Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5G496

Protein Details
Accession V5G496    Localization Confidence High Confidence Score 23.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-54EQTVKKSKVPESRKTKSKKQPSETSGSDHydrophilic
215-243TAYSKEKPDARKPPRPQPKDLKMRFRPVGHydrophilic
265-340SFKNPKGSKAEREERKRKHQQTEGDEKNVEVAPRKKSKKHSSKETGKTESSQDAGDKPKKSKHGDEKKRKKAEKAVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-44ESRKTKSK
223-233DARKPPRPQPK
269-284PKGSKAEREERKRKHQ
294-340EVAPRKKSKKHSSKETGKTESSQDAGDKPKKSKHGDEKKRKKAEKAV
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013240  DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34  
Gene Ontology GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
Pfam View protein in Pfam  
PF08208  RNA_polI_A34  
Amino Acid Sequences MARKSKVESPSPSESDDSSSSSSSVSEQTVKKSKVPESRKTKSKKQPSETSGSDSSSSDEGNDGSIGSESESEDAASQSGKSSRASSEDESDSPREAFRPPPGFKPIKSQRAPSSGVKSVLSDLPGKQVFHITAPASLPLSSIKEVSLAKVLSGEPVLEHKGVKYGIPADTISQQDADEKILLAYDEKTKTYYNTSIGNIQSYHLQELVSLPNGTAYSKEKPDARKPPRPQPKDLKMRFRPVGSTYGPPETIGTSDEESEGEQASFKNPKGSKAEREERKRKHQQTEGDEKNVEVAPRKKSKKHSSKETGKTESSQDAGDKPKKSKHGDEKKRKKAEKAV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.42
3 0.37
4 0.33
5 0.26
6 0.24
7 0.22
8 0.2
9 0.19
10 0.16
11 0.16
12 0.16
13 0.2
14 0.22
15 0.3
16 0.39
17 0.41
18 0.43
19 0.48
20 0.53
21 0.57
22 0.63
23 0.65
24 0.66
25 0.73
26 0.79
27 0.81
28 0.83
29 0.84
30 0.86
31 0.86
32 0.86
33 0.87
34 0.83
35 0.84
36 0.76
37 0.72
38 0.63
39 0.54
40 0.46
41 0.36
42 0.32
43 0.24
44 0.21
45 0.15
46 0.13
47 0.11
48 0.1
49 0.1
50 0.07
51 0.07
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.07
56 0.07
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.08
62 0.07
63 0.07
64 0.07
65 0.09
66 0.11
67 0.12
68 0.13
69 0.15
70 0.16
71 0.2
72 0.24
73 0.24
74 0.27
75 0.28
76 0.28
77 0.3
78 0.3
79 0.27
80 0.24
81 0.22
82 0.18
83 0.17
84 0.19
85 0.24
86 0.31
87 0.32
88 0.36
89 0.44
90 0.46
91 0.45
92 0.53
93 0.54
94 0.55
95 0.56
96 0.57
97 0.54
98 0.56
99 0.6
100 0.54
101 0.51
102 0.44
103 0.43
104 0.38
105 0.32
106 0.28
107 0.25
108 0.22
109 0.17
110 0.14
111 0.18
112 0.19
113 0.19
114 0.17
115 0.18
116 0.17
117 0.16
118 0.18
119 0.13
120 0.12
121 0.13
122 0.13
123 0.11
124 0.11
125 0.1
126 0.09
127 0.1
128 0.09
129 0.09
130 0.09
131 0.11
132 0.11
133 0.11
134 0.13
135 0.11
136 0.1
137 0.11
138 0.11
139 0.09
140 0.09
141 0.08
142 0.05
143 0.07
144 0.09
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.1
149 0.1
150 0.1
151 0.1
152 0.1
153 0.1
154 0.11
155 0.11
156 0.1
157 0.13
158 0.13
159 0.12
160 0.1
161 0.1
162 0.1
163 0.1
164 0.1
165 0.07
166 0.07
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.1
173 0.11
174 0.11
175 0.13
176 0.14
177 0.15
178 0.18
179 0.2
180 0.17
181 0.19
182 0.2
183 0.23
184 0.23
185 0.23
186 0.19
187 0.17
188 0.18
189 0.16
190 0.16
191 0.12
192 0.11
193 0.1
194 0.11
195 0.12
196 0.11
197 0.1
198 0.09
199 0.09
200 0.1
201 0.1
202 0.1
203 0.12
204 0.15
205 0.16
206 0.2
207 0.23
208 0.29
209 0.39
210 0.48
211 0.54
212 0.6
213 0.66
214 0.74
215 0.8
216 0.79
217 0.79
218 0.78
219 0.8
220 0.81
221 0.81
222 0.81
223 0.77
224 0.8
225 0.75
226 0.65
227 0.59
228 0.5
229 0.49
230 0.4
231 0.37
232 0.32
233 0.31
234 0.3
235 0.26
236 0.24
237 0.19
238 0.17
239 0.14
240 0.13
241 0.11
242 0.11
243 0.12
244 0.11
245 0.11
246 0.11
247 0.1
248 0.08
249 0.08
250 0.08
251 0.12
252 0.16
253 0.16
254 0.24
255 0.24
256 0.3
257 0.38
258 0.44
259 0.48
260 0.54
261 0.64
262 0.65
263 0.75
264 0.8
265 0.81
266 0.85
267 0.88
268 0.87
269 0.87
270 0.84
271 0.83
272 0.82
273 0.84
274 0.8
275 0.74
276 0.65
277 0.55
278 0.5
279 0.43
280 0.35
281 0.32
282 0.31
283 0.34
284 0.44
285 0.51
286 0.56
287 0.65
288 0.75
289 0.78
290 0.83
291 0.85
292 0.86
293 0.89
294 0.92
295 0.9
296 0.86
297 0.78
298 0.71
299 0.64
300 0.57
301 0.47
302 0.39
303 0.32
304 0.3
305 0.36
306 0.41
307 0.42
308 0.44
309 0.51
310 0.58
311 0.63
312 0.68
313 0.7
314 0.75
315 0.8
316 0.86
317 0.9
318 0.92
319 0.95
320 0.91