Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5G6M3

Protein Details
Accession V5G6M3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
137-162ASTGRPRRGRHVHHHHHHHHHHRQRABasic
433-455EERSGEARRKRLRNMMRSGRICTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
108-120GAAGPGRRSRKSK
441-443RKR
Subcellular Location(s) mito 14, cyto 7, cyto_nucl 7, nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036609  LCCL_sf  
IPR013951  Rxt3  
Gene Ontology GO:0016575  P:histone deacetylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF08642  Rxt3  
Amino Acid Sequences RKGSDELLQHRNLLGVGNDGKRGGRASPLPQAVQGAQAQIIGPAGESGIKNELGRVFSGIGSGVGGVTAPPLSSGASTPMAASPFKRESVTARSANGDATDDAKSARGAAGPGRRSRKSKDEESRFDADSGAEQRTASTGRPRRGRHVHHHHHHHHHHRQRAEDEVSLSGSAHRAAASLNMFHRTSTPTEVAGPVPAHHHHHHHHHHHHAPRAVSVTGPPPPTREPNIFVNVEPLLESVAHLPRHHLGSTLYAPRVGVPTPSASLESAKFGFTTTPVPIPRFEGKENCTFTVRVPRFRIDASHREEICARRALWGTGVYTDDSDPVAAAIHSGFIRGEWGDDVDVEMLDLEIKDTYQHAPRATDEESKGRRIPPVPPADKDLHITLLILPRLERYDGSVLFGLKSRGWEGQHDGMSFKVERIEWVDEGVARGEERSGEARRKRLRNMMRSGRICTGPGLVKLRNAELARRKMGASAAPVETVS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.18
3 0.22
4 0.23
5 0.24
6 0.24
7 0.24
8 0.24
9 0.25
10 0.21
11 0.22
12 0.25
13 0.29
14 0.37
15 0.41
16 0.4
17 0.39
18 0.41
19 0.35
20 0.34
21 0.29
22 0.22
23 0.17
24 0.17
25 0.16
26 0.13
27 0.13
28 0.09
29 0.07
30 0.06
31 0.06
32 0.08
33 0.08
34 0.1
35 0.13
36 0.14
37 0.14
38 0.17
39 0.2
40 0.18
41 0.19
42 0.19
43 0.17
44 0.15
45 0.16
46 0.13
47 0.11
48 0.09
49 0.08
50 0.06
51 0.05
52 0.04
53 0.04
54 0.04
55 0.04
56 0.04
57 0.04
58 0.05
59 0.06
60 0.07
61 0.08
62 0.1
63 0.12
64 0.12
65 0.12
66 0.14
67 0.15
68 0.16
69 0.16
70 0.2
71 0.21
72 0.23
73 0.23
74 0.22
75 0.26
76 0.33
77 0.39
78 0.35
79 0.33
80 0.34
81 0.34
82 0.33
83 0.29
84 0.23
85 0.16
86 0.15
87 0.15
88 0.12
89 0.12
90 0.12
91 0.12
92 0.1
93 0.1
94 0.09
95 0.09
96 0.15
97 0.22
98 0.27
99 0.34
100 0.41
101 0.45
102 0.49
103 0.54
104 0.58
105 0.58
106 0.64
107 0.67
108 0.7
109 0.72
110 0.73
111 0.72
112 0.63
113 0.56
114 0.45
115 0.35
116 0.28
117 0.24
118 0.19
119 0.15
120 0.13
121 0.13
122 0.14
123 0.15
124 0.14
125 0.21
126 0.27
127 0.34
128 0.42
129 0.45
130 0.53
131 0.62
132 0.68
133 0.69
134 0.73
135 0.77
136 0.78
137 0.85
138 0.84
139 0.85
140 0.86
141 0.85
142 0.85
143 0.81
144 0.8
145 0.73
146 0.7
147 0.62
148 0.59
149 0.51
150 0.42
151 0.36
152 0.29
153 0.25
154 0.2
155 0.18
156 0.12
157 0.1
158 0.08
159 0.07
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.09
164 0.09
165 0.1
166 0.11
167 0.14
168 0.15
169 0.15
170 0.16
171 0.15
172 0.17
173 0.19
174 0.18
175 0.16
176 0.17
177 0.18
178 0.16
179 0.16
180 0.14
181 0.11
182 0.13
183 0.14
184 0.18
185 0.18
186 0.23
187 0.25
188 0.34
189 0.42
190 0.48
191 0.53
192 0.56
193 0.62
194 0.62
195 0.65
196 0.59
197 0.51
198 0.43
199 0.39
200 0.31
201 0.24
202 0.2
203 0.16
204 0.17
205 0.18
206 0.17
207 0.17
208 0.2
209 0.23
210 0.26
211 0.26
212 0.26
213 0.28
214 0.32
215 0.3
216 0.27
217 0.25
218 0.21
219 0.18
220 0.15
221 0.11
222 0.07
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.1
227 0.11
228 0.1
229 0.12
230 0.13
231 0.15
232 0.15
233 0.14
234 0.11
235 0.13
236 0.17
237 0.19
238 0.17
239 0.15
240 0.15
241 0.15
242 0.16
243 0.12
244 0.09
245 0.07
246 0.08
247 0.09
248 0.1
249 0.1
250 0.09
251 0.1
252 0.1
253 0.11
254 0.11
255 0.1
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.08
260 0.1
261 0.1
262 0.13
263 0.15
264 0.16
265 0.17
266 0.21
267 0.24
268 0.25
269 0.27
270 0.28
271 0.3
272 0.36
273 0.38
274 0.35
275 0.33
276 0.3
277 0.28
278 0.34
279 0.33
280 0.33
281 0.33
282 0.34
283 0.34
284 0.34
285 0.38
286 0.34
287 0.39
288 0.39
289 0.44
290 0.42
291 0.41
292 0.44
293 0.41
294 0.38
295 0.34
296 0.28
297 0.24
298 0.25
299 0.24
300 0.22
301 0.22
302 0.18
303 0.15
304 0.16
305 0.12
306 0.12
307 0.12
308 0.1
309 0.09
310 0.08
311 0.06
312 0.05
313 0.05
314 0.04
315 0.05
316 0.04
317 0.05
318 0.05
319 0.06
320 0.06
321 0.05
322 0.07
323 0.06
324 0.07
325 0.06
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.08
330 0.07
331 0.06
332 0.06
333 0.05
334 0.04
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.05
341 0.06
342 0.1
343 0.15
344 0.18
345 0.19
346 0.21
347 0.23
348 0.27
349 0.28
350 0.31
351 0.29
352 0.35
353 0.37
354 0.4
355 0.42
356 0.39
357 0.41
358 0.38
359 0.4
360 0.4
361 0.48
362 0.48
363 0.47
364 0.5
365 0.48
366 0.48
367 0.45
368 0.37
369 0.28
370 0.24
371 0.22
372 0.19
373 0.21
374 0.2
375 0.18
376 0.16
377 0.16
378 0.19
379 0.19
380 0.16
381 0.15
382 0.21
383 0.2
384 0.23
385 0.23
386 0.22
387 0.22
388 0.23
389 0.21
390 0.16
391 0.18
392 0.17
393 0.19
394 0.21
395 0.24
396 0.28
397 0.33
398 0.35
399 0.34
400 0.32
401 0.28
402 0.3
403 0.27
404 0.21
405 0.18
406 0.15
407 0.16
408 0.2
409 0.24
410 0.2
411 0.21
412 0.22
413 0.19
414 0.2
415 0.19
416 0.15
417 0.11
418 0.11
419 0.1
420 0.1
421 0.12
422 0.16
423 0.21
424 0.3
425 0.36
426 0.46
427 0.55
428 0.62
429 0.67
430 0.72
431 0.77
432 0.77
433 0.82
434 0.83
435 0.84
436 0.8
437 0.78
438 0.72
439 0.64
440 0.55
441 0.46
442 0.41
443 0.34
444 0.36
445 0.37
446 0.33
447 0.36
448 0.37
449 0.38
450 0.4
451 0.37
452 0.4
453 0.44
454 0.5
455 0.5
456 0.49
457 0.47
458 0.42
459 0.44
460 0.39
461 0.34
462 0.32
463 0.29