.23
328	0.23
329	0.24
330	0.24
331	0.17
332	0.23
333	0.23
334	0.24
335	0.23
336	0.22
337	0.19
338	0.18
339	0.18
340	0.17
341	0.17
342	0.17
343	0.15
344	0.16
345	0.15
346	0.17
347	0.16
348	0.12
349	0.12
350	0.13
351	0.13
352	0.16
353	0.17
354	0.17
355	0.19
356	0.19
357	0.22
358	0.22
359	0.27
360	0.28
361	0.28
362	0.29
363	0.27
364	0.27
365	0.26
366	0.25
367	0.2
368	0.17
369	0.16
370	0.16
371	0.22
372	0.23
373	0.22
374	0.26
375	0.26
376	0.29
377	0.38
378	0.45
379	0.42
380	0.4
381	0.38
382	0.38
383	0.43
384	0.41
385	0.33
386	0.24
387	0.2
388	0.19
389	0.19
390	0.15
391	0.1
392	0.08
393	0.08
394	0.07
395	0.1
396	0.1
397	0.1
398	0.1
399	0.1
400	0.1
401	0.1
402	0.09
403	0.07
404	0.07
405	0.07
406	0.05
407	0.05
408	0.06
409	0.06
410	0.06
411	0.05
412	0.05
413	0.05
414	0.06
415	0.06
416	0.04
417	0.04
418	0.04
419	0.04
420	0.05
421	0.04
422	0.04
423	0.03
424	0.04
425	0.04
426	0.04
427	0.03
428	0.03
429	0.03
430	0.04
431	0.05
432	0.05
433	0.07
434	0.11
435	0.11
436	0.12
437	0.12
438	0.11
439	0.13
440	0.19
441	0.22
442	0.18
443	0.19
444	0.21
445	0.22
446	0.22
447	0.21
448	0.17
449	0.16
450	0.18
451	0.19
452	0.17
453	0.16
454	0.16
455	0.15
456	0.14
457	0.12
458	0.09
459	0.08
460	0.07
461	0.07
462	0.07
463	0.06
464	0.07
465	0.07
466	0.08
467	0.08
468	0.08
469	0.09
470	0.11
471	0.12
472	0.13
473	0.12
474	0.15
475	0.15
476	0.17
477	0.17
478	0.17
479	0.18
480	0.21
481	0.23
482	0.2
483	0.2
484	0.18
485	0.21
486	0.21
487	0.19
488	0.14
489	0.14
490	0.14
491	0.15
492	0.15
493	0.13
494	0.14
495	0.14
496	0.14
497	0.13
498	0.13
499	0.12
500	0.11
501	0.09
502	0.06
503	0.06
504	0.06
505	0.05
506	0.05
507	0.05
508	0.05
509	0.05
510	0.05
511	0.04
512	0.03
513	0.04
514	0.04
515	0.04
516	0.04
517	0.04
518	0.05
519	0.05
520	0.06
521	0.06
522	0.06
523	0.07
524	0.08
525	0.08
526	0.08
527	0.08
528	0.08
529	0.08
530	0.1
531	0.13
532	0.14
533	0.14
534	0.15
535	0.16
536	0.15
537	0.16
538	0.18
539	0.16
540	0.15
541	0.15
542	0.18
543	0.2
544	0.23
545	0.25
546	0.21
547	0.19
548	0.19
549	0.18
550	0.16
551	0.14
552	0.12
553	0.11
554	0.1
555	0.1
556	0.12
557	0.13
558	0.14
559	0.19
560	0.18
561	0.18
562	0.2
563	0.2
564	0.19
565	0.18
566	0.16
567	0.12
568	0.14
569	0.13
570	0.11
571	0.13
572	0.13
573	0.13
574	0.12
575	0.11
576	0.1
577	0.1
578	0.15
579	0.17
580	0.17
581	0.17
582	0.17
583	0.17
584	0.19
585	0.18
586	0.13
587	0.1
588	0.09
589	0.12
590	0.12
591	0.12
592	0.1
593	0.1
594	0.1
595	0.11
596	0.1
597	0.08
598	0.11
599	0.11
600	0.11
601	0.15
602	0.15
603	0.16
604	0.19
605	0.19
606	0.16
607	0.19
608	0.19
609	0.16
610	0.24
611	0.25
612	0.28
613	0.3
614	0.3
615	0.28
616	0.27
617	0.26
618	0.2
619	0.22
620	0.19
621	0.26
622	0.3
623	0.38
624	0.42
625	0.44
626	0.44
627	0.42
628	0.39
629	0.31
630	0.26
631	0.18
632	0.16
633	0.13
634	0.11
635	0.07
636	0.07
637	0.06
638	0.07
639	0.07
640	0.06
641	0.07
642	0.08
643	0.1
644	0.15
645	0.16
646	0.17
647	0.18
648	0.19
649	0.18
650	0.17
651	0.16
652	0.16
653	0.19
654	0.2
655	0.18
656	0.2
657	0.19
658	0.2
659	0.2
660	0.2
661	0.18
662	0.22
663	0.23
664	0.21
665	0.22
666	0.22
667	0.21
668	0.22
669	0.23
670	0.22
671	0.22
672	0.23
673	0.23
674	0.25
675	0.28
676	0.25
677	0.24
678	0.19
679	0.19
680	0.17
681	0.15
682	0.14
683	0.1
684	0.08
685	0.06
686	0.07
687	0.05
688	0.05
689	0.06
690	0.06
691	0.07
692	0.09
693	0.1
694	0.11
695	0.12
696	0.13
697	0.16
698	0.19
699	0.26
700	0.28
701	0.29
702	0.3
703	0.3
704	0.32
705	0.33
706	0.32
707	0.32
708	0.29
709	0.31
710	0.32
711	0.34
712	0.35
713	0.32
714	0.34
715	0.31
716	0.31
717	0.29
718	0.27
719	0.29
720	0.29
721	0.28
722	0.25
723	0.24
724	0.27
725	0.27
726	0.26
727	0.22
728	0.22
729	0.25
730	0.29
731	0.27
732	0.24
733	0.28
734	0.28
735	0.29
736	0.27
737	0.26
738	0.23
739	0.22
740	0.2
741	0.16
742	0.14
743	0.16
744	0.17
745	0.14
746	0.14
747	0.15
748	0.15
749	0.18
750	0.19
751	0.16
752	0.17
753	0.2
754	0.24
755	0.25
756	0.27
757	0.29
758	0.33
759	0.34
760	0.36
761	0.36
762	0.32
763	0.32
764	0.3
765	0.26
766	0.23
767	0.24
768	0.22
769	0.21
770	0.19
771	0.22
772	0.25
773	0.28
774	0.32
775	0.33
776	0.36
777	0.4
778	0.41
779	0.45
780	0.48
781	0.45
782	0.42
783	0.38
784	0.32
785	0.3
786	0.28
787	0.21
788	0.16
789	0.16
790	0.16
791	0.18
792	0.17
793	0.15
794	0.16
795	0.15
796	0.16
797	0.15
798	0.13
799	0.12
800	0.12
801	0.11
802	0.1
803	0.1
804	0.08
805	0.09
806	0.1
807	0.11
808	0.13
809	0.17
810	0.25
811	0.3
812	0.4
813	0.48
814	0.54
815	0.62
816	0.66
817	0.68
818	0.71
819	0.74
820	0.74
821	0.74
822	0.77
823	0.71
824	0.69
825	0.65
826	0.59
827	0.53
828	0.44
829	0.37
830	0.29
831	0.26
832	0.22
833	0.2
834	0.19
835	0.17
836	0.16
837	0.14
838	0.13
839	0.12
840	0.16
841	0.22
842	0.23
843	0.24
844	0.3
845	0.33
846	0.34
847	0.35
848	0.39
849	0.42
850	0.42
851	0.43
852	0.37
853	0.34
854	0.37
855	0.36
856	0.31
857	0.25
858	0.22
859	0.2
860	0.19
861	0.19
862	0.15
863	0.15
864	0.12
865	0.09
866	0.09
867	0.13
868	0.12
869	0.12
870	0.13
871	0.15
872	0.18
873	0.19
874	0.25
875	0.21
876	0.28
877	0.36
878	0.41
879	0.42
880	0.41
881	0.4
882	0.36
883	0.35
884	0.32
885	0.26
886	0.26
887	0.29
888	0.28
889	0.28
890	0.3
891	0.35
892	0.35
893	0.41
894	0.42
895	0.4
896	0.42
897	0.42
898	0.41
899	0.38
900	0.4
901	0.36
902	0.32
903	0.29
904	0.31
905	0.31
906	0.3
907	0.3
908	0.33
909	0.31
910	0.29
911	0.32
912	0.3
913	0.31
914	0.3
915	0.31
916	0.24
917	0.21
918	0.22
919	0.2
920	0.19

V5GCK1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer